Rosa chinensis (China rose): 112195823
Help
Entry
112195823 CDS
T06020
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
rcn
Rosa chinensis (China rose)
Pathway
rcn03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rcn00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
112195823
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
rcn03019
]
112195823
Messenger RNA biogenesis [BR:
rcn03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
112195823
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
S1CSD-TOTE-2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
112195823
NCBI-ProteinID:
XP_024191803
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(10497883..10501668)
Genome browser
AA seq
469 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEDKLKEYFSNYGDVLQTVVMRDKITQRPRGFGFVVFVDPAVL
DRVLQEKHTIDGRTVEAKRALSREEQQTSVRSGNPNPGRNAGSGGNVRTKKIFVGGLPPT
LTEEEFREYFEAYGHVTDVVVMYDQNTGRPRGFGFISFDTEDAVDRVLHKTFHDLSGKQV
EVKRALPKDANPGGGGRSLGGGQGGGGASGGGYQGYGASGGNPNAYDGRIDSNRYMQSQS
TGGGFPPYGSSGYSAPSYGYAPSSNGIGYGGYGGYGGTNTGYGGPAAAAYGNPNAPNAGY
GGGPPGAPRSSWSSQAPSGYGGMGYGNTAPWGVQSGSAATGSGGPGSAPAGQSPSAAAGY
GAQGYGYGGYGGGDASYGNPSAYGAVGGRSGSVPNNNVGGPGGEQGSGGGYIGSGYGDSN
GNAGYGNSGWRADPSQASGNYGGQANGAHGGQVGYGGYSSAQARQAQQQ
NT seq
1410 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcagggcaagcttttcatcggcgggatttcgtgggagacgtcggaggat
aagctgaaggagtacttcagcaattacggcgacgttttgcagacggtggttatgagagac
aagatcactcaaagacccaggggttttgggttcgtcgtctttgtagatcctgctgttctt
gatagggttcttcaggaaaagcacaccatcgatggcaggacggttgaggctaagagggcc
ctctcaagagaggagcaacaaacttctgtcagatcaggaaatcctaatcctggtagaaat
gcaggaagcggtggaaatgttaggaccaagaagatatttgttggtgggctgcctcccact
ctaactgaagaagaattccgtgaatattttgaagcttatggccatgtaacagatgtagtt
gtaatgtatgaccaaaatactggacgacctcgtggatttggatttatttcatttgacact
gaagatgcagttgatagggttttgcacaagacatttcatgatttaagtggtaagcaagtg
gaagtaaagagggctcttcccaaagatgccaatcctggtgggggtggccgttccttgggg
ggtggtcagggcggtggtggtgcatctggtggtggttaccaaggctatggggcatctggt
ggcaacccaaatgcatatgatggtcgaattgactccaataggtacatgcaatctcagagc
actggaggtggttttcctccttatggttcttctgggtatagtgcacccagttatgggtat
gctccttctagtaatggcattggttatggtggctatggaggttatggtggtaccaatact
ggatatggtggtccagctgctgctgcctatggaaaccccaatgccccaaatgctggttat
ggtggtggtccaccaggtgctcctagaagttcatggagctcccaagccccctcaggatat
ggtggtatgggctacgggaatactgctccttggggtgttcaaagtggcagtgcagctaca
ggaagtggtggccctggatctgcgcctgctggtcaatctcctagtgcagcggctgggtat
ggagctcaaggttatggttatggtgggtacggtggaggtgatgcatcctatggaaatcca
tctgcgtatggtgcagttggagggcgttctgggagtgtcccaaataacaacgttggtggt
ccaggtggggagcaaggtagtggtggtggatacatcggaagtggctatggcgactcaaat
ggaaatgcaggttatggaaattctggttggagagctgatccatcacaagcttctggaaat
tatggtggtcaggctaatggcgctcatggtgggcaagttggctatggaggctatagcagt
gctcaggcacgacaagctcagcagcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
