Rosa chinensis (China rose): 112197705
Help
Entry
112197705 CDS
T06020
Name
(RefSeq) disease resistance protein At4g27190 isoform X1
Organism
rcn
Rosa chinensis (China rose)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_RPS2
NB-ARC
LRR_14
LRR_4
LRR_R13L1-DRL21
AAA_22
ATPase_2
AAA_16
TniB
AAA_18
LRR_8
KAP_NTPase
AAA_14
NACHT
AAA_24
CM_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
112197705
NCBI-ProteinID:
XP_024194265
LinkDB
All DBs
Position
4:31017176..31051550
Genome browser
AA seq
1410 aa
AA seq
DB search
MAFLIDIGTGIVAKIAEYTVAPVGRQVGYLIFYNRNLKNLDSQLSDLIAVRQDVEQKIGE
EKRNNREAEVHVSKWVIDAKSITKEANNILNEGHKAKVKCLCGLCPNLMLRHKLSRKSTK
LVPDIADLYAKIDVKTFAHATTPQDVPTKDYEAFRSRTLLVDQIMDVLGSPNIDMIGVYG
FGGVGKTTLVKEVSRQATEDKTLFDDVAMILDVKQNPSIPRIQKEIAEKLGLDLPENETV
AARARRLFSRIKDQKTLVILDDVWERIDLEAVGLSGVATCKVLLTSRMREVLSREMHTQK
EFPLDLLGEEETWNLFKKKAGDGIKDPAIKTIATKVAKRCGGLPVLVVTVASALKNSTLH
EWKDALRRLKRFDKEEFTEKTYLALEWSYSQLNDDELKPLFLLCGFYTLSPKTIHIQYLF
KYGIGLGLFKNLNTLGEAWDALNSQLEKLKNSCLVLDHEDSGCVKMHDLVHDVAKRISSR
DKQVLKISGGDELKEWPDCEKCTMISLQMLNIPKFPEVLQCKELKLFHLYNIAEDYSLEI
PCNFFKETTELGVLDLTCLSIPSLPQSLQFLKNLKTLCLDACILGDIALIGQLHNLEVLS
FLDSKFKELPKEIGQLTHLRSLDLTNCSQLELIEPNVISRLKRLEELRMGNSFNGWEAEG
VISTEKNSASLSELKHLSKLSVLDIHILDANILPTDLFSNALERYQIYIGATWNWDDADA
NLNTLKIELTATSNELYQSGLNMLLKRTDELHLHGMETDNNTTYQLDGEGFQQLKHLHVH
NADFRHIINGKGVFPNLKRLVVSDLDGSRFLLSSSMARSLVQLTHLQISGCQTMEEIVST
NESNEKHMKDMFSKLQHLELKDLPILTRFCSRSYIGFPSSGIFQLESYNEIEERDSTENL
ETALFDEKVVFPSLKRLFINGLTRLMTLWHNQLSPESFKNLEIVDVCLCQSLKSVFPSSM
VRSLKQLMHLKVINCGVEEIIANEDGLQTAQEFVFPKANSVFFRDLPHLRCFYPGMHISW
WPSLEDLGVYGCSKVVILAQECSSFERNYESRSLTPTNQALLVIKKDSFPNLKVVGMSGM
EIWDGPFPVKFFNKLEFLRLGNKQSESTAVLEKFLDPDKLSITRSAPSNEIYFHEKSSGG
DINAVGTLSHLSELWLWGMWKLKHLGEDNSQIEGQNFPNLKILWISGCNSLRNLRSSAIS
FKNLTKLQVTGCRRLEYLLTYSIGKSFMQLTCLIVEDCARLVEIVGSTEEDNDSGNEIVF
SKLKYLKLSNLPRLQGFRSGDWIVRFPSLETLIISKRLKLKIFHNDETLQVTEEEVDTDV
EADDGATVIKEKIDIDTGGADGEPIDETTQVDANVDESCSEMPPLLIESGATEVQNAHLF
ERKTVRLMCVLLSVCVLLLVFGTYMRDLLV
NT seq
4233 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcatttcttattgatattggaactggaattgttgcaaaaattgcggagtacacggtt
gcaccagttgggcgccaagtgggctatctaattttttacaaccgcaacctcaaaaaccta
gatagtcaactgagcgacttaattgccgtgagacaagatgtggagcagaagattggagaa
gagaagagaaataatagagaagcggaagtccatgtcagcaaatgggtgatagatgccaag
agcatcacaaaagaggcaaacaatatcttgaatgaaggacataaagcaaaggtgaagtgt
ctatgtggattatgtcctaatctaatgcttcgtcacaagttaagtcgaaaatcaacaaaa
ttggttcccgacattgctgacctctatgcaaaaattgatgttaaaacttttgcacatgct
accaccccacaagatgtacccaccaaagattatgaggcctttagatcaaggactttattg
gtggaccaaataatggatgtattgggtagtccaaatattgacatgataggagtgtacggg
tttggtggtgtgggaaagaccacacttgtcaaagaagtttcccggcaagctacagaagac
aagacattatttgatgatgttgctatgatactggatgtaaaacaaaatccaagcatccca
agaattcaaaaagaaattgctgagaagttaggtcttgaccttcctgaaaatgagactgtt
gctgcaagagcacgccgtctatttagcaggataaaagatcaaaagactctcgtaatttta
gatgatgtgtgggaaagaattgatttggaagctgtgggactttctggtgtggctacttgt
aaagtattgctgacatcaagaatgcgagaagtattatctcgtgagatgcatacacaaaaa
gagtttccgcttgatcttttaggggaagaagaaacatggaatttgttcaagaagaaggca
ggtgatggtattaaagatcctgccataaaaactatagcaaccaaagtagccaaaagatgt
ggaggtttgccagttttggttgtcactgttgccagtgccttgaaaaatagtacattacat
gaatggaaagatgcgttgagacgtttgaaaaggtttgacaaagaagaattcacagaaaag
acatacttggccctagaatggagttatagtcagttaaatgatgatgagcttaagccatta
ttcttgctctgtggattttatactctttctccaaaaactatccatatccaatacctattc
aaatatggcattggtttgggtttgtttaaaaacctcaatacactgggagaagcatgggat
gcattaaattcacagcttgagaaactgaagaattcttgtctagtgcttgaccatgaagat
agtgggtgtgtcaaaatgcatgatcttgtgcatgatgttgctaaacgtatttcatcaagg
gataagcaagtgttgaaaataagtggtggagatgagttgaaagaatggccagactgtgaa
aagtgcactatgatctctctccaaatgcttaatatccctaaatttcctgaagttttgcaa
tgtaaagaactaaagttgtttcatctttacaatattgctgaggattactccctggaaatc
ccgtgcaacttttttaaagaaacgacagaactcggagtgttggatttaacttgtctgagt
atcccatcactacctcaatctcttcagttcctaaaaaatctaaagacattgtgtttagac
gcctgcatcttgggagacattgctctaattggccagctacataacttagaagtgcttagc
tttctagactccaagtttaaagagttgcccaaagaaatagggcaattgactcatctacga
tcgttggatttgaccaattgctctcaactggaactaattgaacctaatgttatatcaaga
ttgaaaagactagaagaactgaggatgggaaatagctttaacggatgggaggctgaagga
gtcatcagtactgagaaaaatagtgcaagcctttcagagctcaagcacttgtctaagcta
agcgtcttggatatacatatcttggatgctaatattcttccaacagatttgttctccaat
gcattggaaaggtaccaaatatatattggtgctacatggaactgggatgatgctgatgct
aacctcaacacattgaaaatcgagctcactgctaccagcaatgaactgtaccaatctggt
ttaaatatgttgttgaaaagaactgacgagttacacttacatgggatggagactgataat
aatactacctatcaattagatggcgaaggatttcagcaactgaaacatctccatgtccac
aatgctgattttagacatatcattaatgggaagggtgtttttcccaacttaaaaaggttg
gtggtgagtgacctagatggttcgagatttttgttatcatcttccatggctagaagtctt
gtacaactcacacatcttcagatatctggatgtcaaaccatggaagagatagtatcaaca
aacgaatctaatgaaaagcatatgaaggacatgttttctaagctacaacatttggagcta
aaagatcttccaatcctcacaagattctgctcaagaagttatattggatttccatcctcg
gggatttttcaattagagagctacaatgaaattgaagaaagggactcaacagaaaacctt
gagactgctttgtttgacgaaaaggtagtatttccaagcttgaagagattgttcatcaat
ggcttgaccaggttaatgacactatggcacaaccaactttctccagagagtttcaaaaat
ctagagatagtagacgtttgtttgtgtcagagtttgaaaagtgtttttccatcctcaatg
gttagaagtctaaagcagttaatgcatttgaaagtgattaactgcggagtggaggaaatc
attgcaaatgaagatggactacaaacagcacaggagtttgtattcccaaaagcaaactct
gtcttttttcgggatttgccacatttgaggtgtttctatcctggaatgcatatttcctgg
tggccgtcacttgaagacttgggggtatatggttgcagtaaagtggtgattttggcccaa
gagtgttcaagctttgagagaaactacgagtcgaggagtcttacaccaactaaccaagct
ctcttggtaattaagaaggattcattccccaacttgaaagtagtgggcatgtccggtatg
gagatttgggatggtccattcccagtaaagttctttaacaaactagaatttcttcgactt
ggtaataaacagtccgagtctactgctgtacttgagaagttccttgatcccgataaactc
agtataacgaggtctgctccttccaatgaaatatatttccatgagaaaagcagtggtgga
gatataaatgcagttgggaccctctctcatttaagtgagttatggctttggggcatgtgg
aagctgaagcatttaggggaagataactcccaaatagaaggtcaaaattttccgaacctg
aaaattctatggataagtggttgtaacagcttaaggaatctaagatcatcagctatatcc
ttcaagaatctgacaaaattgcaagtcactggttgtcggagattggaatacttgttaact
tactcgataggtaaaagtttcatgcaactcacatgcctgatagttgaggattgtgcaaga
ctggtagaaatagtgggtagcacagaagaagataatgattcaggaaatgagattgtattt
agcaagttgaaatatctgaaactttctaaccttccaagattgcaaggctttcgctctgga
gattggattgtcagattcccatctttggaaactttaatcataagcaaacgcctcaagctg
aagatttttcataacgatgaaacgctacaggtgacagaagaagaggttgacacagacgtt
gaagctgatgatggtgcaacggtaataaaggaaaagatcgacatagatactggtggtgct
gatggtgaaccaattgatgaaactacacaggttgacgcaaatgttgatgaatcgtgctcg
gagatgccgccattgctcatcgaatccggtgcgacagaagtccagaacgcacacctgttt
gagaggaagactgtgcgcttaatgtgtgtactattgtcagtgtgcgtgctactgttggtg
ttcgggacttacatgcgtgatttgcttgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
