Rosa chinensis (China rose): 112202151
Help
Entry
112202151 CDS
T06020
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
rcn
Rosa chinensis (China rose)
Pathway
rcn03015
mRNA surveillance pathway
rcn03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rcn00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
112202151
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
112202151
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
rcn03041
]
112202151
Spliceosome [BR:
rcn03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
112202151
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
112202151
NCBI-ProteinID:
XP_024198838
LinkDB
All DBs
Position
5:77190008..77193520
Genome browser
AA seq
470 aa
AA seq
DB search
MAGMYGQEGGGGAAPPYGSSGGGGYGGSGGYGGGSGGYGGGGGGGGYGGGGGGYGGKGGD
SGGYGGGGRGGRGGGGYGGGGGRGGGYQGDRGGGRGGGGGGGRGGRGGSGRDGDWPCPNP
GCGNVNFARRTECNKCGTPSPAGAGGGGGDRGGGGGYNRGGSGGGYGDNRGGRGGNYDGG
RSGNYEGGKGSNYDGGRGGGFDSRGGGGGSRGGSYGGNQGRDDGGYGQAPAAAPPSYGAG
GSYPPSYNANYGTDAVPPPTSYTGGPASYPPSYGGPAGAYGGDGPGDARSGGRGGPPAKY
DGGYGGGGRGGYASAPTEAPAKVKQCDENCDDTCDNARIYISSLPPDVTVDELQALFGGI
GQVGRIKQKRGYKDQWPYNIKIYTDESGKNKGDACLAYEDPNAAHSAGSFYNGHDIRGYK
ISVAMAERSAPRAYDNGGGRGGYGGGGRRDNYRDGGPDRHQHGGNRSRPY
NT seq
1413 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgggatgtatggtcaggagggcggcggtggtgccgctccgccgtatggatctagc
ggcggtggtggctacggtggctccggagggtatggaggcggttccggaggttatggagga
ggcggtggcggtggaggctacggaggaggaggtggtggatatggaggtaaaggcggcgat
agcggtggttacggtggtggaggccgtggcggtcgaggtggaggaggttatggtggcggt
ggcggtcgaggtggaggatatcaaggcgaccgtggtggcggccgcggaggtggtggcggc
ggcggcagaggtggccgtggtggcagtggaagggatggtgattggccttgccctaatcca
ggctgtgggaatgtgaactttgcgagaagaactgagtgtaacaagtgtggtacgccctct
cctgcgggtgctggtggcggtgggggagaccgtggtggtggaggtggttataatagaggt
ggaagtggtgggggatatggtgataaccgtggtggcagaggtggtaattatgatgggggt
cgaagtggcaactatgaaggaggtaaaggtagcaattatgatggaggcagagggggtggt
tttgatagtagaggtggaggaggtgggagtagaggtggttcttatggtggtaaccaagga
agagatgatggtgggtacggtcaggctcctgcagctgctcctccatcttatggtgcaggt
ggcagttacccaccatcgtacaatgctaattatggaacagatgcagtccctcctcctaca
agctatactggtgggcctgcttcatatcccccatcctatggtggtcctgcaggtgcttat
ggtggtgatggtccgggtgatgcaaggagtggcggccgaggtggccctcctgctaaatat
gatggcggatatggtggtggtggtcgaggtggttatgcaagtgctcctacagaggcccct
gctaaggtgaagcaatgcgatgagaactgtgatgatacttgtgacaatgctagaatctac
atttcaagtctgccaccagatgtcacggtcgatgaactgcaagctctttttggaggcatt
ggacaagttgggagaatcaagcagaaacgtgggtacaaggatcagtggccatataacatc
aaaatttacacagatgagtcgggaaagaacaaaggtgatgcatgtttagcctatgaagat
ccaaatgctgcacattcagctggcagtttttacaacggtcatgacataaggggctataag
atcagtgttgcgatggcagagaggtcggcacctagggcttacgacaatggtggtggtaga
ggtggttatgggggcggtgggcgcagggacaattatcgagatggtggacctgacagacat
cagcatggtggaaaccgttcacgtccatattga
DBGET
integrated database retrieval system
