KEGG   Rickettsia conorii: RC1085
Entry
RC1085            CDS       T00061                                 
Symbol
rompB
Name
(GenBank) outer membrane protein B (cell surface antigen sca5)
Organism
rco  Rickettsia conorii
SSDB
Motif
Pfam: rOmpB_passenger Autotransporter
Other DBs
NCBI-ProteinID: AAL03623
UniProt: Q9KKA3
LinkDB
Position
complement(1007188..1012155)
AA seq 1655 aa
MAQKPNFLKKLISAGLVTASTATIVASFAGSAMGAAIQQNRTTNAVATTVDGVGFDQTAV
PANVAVPLNAVITAGVNKGITLNTPAGSFNGLFLNTANNLDVTVREDTTLGFITNVVNNA
NHFNLMLNAGKTLTITGQGITNVQAAATKNANNVVAQVNNGAAIDNNDLQGVGRIDCGAA
ASTLVFNLANPTTQKAPLILGDNAVIVNGANGTLNVTNGFIKVSSKSFATVNVINIGDGQ
GIMFNTDADNVNTLNLQANGATITFNGTDGTGRLVLLSKNAAATDFNVTGSLGGNLKGII
EFNTVAVNGQLKANAGANAAVIGTNNGAGRAAGFVVSVDNGKVATIDGQVYAKDMVIQSA
NAVGQVNFRHIVDVGTDGTTAFKTAASKVAITQNSNFGTTDFGNLAAQIIVPNTMTLNGN
FTGDASNPGNTAGVITFDANGTLASASADANVAVTNNITAIEASGAGVVQLSGTHAAELR
LGNAGSVFKLADGTVINGKVNQTALVGGALAAGTITLDGSATITGDIGNAGGAAALQGIT
LANDATKTLTLGGANIIGANGGTINFQANGGTIKLTSTQNNIVVDFDLAIATDQTGVVDA
SSLTNAQTLTINGKIGTVGANNKTLGQFNIGSSKTVLSDGDVAINELVIGNNGAVQFAHN
TYLITRTTNAAGQGKIIFNPVVNNNTTLATGTNLGSATNPLAEINFGSKGAANVDTVLNV
GKGVNLYATNITTTDANVGSFIFNAGGTNIVSGTVGGQQGNKFNTVALDNGTTVKFLGNA
TFNGNTTIAANSTLQIGGNYTADFVASADGTGIVEFVNTGPITVTLNKQAAPVNALKQIT
VSGPGNVVINEIGNAGNYHGAVTDTIAFENSSLGAVVFLPRGIPFNDAGNRIPLTIKSTV
GNKTATGFDVPSVIVLGVDSVIADGQVIGDQNNIVGLGLGSDNDIIVNATTLYAGIGTIN
NNQGTVTLSGGIPNTPGTVYGLGTGIGASKFKQVTFTTDYNNLGNIIATNATINDGVTVT
TGGIAGIGFDGKITLGSVNGNGNVRFVDGILSHSTSMIGTTKANNGTVTYLGNAFVGNIG
DSDTPVASVRFTGSDGGAGLQGNIYSQVIDFGTYNLGISNSNVILGGGTTAINGKINLRT
NTLTFASGTSTWGNNTSIETTLTLANGNIGNIVILEGAQVNATTTGTTTIKVQDNANANF
SGTQTYTLIQGGARFNGTLGGPNFVVTGSNRFVNYGLIRAANQDYVITRTNNAENVVTND
IANSSFGGAPGVGQNVTTFVNATNTAAYNNLLLAKNSANSANFVGAIVTDTSAAITNAQL
DVAKDIQAQLGNRLGALRYLGTPETAEMAGPEAGAIPAAVAAGDEAVDNVAYGIWAKPFY
TDAHQSKKGGLAGYKAKTTGVVIGLDTLANDNLMIGAAIGITKTDIKHQDYKKGDKTDVN
GFSFSLYGAQQLVKNFFAQGSAIFSLNQVKNKSQRYFFDANGNMSKQIAAGHYDNMTFGG
NLTVGYDYNAMQGVLVTPMAGLSYLKSSDENYKETGTTVANKQVNSKFSDRTDLIVGAKV
AGSTMNITDLAVYPEVHAFVVHKVTGRLSKTQSVLDGQVTPCISQPDRTAKTSYNLGLSA
SIRSDAKMEYGIGYDAQISSKYTAHQGTLKVRVNF
NT seq 4968 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggctcaaaaaccaaattttctaaaaaaattaatttccgcagggttggtaactgcttct
acagctaccatagtagcaagttttgcaggttcagctatgggtgctgctatacagcagaat
agaacaacaaacgcagttgctacaactgttgatggtgtgggatttgaccaaactgcagtt
cctgcaaatgttgcagttcctctaaatgcagttattactgctggtgttaataagggtatt
actttaaatactccagccggtagttttaacggtttgtttttaaatactgcaaacaattta
gacgtgacagtgcgtgaagatactaccttagggttcatcactaatgttgttaataacgct
aaccactttaaccttatgcttaatgccggtaaaactcttactataacaggtcaaggtatt
actaatgtacaagctgctgctacaaaaaatgctaacaatgttgttgcacaagttaataat
ggtgctgctattgacaataatgatcttcaaggtgtaggaagaatagactgcggtgctgcg
gcttctacattagtatttaatttagcaaatcctacaactcaaaaagctcctcttatactt
ggagataatgctgtaatagttaatggtgctaacggtacattaaatgttactaatggattt
attaaagtttcaagtaaaagttttgctactgttaatgtaattaatatcggtgacggtcaa
ggtatcatgttcaatactgatgctgataatgttaatactttaaatttacaagcaaatggt
gctactattacttttaatggaacagacggtacgggtagattagtattattaagtaagaat
gctgctgctaccgactttaacgttacaggaagtttaggcggtaatctaaaaggtattatt
gaatttaacactgttgcagtaaacggtcaacttaaagctaatgcaggcgctaatgcagca
gtaataggtactaataatggcgcaggtagagctgcaggatttgttgttagcgtagataat
ggtaaggtagcaacaatcgacggacaagtgtatgctaaagacatggttatacaaagtgct
aatgcagttggacaagtaaattttagacacatagttgacgttggtacagacggtactact
gcctttaaaacagcagcttctaaagttgcaataacccaaaactcaaactttggtactact
gatttcggtaatcttgcagcacagattatagttcctaatactatgacccttaacggtaat
tttacaggtgatgctagcaatcccggtaacactgcaggtgtgataacttttgatgctaac
ggtactttagcaagtgctagtgcagatgcaaatgttgcggtgacaaataatattacagca
attgaagcatcaggtgccggagttgtccaattatcaggaacacatgctgccgagttacgt
ttaggaaatgccggttctgtctttaaacttgctgacggtacagttataaacggtaaagtt
aaccaaactgctcttgttggcggtgctcttgcagccggtactattaccttagacggtagt
gctacaattaccggcgatatagggaacgctggcggtgctgctgcgttacaaggcattact
ttagctaacgatgctacaaaaacattaacacttggtggagcaaatattatcggtgctaat
ggtggaacgattaatttccaagctaacggtggtactattaaattaacaagcactcaaaat
aatattgtagttgattttgatttagctatagctactgatcaaacaggcgttgttgatgcg
agtagcctaacaaatgctcaaactttaactattaacggtaaaatcggtactgttggagct
aataataaaactcttggacaatttaatattggctcaagtaaaacagttttaagtgacggt
gatgttgctattaacgagttagttattggaaataacggtgcagtacaattcgcgcataat
acttatttaataacaagaactacaaatgctgctggtcaaggtaaaataatatttaatcct
gttgtaaataataatacaactcttgcaaccggtacaaatttaggtagtgctacaaatcca
cttgcagaaattaattttggatctaaaggggctgctaatgttgatactgtattaaatgtt
ggtaaaggtgtaaatttatatgctactaatattactactaccgatgctaacgtaggttct
ttcatctttaatgccggtggaacaaatatagtaagcggtacagtcggtggacagcaaggt
aataagtttaatactgtagcattagataacggtactactgttaagttcttaggtaatgca
acatttaacggtaacactacaattgcagctaattctaccttacaaatcggtggtaactat
actgcagactttgttgcatctgccgatggtaccggtatagtagaattcgttaacaccggt
cctattaccgtaacattaaacaaacaagctgcacctgttaatgctttaaaacaaataacg
gtttctggtcccggtaacgtagtgattaatgagataggtaatgcaggtaattatcatggt
gccgtgactgatacgattgcttttgaaaattcaagtttaggtgcagttgtattcttacct
agaggcattccattcaatgatgcaggcaacagaattcctttaacaattaaaagtaccgta
ggtaataaaacagctacaggttttgatgttcctagcgtgattgttttaggtgttgatagt
gtcatcgctgacggtcaagtaatcggtgatcaaaataatatcgtaggtctaggtcttgga
agcgataacgatataatcgttaatgctactacattatatgcaggtatcggtactataaac
aataatcaaggtactgtcacacttagcggtggtattcctaatacccctggtacagtttat
ggcttaggcacaggtattggcgcttcaaagttcaagcaagtaacgtttactacagactat
aacaacttaggtaatattattgcaactaacgcaacaattaatgacggtgtaactgttact
acaggcggtatagccggaataggttttgacggtaaaattactcttggaagtgttaacggt
aacggtaatgtaagatttgttgacggtatattgtctcattctacaagtatgattggtact
actaaagctaataatggtactgtaacttatttaggtaatgcattcgtcggtaatataggt
gattcagatactcctgtagcttctgttagatttacaggtagtgatggtggtgcaggatta
caaggaaatatttattcacaagtcatagactttggtacttataacttaggtatttcaaat
tctaatgtaattttaggcggcggtactactgctattaacggtaaaatcaatcttcgtaca
aatactttaacatttgcaagtggtacttcaacatggggaaacaatacttctattgaaact
actttaacattagcaaacggtaatataggtaacatcgttattttggaaggtgcgcaagtt
aatgcaacaaccacaggaactacaaccattaaagtacaagataatgccaatgcaaatttc
agtggtacacaaacttatactttaatccaaggtggtgctagatttaacggtactttagga
ggtcccaactttgttgtaaccggaagtaatcgtttcgtaaattacggtttaatacgtgct
gctaaccaagattatgtaataacacgtactaacaatgcagaaaacgtagttactaatgat
atcgcaaatagttcgtttggaggtgcaccgggtgtaggtcagaacgttacaacatttgta
aatgcaactaatactgcagcatataataatcttcttttagctaaaaatagtgctaattct
gctaactttgttggagctatcgttaccgatacaagtgcggccataactaatgcacaatta
gatgtagctaaagatatccaagctcaacttggtaacagattaggtgctcttagatattta
ggtactcctgaaactgctgaaatggctggacctgaagctggagcaataccggctgcggtt
gctgcaggtgacgaggctgttgataatgtagcttacggtatatgggcaaaacctttctat
actgatgcacatcaaagtaagaaaggtggtttagctggttataaagctaaaaccaccggt
gttgtaatcggtttagatacgctagctaacgataacttaatgatcggtgctgctattggt
atcactaaaactgatataaaacaccaagattataagaaaggtgataaaaccgacgttaac
ggtttctcattctctctatatggtgcccagcagcttgttaagaacttctttgctcaaggt
agtgcaatatttagcttaaaccaagtgaagaacaaaagtcagcgttacttcttcgatgct
aacggtaatatgagcaagcaaattgctgccggtcattacgataacatgacattcggtggt
aacttaacagtcggttatgattacaatgcaatgcaaggtgtgttagtaactccaatggca
ggacttagctacttaaagtcttctgacgaaaactacaaagaaaccggtacaacagttgca
aacaagcaagttaacagcaaatttagcgatagaaccgatttaatagtaggtgctaaagta
gccggcagtactatgaacataactgatcttgcggtatatccggaagttcacgcttttgtg
gttcacaaagtaaccggtagattatctaaaactcagtctgtattagacggacaagttact
ccgtgtatcagccagcctgacagaaccgctaaaacatcttataatttaggtttaagtgca
agcataagatctgatgctaagatggagtacggaatcggttacgatgctcagatttcaagt
aaatatactgcacatcaaggtactctaaaagtccgtgtaaacttctaa

DBGET integrated database retrieval system