Rickettsia conorii: RC1211
Help
Entry
RC1211 CDS
T00061
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III alpha chain
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
rco
Rickettsia conorii
Pathway
rco03030
DNA replication
rco03430
Mismatch repair
rco03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rco00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
RC1211 (dnaE)
03430 Mismatch repair
RC1211 (dnaE)
03440 Homologous recombination
RC1211 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
rco03032
]
RC1211 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
rco03400
]
RC1211 (dnaE)
Enzymes [BR:
rco01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
RC1211 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
rco03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
RC1211 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
rco03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
RC1211 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
DUF5487
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAL03749
UniProt:
Q92GB2
LinkDB
All DBs
Position
complement(1105664..1109209)
Genome browser
AA seq
1181 aa
AA seq
DB search
MRPEFIHLRTQSSYSFLESALTIEKVVELASSNKMPAICLADKGNLFGSLEFALCAVKKG
LQPIHGVILNIKYDIDIFAQILLIAKDETGYKNLLKLSSLTFTKNDRKICDHIDFEDLIE
YQEGLIGLCCYTDGIVGKCLLARNEEQAMLFARKLQEILGDRFYFEIMRHELPEEQFIED
SYIRIAAELAIPLVATNKVLFSEKSMHDAHDVLLCISAGVTKEYLDRKTVSENCYFKSPH
EMIELFSDLPSAIQNTVNLRERCYFAAHANPPMLPNFATENISETDLIKKDAKEGLLARL
ATKFKSENIALENQEALKTEYFARLNYELDIICNMNFAGYFLIVSDFIKWSKKEGILVGP
GRGSGAGSVVAWSLLITDLDPIKFGLLFERFLNPERISMPDFDIDFCQERREEVINYVRS
KYGNNRVGQIITFGKMQAKAVIKDVARVLSLPYKFADYLTELVPFSAVNPVSLEQAMREV
PELANAAKGNGLYNLDGEAELIKLVIDTSLILEGLHRHSSTHAAGIVIAGTDLVDIVPVY
KDANSDMLIVGYSMKYSEIAGLIKFDFLGLQTLTVITDCKKLLKEQGIEVDFNNMTFDDN
KTYQMLCKGKGVGVFQFESIGMKDALRRLKPDSIHDLIALGALYRPGPMENIPTYIACKH
KLQQPDYLHELLQPILEETYGVVIYQEQVQRIAQVLAGYTLGAADLLRRAMGKKIKKEME
EQEEIFVKGAIANNISESQAKSIFATVAKFAGYGFNKAHAASYGVISYQTAYLKANYPAA
FLVACLNLELNNHDKINLFLQEAKDNGIKIIAPNINISEGYFSVKFSDTVIPHSVKPVIP
RLDRGIQKISKDTVVKPRCDIAGAIIFALGAIKGVTPNFGKLVTDERKARGAFKSITDFI
ERLPPKSINSKLLENLIKSGCFDELHDNRLQLLSSIPKLLSYSTAYHEEQESNQFSLIKV
SSLSPTILVSSDYADKNTLAFYEFEAMGLFISNHPLTEYQEIFSRLNILNTADLHNNLPD
GTNRVNLAGVIQKKDSRMSARGRFVTLVLSDPENIFELSIFSEEVLKDYVHLLDVKSLVV
VNCDIVKDEGGIKLTAKSFSSIEDAINNKQFELQFYPQNHEELRQIVTLLAARINNEDQS
NAKATIYLQSADVKNFVAKITLPEKFLLQGQDFEILKGYSK
NT seq
3546 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgacctgaatttattcatttaagaactcaaagctcttattcttttctagaaagtgca
ttaacgattgagaaggtagtagaacttgcttcatcgaataaaatgcctgctatttgtttg
gcagataagggaaatttattcggctcattagagtttgcattatgtgcagtaaaaaaagga
ctgcagccgatacacggagttattctaaatataaaatacgatatagatatttttgctcaa
attttgcttatagctaaagatgaaactggttataaaaatttactcaaactatcaagcctt
acttttactaaaaatgatcgtaagatatgcgatcacattgattttgaagatttaatcgaa
tatcaagaaggattaataggattatgctgttataccgacggtattgtcggaaaatgcttg
ctagctcgtaacgaggagcaagcgatgctgtttgcacgtaaattacaggaaattttagga
gatcgtttttactttgagattatgagacatgagctaccggaagaacagtttattgaggat
agttatattagaattgctgccgagcttgctattccgcttgttgctactaataaagtttta
tttagtgagaaaagcatgcatgatgcacatgatgtattgttatgtatatcagccggtgtt
actaaagaatatctggatcgaaaaacagttagcgaaaattgttattttaaatcaccgcat
gagatgatagagcttttttccgatttacctagtgccatccaaaataccgtgaatttaaga
gagcgttgttattttgccgcacatgcaaacccgccgatgttgcctaattttgccaccgaa
aatattagtgaaacggatttaattaaaaaagatgcaaaagaagggttgcttgcaaggctt
gctacaaagtttaaatctgaaaatattgcgttagagaatcaagaagcattgaaaaccgaa
tattttgctcgtcttaattatgagctggatattatctgtaatatgaattttgccggttat
tttttgattgtatctgattttattaaatggagtaaaaaagagggtattttagtcggaccg
ggtagaggatcgggagcaggctcggttgttgcttggagcttgcttattactgatctcgat
ccgattaaatttggcttattatttgaaagatttttaaatcctgaacgtatttcaatgcct
gattttgatattgatttttgtcaggaaaggcgtgaggaagtaattaattacgtacgttcc
aaatacggtaataatagagtaggacagattataactttcggtaagatgcaggcaaaggct
gtaattaaggatgtcgctcgtgtgcttagcttaccttataaatttgctgattatctaacg
gagcttgtcccttttagtgcagttaatccagttagcttagaacaggcaatgcgtgaagtt
ccggagcttgcaaatgccgctaaaggtaatgggctgtataatttagacggtgaagcggag
ttaattaagttagtgattgatacttcgttaattcttgaggggctgcataggcattcctca
actcatgctgcaggaatcgtaatagcaggtactgatttagtcgatatagtaccggtatat
aaagatgctaactccgatatgctgatagtcggttattctatgaaatattccgagattgcc
ggtttaattaaatttgattttttagggctacaaaccctaacggttattaccgattgtaag
aaactgcttaaagagcaagggatagaagtagattttaacaatatgacgtttgatgataat
aagacttatcaaatgttgtgtaaaggtaaaggagtcggcgttttccaatttgaaagtatc
gggatgaaagatgcacttagacgccttaaacctgattctatacatgatttgatagctctt
ggtgctttataccgtcctggtcctatggaaaatattcctacctatatagcttgtaagcat
aaattacaacagcctgattatttacatgagctattgcaaccaatcttagaagaaacttac
ggagtggtgatatatcaggagcaggtacaaagaattgctcaggttcttgcaggttatacg
ctaggagctgccgatttacttcggagagcaatgggtaagaagataaaaaaagaaatggag
gagcaggaagaaatttttgttaaaggagcaattgctaataatatttcggaatctcaagct
aaatccatttttgcgaccgtggctaaatttgccggatacggttttaataaggcacatgct
gcgtcttacggtgttatttcataccaaactgcatatcttaaagctaattatcctgctgca
tttttagtagcatgcttaaatcttgaattgaataatcacgataaaattaatttattttta
caagaagcaaaagataacggcataaaaattattgcacctaatattaatatttctgaaggg
tattttagtgtaaagttttcggacactgtcatcccgcatagtgtaaagcctgtcatcccg
cgacttgatcgtggtatccagaaaatttcaaaagataccgtggtcaagccacggtgtgac
atcgcgggtgcaataatcttcgccttaggtgctattaagggagttacgccgaatttcggt
aagttagtaacggatgagcgaaaagcaagaggggcgtttaaatcaattactgattttatt
gaaagattacccccaaaatctattaacagtaaattattggaaaatttaatcaagtcaggc
tgttttgatgagctacatgataatcgattgcaattattgtcaagcattccaaaattgctt
tcttattcaactgcatatcacgaagagcaggaatctaatcaatttagcttaattaaagtt
tctagtttaagtccaactattttagtatcaagcgattatgccgataaaaatactttagcc
ttttatgaatttgaggctatgggtttatttatctctaatcatcctcttacggaatatcaa
gaaatatttagtcgtttaaatattttaaatactgcggatttgcataataacttacctgat
ggtactaaccgagtaaatcttgccggtgtaatacaaaaaaaggattctcgtatgtcggca
agaggtaggtttgtgacgctcgtgctttccgatcctgagaatatctttgaacttagtatt
tttagtgaggaagttttaaaagattatgtacatttacttgatgttaaaagtttggtagtt
gttaattgtgacatagttaaagatgagggaggaataaaactaacggcaaaaagcttttca
tcaattgaggatgcaattaataataaacaatttgaactacagttttatccacaaaatcat
gaagaattacggcagatagtaaccttgcttgcagctcgtataaataatgaagatcagagt
aatgctaaagctacaatctatttacaaagcgcagatgtaaaaaattttgtagcaaaaatt
acattacctgaaaaattcttgctccaagggcaagattttgagattttaaaaggatatagt
aaatag
DBGET
integrated database retrieval system
