Raphidiopsis curvata: NIES932_29170
Help
Entry
NIES932_29170 CDS
T09812
Name
(GenBank) PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase
Organism
rcs
Raphidiopsis curvata
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Response_reg
HATPase_c
HisKA
PAS
PAS_9
PAS_8
PAS_3
HPTransfase
PAS_4
PAS_12
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAZ91409
LinkDB
All DBs
Position
complement(3173738..3175681)
Genome browser
AA seq
647 aa
AA seq
DB search
MIAGDDKNRIIMNDEIIKVLLINDAEDDYILTRSWFRQFQLITCDLEWVNSYQLAKESIA
QYQHDIYLVDYYLESNNGLKLLREATENGWNFPFILLARKEDIKSDMEVIKIGAVDYLEK
SQLTAPLLEKSIRYAIEKKQRDEKIHQQEILLDGSNDAIFVTDLDHQHILFWNKAAERIY
GWSAEIAMTKQIHHLFSAEKLPQLSRVLKLLTSYGNWEGELTQINKSEQEVIVASRWTLV
MTFNRKHQSILVVNTDITQKKQLEQKFLRVQRLESIGTLASGVVHDLNNVLTPILMTAQI
LETQVKDEKPRQLIPILIASAKRGANLVKQVLSFARGMEGERTILQIKHLLIEVQNIIKE
TFPKTIILTTEIPQSLWTVCGDATQLHQVLMNLCINARDAMPNGGTLSIKSENILIDEHY
TQTHTDFKPGAYVLISIRDTGVGIKPTLIDRIFEPFFTTKDVGQGTGLGLSTVLGIVKAH
GGFINVYSQENKGSEFQVYLPAQDTSEVMETTEISPPRGHGETILVVDDEPAICEITKAS
LENYNYRVMTAHDGIEAIALYVEHRDQISLILTDIVMPSMDGLTSIRTLKKINPHLKIIA
FSGLAPSDKINAAYSIGVTAFLCKPFTATQLLQTISAVNGVNNFAIN
NT seq
1944 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgattgctggagatgataaaaatcgaataatcatgaatgatgaaatcataaaagttttg
ttaattaatgatgctgaggatgattatattttaactcgcagctggtttagacaattccag
ctgattacctgcgacttagaatgggtgaatagttatcaattggcgaaggaatccatagcc
caataccaacatgatatttatctagtggactattatttagagagtaataatggcttaaaa
ctattgcgggaggctacagaaaatggttggaactttccatttattctgttagcacgtaaa
gaggatataaaatcagatatggaggtgataaaaattggagcggtcgattatctggaaaaa
agtcaattaacagcccccttgttagaaaaatccatccgttatgcgattgaaaaaaaacaa
agagatgagaaaattcaccaacaagagatcttgctggatgggtctaatgatgcgattttt
gtaactgatttagatcatcagcacattttattttggaataaagcagcagaacgtatatat
ggttggtctgcggaaatagcaatgacaaaacaaattcatcacttattttcagcagaaaag
ttacctcaactttcccgggtgcttaaattactaaccagctatggcaattgggaaggggaa
ctgacacaaattaataagtccgagcaagaagtaattgttgcgagtcgctggacattagta
atgaccttcaaccgtaaacatcaatctattttagtggttaatactgatattacccaaaaa
aagcaattggagcagaaattcctacgggttcaaagactagaaagtatcggtactttggct
agtggtgtggtccacgatctaaataatgttctcaccccaattttgatgacagcacaaatc
ttagaaactcaagtgaaagatgaaaaacctcgtcaactgattcctatattaattgctagt
gctaaacgcggcgcaaatttggttaaacaagtgttatcctttgccagaggtatggaaggg
gagcggactattttacaaataaaacacttactcatagaagttcagaatattattaaagaa
acattccctaaaactattattttaaccactgaaattcctcaaagtctatggactgtctgt
ggtgatgctactcaattacatcaggttttaatgaatttatgtatcaatgcccgggatgct
atgcccaatggtggtactttaagtattaagtctgaaaatatattgattgatgaacattat
acccaaacacatactgattttaaaccaggtgcttatgtattgattagtatcagagatacg
ggtgtgggtattaaaccaaccctcattgatcggatatttgaacctttcttcaccactaag
gatgttggtcagggtaccggtttaggactttccacggttttgggaattgttaaagctcat
ggtggttttattaatgtttacagtcaagaaaacaagggtagtgagtttcaagtttatttg
ccagctcaagatacaagtgaagttatggagaccacagaaatatcccctcctcgtggtcac
ggagaaaccattttggtggttgatgatgaaccagctatttgtgaaataacaaaagcatca
ctagagaattataactatcgggtaatgaccgcccatgacggtattgaagcgatcgcctta
tatgtggaacatcgagatcagatatctctgattctaactgatatagttatgccatccatg
gatggattgaccagtattcgaactctcaagaaaattaatccccatttaaaaattattgct
tttagtgggttagcacctagtgataaaattaatgcagcttatagtataggcgtaacagca
tttttatgtaaaccttttactgctactcagttattgcaaaccattagtgcggtaaatgga
gtaaataattttgccatcaattaa
DBGET
integrated database retrieval system