Ricinus communis (castor bean): 11542378 Help Entry 11542378          CDS       T01087                                  Symbol ndhF, RCOM_ORF00102 Name (RefSeq) NADH dehydrogenase subunit 5   KO K05577   NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5 [EC:7.1.1.2] Organism rcu  Ricinus communis (castor bean) Pathway rcu00190   Oxidative phosphorylation rcu01100   Metabolic pathways Brite KEGG Orthology (KO) [BR:rcu00001]  09100 Metabolism   09102 Energy metabolism    00190 Oxidative phosphorylation     11542378 (ndhF) Enzymes [BR:rcu01000]  7. Translocases   7.1  Catalysing the translocation of protons    7.1.1  Linked to oxidoreductase reactions     7.1.1.2  NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)      11542378 (ndhF) BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Proton_antipo_C Proton_antipo_M Proton_antipo_N Motif Other DBs NCBI-GeneID:  11542378 NCBI-ProteinID:  YP_005090225 UniProt:  G1D7A5 LinkDB All DBs Position CP Genome browser AA seq 749 aa AA seqDB search MEHIYQYSWIIPFVTFPAPMLIGAGLLLFPAATKKLRRMWAFPSLFLLSIVMIFSIDLSI HQINSSFIYQYIWSWTINNDFSLEFGHLIDPLTSILSVLITTVGIMVLFYSDNYMSHDQG YLRFFAYMSFFNTSMLGLVTSSNLIQIYIFWELVGMCSYLLIGFWFTRPIASNACQKAFV TNRVGDFGLLLGILGIYWITGSFEFRDLFKILNNLISNNQVHFLFVTLCAFLVFSGAIAK SAQFPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLFPLFVVIPYIMNLIALIGII TVFLGATLALAQKDIKRSLAYSTMSQLGYMMLALGMGSYRVALFHLITHAYSKALLFLGS GSIIHSMEAIVGYSPDKSQNMILMGGLTKHIPITKTAFFLGTLSLCGIPPFACFWSKDEI LNDSWLYSPVFAIIACFTAGLTAFYMFRVYLLTFEGHLNVHLKNYSGKKNSSFYSISLWG KEGSKMLNESLGLLPFLTTNNNERASFFWKNTYQIDGNVRKMMWPFITIKNFNTKRIFAY PHESDNTMLFPMLVLVLFALFIGAIGIPFNQIPFNQKGMEVDILSKLLTPSLNLLHQNSK NSVDWYEFVTNAIFSVSIAFFGIFIASSLYKPVYSSLQNLNFLNSLAKKGSKRILWDKII NVIYNWSYNRGYIDAFYEISFIGGIRKLAELIHFFDKRIIDGITNGVGVTSFFVGEGIKY VGSGRISSYLLLYLFYALIFLLIYSFYNL NT seq 2250 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atggaacatatatatcaatattcatggatcataccttttgttacattcccagctcctatg ttaataggagcgggactcctactttttccggcggcaacaaaaaaacttcgtcgtatgtgg gcttttccaagccttttcttgttaagtatagtcatgattttttcaatcgacttgtctatt caccaaataaatagcagttttatttatcaatatatatggtcgtggactatcaataatgat ttttctttagaattcggacacttgattgacccacttacttctattttgtcagtattaatt actacagttggaattatggttcttttttatagtgacaattatatgtctcatgatcaaggc tatttgagattttttgcttatatgagttttttcaatacttcaatgttgggattagttact agttctaatttgatacaaatttatattttttgggagttggttggaatgtgttcttatcta ttaatagggttttggttcacacgacctattgcatcgaatgcttgtcaaaaagcctttgta actaatcgtgtaggggattttggtttattattgggaattttgggcatttattggataacg ggcagtttcgaatttcgggatttgttcaaaatattgaataacttgatttctaataatcag gttcattttttatttgttactttgtgtgcctttctagtattttctggcgcaattgctaaa tcggcgcaatttcctctccatgtatggttaccggatgccatggaagggcctactcctatt tcggctctaatacatgctgctactatggtagcggcaggaatttttcttgtagctcgactt tttcctctttttgtagtcataccttacataatgaatctaatagctttgataggtataata acagtatttttaggagctactttagctcttgctcaaaaagatattaagagaagtttagcc tattctacaatgtctcaattaggttatatgatgttagctctaggtatggggtcttatcga gtcgctttatttcatttgattactcatgcctattcgaaagcattattgtttttaggatct ggatccattattcattcaatggaagctattgttggttattctccagataagagtcaaaat atgattcttatgggtggtttaacaaaacatattccaattacaaaaactgcttttttttta ggaacactttctctttgtggtattccacccttcgcctgtttttggtccaaagatgaaatt cttaacgatagttggttgtattcaccggttttcgcaataatagcttgtttcacggccgga ttaactgcattttatatgtttcgggtttatttacttacttttgaaggacatttaaatgtt catttaaaaaattacagtggtaaaaaaaacagttcattttattcaatatctttatggggt aaagaaggatcaaaaatgcttaacgaaagtttgggtttattacctttcttaacaacgaat aataacgaaagggcttcttttttttggaagaacacatatcaaattgatggtaatgtaaga aagatgatgtggccttttattactattaaaaattttaacactaaaaggatttttgcctat cctcatgaatcggataatactatgttatttcctatgcttgtcttggtactatttgctttg tttattggagccataggaattcctttcaatcaaattcctttcaatcaaaaaggaatggag gtggatatattgtcaaaactgttaactccgtctttaaaccttttgcatcaaaattcaaag aattctgtggattggtatgaatttgtaacaaatgcaattttttcagtcagtatagctttt ttcggaatatttatagcgtcctctttatataagcctgtttattcatcgttacaaaatttg aatttcttgaattcgctcgctaaaaaaggttctaagagaattctttgggacaaaataata aacgtcatatataactggtcctataatcgaggttacatagatgctttttatgaaatatct tttattggaggtataagaaaattagctgaattaattcatttttttgataaacgaataatt gatggaattaccaatggagttggtgttaccagtttctttgtaggagagggtataaaatat gtaggaagcggtcgcatctcttcttatctcttattatatttattttatgcattaatcttt ttattaatttattctttttacaatttgtaa

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