Ricinus communis (castor bean): 8258914
Help
Entry
8258914 CDS
T01087
Name
(RefSeq) protein DETOXIFICATION 54
KO
K03327
MATE family, multidrug and toxin extrusion protein
Organism
rcu
Ricinus communis (castor bean)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rcu00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
rcu02000
]
8258914
Transporters [BR:
rcu02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
8258914
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8258914
NCBI-ProteinID:
XP_048227456
LinkDB
All DBs
Position
2:9605279..9609244
Genome browser
AA seq
501 aa
AA seq
DB search
MAEKDTDFPSQKLPSASQVLEELKELWGMALPITAAHLMAFFRAVVSVMFLGRLGSLELA
GGALSIGFTNITGYSVIVGLASGLEPVCSQAYGCKNWDLLSLSLQRMILILFVAIIPISL
LWINLESIMNFMGQDPNITSMAATYCIYSLPDLLTYTLLQPLRVFLRSQRVTQPIMYCSL
LAVIFHVPLNYVLVIVMGLGVPGVAMASVVTNMNMVALMVGYVWWVSGRWEMRWTVDIGG
VCGGVGELLKLAVPSCLGICLEWWWYEIVIVMAGYLPNPTLAVAATGILIQTTSMMYTVP
MALAGCVSARVGNELGAGKPYKAKLAAMVALGCAFVIGIINVTWTAILRERWAGLFIKDN
LVKGLVASVLPIIGLCELGNCPQTTGCGILRGTARPAIGARINLGSFYFVGTPVAVGLAF
GLNVGFAGLWFGLLSAQVACAVSILYVVLIRTDWEHEALKSKKLTSMEMTGISNGIGDEE
HHEEEEDESKRLLVNGNGNMV
NT seq
1506 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgagaaagacacagatttcccttctcaaaagctaccctctgcttctcaggtcctt
gaagagctaaaagagctatggggtatggctttaccaataacagcagcacatttaatggcc
ttttttagagcagtggtctcagttatgttcttgggcagactgggtagtctagagttagct
ggtggtgcactatctattgggttcacaaacatcactggttactcagttattgtgggctta
gcctctggacttgagccagtgtgtagtcaagcttatggttgcaagaactgggaccttctc
tcactctccctccaaagaatgatcttaatcctcttcgtagcaatcatacccataagtctt
ttatggattaatcttgaatcaatcatgaattttatgggccaagatccaaatattacatca
atggcagctacttactgtatttactccttacctgatcttttgacatacactttgttacaa
cctttaagggtattcttaagatcacaaagggtgacccaacctataatgtattgttcattg
ttggctgttatatttcatgtgccattgaactatgttcttgtgattgtaatggggttagga
gtcccaggagtggcaatggcatcagtggtgactaacatgaatatggtggctttgatggta
gggtatgtatggtgggtaagtggacggtgggagatgagatggacggttgatattggaggg
gtatgtggtggggttggagaattgttgaagttggcagtgcctagttgtttagggatctgc
ttggagtggtggtggtatgagatagtgatagtgatggcagggtacttgcctaatccaaca
ctggctgtggccgccactgggatactgatccaaaccactagcatgatgtacactgtacct
atggcccttgctggctgtgtctctgctcgggtaggcaatgagcttggtgctggtaagcct
tacaaagccaagctagcagccatggttgcattaggttgtgcctttgtcatcggtatcatc
aatgttacatggactgccattcttagagaaagatgggctggtttgttcattaaggataat
cttgttaaaggactagttgcatctgttttgcctataataggactatgtgagcttggtaat
tgcccgcaaacaactggctgcggaatcctacgtggcacagcgcggcctgcgattggggcc
cgtatcaatttgggctcgttttactttgtgggtaccccggtcgcggtgggcctggccttt
gggctgaatgttgggtttgctgggctgtggttcggcctcctttcagctcaagtagcttgt
gctgtgtcaattctgtatgttgtgttgatccgtacggattgggaacatgaagcattgaag
tctaagaaactcaccagcatggaaatgactggaatctccaatggcattggagatgaagaa
catcatgaagaagaagaagatgaaagtaaaaggttgttagttaatggaaatggtaacatg
gtatag
DBGET
integrated database retrieval system