Ricinus communis (castor bean): 8262063
Help
Entry
8262063 CDS
T01087
Name
(RefSeq) callose synthase 12
KO
K11000
callose synthase [EC:2.4.1.-]
Organism
rcu
Ricinus communis (castor bean)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rcu00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
rcu01003
]
8262063
Glycosyltransferases [BR:
rcu01003
]
Polysaccharide
Structural polysaccharide
8262063
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glucan_synthase
FKS1_dom1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8262063
NCBI-ProteinID:
XP_002517915
UniProt:
B9RVZ6
LinkDB
All DBs
Position
7:1021952..1029519
Genome browser
AA seq
1767 aa
AA seq
DB search
MSTLRHRTRPGPNRPEQPPEEEAYNIIPVHNLLADHPSLRYPEVRAAAAALRTVGNLRKP
PYAQWHPSMDLLDWLALFFGFQNDNVRNQREHLVLHLANAQMRLTPPPDNIDTLDSTVLR
RFRRKLLKNYTNWCSYLNKKSNIWISDRSNSDQRRELLYISLYLLIWGESANLRFMPECI
CYIFHNMAMELNKILEDYIDENTGQPVMPSISGENAFLNCVVKPIYETIKAEVESSRNGT
APHSAWRNYDDLNEYFWTKRCFEKLKWPIDIGSNFFVISSRQKHVGKTGFVEQRSFWNLF
RSFDRLWVMLILFLQAAIIVAWEQKEYPWQALEEREVQVRVLTVFFTWSGLRFLQSLLDA
GMQYSLVSRETMGLGVRMVLKTVVAAGWIIVFGVLYGRIWSQRDRDRGWSTEANRRVVNF
LEACFVFVLPELLAVALFIIPWIRNFLENTNWRIFYLLSWWFQSRSFVGRGLREGLVDNI
KYTLFWVVVLATKFAFSYFLQIKPMIKPSIVLLDFKDVKYEWHEFFANSNRFAVGLLWLP
VVFIYLMDLQIWYAIYSSFVGAAVGLFAHLGEIRNIQQLRLRFQFFASAIQFNLMPEEQL
LNARGTLKSKFKDAIHRLKLRYGLGRPYKKLESNQVEANKFSLIWNEIIMTFREEDIISD
RELELLELPQNSWNVRVVRWPCFLLCNELLLALSQAKELVDAPDKWLWYKICKNEYRRCA
VIEAYDSVKHLLLEILKVNTEEHSIITVLFQEIDHSLQIEKFTKTFNMISLPHFHTRLIK
LAELLNKPKKDIGQVVNTLQALYEIAVRDFFKEKRTTEQLREDGLAPRDPAAMAGLLFQN
AVELPDASNETFYRQVRRLHTILISRDSMHNIPKNLEARRRIAFFSNSLFMNMPHAPQVE
KMMAFSVLTPYYNEEVLYSREQLRTENEDGISILYYLQTIYDDEWKNFIERIRREGMVKD
HELWTERLRDLRLWASYRGQTLARTVRGMMYYYRALKMLAFLDSASEMDIRDGSRELGSM
RRDGGLDSFKSERSPPSKSLSRNSSSVSLLFKGHEYGTALMKYTYVVACQIYGSQKAKKD
PRAEEILYLMKSNEALRVAYVDEVNTGRDETEYYSVLVKYDQQSEREVEIYRVKLPGPLK
LGEGKPENQNHAFIFTRGDAVQTIDMNQDNYFEEALKMRNLLEEYRLYYGIRKPTILGVR
EHIFTGSVSSLAWFMSAQETSFVTLGQRVLANPLKVRMHYGHPDVFDRFWFLTRGGISKA
SRVINISEDIFAGFNCTLRGGNVTHHEYIQVGKGRDVGLNQVSMFEAKVASGNGEQILSR
DVYRLGHRLDFFRMLSFFYTTVGFYFNTMMVILTVYAFLWGRLYFALSGVEASAMANNNS
NNKALGAILNQQFIIQLGLFTALPMIVENSLEHGFLQAIWDFLTMQLQLSSVFYTFSMGT
KTHFFGRTILHGGAKYRATGRGFVVEHKSFAENYRLYARSHFVKAIELGLILTVYASHST
VAKSTFVYIALTITSWFLVVSWIMAPFVFNPSGFDWLKTVYDFDDFMNWIWYKGGVFDKA
EQSWERWWHEEQDHLRTTGLWGKLLEIVLDLRFFFFQYGIVYQLGIADNSTSIAVYLLSW
IYVVVAFGLYWIIAYARDKYSAREHIYYRLVQFLVIVLTIVVIVALLEFTAFRFVDLFTS
LLAFVPTGWGMLLIAQVLRPFLQSTSIWGAVVSVARLYDIMLGVIVMAPVAFLSWMPGFQ
AMQTRILFNEAFSRGLRIFQIITGKKS
NT seq
5304 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaactctacgccaccgcacacgtccaggccccaaccggccagaacagccgccggaa
gaggaggcatacaacataatccctgtccacaatctcttagccgaccacccgtccctccgt
tatccggaagtacgcgccgccgcagcagctctccgcaccgtcggaaaccttcggaagcca
ccttatgcacaatggcatccttcaatggatcttttagactggttagctttgttctttggt
tttcaaaacgacaacgttcgtaaccaaagagaacatttagtacttcacctagcaaacgct
cagatgcgtttaacaccacctcctgataacatcgatacactggactccaccgttttgcgt
agatttcggagaaagttactaaaaaattacaccaattggtgttcctatcttaacaagaaa
tccaacatctggatctctgaccggtcaaacagtgatcagcggcgtgagttgttgtatatt
tcgctttatttattaatttggggagagtcagcgaatttaaggtttatgcctgaatgtatt
tgctatatatttcataatatggctatggaattgaacaagatattggaagattatattgat
gagaatacaggtcagcctgtgatgccttcaatttctggtgagaatgcgtttctgaattgt
gttgttaagcccatttatgagaccattaaagctgaagttgagagtagtaggaatggaact
gcaccgcatagtgcctggagaaattatgatgatttgaatgagtacttttggactaaaaga
tgttttgagaagttgaagtggcctattgatattgggagtaacttttttgtgatttctagc
aggcaaaagcatgttgggaagacagggtttgttgaacagagatcattttggaatttgttt
aggagttttgacaggctatgggttatgttgatattatttttacaagcggccattattgtt
gcttgggaacagaaggagtatccatggcaggcattggaagagagggaagttcaggttcgg
gttttgactgttttctttacttggagtgggttaaggtttttgcagtctttgcttgatgca
ggaatgcaatatagtttagtttccagggagactatgggactcggggtcagaatggtgcta
aaaactgttgttgctgctgggtggattattgtgtttggggttctttatgggaggatttgg
agtcaaagggatcgtgataggggttggtctactgaggctaataggagggtagtgaatttt
cttgaggcatgttttgtgtttgtgttgcctgagttgttggctgttgctctctttattatc
ccatggattaggaattttcttgagaatacaaattggaggattttttacttattgtcgtgg
tggtttcagagtaggagttttgtgggtcgtgggttgagggaggggcttgttgataatatc
aagtatactttgttctgggttgtggttttagctacaaaatttgctttcagttactttctg
cagattaaaccgatgattaagccgtcgatagtgttgctggactttaaggatgtaaaatat
gaatggcatgagttttttgcaaacagcaacaggtttgcagtagggttgctgtggcttcct
gtggtgttcatttacttgatggacttgcagatatggtatgccatttattcctcttttgtg
ggtgcagcagtgggattatttgcccatttgggtgaaatccgaaacatccaacaattgaga
ttgagatttcagttctttgcaagtgcaattcagtttaatctcatgccagaagaacagctg
ttaaatgcaagagggactttgaagagcaagttcaaagatgcaattcatcggttgaaattg
aggtatgggcttggccgaccatataagaagctggagtccaaccaggttgaggcaaacaag
ttctctttgatctggaatgaaattataatgacttttagagaagaggatattatctctgac
cgggagcttgagttgttggaactaccgcaaaattcttggaatgtgagagttgttcgctgg
ccatgttttctactctgcaatgagctgctacttgctcttagccaggcgaaagagttggta
gatgctcctgacaagtggctctggtacaagatatgcaagaatgagtacaggcgctgtgct
gtgatagaagcctatgacagcgtcaagcacttgctgcttgagatccttaaggtcaacact
gaagagcactcaattatcaccgttttgtttcaggaaattgatcactcactgcagattgag
aagtttaccaagactttcaacatgatttctctgcctcattttcatacaaggttgattaaa
cttgctgagctgttgaataaacctaagaaagatattggtcaggtggtgaacaccttacag
gctctgtatgagattgctgttcgggatttttttaaagagaagaggaccacagaacaatta
agggaggatggtttggctcctcgtgatcctgctgccatggctggtctgctttttcagaat
gcagttgaattacctgatgccagtaatgaaaccttctatcggcaggttcggcgtttgcac
acgattctcatctctagggattcaatgcataatattcctaaaaatctggaggccagacgt
agaattgcattttttagtaattccctatttatgaacatgccccatgctccccaagttgag
aaaatgatggcttttagtgtcctgaccccttactacaatgaagaagtgctgtacagcaga
gagcaacttcgaacagagaatgaagatgggatttccattttatactatttgcaaacaatt
tatgatgatgaatggaagaactttatagaaaggatacgcagagaaggaatggtgaaggat
catgaattgtggacagaaaggttgagagatcttaggctctgggcatcttacagaggccag
acattggcccgtactgtaaggggaatgatgtactattaccgtgctctcaagatgctggct
tttcttgattctgcctcagagatggacatcagggatggttcgcgtgagcttggttcaatg
aggcgagatggtggtttggatagcttcaaatctgaaaggtctcctccttccaagagttta
agtagaaatagtagttcagtgagtttgttgtttaaaggccatgaatatggtactgctttg
atgaaatacacttatgtggttgcttgccagatatatgggtctcaaaaggcaaagaaggat
ccccgtgctgaggagattctgtatttgatgaaaagtaatgaggcccttcgagttgcttat
gtcgatgaggtgaacacaggaagagatgagacggaatattactctgtgcttgtaaagtat
gatcagcagtcggagagggaagttgagatctatagggtgaagttgccaggtcctttgaaa
cttggagagggtaagccagagaatcaaaaccacgctttcatctttactcgtggtgatgca
gtgcagactattgatatgaaccaggacaattactttgaagaagcactcaaaatgagaaac
cttttggaagaatacaggctctattatggaattcggaagccgactatcttgggagtcagg
gaacacatatttactggttctgtctcatcactggcatggtttatgtcggcccaggaaaca
agttttgtcaccttgggacagcgtgttttggcaaatcctctgaaagttagaatgcattat
ggccatccagatgtctttgacaggttttggttcttaactcgtggcggcatcagcaaggct
tccagggtgattaacattagtgaagatatttttgctggctttaactgcactttgcgaggg
ggcaatgtcactcaccatgaatacatccaagttggcaagggaagggatgttggattgaat
caagtttccatgtttgaagcaaaggttgccagtggaaatggcgagcagattcttagcaga
gatgtctacagattgggccataggctggatttctttcggatgttatcattcttttatacc
actgttggattctattttaatacaatgatggtcattctgacagtctatgcatttctatgg
ggccgtctttattttgctcttagtggagttgaggcttctgccatggctaataacaacagt
aacaataaggcacttggtgctattctgaatcagcagttcattatccagctaggcctcttc
actgctcttccaatgatagtagagaattctcttgagcatgggttcctccaagctatctgg
gatttcttgacaatgcaacttcagctctcatctgttttttatactttctccatgggaacc
aagactcacttctttggtcgaactatccttcatggtggtgcaaagtatcgggcaactggg
cgtggctttgttgtggagcacaagagttttgcagagaattataggctttatgctcgtagc
cattttgttaaggcaattgagcttgggctgatacttacggtttatgcctcacacagcact
gtggctaagtctacatttgtttacatagctttgacaataactagttggttcctggttgtg
tcgtggataatggctccatttgttttcaatccatctggctttgattggttgaaaactgtt
tatgactttgatgattttatgaactggatttggtacaaaggtggtgtgtttgataaagca
gagcagagctgggaaagatggtggcatgaggagcaagatcatttgcggacaactgggctt
tggggaaagttactggagatagttttggaccttcgcttcttctttttccaatatgggatt
gtctaccagctaggaattgctgataatagtactagcattgctgtttacttgctgtcttgg
atttatgttgttgttgctttcggtttatattggataatagcatatgctagggacaagtac
tcggccagagaacacatctattatcgccttgtccagtttcttgttattgtactgacaata
gttgttatagtagccttgcttgagttcacggcttttagatttgtggatttattcaccagt
ttgttggcttttgtccccactggatggggcatgttattgattgcccaagtactccgcccc
tttctgcagtccacttcgatttggggcgcagtggtgtctgtggctcggctctatgacatc
atgttaggagtgatagttatggctcctgtggcatttctatcatggatgcctgggttccaa
gcaatgcagacgaggattctattcaatgaagcattcagtagggggctcagaatctttcag
attattacgggaaaaaagtcctag
DBGET
integrated database retrieval system