Ricinus communis (castor bean): 8266556
Help
Entry
8266556 CDS
T01087
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21065
Organism
rcu
Ricinus communis (castor bean)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
DYW_deaminase
PPR
PPR_1
PPR_3
E_motif
PPR_long
TPR_24
Eplus_motif
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8266556
NCBI-ProteinID:
XP_015582012
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(20238464..20241050)
Genome browser
AA seq
613 aa
AA seq
DB search
MHSTPPTDQQLVLHSSQNPITYFTAPKPASKENPIPYIVKKCIALLQICASSKYKLQQIH
AFSIRHGVLPNNPDMGKHLIYSIVSVSAPMTYAHNIFTLIQNPNIFTWNTMIRGHAESEN
PKPAIELYHRLHFNSIEPDTHTYPFLLKAVSKMVNVRVGEKIHSISIRNGFESLVFVQNS
LMHMYAACGQYESAHKLFEFMLDRDLVAWNTVISGFALNGKPNEALKLYMEMGLEGVEPD
GFTLVSLLSACAELGALALGRRIHAYMVKVGLDENLHANNSLIDLYAKCGRIRDAQQVFD
EMELRNVVSWTSLIVGLAVNGFGMEAIEHFKEMEKQGLVPSEITFVGVLYACSHCGMVNE
GFNYFKRMKEEYNIMPRMEHYGCMVDLFGRAGLVIDAYKYIQNMPLQANAVIWRTLLGAC
TIHGHLALGEIARAQLLLLEPKHCGDYVLLSNLYASEQRWSDVHNLRRTMLHKGIRKTPG
HSLVELGNLVHEFVMDDRTHPQSEAIYRMLVEISKKLKLEGYVPCTSNVLADIEDEEKEN
ALIYHSEKIAVAYMLINTPPGTPIRVVKNLRICADCHLAIKLISKIYNREIVVRDPSRFH
HFRDGSCSCKDYW
NT seq
1842 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcactcgactcctccgaccgaccaacaattggttctccactcttcccaaaaccctata
acctacttcacggccccgaaaccagcctctaaagaaaacccgattccttacattgtcaaa
aaatgcattgcccttttgcaaatttgtgcctcgtccaaatacaaactacaacagatccat
gctttttccatcaggcatggtgtcctacccaacaacccagacatgggcaagcaccttata
tattctattgtgtcagtttcagcccccatgacttatgctcacaatatctttaccctgatc
caaaacccaaacattttcacttggaatactatgattagaggccacgctgagagtgaaaat
ccaaaaccagctattgagttgtatcaccgcttgcatttcaattccattgaacccgataca
cacacttaccctttccttttaaaggctgtctctaaaatggtgaatgttagagtaggtgaa
aagatacattccattagtataagaaatgggtttgagtcactagtgtttgttcaaaacagt
ttgatgcatatgtatgctgcttgtgggcaatacgagagtgcacacaagttgtttgagttt
atgcttgatagagatcttgtagcatggaatacagtgattagtgggtttgctcttaatggg
aaacccaatgaagctttaaaactttatatggaaatgggtttagagggtgttgagccagat
gggttcactctggttagcttgctgtctgcttgtgctgagctcggtgctttggccttgggt
aggaggattcatgcttatatggttaaagttgggttggatgagaatttacatgccaataat
tcccttatagacctttatgcaaagtgtggacgcattagagatgcacagcaggtatttgat
gagatggagttgagaaatgtggtttcttggacttctttaattgttggattggctgttaat
gggtttggaatggaagcaattgagcattttaaggagatggagaaacaaggactggtgcca
agtgagattacttttgtcggtgtcttatatgcttgtagtcattgtgggatggtaaatgag
gggttcaattacttcaaaaggatgaaagaagaatataatataatgcctagaatggaacat
tatggatgtatggttgatttgtttggtagagctggcttggtgatcgatgcatacaaatat
attcagaatatgccattgcaggctaatgctgtcatttggaggaccttgctaggggcatgc
acgatacacgggcatttggctttaggagagattgcaagagcccaactattgctgttagag
cctaaacattgtggagactatgtgctactctccaatctttatgcatcggagcaacgctgg
tcagatgtgcataatctgagaaggaccatgcttcataaaggaataagaaaaactccaggg
catagcctagtcgagcttggaaatcttgttcatgaatttgttatggacgataggactcac
cctcaaagcgaggcaatatacaggatgttggtagagatctcaaagaagctgaaattggaa
ggttatgtgccttgcacatcaaacgtgcttgcagatatagaggatgaagaaaaggaaaat
gccttgatttatcacagcgagaagattgcagtcgcgtatatgcttatcaatacacctcct
ggaaccccaatcagggttgtcaagaatttgagaatatgtgccgattgtcatttggcaatc
aaactcatatcaaagatttacaatagagaaattgttgtgagagatcctagtcgatttcat
cattttagagatggttcttgttcatgtaaagattattggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
