Ricinus communis (castor bean): 8272545
Help
Entry
8272545 CDS
T01087
Name
(RefSeq) beta-galactosidase
Organism
rcu
Ricinus communis (castor bean)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_35
BetaGal_gal-bd
Gal_Lectin
GHD
BetaGal_ABD2
Glyco_hydro_42
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8272545
NCBI-ProteinID:
XP_002514108
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(28375853..28381846)
Genome browser
AA seq
843 aa
AA seq
DB search
MKNMLKGSNTVFLFLFLLFLLSSSWVCSILATVSYDHRAITINGQRRILISGSIHYPRST
PEMWPDLIQKAKDGGLDVIQTYVFWNGHEPSPGNYYFEDRYDLVKFIKVVQAAGLYVHLR
IGPYICAEWNFGGFPVWLKYVPGIEFRTDNGPFKAAMQKFTEKIVSMMKSEKLFESQGGP
IILSQIENEFGPVEWEIGEPGKAYTKWAADMAVKLGTGVPWVMCKQDDAPDPVINTCNGF
YCENFKPNKDYKPKLWTENWTGWYTEFGGAVPYRPAEDLVFSVARFIQNGGSFMNYYMYH
GGTNFGRTSAGLFIATSYDYDAPLDEYGLTRDPKWGHLRDLHKAIKLCEPALVSVDPTVK
SLGSNQEAHVFQSKSSCAAFLANYDTKYSVKLTFGNGQYDLPPWSISILPDCKTAVFNTA
RLGAQSSQMKMTPVGGALSWQSYIEEAATGYTDDTTTLEGLWEQINVTRDASDYLWYMTN
VNIDSDEGFLKNGDSPVLTIFSAGHSLHVFINGQLAGTVYGSLENPKLTFSQNVKLTAGN
NKISLLSVAVGLPNVGVHFEKWNAGILGPVTLKGLNEGTRDLSGWKWSYKIGLKGEALSL
HTVTGSSSVEWVEGSLSAKKQPLTWYKATFDAPEGNDPVALDMSSMGKGQIWVNGQSIGR
HWPAYTARGSCSACNYAGTYDDKKCRSNCGEPSQRWYHVPRSWLNPSGNLLVVFEEWGGE
PSGISLVKRTTGSVCADIFEGQPALKNWQMIALGRLDHLQPKAHLWCPPGQKISKIKFAS
YGSPQGTCGSFKAGSCHAHKSYDAFEKKCIGKQSCSVTVAAEVFGGDPCPDSSKKLSVEA
VCT
NT seq
2532 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaatatgttaaagggcagcaacactgtgttcttgttcttgttcttgctgtttttg
ttatcctcttcatgggtttgttctattttagctactgtgtcttatgaccatagagctatt
acaatcaatggccaaagaaggattcttatttctggttccattcactatccaagaagcact
cctgagatgtggcctgatcttattcaaaaggctaaagatggaggcttggatgttatacaa
acttatgtgttttggaatggacatgagccttctcctggaaattactatttcgaagataga
tatgatctagtcaagttcatcaaggtggtacaagcagcaggactttatgttcatctccgg
attggaccctatatttgcgctgaatggaacttcgggggatttcctgtgtggctaaaatat
gtaccaggcattgaatttagaacagacaatggacctttcaaggcggcaatgcaaaagttc
actgagaaaattgtcagcatgatgaagtcagaaaagttgtttgaatctcaaggaggtcca
ataattctatctcagatagaaaatgaatttggaccagttgagtgggagattggtgaacca
gggaaagcttatacaaaatgggcagctgatatggcagttaaacttggcactggggtccca
tgggtcatgtgcaagcaagacgatgcccctgatcctgttattaacacctgcaatggtttc
tactgcgaaaacttcaaaccaaacaaggattacaaacccaaactgtggacagaaaactgg
actggctggtacacggaatttggtggtgcagttccttataggccagcagaagatttggta
ttttcggttgcaaggtttatacagaatggtggttcgttcatgaactattatatgtaccat
ggaggaactaattttggcagaacttctgccggtctctttattgccactagctatgattat
gatgctccacttgatgaatatggactgacaagggatccaaaatggggacacttgagagat
ttgcataaagccatcaagctatgtgaacctgctttagtctctgtagatcccacagtaaaa
tcacttggaagtaatcaagaggctcatgtattccagtcaaagtcatcatgtgcagcattc
ttggcaaactatgatacaaagtactctgtaaaattgacctttggaaatgggcaatacgat
ttgccaccttggtctatcagcattctccctgattgtaagactgcagtttttaacaccgca
aggcttggtgcacaaagctcacagatgaagatgactcctgttggcggcgcactttcttgg
caatcatacattgaagaagctgcaactggttatacggatgacacaactactctggaagga
ttgtgggagcaaataaatgttacaagggatgcttcagactatttgtggtatatgacaaat
gtcaatatagattctgatgaaggatttttgaaaaatggagatagtcctgttctcacaatt
ttttcagctggccattctttgcatgttttcatcaatggtcaactagcaggaactgtgtat
ggatcattagagaatcctaaattaacatttagccagaatgtgaagttgacagctggtaat
aacaagatttctttgttaagcgttgctgtgggtctcccgaatgtcggtgtccacttcgaa
aaatggaatgccggaattctgggcccagtcacattgaagggtttgaatgagggaacaaga
gacctgtcaggatggaaatggtcttacaagattggtctgaaaggtgaagctctaagcctt
catactgtcactgggagttcatcagttgaatgggtagaaggatcactatcagctaaaaaa
caaccactaacgtggtacaaggctacttttgatgcaccagaaggtaatgacccagtagct
ttagatatgagtagcatgggaaaaggtcagatatgggtaaatggtcagagtataggacgc
cactggcccgcatatacagcacgtggtagttgcagtgcttgcaactatgctggaacttat
gatgataagaaatgtcgaagtaattgtggagaaccctcccagagatggtaccatgttcca
cgctcatggctgaacccgagcgggaatctattagttgtgtttgaagaatggggtggtgaa
ccaagtggaatttctttggttaaaaggactacaggaagtgtttgtgctgatatatttgaa
ggacagccagcactgaaaaactggcagatgatagctttgggcagacttgatcacctccaa
cccaaagctcatttgtggtgtcctcctgggcagaaaatctctaaaattaagtttgctagc
tacggatcacctcaaggaacatgtggaagcttcaaagcgggaagctgtcatgcccacaag
tcatatgatgcttttgaaaagaaatgtatcggaaaacagtcttgttctgtaactgtggct
gctgaggtttttggaggggatccttgtcctgatagctcaaaaaagctttcagttgaggct
gtctgcacttga
DBGET
integrated database retrieval system