Ricinus communis (castor bean): 8285854
Help
Entry
8285854 CDS
T01087
Name
(RefSeq) piezo-type mechanosensitive ion channel homolog isoform X1
KO
K22128
piezo-type mechanosensitive ion channel component 1/2
Organism
rcu
Ricinus communis (castor bean)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rcu00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
rcu04131
]
8285854
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
rcu04040
]
8285854
Membrane trafficking [BR:
rcu04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Others
Others
8285854
Ion channels [BR:
rcu04040
]
Other channels
Mechanosensitive channel (Piezo)
8285854
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Piezo_cap
Piezo_THU9_anchor
THU_Piezo1
Mmc1_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8285854
NCBI-ProteinID:
XP_015578213
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(6517756..6533236)
Genome browser
AA seq
2482 aa
AA seq
DB search
MGNFLVGFVLPLLLLTAALINWSLISLVDLIAFLLIHYAAPKIGFRFRRRFLLLWPVILF
SFLVIFAQVAYLIIWAIKGNKWSGANVWWAHLIGFMVVESWRSPYVIYFLVVQLLALLVA
LIDIHGNRFGLFPWQDSCWVHFLNILERIGSHLRVGSCLLLPAIQLCVGISHPTWLSLPF
FIGSCAGLVDWSLTSNFLGLFRWWRPLQLYASFNIILLYVYQLPVEVPNLFHWIADFIGL
SKISGKTEWPEICSGASLVLFYIMLSFVKCDLEEMDFIMSMRESNLTEQLLPLRHSFFIR
ESRSGVRHTNVLLRRAVFRTFSINFFTYGFPVSLFALSYWSFHFSSICAFGLLAYVGYIV
YAFPSVFRMHRLNGLLLVFILFWAVSTYIFNVAFSLLTRKLGKDMQIWEMVGLWHYPIPG
FFLLAQFFLGILVALGNLVNNSVFLYVSDESNRPSNENSSAEVEEDSKVLIVATIAWGLR
KCSRAIMLALIFLIAMKPGFIHATYMIFFLIYLLSHDISRKIRQSMILLCEAHFALLYIL
QIDLISHTLEQTGSSTMEVLLQLGLLKQDSSWDFLEIALLACFCAIHNHGFEMLFSFSAI
VQHTPSPPVGFSILKAGLNKSVLLSVYASPTAKYSHDHHSYESRIAAFLSAVGQKFLSMY
RSCGTYIAFLTILLAVYLVTPNYISFGYIFLLLVWIIGRQLVEKTKRRLWFPLKAYAIMV
FVSIYSLSSFPHFEMWLSRFIDLYFYLGYNSEASLLQNVWESLAILIVMQLYSYERRQSK
CNRSNDPDPLDSGVFGFIKRFLIWHSQKILFIALFYASLSPVSAFGFVYLLVLVICSTLP
KTSRIPSKSSLLYTGLLVTSEYLFQMWGRQAGMFPGQKHSDLSLFLGFRAYAPGFWGLES
GLRGKVLVIAACTLQYNVFRWLGKMPNTFPDKGKWEEPCPLFVSDENAFANGSIINDENK
APSEYNVPSVKKETVTATSTFSFTSSFTQPPHTFSNKTGSSVGSGTRIFSFGYIWGSTKE
SHKWNRKRILALRKERFETQKALLKIYLKFWIENMFNLFGLEINMIALLLASFTLLNAIA
MLYIALLAACILVSRHIIRKLWPIVVTLFASILILEYFAIWKSIFPLNQHAPSETDIYCH
NCWNSSTLYFQYCKNCWLGLVVDDSRMLANYFVVFLLACFKLRADRLSSFSASSTYRQMI
SQRKNTFVWKDLSFETKSMWTFLDYMRLYCYVHLLDLVLCLILITGTLEYDILHLGYLAF
ALVFFRMRLVILKKKNKIFRFLRIYNFALIVLSLAYQSPFVGVFSSGKCETISYIYEMIG
FYKYEYGFRITARSALVEIIIFMLVSLQSYMFSSNEFDYVSRYLEAEQIGAIVREQEKKA
AWKTAQLQHIRESEEKKRQRNLQVEKMKSEMLNIQIQLHTINSTTKCNDTSPDREGLRKR
RSTSLTSKRGSASPIKDDGTLKEQEQIINQDSEFPFDMNESPDSLNIESLEREMSPKYVS
ESPICEIRQESTDSIHFDSGKIGRGQSKENALKSAVQLIGDGVSQVQSIGNQAVNNLVSF
LNIPEDSDTSEHSLSENGVYDEMESQKNKHVNLDRASSLQSDMSSDATSLQIGRIFRHVW
SQMQSNTDIVCYCCFIIVFLWNFSLLSMVYLVALFLYALCVNTGPNYIFWIVMLIYTEVY
ILLEYLYQIIIQHCGLTIDPLLLRDLGFPAHKISSSFVISSLPLFLVYLFTLLQSSITAK
DGEWTPSMENKFCRRSSLHGEEVHLNYSWSKKAEELQHLMTSMVKLIIRSIFRYWESLTQ
GAESPPYFIQVSMDVHSWPEDGIQPERIESGINQLLKIVHDERCEEKSLNHCPFASRIHV
QSIERSEENPNMAVVVFEVVYASPLTSCASAEWYKSLTPAADVAKEILKAKDDGFVGEIG
FPYPIVSVIGGGKREIDLYAYIFGADLSVFFLVAMFYQSVIKHRSEFLDVYQLEDQFPKE
FVFILMVIFFLIVLDRIIYLCSFATGKVIFYIFNLILFTYSVTVYAWQLEPSQEHATGLA
LRAIFLAKAVSLALQAIQIRYGIPHKSTLYRQFLTSQVSRINYLGYRLYRALPFLYELRC
VLDWSCTTTSLTMYDWLKLEDINASLYLVKCDNVLNRASHRPGERQTKWTKCCNGICLFF
ILICVIWAPMLIYSSGNPTNMANPIKDASVQLDIKTVGGRLTLYQTTLCEKLPWDNVNSD
VDLDPHHFLDIYNKNDIQLICCQADASMLWLVPDVVQKRFIQSLDWDLDMDILFIWVLTR
DRPKGKETVKYEKPVELMDLPKRSDIQKVLNGSTNSFRMHNLYPRYLRVTGSGDVRPLEQ
EAGAVSADLIMNSADFNWWSFHDINSSDVRGCGGLAGPMAIIMSEETPPQGILGDTISKF
SIWGLYITFVLAVGRFIRLQCSDLRMRIPYENLPSCDRLIAICEDIYAARAEGELGVEEV
LYWTLVKIYRSPHMLLEYTKPD
NT seq
7449 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtaattttcttgttggatttgttttgccgttgctcctcttaacagctgctttgatt
aattggagtttgatttcacttgttgatttaatagctttcctcctaattcattatgctgca
ccgaagataggttttcgttttcggaggagatttttgttattatggcctgttattttgttt
tcctttcttgtaatttttgctcaagttgcatatcttattatatgggcaatcaagggaaac
aaatggagtggagcaaatgtttggtgggcgcatctaattggttttatggtagttgagtcc
tggagatcaccatatgtgatctattttttggttgtgcaactattagcacttttagttgct
ttaattgatatacatgggaacaggtttggcctcttcccatggcaagattcctgctgggtt
cacttcttaaacattcttgaacggataggttctcatcttagggttggttcctgtctgcta
ttaccggccattcagctgtgtgtgggaatcagccatcccacatggctttctctacctttc
tttatcggtagctgtgcaggtcttgtggattggtctcttacaagcaattttctagggctt
ttcaggtggtggaggcctcttcagctgtatgcaagctttaacataatcttgctttatgtc
tatcagcttcctgtagaagtccccaatttatttcactggatagctgattttattggtctt
tccaaaatatctggaaagacagagtggcctgaaatttgttctggtgcttctcttgtactt
ttttacatcatgctatcctttgttaagtgtgacttggaggaaatggatttcattatgtct
atgagagaaagtaatttgacagagcaacttctccccttgagacattcgtttttcatccgt
gaatctagatccggtgtcaggcataccaacgttttattaagaagagcagtttttcgcacc
tttagtatcaactttttcacatacggtttcccggtctccttgtttgctctttcctactgg
agttttcatttttccagtatatgcgcatttgggttgcttgcatatgtaggctacattgtt
tatgccttcccttctgtattccgtatgcaccggttaaatgggctgcttcttgtcttcatt
ctcttttgggcagttagcacttatatcttcaatgtagctttttcgctcttgaccagaaag
cttgggaaggatatgcaaatatgggagatggttggattatggcattatcccattcctgga
ttctttttgcttgcacaattttttcttggcattttggttgctttgggtaatcttgtgaat
aactctgttttcctctatgtgtctgatgagagtaatcgaccttcaaatgaaaactccagt
gcagaagtggaagaagattccaaagtgttgattgtggcgacaattgcatggggactccga
aaatgttctcgggctattatgttggcacttattttcctcattgccatgaaacccggtttt
atccatgctacttacatgatatttttcttgatatatcttctgagccacgacatcagcaga
aagatacgccaatccatgattcttttatgtgaagctcacttcgcactgttgtacattctt
cagatcgatttaatttctcacactttggagcaaacaggctcttcaactatggaagttttg
ctgcagttaggtcttcttaaacaagatagttcctgggatttcttggaaatagcgttgctt
gcttgcttctgtgccattcataaccatggttttgagatgttattttcattctcagcaatt
gtgcagcacaccccgagtcctcctgttggatttagcatcttgaaagcaggtctgaacaaa
tcagtcctactgtcagtgtatgcctccccaacagccaaatatagccatgatcatcattct
tatgagagcaggatagcagcattcctcagtgcagtcgggcagaagtttctatccatgtat
cgatcatgtggaacctacattgcttttctgactattcttcttgcagtatacctggtaaca
cccaattacatatcatttgggtatatattcctgctccttgtttggataattggaaggcaa
cttgttgagaaaacaaaaaggcgtttatggttcccattaaaagcatatgcgatcatggtt
tttgtctccatctatagcttgagcagtttcccccactttgagatgtggctgtccaggttc
attgatctgtacttttatttgggctacaactcagaggcttcattgttgcaaaatgtttgg
gaatctctggctatcttgatagtgatgcaactttatagctatgagaggagacagagtaaa
tgtaacaggtccaacgatcctgatccattggattctggggtatttgggttcatcaagagg
tttctgatttggcacagtcagaagatcttgtttatagcattattctatgcttctttgtct
ccagttagtgcatttggttttgtatatttactcgtccttgtaatatgttcaactttaccc
aaaacttctcgaataccatccaaatcatccctgttgtatacaggacttttagtgacatcc
gagtatctattccagatgtggggtagacaagctgggatgtttcctgggcaaaagcattct
gacctttcacttttcttgggtttccgtgcatatgcgccaggtttttgggggctagaatca
ggattgaggggaaaagtgctagtaattgctgcttgcactcttcagtacaatgtcttccgt
tggttggggaagatgccaaatacttttccagataaaggaaagtgggaagagccttgtcca
ttgtttgtctcagatgaaaatgcatttgccaatggttccataatcaatgatgaaaataag
gcaccatcagaatataatgtgccttctgtaaaaaaagaaacagttacggctacaagcaca
ttctctttcacctctagttttactcaaccacctcatactttttccaataagacaggtagt
tctgtgggtagtggcaccagaatattttcatttgggtatatttggggaagcaccaaggag
agtcataagtggaataggaagaggattcttgcattgagaaaggaaagatttgaaacacaa
aaggccctcttgaaaatatatttgaagttctggatcgagaatatgttcaacctctttggc
cttgaaataaacatgattgcattgcttctggccagcttcactttgttgaacgccatcgcg
atgctatatattgcattgcttgctgcttgtattcttgttagtcgccacattatacggaag
ctgtggcctatagttgtcaccttattcgcctccattctaattttggagtactttgctatc
tggaaaagtatctttcctttgaatcaacatgccccaagtgagactgacatatattgccac
aactgctggaacagctcaactctttattttcagtattgcaagaactgttggctgggacta
gttgtggatgattcgcgcatgcttgccaactattttgtggtctttctgctggcctgtttc
aaactccgtgctgatcgattgtccagtttctcagcttcatcaacataccgccaaatgatc
tctcaacgtaaaaatacctttgtttggaaggatctctcttttgaaactaaaagcatgtgg
acttttctcgattacatgagactttactgctatgtccatctgttggatcttgtgctatgc
ttgatattgattactggaaccctggaatatgacattctgcaccttggttatcttgcattt
gctctggttttttttcggatgagacttgtaatactgaaaaagaagaacaagattttcaga
ttcttgcgcatatacaactttgctctcattgttctatctcttgcctatcaatctcctttt
gtgggtgtatttagttctgggaagtgtgagacaatcagttacatatatgagatgattgga
ttttataaatatgagtatgggtttcgaattactgcaagatctgcacttgttgaaattatc
atatttatgctggtttcactgcagtcctatatgttctcctccaacgaatttgattatgtg
tcacgatatcttgaagcagagcaaattggagccattgtgcgcgagcaagagaagaaagct
gcatggaaaactgcacagttacaacatattcgtgaatctgaggagaaaaaacgccagcgt
aacctgcaagtagaaaagatgaagtctgaaatgcttaacatacaaattcagcttcacacc
attaactcaacaactaagtgtaatgacacttcccctgacagagaaggcctaaggaaaagg
agaagtacttctcttacttctaaaaggggttctgctagccctattaaagatgatggaacc
ctcaaggaacaagagcagataattaatcaggattcagaatttccttttgatatgaatgaa
tctccagatagtttaaatatagaaagcctagaaagagaaatgtctccaaaatatgtttca
gagtctcctatttgtgagatcagacaggaatcaactgatagcatacattttgattctgga
aaaattggaaggggtcaatctaaggaaaatgctctgaaatctgcagtacagctgatagga
gatggtgtttcccaggtgcagtctattggaaatcaagcagttaataaccttgtgagcttc
ttgaacattccagaagattcagatactagtgagcactccttatctgaaaatggagtttat
gatgagatggagagccagaagaacaagcatgtaaatttggaccgtgcatcttctctccag
tctgatatgagttctgatgctacaagtctgcagattggaaggatcttccgacatgtatgg
tcccaaatgcagtccaatactgatattgtatgttattgttgtttcattattgtctttcta
tggaactttagtttgctctctatggtgtatcttgtggctctcttcttatatgctttatgt
gtaaacactggcccaaattacatcttctggattgtcatgctgatttacacagaagtgtac
attttgctggagtatctgtaccagattatcattcaacactgcgggttgacaattgatcca
ctcctacttcgtgacttgggatttcctgcacataaaatcagctcatcctttgtaatcagt
tcactgcctctgttccttgtctacttatttaccctcctgcagagctcaataacagcaaaa
gatggtgaatggacaccatctatggagaataaattttgtagaagaagttctctgcatgga
gaagaggttcatctgaactacagctggagcaaaaaggcagaggaactgcaacatttaatg
acaagtatggtaaagttgataatcagaagcatctttaggtattgggaatcattgacacag
ggggcagagtctcctccatattttatccaggtgtcaatggatgttcactcgtggccagaa
gatggaattcagccagagagaattgaatctggaataaaccaattgcttaaaattgttcat
gatgagagatgcgaagagaagagcctgaatcattgtccttttgctagtaggattcatgtc
cagagcattgaaagaagtgaagaaaacccaaacatggcggtagttgtttttgaggtggtg
tatgcctctcctttgacaagctgtgcatcagcagaatggtacaagtcactaactccagca
gctgatgtagcaaaggagattcttaaagcaaaggatgatgggtttgttggagaaattggt
tttccataccctattgtctctgtcattgggggaggtaaaagagaaattgatctgtatgcc
tatatattcggtgcagatttgagtgtgttcttcctagttgcaatgttctaccaatctgtc
attaagcatagaagtgaattcttagatgtttatcagcttgaagatcagtttccgaaagag
tttgtgtttatcttgatggttatctttttcttaattgttcttgatcgcatcatttacctc
tgttcatttgccactggaaaggttatcttttatattttcaacctcatcctctttacatat
tcagtcacagtgtatgcctggcagttggaaccttcccaagaacatgctacaggactagca
ctccgtgctatatttcttgcaaaagcagtgtctctagcactgcaggcaatacaaatccgc
tatggtattccgcataagagcacattgtatcgacagtttctgactagccaagtatcgcgt
ataaattatttaggctatagactttatcgtgctctgccatttctttatgaattacgatgt
gtgctggactggtcgtgtacaaccacatctttgactatgtatgattggctgaagctggag
gacataaatgcaagtctttaccttgtcaaatgcgataatgtcttgaatagagcttcacac
agaccaggagagagacaaacgaaatggaccaaatgttgcaatgggatatgcctgttcttc
atattgatctgtgttatctgggctcctatgttgatatacagcagtggcaacccaacaaat
atggctaaccccattaaagatgcaagtgttcagcttgacatcaagacagtgggtggaagg
ttaacattgtatcaaactacactttgcgaaaaactcccgtgggataatgtcaactctgat
gttgatctagatccccatcactttttagatatttataacaagaatgatattcagctgata
tgctgccaagcagatgcaagtatgttgtggcttgttcctgatgtggttcagaagagattt
atccagtccctggactgggatttggatatggatattctttttatttgggtactaaccaga
gataggccgaagggcaaggaaactgtgaaatatgagaaacctgttgaacttatggatctt
ccaaaacgatcagacatccagaaagttcttaatggctctacaaacagctttaggatgcat
aatctttatccaagatacttgcgtgttactggttccggtgatgtcaggcccctggagcaa
gaggctggtgcagtcagtgcggatctcattatgaatagtgcagattttaactggtggtca
tttcatgatatcaattcatcagatgtgagaggctgcgggggtttggcaggacccatggcc
atcataatgtctgaggaaaccccgccgcagggcattctaggggacacaatcagcaagttc
agcatttggggtctctatattacttttgtgcttgccgtaggacgttttatcagacttcaa
tgctcagacttaagaatgagaataccgtacgaaaatttaccttcctgtgacaggttgata
gcgatctgtgaagatatatatgctgcaagagcagaaggtgagcttggagttgaagaggtc
ctttattggacgcttgtaaagatttatagatcaccacacatgctgctcgaatacactaaa
ccagactag
DBGET
integrated database retrieval system
