Rothia dentocariosa: HMPREF0733_11446
Help
Entry
HMPREF0733_11446 CDS
T01343
Name
(GenBank) ribonuclease
Organism
rdn
Rothia dentocariosa
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
DUF6531
TEN_YD-shell
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADP40903
UniProt:
E3H5X3
LinkDB
All DBs
Position
1582530..1590002
Genome browser
AA seq
2490 aa
AA seq
DB search
MPSILFHSNTQPIEYSFTDAAALANTFDSAASKLQEYHGRIRLEGIRAAEEFRGRYANLF
VQNYKQCIDDAHRLEDACRRAAHAVRQISRNAEIEQDNRRKAREAEEEYNRKLNENNLFN
VLSGLSVSKQIKRNFLNGPAYVPSEEPNVRIDTYDLERGMCKAPEGGSSEFVSSLSRSDS
EKYADSLASSGGVSSAVPEALERYAKFLSQVVYEDMTYYFTSINTAYERYLSSCKWGVLD
ITGLLKATVEWINDNNHDAAWIDAVAYAFRIAGSNGQYVIADATLTAFLNDNGLNPGRKN
LVIPDVSIYGTMPTSGYANDPVNVATGNFIEEERDLSVGSVSLVRMYNSIAAAGAASTHE
GYTAPVGAFGPGWSSTVDTHLGFTASGVVWADVDGRQVFFARAGAGFTRAAGEAWWLHRY
TVNPADSSASQASDSENGAAHDEANGDVRAQAARAGFAAVISLAAEHSDQVVSGGEFYAV
SNNAGQYHYYTRGGAWLGSWGSEPGSAVAAIYEDASNGGSSSRVRAMVGAFGKAIRLSYD
DVSGRAVAVTGAGSRVEYAYSETGHLAEATTYALASQTTSDPVDEPESAVKGGTAAACGV
VVASRVYTHTEDGLVQTVTGTGGVREVTNVYGDPDNPGRVTQQVSEHGRVIDYTYLPGGI
TQITTGTHENTLAADSDGSDAADTAERALHPNTWVSDSKGRLVSVTSAEGSTARFIYDAF
GNRIQVTDLEGSRTVRSANTRGLVVKELASTGSMSITEYDDLDRPVHKRTYGSKDEWIRK
DAPVKVVSYEYAEEGFSRQPVAVTTDGATSRYTYTSTGQMSSVTDPTGVVTRLSYDARGN
LTGVLNAVGDMLKVEYDAQDRPVAVISPSGATMRVEYDAASRPVRVIDPVGNATVYTYTP
AGKVASITDAVGGVRRFEYNAAGELVAQVAPDGARTVREINELGYTVAETDPLGHVTKFV
HDGMGRVTEKIDPAGNVWASRYNAADTLVEHTDPTGVLTRVSRDSAAGEITHQDGVGNTA
TVGFDALGRVMSSIDPSGAVTSWAYQFLTNTTTASSGEGDRGAAHHQGTSEPVRVQDPTE
NLVRVPGAHALRTCTDAAGQVSGEVCDAAGRLLRQVSASGAVTEYSYDACGRVASVTDAD
GVMTEYRYDADSRLVAKTRAGVVVESFVYDLCGRVLERRAGTKLVGRYAYDACGRVVRCV
DAAWGTRSFSYDACGRVVKAVSGVGGTCFFDYDGAGRLLARRVATSEGFATTSYAYDAVG
NVMSVTDPFGAVTKYAYDGAHRCTEVMNPDGSRVSYAYDGAGEVASMHVAKPGERLGRLA
CAWVRDRAGRCLTVKDYLAGENLARLGAQRSAAATVATATTTVGSANASATTAAGRSSIG
VSDGAESEADVYVQTTYVSDALGRLVRVDSAPKLGDEVSDMAFFASGNRVCAAGDASAAE
VFASTGAWSLAYSYDADGNVVQRTTPYGSTVYGYSPGGRIRSTQQVPAGIGVEDSSSAGD
KPGVAEFAYDALGYLERVQVGECVSSWVRDTSGAVMGYTEEVLGEADEPSGSSSGMVQGV
RVRRNPAGKITRVEDTVKGSWCEYAYDASGRLIRAVSSDDVLVAWVYDPVGLLMREETHQ
EGALVRVRAFSYAGERVQTVRLYEALEDGGSSAAPVAGVVEDLTGLDTSSLVCTGSVQYS
YDVRGFRTGAADHTGAAVTWGWDALGSLERVERINHSSESLLGRHVATGGEDSLMGNSTV
WFATSSVRNMPVAVGSQQDRQDPVVSPLVWDTTVPDAASLVGVGVTEAVSAGSVLGGRDS
ILTGTGMGAYGFGTDIFGAASPVTWGSNTTAAAGNGLPGLPADVGLTVQGALATVGGELM
GARLYDPVTAGFLSPDPVEPVAGSGYMGASYLFASGDPVNLHDPTGLQPLSIDAIRQYRD
FFGFELTVQDKFIRYWLSAAADFDNFNREFWNDPSGWIASHPDEVDVVLTYGLAGLIALV
GGPAGWFIGGGMFLSMNTSIVVQRWETGHVDPREVTREGLISLLLDVATLGLGKIFKIAA
KPAVDYLLARWGIRWGSYEVRHLPVMRPSAASGDAVSVRAQTEMLRKNAITIKYPVLFRK
SAQEGAEKAASKESLEAVSYQGRYGNLFDRSHLNTTGYGFAAPRVAAPEAGAHTPLPYST
RGVAQESSVPLKPVEAPQVGEVPPASGAGSGAVGMQAVKPGGVADDAVVARGSAGVREPE
VQLKPVEEPKVENLPPAKGAGAAEGPTVSMRDVQTHLDEKLEGVRRKEWRGKDKKGRSRT
DYYDYEKFKEAEKNYFDDRANLQEYEARKKQAELEGREFTEAPPKDPGPRPQHALWKDAE
ERFAPDLQTAMQLDEEGLKHHRVVKSEDYQGQIPQETAEHLQQATQKIIKDGAPPHYPGA
NEGRVFNNEPWKGEGKGKILPTTDVEGNPITYTEMDFMAPKPKIGENGKVELKPNGKPDT
TRGDDRLIVGSNGSIYYSPDHYHTFILIVE
NT seq
7473 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccttctatcctttttcactctaacacccagcccattgagtacagttttactgatgct
gccgcgcttgcaaatacatttgacagcgctgcctccaaacttcaggagtaccacggaaga
attcgtttagaaggtatacgggcggccgaggaatttcgggggcggtacgcaaacctcttc
gtacagaactacaaacagtgcatagatgatgcgcatcgactagaggatgcgtgccgtcga
gcagctcatgcagtgaggcagatttcccggaatgctgaaatagaacaagataaccgtagg
aaagcccgagaagcagaagaagagtataacagaaaactcaacgaaaataatctgtttaat
gtgttatctggattgtctgtatccaagcagatcaaaaggaattttctgaatggtccagca
tatgttccttctgaggaacctaacgttagaatcgatacttatgacctagaacggggaatg
tgcaaagcgcctgaaggtggttcctccgaatttgtttcgtctctttctcgttctgatagc
gagaaatatgctgacagccttgcctcttctggcggtgtctcgtccgctgtgcctgaagct
ttggagagatatgcaaagtttctctcgcaagttgtctatgaagacatgacctattacttc
acctctattaatacagcgtatgagcggtatttaagctcatgtaagtggggtgttcttgat
attaccggtcttttaaaagcaactgttgagtggattaatgataataaccacgatgcagcc
tggattgatgctgttgcttatgcatttcggattgctggtagtaatgggcagtatgttatt
gcggatgcgacgcttacggctttcttaaacgataatggtcttaaccctgggcgtaaaaac
cttgtaattcctgacgtttcaatttatggaactatgcctacgagtggctatgcgaatgat
ccggtgaatgtggcgacggggaatttcattgaggaagagcgggatctttctgtcgggtct
gtgtcgttggtgcggatgtataacagtatcgctgctgctggggcggcgtctacgcatgag
gggtatacggctccggtaggcgcgtttgggcctgggtggtcttctacagtggatacgcat
ttggggtttacggcttctggtgtggtgtgggctgatgttgatgggcggcaggtcttcttt
gctcgtgctggggctgggtttactcgggctgctggggaggcgtggtggctgcatcgatat
acggtgaacccagcggattcgtctgcgtctcaggcttctgactctgagaatggtgctgct
catgatgaggctaacggtgatgtgcgtgcgcaggctgcgcgtgctgggtttgctgctgtg
atttctttggccgctgagcattctgaccaagtggtctctggcggtgagttttatgcggtg
tcgaataatgccgggcagtaccattactatacgcggggcggtgcctggctgggctcttgg
ggttcggaacctggttctgcggttgccgctatctatgaggatgcttccaatggtggttct
tcctctcgtgtgcgggctatggtgggtgctttcggtaaggctatccgcctctcgtatgat
gatgtttctgggcgtgcggtggctgttactggggctggatctcgggtggagtatgcctat
agtgagacgggacatctggcagaggcgacaacctacgccctagcctcgcagacaacatcc
gatcccgtggatgagcctgagagtgctgtcaagggtggtactgctgcggcttgcggcgtt
gtggttgcctcgcgcgtgtatacgcataccgaggatggtttggtgcagacggtcacgggc
actggtggcgtgcgtgaggtgactaatgtgtatggggatccggataatccggggcgtgtt
acccagcaggtcagtgagcatggtcgtgtgattgactatacgtatttgccgggtgggatt
acgcagattaccaccggtacccatgagaacactctagcggctgactctgatggctctgat
gctgcggacactgctgaacgggcgctgcatccgaatacgtgggtgtctgatagtaaaggg
cgtttagtctcggttacgtcggcagaagggtctacggctcggtttatttatgacgcgttt
gggaaccggattcaggtgaccgatcttgaagggtcgcggacggtgcggtctgcgaatact
cgtgggcttgtggtgaaggagcttgcttctacaggttcgatgagtattaccgagtatgac
gacttggaccgaccggttcacaagcggacatatggctcgaaggatgagtggattcgtaaa
gatgctccggtaaaggttgtttcatatgagtatgctgaggagggtttttcgcgtcagccg
gttgcggtgacgactgatggtgccaccagccggtatacctatacatcgacgggacagatg
tcgtcagtgacagatccgacaggggtcgtgacgcggctttcctacgatgctcgggggaat
ctgaccggagtgcttaatgctgtgggcgacatgctcaaggttgagtatgatgcccaggat
cgaccggtggcggtgatctctccatcgggggcaactatgcgtgtggagtatgacgctgcc
tcgcgtcctgttcgggtaattgacccggtggggaacgcaactgtgtatacatatactcct
gcgggtaaagtcgccagtatcacggatgcggttgggggtgtgcgccggtttgagtacaac
gccgctggggaactggttgcgcaggtggcacctgatggtgcccgtaccgtgcgtgagatc
aacgagctgggatacacggttgctgagactgatccgctggggcatgtgacgaagtttgtc
catgatggtatgggcagggttacagaaaagattgacccagccgggaatgtgtgggcgagc
aggtataacgctgctgatactttggtggagcataccgatccgacgggtgtgctcacacgg
gtaagtcgagatagtgctgccggtgagatcacgcatcaggacggtgttgggaacaccgcg
acggtgggatttgacgcgctgggccgggtgatgagcagtattgacccgtccggggcagtc
acgtcgtgggcgtatcagtttttgactaacactacgactgcctcctcgggtgaaggggat
cggggtgccgcgcatcatcagggtacttcagagcctgttcgcgtgcaggatccgaccgag
aatctggtgagggtccccggtgcccatgcgttgcggacgtgtactgatgctgctggtcag
gtttcgggtgaggtgtgtgatgctgctgggcggttactcaggcaggtgagtgcctcgggg
gctgtgacggagtattcgtatgatgcgtgtggtcgggttgcctcagtgacagatgctgat
ggggtgatgactgagtaccggtatgatgcggattcgcgtttggtggcgaagactcgtgct
ggcgtggtagtggagtcttttgtgtatgatctgtgtgggcgtgtgttggagcgtcgtgct
gggactaagctggtgggcaggtatgcctatgatgcgtgtgggcgtgtggtgcggtgtgtg
gatgctgcttggggcacccggtcgttctcctatgatgcgtgtgggcgtgtggttaaagct
gtttccggcgtgggtggaacatgcttttttgattatgacggtgcggggcgtttgctagcg
cgtcgggtagctacgtctgagggctttgcgacaacctcgtatgcctatgatgcggtaggg
aatgtgatgtcggtgacggacccattcggggcggtgaccaagtatgcgtatgatggcgcg
caccggtgcactgaagtcatgaacccagatggttcgcgggtgtcgtatgcatacgatggt
gccggcgaggtggcgagtatgcatgtggctaagccaggtgagcgcttgggtcggttggcg
tgtgcgtgggtgcgggatcgagccggtcggtgcctgacggtgaaggattatctggcgggg
gagaatctggcacggctgggcgctcaacggtctgcagctgctacggtcgctacagcaaca
accaccgttggttctgctaacgcgagtgcaacaacggctgctggtaggtcttctatcggt
gtctcggatggcgcggaatccgaagctgatgtgtatgttcagacgacctatgtctcagat
gctttgggacgtttggtgagggtggattctgccccgaaactcggggatgaggtttctgat
atggcgttctttgcatcgggtaatcgagtatgtgctgccggggatgcttctgcggctgag
gtgtttgcatctacgggtgcgtggagcctagcgtactcctatgatgctgatgggaatgtg
gttcagcgtactactccgtatggttctaccgtatatgggtattctccgggcgggcgtatt
aggtctacacagcaggtccctgccggtatcggggtagaggactcatcgagtgctggtgat
aagcctggggtggctgagtttgcttatgatgcgctggggtatttggaacgtgttcaggtt
ggggagtgtgtctcttcgtgggtgcgtgatacgtccggagccgttatggggtacactgag
gaagttctcggtgaggccgacgagcctagtggttcatcgtcgggtatggtgcagggtgtg
cgggtacgccggaatcctgcggggaagattactcgagtggaagataccgttaagggttcc
tggtgtgagtacgcctatgatgcttccggcaggttgattcgtgcggtgagctcggatgat
gtgttggtggcgtgggtgtatgatccggtcgggttgcttatgagggaagaaacccatcag
gaaggtgccctggttcgggtgcgtgcgttttcctatgcgggggagcgggtacagacggta
cgcctgtatgaggcactagaggatggtggttcttccgctgcacctgttgcgggtgtggtg
gaggatctaaccgggttagatacgtcatctttggtgtgtacggggtcggttcagtattcc
tatgatgtgcggggtttccgtacgggggcggctgatcatactggtgctgctgtgacgtgg
ggctgggatgctctgggttctttagagcgggtggagcgtatcaaccacagctccgagtct
ttgctgggcaggcatgtggctactggtggtgaggattctctgatgggtaactcgacggtg
tggtttgcgacatcgtcggttcggaatatgccggtagctgttgggagtcagcaggatagg
caggatcctgttgtctcgccgctggtgtgggatacgacagtacctgatgctgcttcgttg
gtgggtgttggtgttaccgaggcggtttcggcggggtctgtgcttggtggacgcgatagt
atcctcaccggcacaggtatgggggcgtatggttttggcacggatatcttcggtgccgcg
tctccggtgacttggggaagcaacaccactgcagctgctggtaatgggttgccgggtttg
cctgctgatgtgggtttgacagttcagggtgcgttagcaaccgttggcggtgagttgatg
ggtgcgcgcttgtatgatcctgtgacggctgggtttttgtcgccggaccctgtggagcct
gtggccgggtcggggtatatgggtgcgtcgtatctgtttgcgtcgggtgatccggtgaac
ctgcacgaccccacaggtttacaaccattatctattgatgctatccgtcagtatagggat
ttctttgggtttgagctgacagttcaggataaatttatccgctactggctatctgctgca
gcggattttgacaattttaatcgtgagttttggaatgatccatctggatggatagcttcg
catcctgacgaggtggatgttgtccttacttatggactcgctggtcttattgctctagtt
ggaggccccgctggatggttcattggtggaggcatgtttctttcaatgaatacttccata
gtcgttcagcgctgggagacagggcatgttgatcctcgtgaagtaacgcgtgaggggctc
atcagtcttttgcttgatgtggccacattgggcttggggaagattttcaaaattgctgct
aagcctgctgttgattatttgctcgctcgctggggcattcgctggggaagttatgaggtc
cgtcatcttcctgtaatgagaccaagtgcagcttcaggcgatgctgtaagtgttcgcgct
cagacagagatgctacgtaaaaatgctataacgatcaaatatcctgtgcttttccgcaag
agtgctcaagaaggtgctgaaaaagcggcttctaaagaaagtttagaggcagtttcttat
caggggcgttatggcaatctcttcgaccgttcgcacctgaataccacaggatatggtttt
gctgctccgcgagttgcggctcctgaagcaggagcacacaccccgctgccctatagtacc
cgtggggtagcccaagagtcttcagtgccgctcaagcctgtggaggctccgcaggtgggc
gaggttcctcctgcttcgggtgctgggtccggtgctgttggtatgcaggctgttaagcct
ggtggtgtggctgatgatgctgtggtggctcgtggttctgctggtgtgcgtgagcctgag
gtgcagctgaaacctgttgaggaaccgaaggttgagaacctgcctccggcaaagggggct
ggtgccgctgaggggccgacggtttcgatgcgtgatgtgcagactcatctggacgagaag
ttggagggtgtacgtcgtaaagagtggagggggaaggataagaaaggacgctcacgcact
gattattacgattacgaaaagtttaaagaggctgagaaaaactactttgacgacagggct
aatttacaggaatacgaggctcgtaagaagcaggctgagcttgagggcagagaatttacc
gaggcacctccaaaagatccggggcctcgtcctcagcatgcgttatggaaagacgccgag
gagcgatttgcgccagatttgcagactgcaatgcagcttgatgaggagggtttgaagcac
caccgggtggtgaagagtgaggactatcagggtcagattcctcaagaaactgctgagcat
ctccagcaggctacgcagaagatcataaaggatggagctcctccgcactatcctggcgct
aatgagggtcgggtctttaataatgaaccttggaagggagaaggaaaaggaaaaatccta
cccactaccgatgttgaggggaatcctattacgtatacggaaatggatttcatggcgcct
aaacctaagatcggtgaaaacggtaaagttgagttgaagcctaacgggaaacctgatacg
actcgtggtgatgacaggttgatagtgggtagtaatggcagtatctattacagcccggat
cattatcacacgtttatcctgatagtagagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
