Rickettsia endosymbiont of Culicoides impunctatus: LF885_01720
Help
Entry
LF885_01720 CDS
T10695
Name
(GenBank) tetratricopeptide repeat protein
Organism
rem Rickettsia endosymbiont of Culicoides impunctatus
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_2
TPR_11
TPR_1
TPR_17
TPR_16
TPR_9
TPR_8
TPR_12
TPR_19
TPR_7
ANAPC3
TPR_Psidin_N
TPR_Slam
RMD1-3
ETO1_C
Ig_CFAP65_4th
ARM_TT21_N
ARM_TT21_C
Coatomer_E
ARM_TT21_5th
NatA_aux_su
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UCM85994
LinkDB
All DBs
Position
complement(355249..356172)
Genome browser
AA seq
307 aa
AA seq
DB search
MKMINIKQLIIFIGLVLITFSGCANRNKIVTSSLDGCVHWEKGYNLAEEGKLEEAIKEYD
LAIKYQPENPVNYYNKAIALVGLNKWQEAIKEYDLAIKYQPNNADAYNNKGIVLEKLGKW
QDAIINYDLAIKYQPENPVNYYNKAIALVGLNKWQEAIKEYDLAIKYQPNNADAYNNKGI
VLEKLGKWQDAIINYDLAIKYQPEIFMSHSNRARVLIHLGKWQEAIKECDLAIKYNPDNA
KLNAILYCAKGSILLLSHKLPEAITEFDKAIKHDPNYASAYKLKDTALIELDRQKARSKE
TLTNQIF
NT seq
924 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaatgattaatataaaacaactaataatttttattggtttagtgttaataacattt
agtgggtgtgctaaccgtaataaaatagttaccagtagtcttgatggctgtgtacattgg
gaaaaagggtataatttagcagaggaaggtaagttggaagaggcaattaaggagtatgat
ttggcaataaaatatcaacctgagaatcctgttaattattataataaagctatcgctttg
gtaggcttaaacaaatggcaagaggcaattaaagagtatgatttagcaattaaatatcaa
cctaacaatgctgatgcttacaataacaaaggtattgttttggagaaattaggtaaatgg
caggatgcgattataaactatgatttggcaataaaatatcaacctgagaatcctgttaat
tattataataaagctatcgctttggtaggcttaaacaaatggcaagaggcaattaaagag
tatgatttagcaattaaatatcaacctaacaatgctgatgcttacaataacaaaggtatt
gttttggagaaattaggtaaatggcaggatgcgattataaactatgatttggcaataaaa
tatcaacctgaaatatttatgtctcactctaatagagctcgagttttaatacatttaggt
aaatggcaggaagcaattaaggaatgtgatttagcaattaaatataatcctgataatgct
aaacttaatgctatactttactgtgctaaaggttcaattttgctgctgtcacataaatta
ccagaggcaattacagaatttgataaggcaattaaacatgaccctaattatgcttcagct
tataagttgaaagatactgctttgatagaattagacaggcaaaaagcaagaagcaaagag
accttgacaaatcagatcttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
