Rickettsia endosymbiont of Culicoides impunctatus: LF885_03670
Help
Entry
LF885_03670 CDS
T10695
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein/permease
KO
K11085
ATP-binding cassette, subfamily B, bacterial MsbA [EC:
7.5.2.6
]
Organism
rem Rickettsia endosymbiont of Culicoides impunctatus
Pathway
rem02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rem00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
LF885_03670
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
rem02000
]
LF885_03670
Enzymes [BR:
rem01000
]
7. Translocases
7.5 Catalysing the translocation of carbohydrates and their derivatives
7.5.2 Linked to the hydrolysis of a nucleoside triphosphate
7.5.2.6 ABC-type lipid A-core oligosaccharide transporter
LF885_03670
Transporters [BR:
rem02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
LF885_03670
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_15
RsgA_GTPase
AAA_22
ABC_ATPase
nSTAND3
AAA_29
nSTAND1
AAA_16
DUF4957
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UCM85121
LinkDB
All DBs
Position
758957..760729
Genome browser
AA seq
590 aa
AA seq
DB search
MPKKHNLINYDYSAYSTLRRLVVDHIKPYLKQIGVAVLFMVVNACCNAYIVKLVQPTIDQ
IFLTHNRQMLLFLPLMVVLTFTIKGIAEYYSSYLIKFIGQRILTDLQIKMYEHLLFADIL
FIQSQSSGRLISRFTNDISMMRGAVSNILVCCAKHFLTVVGLIIVMFKLEPKLSCIVFMT
FPAAIYPIQKLGRKIRKISGQAQEELANYTSRLDETFGSIKIVKSFLGEKIESNRALLIS
SNILRFLKKTAKLDALISPLMEILSGITVGGLIWYGGLLVIEGETTPGAFFAFITAFTTA
YRPFKSLVSLNMNLQEGIAAARRIFNILDTEPIIKDSVNARTVQLVNPSVIFNNVELKFN
NKVALKHLNLQLMQGKTTAVIGRSGSGKTSLANLLVRFYNPTSGQILIDDYDIKDIKIDS
LRRQISLVTQDTTLFDTSVAENIAYGNPDATRSEIITAAKYADADEFISQLPSGYDTMIG
NQGLTLSGGQRQRLAITRAFLKPAAILVWDEATSSLDQNSERLILNSLVNIRKGKTTLII
THRLSSIKDVDHIIVMKSGMIFEQGTHSQLIENKAEYYKLYHKKLEEGEK
NT seq
1773 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgccaaaaaaacataatctaataaattatgactatagtgcctatagtactttaagacgg
ctagtagttgaccatataaaaccctatctaaaacagattggggtggcagtattgtttatg
gtagttaacgcttgctgtaatgcttatattgttaaattagtccaaccaaccattgaccaa
atatttttaacacataatcgtcaaatgttattattcttaccgttaatggtagtactaaca
tttactattaaggggattgctgaatattattcaagttatttaattaaatttattggtcag
agaattttaactgatttgcaaattaaaatgtatgaacatctattatttgccgatattctg
tttattcaatctcaatcatcggggcgtttaatatcacgttttactaatgatatttcgatg
atgcgtggtgcagtatcgaatatactggtatgttgtgccaaacattttttaacagtagta
ggtctgatcatagtgatgtttaagctagaacctaagctatcttgtattgtgtttatgaca
tttccagcagcaatttatccaatacaaaaattaggacggaaaattcgcaaaatatcaggt
caagctcaagaggaattagctaattatacttcaaggttagatgagacttttgggtcaatt
aaaattgttaaatctttcttaggagagaaaattgaaagcaatcgagctttattgatctcc
agtaatattttacgttttctaaaaaaaactgcaaaattggatgcactgatctcgccactt
atggaaatattaagcggtatcacagttggaggacttatctggtatggtggactattagtc
atagaaggagaaactactccaggagcattttttgcttttattacagcttttactacagct
tatagaccttttaagagtttagtatctttaaatatgaacctacaagagggtattgctgca
gcaagaagaatatttaatattctagatactgaacctattatcaaagatagtgtaaatgct
cgaactgttcagttggttaatccatcagtaatttttaacaatgtagagctaaaatttaat
aataaagtagctttaaagcatctgaatttacaattaatgcaagggaagactacagctgtt
ataggacgttctggtagcggtaaaacttcattagctaatttattagtaagattttataac
ccaactagcgggcaaattttaattgatgattacgatattaaagatataaaaattgactct
ttaagacggcaaatctctttagtaacgcaagatactacattatttgacactagcgttgca
gaaaatattgcttatggtaacccagatgccactcgcagtgaaattattactgcagcaaaa
tatgctgatgctgatgagtttatttcacagcttccatccggctacgacacgatgattggt
aatcaaggtttaacactttcaggggggcaacgtcaacgtttggcgataaccagagcattt
ttgaagccagcagcaattttagtttgggatgaggcaacaagttcgttagaccaaaattct
gagcgattaattttaaattctttagtaaatattcgcaaaggtaagactaccttaattata
acccatcgtttatcgagtattaaggatgttgatcacataattgttatgaaatctggtatg
atatttgagcaaggaactcattcacagcttatagaaaataaagcagaatattataaatta
tatcataaaaaattagaggagggggagaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
