KEGG   Rickettsia endosymbiont of Culicoides impunctatus: LF885_04520
Entry
LF885_04520       CDS       T10695                                 
Symbol
lptD
Name
(GenBank) LPS assembly protein LptD
  KO
K04744  LPS-assembly protein
Organism
rem  Rickettsia endosymbiont of Culicoides impunctatus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:rem00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:rem02000]
    LF885_04520 (lptD)
Transporters [BR:rem02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   LF885_04520 (lptD)
SSDB
Motif
Pfam: LptD Pox_J1
Other DBs
NCBI-ProteinID: UCM85266
LinkDB
Position
942097..944244
AA seq 715 aa
MRIFCNLLIIKIIILLPVCALAQVEQQGINKQFSFLSTDYIEYNHKEQFIYAKGNVQIIL
DSYFLTANSLIYDIEQDTLWAEGNVKITDQQNRVILGEFVILKDKLKAGIISDFILYFGD
NTLLAAKLAERVNKDVFRLHNSTFTPCKILCNQKPIWQVSAKNTEIDLNKNIMVYKHLFF
EIYGVPIFYTPYFSHPTPKAPAKSGILMPEWRDNALGIPLYYRAKSNLDFTLTPRFFWKK
HDTTYTIFELETRYKPNESDYISLDANYGKVPYSLNDDDITIKDTKVNSYYLLSNGNFIK
NDYRYGFRLERTSDKAYLKNYYNNYTSYLTSKLYLEHVNNYNYSLVEGMYFEGLGINDSS
STSPLIFPKVRTKNVIPLNDDETTNLVVENNALIYKEKSGRELGQVALQLAVDNNFLTSS
GHLFNVTLRNRADVYFINHLYLNDYRTNKVLTRNIPEIQNTWRYPLAGSIFDKTSLFVEP
IISATIGRKHNSNKKFSFIDPSKYELSENNIFSSNRYSGIDYHEFGNRLSYGVNSSILSE
QNYSSVFLGQTYNTNLINSKSVDNIENVGRISSSFSDKIELFYRFRKSKNFKPIRDELGG
SLNSKTIQLTAGFVQISNLRKYYSTDELIDNKVRQLYYNLTYQLAENWSVAYDMRIDWSK
NKINILSKSIQVTYLNDCVRIAGKLSDNYMGDSSRGIKKTFAVPTISVGLKILNM
NT seq 2148 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcgaattttctgcaatttattgattattaaaattattattttattgccggtttgtgct
ttggcacaagttgaacagcaaggaataaacaaacagtttagctttttgtcaacagattat
attgaatataaccacaaggaacaatttatttatgctaaaggtaatgttcaaattatattg
gatagttattttctaacagctaattccttgatttacgatatagaacaagatacattatgg
gctgaggggaatgttaaaattacagatcagcaaaatagagttattttgggagaatttgtc
atattaaaagataagttaaaggcaggaataatttcagattttattttatattttggtgat
aatactcttttagcagcaaaattagcggaaagagttaataaagatgtttttcgtttgcat
aatagtacctttaccccatgtaaaatactatgcaaccaaaaacctatttggcaagtttct
gccaaaaatactgaaatagatcttaataagaacataatggtttataagcatctatttttt
gagatatatggtgtcccaatcttctatacaccatatttttctcatccaacacctaaggct
cctgcaaaatcaggaatattgatgcctgaatggcgggataacgctttggggataccacta
tattatagagctaaatccaatctagattttactctaactcctaggtttttttggaaaaaa
catgatactacatatacgatttttgaactagaaactcgttacaaaccaaatgaaagtgat
tatatatctttagatgctaactatggtaaagtaccctactctttaaatgatgatgatata
acgataaaagacactaaggtaaactcatattatctattaagcaatggtaacttcatcaaa
aatgattatcgatacggatttaggctggaacgtacttctgataaagcctacttaaaaaac
tattataataattatacttcatatttgacatctaagttatatttggaacatgtcaataat
tacaattactcattagtggaggggatgtattttgaaggattgggaataaatgattctagt
agtaccagtccattaattttccccaaggtcagaaccaagaatgttatacctttaaatgat
gatgaaactactaacctagtcgttgagaataatgcattaatctataaagaaaaaagcgga
agagaactagggcaagttgcattacaactggcagtggataataatttcttaacttcatct
ggtcatttatttaatgttaccttacggaatagagcagatgtctattttattaatcaccta
tatttaaatgattataggactaacaaggttctcactagaaatataccagaaattcaaaat
acttggcgttatccattagctggatcaatctttgataaaactagtctgtttgttgaacca
attatatcggcaactatcggacgtaaacataattctaataagaaattttcttttatcgat
ccatcaaaatatgaactatcagaaaataatatattcagttcgaatcgctatagtggtata
gattaccatgaatttggcaatagattaagttatggcgttaactcttctatactttcagaa
caaaattattcaagtgtgtttctaggacagacctataatactaatcttattaatagtaaa
tctgttgataatattgaaaatgttggaagaatttccagtagtttttctgataaaatagaa
ttgttctatagatttagaaaaagtaagaattttaagcccattagagatgaattaggtgga
agccttaattctaagacaattcagttaactgctggatttgttcagatttcaaatttacgg
aaatattattctacagatgaattaattgataacaaagtaagacaactttactataatctc
acttatcaattagcagaaaattggtcagttgcctatgatatgagaatagattggtcaaaa
aacaaaataaatattctttctaagagtatccaggtgacatacttgaatgattgtgttaga
atagccggaaaactttcagacaattatatgggagatagtagtcgggggataaaaaagact
tttgctgttcctactatttctgtaggtttaaaaatattaaatatgtga

DBGET integrated database retrieval system