Rickettsia endosymbiont of Culicoides impunctatus: LF885_04520
Help
Entry
LF885_04520 CDS
T10695
Symbol
lptD
Name
(GenBank) LPS assembly protein LptD
KO
K04744
LPS-assembly protein
Organism
rem Rickettsia endosymbiont of Culicoides impunctatus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rem00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
rem02000
]
LF885_04520 (lptD)
Transporters [BR:
rem02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
LF885_04520 (lptD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LptD
Pox_J1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UCM85266
LinkDB
All DBs
Position
942097..944244
Genome browser
AA seq
715 aa
AA seq
DB search
MRIFCNLLIIKIIILLPVCALAQVEQQGINKQFSFLSTDYIEYNHKEQFIYAKGNVQIIL
DSYFLTANSLIYDIEQDTLWAEGNVKITDQQNRVILGEFVILKDKLKAGIISDFILYFGD
NTLLAAKLAERVNKDVFRLHNSTFTPCKILCNQKPIWQVSAKNTEIDLNKNIMVYKHLFF
EIYGVPIFYTPYFSHPTPKAPAKSGILMPEWRDNALGIPLYYRAKSNLDFTLTPRFFWKK
HDTTYTIFELETRYKPNESDYISLDANYGKVPYSLNDDDITIKDTKVNSYYLLSNGNFIK
NDYRYGFRLERTSDKAYLKNYYNNYTSYLTSKLYLEHVNNYNYSLVEGMYFEGLGINDSS
STSPLIFPKVRTKNVIPLNDDETTNLVVENNALIYKEKSGRELGQVALQLAVDNNFLTSS
GHLFNVTLRNRADVYFINHLYLNDYRTNKVLTRNIPEIQNTWRYPLAGSIFDKTSLFVEP
IISATIGRKHNSNKKFSFIDPSKYELSENNIFSSNRYSGIDYHEFGNRLSYGVNSSILSE
QNYSSVFLGQTYNTNLINSKSVDNIENVGRISSSFSDKIELFYRFRKSKNFKPIRDELGG
SLNSKTIQLTAGFVQISNLRKYYSTDELIDNKVRQLYYNLTYQLAENWSVAYDMRIDWSK
NKINILSKSIQVTYLNDCVRIAGKLSDNYMGDSSRGIKKTFAVPTISVGLKILNM
NT seq
2148 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgaattttctgcaatttattgattattaaaattattattttattgccggtttgtgct
ttggcacaagttgaacagcaaggaataaacaaacagtttagctttttgtcaacagattat
attgaatataaccacaaggaacaatttatttatgctaaaggtaatgttcaaattatattg
gatagttattttctaacagctaattccttgatttacgatatagaacaagatacattatgg
gctgaggggaatgttaaaattacagatcagcaaaatagagttattttgggagaatttgtc
atattaaaagataagttaaaggcaggaataatttcagattttattttatattttggtgat
aatactcttttagcagcaaaattagcggaaagagttaataaagatgtttttcgtttgcat
aatagtacctttaccccatgtaaaatactatgcaaccaaaaacctatttggcaagtttct
gccaaaaatactgaaatagatcttaataagaacataatggtttataagcatctatttttt
gagatatatggtgtcccaatcttctatacaccatatttttctcatccaacacctaaggct
cctgcaaaatcaggaatattgatgcctgaatggcgggataacgctttggggataccacta
tattatagagctaaatccaatctagattttactctaactcctaggtttttttggaaaaaa
catgatactacatatacgatttttgaactagaaactcgttacaaaccaaatgaaagtgat
tatatatctttagatgctaactatggtaaagtaccctactctttaaatgatgatgatata
acgataaaagacactaaggtaaactcatattatctattaagcaatggtaacttcatcaaa
aatgattatcgatacggatttaggctggaacgtacttctgataaagcctacttaaaaaac
tattataataattatacttcatatttgacatctaagttatatttggaacatgtcaataat
tacaattactcattagtggaggggatgtattttgaaggattgggaataaatgattctagt
agtaccagtccattaattttccccaaggtcagaaccaagaatgttatacctttaaatgat
gatgaaactactaacctagtcgttgagaataatgcattaatctataaagaaaaaagcgga
agagaactagggcaagttgcattacaactggcagtggataataatttcttaacttcatct
ggtcatttatttaatgttaccttacggaatagagcagatgtctattttattaatcaccta
tatttaaatgattataggactaacaaggttctcactagaaatataccagaaattcaaaat
acttggcgttatccattagctggatcaatctttgataaaactagtctgtttgttgaacca
attatatcggcaactatcggacgtaaacataattctaataagaaattttcttttatcgat
ccatcaaaatatgaactatcagaaaataatatattcagttcgaatcgctatagtggtata
gattaccatgaatttggcaatagattaagttatggcgttaactcttctatactttcagaa
caaaattattcaagtgtgtttctaggacagacctataatactaatcttattaatagtaaa
tctgttgataatattgaaaatgttggaagaatttccagtagtttttctgataaaatagaa
ttgttctatagatttagaaaaagtaagaattttaagcccattagagatgaattaggtgga
agccttaattctaagacaattcagttaactgctggatttgttcagatttcaaatttacgg
aaatattattctacagatgaattaattgataacaaagtaagacaactttactataatctc
acttatcaattagcagaaaattggtcagttgcctatgatatgagaatagattggtcaaaa
aacaaaataaatattctttctaagagtatccaggtgacatacttgaatgattgtgttaga
atagccggaaaactttcagacaattatatgggagatagtagtcgggggataaaaaagact
tttgctgttcctactatttctgtaggtttaaaaatattaaatatgtga
DBGET
integrated database retrieval system