KEGG   Candidatus Ruthia endofausta: HUE58_06155
Entry
HUE58_06155       CDS       T06701                                 
Name
(GenBank) UvrD-helicase domain-containing protein
  KO
K16898  ATP-dependent helicase/nuclease subunit A [EC:5.6.2.4 3.1.-.-]
Organism
reo  Candidatus Ruthia endofausta
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:reo00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:reo03400]
    HUE58_06155
Enzymes [BR:reo01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     HUE58_06155
DNA repair and recombination proteins [BR:reo03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    AddAB pathway proteins
     HUE58_06155
SSDB
Motif
Pfam: UvrD-helicase UvrD_C AAA_19 UvrD_C_2 Viral_helicase1 DEAD PDDEXK_1 AAA_30 AAA_12 AAA_11
Other DBs
NCBI-ProteinID: QKQ24671
UniProt: A0A6N0HR12
LinkDB
Position
1096123..1099281
AA seq 1052 aa
MNDQVQRQQALDISRSFIVQAPAGSGKTELLTQRYLKLLSVSASPESVIVMTFTKKAVSE
LTTRVIGSLKSAQGNRPNEPHKQITYDLAKVLGKSKAFDWQLLNTPERLKISTIDGLSSL
ITSRYPSKNQLVPKQIIAQNWARNDIYLQAAKQTLLAIDESEYQNSIESVLLYLDNNVNK
FYRLITDMLAKRDQWLLKLYQHGVLNIETLQLSSERVITQHLLLLKNEADCYFDATFFEL
LKDNTKPELMKIQSVPDATIESLETWRDLCQLCLTTQGKWRTSLNKNNGFPTELKTQKQS
IIKIFQDLSSQQQLKELLAGVKQLPDVDFSTNQINALQDIAQVLKLAVTQLNILFDVHQT
HDFIQVALDAEQAFDEHQVSNIALFLDNKVQHILIDEFQDTSATQFALLEKLLASWQIGD
GKTLFLVGDPMQSIYLFRQSQVGLFLQVRARGIANIKPEFLQLSTNFRSSKSVVEGNNKI
FSKIFPQHEDAYKGAIKYEYSQANSVDEDENAINFYPFAHKRYDFEAQKVLEIIQNNPTK
EIVILVRNRAHLGDIVPVLKCANIEFEALKTAPLREDLFTRDLLSLTRALKHLGDKLAWL
AILRAPWCGLLLEDLLVLSQQDGRVIFDLIQDKQTLQNLSKDGQSRMRNFVHTVRDIINQ
KSRFSFTRVLEFAINQLAPQSSLSVKQSMIKTQFLQIIYDCESAQQLDIGTINQMLDELY
TPSVNSRIKLMTIHEAKGLEFELVVILGLGRAPQNNKPSIIHLQEFSNRSLLLAPIRPYT
QLDDSRTYTYLKHIESQQNKFETMRLLYVAMTRAKHEIYLLGTLNQSNQASSNTFLKLLA
PIFQHQFDKLTLSTIEDNQPPIRAPELVRYVKPLEYDNFLDESMEEMDFQLSVDLQYKSL
LGTLLHQYYEDGLFSPDRQSISVRLVECGVGNTDIDSYIDFIVNMLNLTKQDKHFSWLFK
QRTSTQVEAEFISDKRSVIIDRLFIDEDILWIIDFKTTRQANDESIAQFIQRQKAKHTQQ
LLSYKVALSACYSMEIKCVLYYPAVQELIEIG
NT seq 3159 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatgaccaagtccaacgccaacaagctttagatattagccggtcttttatcgttcaa
gcgcctgcgggctcgggcaaaacggagctattgactcagcgttatttgaaattgttatca
gttagtgcttcacctgagagtgtaattgtaatgacctttactaaaaaagcagtaagtgag
ttgactactcgagtgattgggtctttaaaatcggctcaaggcaatcgaccaaacgagcca
cataagcaaattacttacgatttggctaaagtattaggaaaatctaaggcatttgattgg
caattactaaacacgcctgaacggcttaaaatttcaacgattgatggtttgtcaagttta
attaccagtcgttatccaagtaagaatcaattagtgcccaagcaaatcatagctcaaaac
tgggcaagaaatgatatttatcttcaagctgccaagcagacgttattggcaattgatgag
tctgaatatcaaaatagtattgagtcggtgcttctatatttggataataatgttaataag
ttttatcggttgattacagatatgctagctaagcgtgatcagtggcttttgaaattgtac
caacatggtgtacttaatattgaaaccttgcagttgagttctgaaagggttatcactcaa
catttattgttgttaaaaaatgaggcagactgttattttgatgctactttttttgaactg
ttaaaagataatactaagccagagcttatgaaaattcaaagtgtgccagatgccactatt
gaatcgctagagacttggagagacttgtgtcagctgtgtttaaccactcagggtaagtgg
cgtacatcattgaataaaaataacggttttcccacagagttaaaaacgcaaaaacaatcc
attattaaaatttttcaagatttgtctagccaacagcaattaaaggaattattagcaggg
gttaaacaattgcctgatgttgatttttcaaccaatcaaattaatgcccttcaagacatt
gcacaagtattaaagttagctgttactcaattaaatattttgtttgatgttcatcaaacg
catgattttatccaagttgccttggatgcagagcaagcgtttgatgaacatcaagtcagt
aatattgcactatttttagataataaagtccagcatattttaattgatgagtttcaagat
acgtcagccacccagtttgctttattggaaaaattgcttgctagttggcaaataggtgat
ggtaaaacactgtttttagtgggtgatcccatgcaatctatttacttgtttaggcaatct
caggtgggtttgtttttgcaggtacgggcacgaggcattgctaatattaaacctgaattt
ttacaactgagtactaattttcgttcctctaaatctgtggttgagggtaataataaaata
ttttcaaagatatttcctcaacatgaagatgcttataaaggcgcgattaagtatgaatat
tcacaggctaattccgttgatgaagatgaaaatgccattaacttttatccatttgcgcat
aaacgttatgattttgaggcacaaaaagtgcttgaaattattcaaaataatccaacaaaa
gagattgttattttggtgagaaaccgtgcgcatttaggtgatattgtgcccgttttgaag
tgtgctaatattgaatttgaagcattaaaaacagccccattgagggaagatttatttact
cgtgatttacttagtttgactcgagcacttaaacatttaggtgataaacttgcttggttg
gccattttaagagcgccttggtgtggcttgttgttagaagatttacttgtattgtcacaa
caagacgggcgtgttatttttgatttaattcaggataagcaaactttacaaaatttaagc
aaagatggacaatcacgcatgcgaaattttgtccatactgtacgtgatattattaatcag
aaatctaggtttagtttcacgagggtgcttgaatttgccattaatcagttagcacctcag
agttccttatccgttaagcagtctatgattaaaacccaattcttgcaaattatttatgat
tgtgagtctgcacaacagcttgatattggaaccattaatcaaatgttagatgagttgtat
acacccagtgtaaattcacgaattaagctaatgaccatccatgaagctaaaggtttggag
tttgagttggttgttattcttgggttgggtagagcgccacaaaataataaaccgtccatc
attcacttgcaagagtttagcaatcggtcgttattattagccccgataaggccttatacg
caactagatgacagccgtacttatacctatttaaagcatattgaatcacagcaaaataag
tttgaaacgatgcgtttattgtacgtggcaatgacacgtgctaagcatgaaatctattta
ttaggaacgttaaaccagagcaatcaagctagtagcaatacttttttaaaactattagca
cctatatttcagcatcaatttgacaagcttacactatcaactattgaggataatcagcca
cccattcgagcaccagagttggttcgttatgttaagcctttagaatatgataattttctt
gatgagagtatggaggaaatggattttcagttgagtgttgatttacaatataaaagcctg
cttggcactctgttgcatcaatattatgaagacggattgttctcgccagacagacaaagt
ataagtgtaagattggtggaatgcggtgttggcaatacggatattgacagttatatcgat
tttattgtcaacatgcttaatttaacgaaacaagacaaacacttttcttggctattcaaa
caaagaacatcaacccaagttgaggcagagtttataagtgacaagcgtagcgttattatt
gatcgattatttattgatgaagatattttgtggattattgattttaaaaccacaagacaa
gcgaatgatgaatcaatagcacaatttatacaaaggcaaaaagccaaacacactcaacaa
ttattatcctataaagtggctttatcagcgtgttattcaatggaaataaagtgtgttcta
tattatccagcagtacaagaattgattgaaattggctaa

DBGET integrated database retrieval system