Candidatus Reidiella endopervernicosa: HUE57_14345
Help
Entry
HUE57_14345 CDS
T06650
Name
(GenBank) VCBS repeat-containing protein
Organism
rev
Candidatus Reidiella endopervernicosa
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FG-GAP_3
FG-GAP
TSP3_bac
Calx-beta
Ribophorin_II_2nd
HYR
PKD_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKQ27334
UniProt:
A0A6N0HYA4
LinkDB
All DBs
Position
complement(2640262..2646894)
Genome browser
AA seq
2210 aa
AA seq
DB search
MTRTPVHFINAITLLLLLIVSTQLCAATTGLPFTEDFSAATLNDTSLSNAHWSTTEQTVY
LAWRERQIGLPDDTETGTVIDSDVNFTTRVTLGDVDGDGDLDLVAGNTSANLLYLNDGSA
GFPLSGSAIGSEADTTWQVHLIDIDGDGDLDLLTANYNATNKLYFNDGSGVFSATGVDIG
SDTDSTRDIALGDVNGDGKLDLVSGNMGRTHKLYLGDGSGGFSATGVAIGSETEDTLSVR
LGDLDGDGDLDLVVGNQRQVNRRYLNDGSGGFPATGTVIGSEDELTYDTLLGDVDSDGDL
DFLSLGYEGNRLYLNDGSGGFPSNGAPISSDTYKNTLEGVLIDLDYDGDLDLVVANVGAR
NKYYLNDGSGVFSESTDIGSESDITYSLSMGDLNGDGALDMVTGRQSATNKLYMSSSSST
GGGFDASGTVIGSEVEKNWDVSLGDVDGDGDLDVIVAVQSATNKLYLNDGSGGFTTGTGT
SIGTESDITYAVELGDIDGDGDLDLVTGTAPGINKLYLNNGSGSFSATGTAIGSETDNTR
AVALADLDNDGDLDVVAGNAGDTHKYYLNDGSGGFPATGTDIGSDTDTTWEIALADLNGD
GFPDLVAGNFQERNKLYLNDGSGGFTTGAGTDVGSDLGETYDVTLSDVDEDGDLDLISGD
ANQIIKLYLNDGSGGFTTGAGTAIGSETDNTTAVEVADINGDGHIDLVAGAHGNVSKFYL
GDGSGGFSATGTQLGSNRDATFAIILGDLDGDGDFDMVNASDGNTHKLYMNNSGDGFSIS
TAIGSETESSYKAALGDVDGDGDLDLIIGNYNQTNRLYLNDGSGGYPATGSAIGSSDTDS
TRAIKLGDVDGDSDLDLVVGNQNQTNKLYLNDGSGGFPSSGRDIGSETNYTSGIELTDID
QDGDLDVVAGNNGQTSKFYLNNGSGLFSATGSDIGSETNPTWSIAVGDLNGDNYPDVVTG
VGNQTNRLYLNNGSGGFPATGTAIDTDSDNTTTIALGDVDGDNDLDLVSGSYGGINKLYR
NNGSGLFNASGVAIGIDADQHWDLVLGDLDRDGDLDLVTGNPSGSNRLYWNNGSGSFSVS
GEAIGSETDDTRGMALGDVDGNGYLDLIAANYNVTNKLYLQTKQYQLSGLAVSKKVNDSE
TDILTVRLSATETSSADTSIDYYLSNNGGTNWYKVISGEFFTFPDTGTDDLRWKAKLQTL
SAARSPALSQIALQPFNTAPMLGGTFTTAGTVNDNATTSPFSGVTIADIESNDVSVAIGY
SAANGTLSGTGLSGSAGGYILGSTDLTTLTSRLQALIFTPTTDQVITGNSVITTFTLTPN
DGTVNGSANATTKVSATSVNKTPTGGVTISGKPTQFQILRASNDLADVDGLGGIGYQWKR
GGSVIEGATSDSYPLQQADVGQTMTVTASYRDLENTDESVTSSATSTVVNVNDAPINTVL
PIISGTVEVGNTISSSSGSWSDADGDGRVYSYQWRADGTNIGTDSNSYTLTGIEAHKSIS
VVVTANDSKGGITSATSVARTVGNVAPTISGNPATKVGDDVDYSFIPTVNDNDGDKLTFS
IVNKPAWANFDTSSGALFGTPDSSDIGTTRGVVISVSDGEFESSLSAFKVWVFADMDNDN
ISDRIDSDIDGDGIENDWESDNGLDPYDPSDAAGDLDGDGLSNLEEFIAETNPAVDDNPP
LVTAPDDVMVDATGLLTPVSLGSAIAIDGMDGNLTVTSDAPSHFKPGVHLVTWSATDSAG
NSGSAIQMVMVNPMVDFSKDQLTAEGSSVTFNVILNGEAANYPVIVPYSVGGSAATDGSD
HSLISATATLEEGTELAVSFATIDDGAGEGVENIVVTMGSPTNAVKGSMTTHTISLVEGN
VAPIVTLSANQGFGDTRTVISGGGVVSLISSVSDPNIGDTHSYNWVASDNALVDGDGDSE
ADTFSFDPSGLSRGIYTVALDVSDGSASDATEITLNIVAAAPRLDQSDSDGDGIDDESEG
YGDSDGDGVADYLDAISIPNVLQEQSGEAASYLIETEPGLRLSLGAIAFQTGNGQAEVNM
EDVSNGGGDTDDSPEYDYTSELFDFIVSELPVAGQSIKVVIPQFVTIPANAVYRKWMPGG
WQAFVEEGSNGLASAVGEAGFCPPPGDSAYQSGLNEGHWCVELTIEDGGPNDADSEANNS
VVDPGGVAQQLAINEGSSSGGGALHPLWLLLGLTGLSSLMARRKGRGEWV
NT seq
6633 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccagaacgcccgttcattttataaatgccattaccctgttgctgctgttgatcgtc
tctacacaactgtgcgcggcgacgacgggcctgccgtttacggaagatttctcagctgcc
actcttaatgacaccagcttaagcaatgcccactggtcaacgactgagcagaccgtctat
ctggcctggcgcgagcgtcagatcgggctgccagacgataccgaaacaggcacggttatc
gatagtgatgtgaacttcacgacaagggtcacccttggtgatgttgatggtgatggtgac
ctggatctggtggccggtaatacatcagccaatcttctctatctgaatgatggtagtgcg
ggttttccgctttctgggtcggccattggtagtgaggccgacacgacctggcaggttcac
ctgattgatattgatggtgatggtgacctggacctgttgaccgccaattataatgcaacg
aacaaactctattttaatgatggcagtggagtcttttctgccaccggcgtcgatatcggc
tcagatactgatagcacccgagatatcgccctgggtgatgttaacggcgacggcaagctt
gaccttgtctcgggcaacatgggtcgaactcataagctctatttgggtgatggtagcggt
ggtttttcggctacgggtgtggcgattggtagcgagaccgaggatacattaagcgttcgc
ctgggtgatctcgatggtgatggagatctggatctggttgtgggcaatcagagacaggtt
aaccgtcgctatttaaatgacggtagcggggggttcccggccacagggaccgtgattggt
agcgaggatgagttaacctacgacaccctcctcggtgatgttgacagtgatggtgacctc
gattttctctcactcggttatgagggtaatcgcctctatctgaatgatggtagtggtggt
ttcccctctaacggtgcacccattagtagcgacacctataaaaacacactagagggggtc
ttaatcgatctcgattatgatggcgaccttgatctggtggtggctaatgttggtgcgaga
aataaatattatctaaatgacggaagtggcgttttttctgaaagcacggatatcggttct
gaatcggatattacttactctctcagcatgggcgacctgaatggtgatggtgcgctcgat
atggtgacgggaagacagtccgccaccaacaaactctatatgagtagcagtagctcgact
ggcggtggctttgatgccagcggaaccgtgatcggatctgaggtagagaagaactgggat
gtctctctcggtgatgtggacggtgatggggatctggatgtgatagtcgcggttcaaagc
gccaccaataaactctacctcaatgacggctctggtggcttcaccactggcactggaacc
tctatcggcacagagagtgatatcacctatgcggttgagctgggtgacattgatggggat
ggcgatcttgatctggtaaccggaactgcaccaggcatcaataagctctacctcaataac
ggtagtggcagtttctctgccacgggcacagctatcggctcagagaccgataacactcga
gctgtcgcactggccgatctcgataacgatggtgatctggacgtcgttgctggtaacgcg
ggcgatacccacaagtactatctcaatgatggcagcggtggctttccggcaacaggcact
gacatcggttcggatacagataccacctgggagattgcactggcggatctcaatggagac
ggtttccccgatctggtcgcgggcaactttcaagagcgtaacaagctctacctgaatgac
ggtagcggtgggtttaccactggcgcaggtacggatgtcggttccgatctgggcgagacc
tacgatgtaaccctgagcgatgtcgatgaggatggtgacctggatttgatctcgggtgat
gccaatcagatcattaagctctacctcaatgatggctctggtggttttaccaccggtgcc
ggaaccgccatcggatcagagaccgataacaccaccgccgtagaggttgccgatatcaat
ggcgatggccatatcgacctggtcgccggtgcgcatggaaatgtcagtaaattctacctg
ggcgatgggtcgggtggcttttcagcaaccggcacccaactcggctcaaatcgagatgcc
acctttgccatcattctgggtgatctggatggcgatggcgacttcgacatggtgaatgcc
agcgatggcaacacgcacaaactctatatgaacaacagcggcgatggcttctctatcagt
acggctatcggctctgagacggagagcagttacaaggcggcgctaggtgatgtggatggg
gatggtgatctggatctcatcatcggcaactacaaccagaccaacagactctatctcaat
gacggcagtggcggatatcctgcaacgggtagtgctatcggctcatccgatacagacagc
acccgagcgattaagctgggtgatgttgatggtgatagtgacctcgatctggtcgtagga
aaccagaaccagaccaacaagctctacctcaatgatggcagcggaggttttccctccagt
ggtagagacatcggctcagagacgaactacacctccggtatagagctgaccgatattgat
caagacggtgatctggatgtggtggccggtaataacggtcagaccagcaagttctacctc
aataatggcagcggtctctttagtgcaacgggaagtgacatcggatcggagaccaatcct
acctggagcattgccgttggcgacctgaatggcgataactacccggatgtggtgacgggc
gtcggtaaccagaccaatcgactctatctgaacaacggtagtggcggttttcccgcgacg
ggcaccgccatcgataccgatagcgataacaccaccacgattgcgctcggtgatgtagat
ggtgataacgacctcgatctggtttccggctcctatggcggtatcaataagctctatcgt
aataacggtagcggtctcttcaatgcgagtggcgtggctatcggcattgacgccgatcag
cactgggatctggtgctgggcgatctcgatagggatggtgatctcgatctggtgaccggt
aatccatcagggagcaacagactctattggaataacggtagcggtagctttagtgtttca
ggtgaagctatcggttcggaaacggatgacacaagaggcatggcacttggcgatgttgat
ggcaatggttatctcgacctgattgccgccaactataatgtgaccaataagctctatctt
cagaccaagcagtaccaactctcggggctggcggtatcgaaaaaggtcaatgacagtgaa
acggacatcttgacggttcgtctgtcagcgacggagacaagcagcgcagacacctcgatc
gactactacctatctaataatggcggtacaaactggtacaaggtcatctccggggagttc
ttcaccttccccgataccggtacggatgacctgcgctggaaggccaagctacaaacgctc
tcggcagcgcgttcccctgcgttgagtcagattgcactgcagcccttcaatacggcaccg
atgctgggaggcacctttactaccgctggtactgtcaacgacaacgctacaacatcacca
ttcagtggcgtgacgatagccgatattgaatccaatgatgtcagtgtcgcgattggctat
agtgctgccaacggcaccttgagcggcacaggactgagcggaagtgcgggtggctatatc
ctagggagtacggatctcactacgttgaccagccgcctgcaggcgctgatctttacaccc
accaccgatcaggtgattacgggtaatagtgtcattacaaccttcaccctgacacccaat
gatggcacggttaatggtagcgctaatgcgacaaccaaggtttctgctacctccgtgaat
aagactccgactggtggcgtgacaatcagcggcaaacccactcaattccaaatcctacgt
gccagtaatgacctggcggacgttgatggtcttggcgggattggctatcagtggaagcgt
ggggggagtgtgatcgagggtgcgaccagtgatagttacccgctgcagcaggcggatgtg
gggcaaaccatgacggtaacggcgagttatcgtgacctggaaaatacggacgagagtgtc
actagtagtgcgaccagtaccgtggtcaatgtcaatgatgcaccgatcaacacagtgctg
ccgattatcagcggcacggtagaggtcggcaacactatcagcagtagtagcggtagttgg
agtgatgctgacggggacggccgggtttacagctatcaatggagggccgatggcacgaat
atcggtacagacagcaacagttacacgctgaccggcattgaggcacataagtccatcagc
gtggtggttactgcaaatgacagcaagggtggcattaccagtgcgacttctgttgcccga
actgtcggcaatgtcgcgccaaccattagtggtaatccggccacaaaggtaggtgatgat
gttgattacagttttattcctacggtcaatgataatgatggcgacaaactcaccttcagc
atcgtgaacaaacctgcctgggcgaactttgatactagctctggcgcgttgttcggtacc
ccggatagcagtgatataggcactacgaggggggtcgtgattagtgtcagtgatggcgag
tttgagagtagcctgtcggcctttaaggtatgggtctttgccgacatggacaatgacaac
atctccgataggatcgatagtgatattgatggggatgggatagaaaatgactgggagagc
gacaacggtctcgacccttatgatcccagtgatgcggcgggtgatctggacggtgatggg
ttaagtaacctcgaggagtttatcgctgagaccaatcctgccgtggatgataatccgcca
ctggttacagcaccggatgatgtgatggttgatgccacagggcttctcaccccggtgagt
ctgggtagtgctattgccatagatgggatggatggcaacctgacggttacctcagatgca
cccagccacttcaaaccaggagtgcatctggtgacctggagcgcgacggatagtgcgggt
aatagtggctctgccattcagatggtgatggttaatcccatggttgatttcagcaaggat
cagctcactgctgaggggagcagcgttacctttaacgtgattctcaacggcgaagcggca
aactacccggtcatcgtaccctatagcgtgggcggtagtgctgctaccgatgggagtgac
cactctctgatcagtgccactgccactctggaagagggaacggagttagcggtgagtttc
gccaccatcgatgatggtgccggcgagggtgtagaaaatattgtcgttaccatgggcagt
ccaacaaatgcggtgaaggggagtatgactacccacaccattagcctggttgagggcaac
gtcgcaccaatagtcacactgagcgcgaatcagggttttggggatacacgtaccgttatt
agtggagggggggttgttagccttataagtagtgttagcgatcccaatattggtgacaca
cacagttataactgggtagccagtgacaatgcgctcgtcgatggcgatggcgatagcgaa
gcggatacctttagcttcgatccctccggattgagtagagggatctataccgtagcgctg
gatgttagcgatggcagtgcgagtgatgcgaccgagataacgctgaatattgtagcggca
gcaccgcgtcttgatcagagcgatagtgacggtgatggtatcgatgatgagagtgagggc
tacggagatagtgatggtgacggtgttgcagactatctggatgcgatatcgattcccaat
gtactgcaggagcagagcggtgaagcggctagttatctgattgagacggaaccgggtttg
cgattgagcctgggtgcgatcgcattccaaaccggcaacggtcaggcggaggtcaatatg
gaggatgtcagcaacggtggtggcgacactgatgatagccccgagtatgactacacctcc
gagctgttcgattttatcgtctccgagctgcccgttgcaggccagtcgatcaaggtggtc
attcctcagtttgtaacgattcctgccaatgcggtctacagaaaatggatgccagggggg
tggcaggcgtttgtagaagagggcagtaatggccttgcctcggccgtaggtgaagcgggc
ttctgcccgcctccaggtgatagtgcctaccagagtggccttaacgaggggcactggtgc
gtggagctgactattgaggatggtggacctaatgatgccgatagcgaggcaaataatagt
gtggtcgaccccggtggagtagcgcagcagctggctatcaatgagggcagtagtagtggc
ggcggtgctcttcatccgctgtggctgctgctgggtctgactggactgtcgtctctaatg
gccaggagaaagggaaggggggagtgggtttag
DBGET
integrated database retrieval system