Rickettsia endosymbiont of Cimex lectularius: LF884_01025
Help
Entry
LF884_01025 CDS
T10696
Name
(GenBank) autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein
Organism
rex Rickettsia endosymbiont of Cimex lectularius
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
rOmpB_passenger
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UCM92899
LinkDB
All DBs
Position
225795..230564
Genome browser
AA seq
1589 aa
AA seq
DB search
MNNKSKKSSFLKNLLATASIASVIVGGSNTAFAGATVGRIEARQTTGNAVVFTTGAQLNK
SVANANVLFTSGSSLTIDADGRTPNLDLPGGQTISHLDLGGHDIGLSTVTTDTTINSITN
GGAPATFQVAAGRSLTLGGNVVAGSRALVGGGLGNGLLGAVTFDAAGGGILNITTGPVAD
GFAFAPADIVFGELTVVNGDRVTLNINNAGAKTTFSKSEVATAHTINISDGSTVEFNSTA
TAGGAANTLDLQQRAGSRINFGTNGDGTLLLTSNNGVATSFRLRDGSLGGNNKDGDGTIH
FNTTAAAGFLVPHAVGNAVVGINKENRAKKFIVTATAGARATIEGKVYAKDIELRGGAVT
FENEVDVGDKGATNMITAQSNVILNDNSNLGTTDFHGVLNSTITVVAGKTLEGNFHADVN
NSAAQVGTIIFQGEGVLKADIINKLVAIRNTAVGTLKLSGQHAVTELQGGAANTHFTFTD
GYKLIGNINEVAANVNAAAASNLTFEGNAEITGNIGAAGAGTVGNIIIPKDKTVKVGGAT
INAASIFSNTDGGTLKLTNKAGDVTITSTISANGGGTIDATEMKKDGTLKIVGSIGMNPA
DNNNKKPLDKLLLKGQKLNFDIAAANKWVNIAGIDFGGDASTVKMDVGDAKYAFGALTNA
GEATFKVSENVALYNTTTSKDGGVKEIEFTADNKTLTLHKGNDITANSITASNGANGSNL
IFAGDAALKGDIGTSNRKFKGLKVNADVKAITSGQGFFSGNIELADAGSTLVVDGNYTAK
AVVGNVAGKGTLKFVNAAGVGTGVKFTTTAAANDPAVNAISTLELHGGDVELVGDNGLKF
SNIKFATAASLTLASNMELKDINVDSTLSSKDARPTVILSAIDHTINKHIGDKDHLVNLQ
FAGDNTLNVTITDFFAGVTTTTDNQGAVNFKAGSDKVYGLGSSGHNLKAATFEVNTENFG
DTYVNNAIINDKLKYTAGGTVAGGLQVGSDKGGSVAEFKDGVILTAAVTSKGVGNNINFT
NKATIIGTKLGTENDRFKTITFNGNKEVTLNNAAMYAEVVNFGTENIVITADNNIISGTS
HVNANINLNSGKLIFQDKQNDVNSTWGPKTSIATTLTADGKLGSIEVNTPIEVAASVPVN
AIIVKDEAQLGADQEYKLISNGKNLILGNDVRFGPLTVAKSTNQAYAKWVVSTKDDKDVY
LLRLNDAATVAPADMKAAGGDDKDQENAALLGREALAAMTDIGTLSQDPKVRGEALKRIT
NAENALVTDAVEHTNAGIASLVGARLAQVDDQQKPVASGSDDVAGESMGAWAMPYYNQAV
QKGEGSVVGYKTKSVGGILGFDALANENLMIGAAVSIVRTDMKYKDYKIGEKTNINTVML
SIYGSQQLDKNFFVQGLVSLGSNKIKNSDPRKVPTSRNASGQQIAKASYDSLSYGGQVLF
GYNAKMSDSMSLIPMAGIRYTGSSDEGYKETGTDNVNKVVAKKTNNKVEAVLGTRFAVSV
DTSGITVMPEAHAFVSQKLFGSSGKVSAKLDGMTSSFATRSDKEAKTLFNLGLGVTAKAG
NMEYGAGYDAYLASKYVGHQGTLKVRVNF
NT seq
4770 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataataaaagtaaaaaaagcagttttttgaaaaacttgctagcgactgcttctatt
gcttcagttatagtcggtggaagtaatacggcatttgctggtgctactgttgggcgtata
gaggctaggcagacaacaggaaacgctgttgtatttactacaggtgctcagttaaataag
agtgttgctaatgcgaatgtgttgtttacttcaggttcgagtctaacaattgatgcagat
ggtcgtacgcctaatcttgaccttcctggtggtcaaactatttcacatcttgatttgggt
ggtcatgatataggtcttagtacagttactaccgatacaactatcaactctataacaaat
ggtggtgctcccgctacttttcaagttgcagctggtcgcagtttaactttaggtggtaat
gttgttgctggtagtagggctcttgttggtggtggtcttggtaatggcttattaggtgct
gttacttttgatgcggcggggggtggtatccttaatattactactggtccagttgctgat
gggtttgcttttgctcctgcagatatcgtgtttggtgagcttacagttgttaatggtgac
cgtgtaacattgaatattaacaatgctggtgctaagacaacatttagcaaatcagaagtt
gccacagcccacacaattaacatctctgatggtagtactgttgaattcaactctactgca
actgctggtggtgctgctaatacgttggacttacaacagagagcaggtagtagaatcaac
tttggtactaatggtgatggtacattgttacttacttctaataacggtgtggctactagc
tttagacttagggatggatctcttggtggtaataataaagatggagatggtacaattcac
ttcaatactactgcggcagctggatttcttgttcctcatgctgtaggtaatgccgtagtt
ggtataaataaggagaatagagctaaaaaattcatagttactgctactgctggtgctcgt
gcaacaattgaaggaaaagtatatgctaaagatattgaattacgcggtggggctgttact
ttcgaaaatgaggttgatgtaggagataagggtgctacaaacatgataacagcacagtcg
aatgtaattctaaacgacaatagtaatcttggtacaacagatttccatggtgtacttaat
agtacaattactgtggtagctggtaaaacacttgaaggaaactttcatgctgacgtaaac
aatagtgcagctcaagttggaacaataatttttcaaggtgaaggtgtattaaaagctgat
ataataaacaaattagttgcaattcgcaatactgctgttggtactctgaaattgtcagga
cagcatgctgtcactgaactacaaggaggggcggctaatacacattttacatttactgat
ggttataaactgatcggtaatattaatgaagttgctgctaatgttaatgctgctgctgct
tcaaatttaacgtttgagggtaatgctgaaattactggtaacattggtgctgctggtgct
ggaacagttggtaatattatcatccctaaggataaaacagtaaaagttggtggtgctacg
attaatgctgctagtatctttagtaatactgatggtggaacattgaaattaactaataaa
gcaggtgatgtaaccattacatctacaataagtgctaatggtggcggtactattgatgca
actgaaatgaaaaaagatggtactttaaagattgttggctctattggtatgaatcctgct
gataataataataaaaagcctctagataaattattactgaaaggacaaaaacttaacttt
gacatagctgcagccaataaatgggttaatattgctggaattgattttggtggtgatgcg
tcaacagttaagatggacgttggtgatgctaaatatgcctttggagctttgacaaatgca
ggggaagctacatttaaagttagtgagaatgttgccttatataatacaacaacctctaag
gatgggggagtaaaggagatcgagtttacagcagataataagactcttactcttcataaa
ggtaatgatattactgctaatagtataactgcttccaatggagctaatggaagtaatcta
atttttgctggggatgctgctctaaaaggtgacataggaacatcaaacaggaaatttaaa
ggtctcaaagtaaatgctgatgttaaggcaattacatctggtcaaggctttttcagcgga
aatatagaattagcagatgccggatctacattagttgtagatggtaattatactgctaaa
gcagttgttggtaatgttgctggtaagggaacgctgaaatttgttaatgctgctggtgtt
ggtactggtgtaaaattcactactacagcagctgctaatgaccctgctgttaacgctata
tctaccttagaattgcatggtggtgatgttgaattagtaggtgataacggtctaaaattt
agcaatattaagtttgcaactgctgcaagcttaactttagcttcaaatatggaacttaaa
gatataaatgttgatagtactttgagttctaaagacgctagacctacagttatattatca
gctattgatcacactatcaataagcatataggtgataaggatcatttggttaatctacaa
tttgctggagataataccttaaatgttactattacagacttctttgctggtgtaacaact
acaactgataatcaaggtgctgttaactttaaggctggttctgataaggtttatggttta
ggttctagcggacacaacttaaaagctgcaacttttgaagtaaataccgaaaactttggt
gatacttatgtcaataatgctattattaatgacaaattgaagtacacagctggtggaaca
gtagctggtggactacaagttggtagtgataaaggtggttctgtagctgagtttaaagat
ggtgttattttgacagctgctgtaaccagtaagggagtaggtaataatattaacttcaca
aataaggctactattattggtactaagcttggtacagagaatgatcgttttaagactata
acatttaatggcaataaagaagtaaccttgaataatgctgctatgtatgcagaagtagtt
aacttcggtactgaaaatatcgtaattactgctgataacaacataattagtggtacttca
catgttaatgccaatattaatttgaactctggtaagttaatcttccaagataagcaaaat
gacgtaaattctacatggggtcctaaaacttctattgcaactaccttaactgcagatgga
aaacttggctctatagaagttaatactcctatagaggtggctgctagtgtaccagttaat
gctataatcgttaaggatgaagctcaattaggggcggatcaagagtacaagttgattagc
aatggtaaaaatctaattctaggtaatgatgtacgatttggtcctctaacagtagcaaaa
tcaacaaatcaagcatatgcaaagtgggttgtttctactaaagatgataaagatgtttac
ttgttgcgtttaaatgatgctgcaactgtagctccagctgatatgaaagctgctggtggt
gatgataaagatcaggaaaatgctgctttgcttggtcgtgaggcattagctgctatgact
gatattggtacgttatcacaagacccaaaagtacgtggtgaagcactaaaaagaattaca
aatgctgagaatgcactagtaactgatgctgtcgaacatactaatgctgggattgctagt
ttagtgggagcaagacttgcccaagttgatgatcaacaaaaacctgtagctagtggctct
gatgatgtagctggtgaatcaatgggtgcatgggctatgccatactataatcaagctgtt
cagaagggtgaaggtagtgttgttggctataaaacgaaatctgttggtggaatccttggt
ttcgatgctttagcaaacgaaaatctaatgatcggtgctgctgttagtattgttagaact
gatatgaaatacaaagattataaaattggagaaaaaacaaacattaatactgtgatgctc
tctatttatggatcacaacaacttgataaaaatttctttgtacaaggtttggtttctctt
ggttcaaataaaattaagaatagcgatcctagaaaagttcctacttctcgtaatgctagt
ggtcagcaaattgctaaagctagttatgattctctgtcttacggtggtcaagtattattt
ggttacaatgctaaaatgtctgactcaatgtcattaataccgatggctggaattcgttat
acaggatctagcgatgaaggttataaggaaactggtacagacaacgtaaataaggtcgtt
gctaagaagactaacaataaagttgaagctgtgcttggtactagatttgcagtttctgta
gatactagcggtattacagtgatgcctgaagcacatgcttttgtttcgcaaaagttattt
ggtagttcagggaaagttagtgctaaattagatggtatgactagttcgtttgctactaga
tctgacaaagaggcaaaaacattgtttaaccttggtttaggcgttactgctaaagctggt
aatatggagtatggagctggttacgatgcatatttagctagtaaatatgttggtcaccaa
ggtactttaaaagttcgtgtaaacttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
