Rickettsia endosymbiont of Cimex lectularius: LF884_05630
Help
Entry
LF884_05630 CDS
T10696
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18307
multidrug efflux pump
Organism
rex Rickettsia endosymbiont of Cimex lectularius
Pathway
rex02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rex00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
LF884_05630
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
rex02000
]
LF884_05630
Transporters [BR:
rex02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
LF884_05630
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
Exo_endo_phos2
AF_0155
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UCM92335
LinkDB
All DBs
Position
complement(1175437..1178445)
Genome browser
AA seq
1002 aa
AA seq
DB search
MIKKLLEHSSFFIVINIVVVLFGIYSYLQLKIQLLPNIPVSNIYISIVNPNVKPDLIEKY
TTKPFEEVFSHIDGLKSIIAISQLGESKITLSIVKKVPIEQAINQVRDLILKNKALLPEG
AKEPIISTESFSVLPMMYIAVSSKNNVSATADDIELIKKKLKYVDGVANTSSFGMTEKVI
NIDIDPEKIAKYYIPLDSILASLTLQNSDFSGGKLSNQYKTEYISFDTAINKLSDFGEIN
LESNNVAIKLKNIASITISDKEALSLAYFGMDKIVLLGIFAKSDANPIDVSKSVKHFLEH
YEKANPQFIFQVIIDDSQDILQAFQEVRKTLLESVLLVSVIVLLLMGSLRYSIIAICAIP
VSLAACFVMLYLCGFTLNAITMLAMVLAIGLVVDDSIVVIENAEHYYRKNKDALTSILQA
IYSLFLSVLILMFTLVVIYVPILFIKGEVGKILQEFALSVIACLVMSFIVAFTLTPILFL
KLANNTHESKFVQIVNKTLDMITYKYQESLFFIIRHAKIFLSLVAVVVAAGTYVAVNNMK
IEIEPFEKKDMLILTNTFMVNTNLSYIHHYMEKITKVIKDNDNIKYTLSIEESPRSTIWL
ILKDKTKAVQTLHEIEAKLAKIAVGGDISVKFAQGKNAGSAKGNVELSFYVNNQSSMENA
WQAVHFIQTNSKDLFTNVIAIEASPVQDYKIWCNQDKLFKYGLSQKDISSTLDILFNARK
IGSFKHYDNSYDVIAKSDPKFGKTLSNIQNMFITTQKNGENLIQLKDICDINRVNTVNQI
MRYNEQYSIEVIATAKHGIKLQDAVHFINQLNSKLPNDSDISYSEQTQILIDSTSSFTVL
ILLSVLGLYLLMFARFNDSILSLFILVGGIPAALSVALLSLYFSQGGLNIYTQISLITLA
GLMTKHSVLLCSAMHQKGQRTLKTILTAATSRIRAILITSLAMSIGLLSLFFDNGNYANS
RFQMAIVLVTGIVVGSILTLYVTPLLYVGFHQLSKVRRAREQ
NT seq
3009 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaaaaattgttggaacatagtagcttctttattgtgataaatattgtggttgtg
ctatttggtatatactcatatttgcagctgaaaattcaacttttaccaaacattcctgtt
tcaaatatttacatttctattgttaacccgaatgtaaagccggacctgatagagaaatat
actaccaaaccttttgaggaagttttttcacacattgatggtcttaagtcgattattgct
attagtcagttaggagagagtaaaataactctaagcattgtcaaaaaagttcctatagaa
caagcaattaatcaagttagagatttgatactaaaaaataaggctctcctgccagagggg
gctaaagagcctataatatctactgaaagcttttctgttttaccaatgatgtatattgcg
gtgagttctaagaacaatgtatcagctactgctgatgatattgagttgatcaaaaaaaag
cttaaatatgtcgatggtgtagccaatacatctagttttggtatgactgaaaaagtgatc
aatatcgatattgatcctgaaaagattgcaaaatattatattccgttagatagtattctt
gcttcgttaacactacaaaacagtgatttctctggtggtaagttatcaaatcaatataaa
acagagtatatttcttttgatacagcaattaataagttgagtgattttggtgaaatcaat
ttagaaagtaataatgttgctataaaattaaaaaatattgccagcattacaatatcagat
aaagaagcacttagccttgcttattttggtatggataaaattgttttattaggtattttt
gctaagtcggatgcaaatccaatcgatgtatcaaagagtgtaaaacatttcctagaacat
tatgaaaaagccaatccccaatttatctttcaggttattatcgatgatagccaagatatt
ttacaagcatttcaagaagtaagaaaaactttgcttgaatcggtcttgttggtgtcagta
attgttttactgctaatgggatcattgcgatattcaattatcgcaatttgtgcaattcca
gtttcgcttgcagcttgttttgttatgctgtacttatgtggttttacactcaatgccata
acaatgttggctatggtactggctatagggttagtggttgacgactctattgtagtgatt
gaaaatgctgaacattattatcggaagaataaagatgctttaactagtatattgcaagca
atttatagtctttttttatctgttttaatattgatgtttacgctagtagtaatatatgtc
cctattttgtttattaaaggagaagtaggaaaaattttgcaggaatttgctttgtcagta
attgcttgtttagtgatgtcctttatcgttgcatttaccttaacacccatattgttttta
aaactagcaaataatacgcatgaaagcaaatttgttcaaattgttaataagacattggat
atgattacatacaaatatcaggagtctttattttttattatacgccatgccaaaatattt
ttatccttggtggctgtcgttgtagcggctggtacatatgttgcagttaacaatatgaaa
atagaaattgagccatttgaaaaaaaagatatgcttatacttactaacacctttatggtt
aataccaatttaagttacatccatcactatatggagaaaattactaaagtaatcaaggat
aatgataatattaaatatactctgagtattgaagaatcaccacgttcaacgatttggttg
atattaaaagataaaactaaagcagtacaaacattgcatgaaattgaagctaaactagca
aaaatagcagtgggtggagatatttcagtgaaatttgctcaagggaaaaatgctggttca
gcaaagggtaacgttgagttaagcttttatgtcaataaccaatcatccatggagaatgct
tggcaggctgttcattttatacagactaactcaaaagatttatttactaatgttatagct
attgaggcttcacctgtacaagattataaaatttggtgtaatcaagataagttatttaaa
tatggtttaagtcagaaagatatatcaagtacgttagacattctgtttaatgctaggaag
atagggagctttaagcactatgataatagctatgatgtcatcgctaaatcagatcctaaa
tttggcaaaacactaagtaatatacaaaatatgttcattacaacacagaaaaatggagaa
aaccttattcagcttaaggatatatgtgatattaatagggtgaataccgttaatcaaatt
atgcgttataatgagcaatattccattgaagtaattgccactgctaaacatggtattaaa
ttgcaggatgcagttcattttattaatcagttaaacagcaagttaccaaatgatagtgat
attagctatagtgagcaaacgcaaatacttattgattcaacatcatcatttacagtacta
attttactatctgtacttggactctacttattaatgtttgcacgttttaacgactcaatt
ctatcactgtttattttagttgggggaattccagccgctttaagtgtagcattattaagc
ttatatttttctcaagggggattaaatatatatacgcaaatatcacttatcacattagca
ggattaatgactaagcatagtgtgttgttatgtagtgcaatgcatcagaagggacaaaga
actctaaaaacaatattaacagcggcaacatcaagaatcagggcaattttaattacttct
ttagctatgagtattggtttgttgtcacttttctttgataatggcaactatgccaatagt
cgttttcaaatggctatagttttggtaacagggattgttgttgggtcgatattaacactt
tatgtaacacctttgctttatgttggttttcatcaactgtcgaaagttagaagagctagg
gagcagtag
DBGET
integrated database retrieval system