Rickettsia felis: RF_1239
Help
Entry
RF_1239 CDS
T00252
Symbol
polA
Name
(GenBank) DNA polymerase I (POL I)
Organism
rfe
Rickettsia felis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
5_3_exonuc_N
5_3_exonuc
HHH_5
HHH_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAY62090
UniProt:
Q9RAA9
LinkDB
All DBs
Position
1303312..1306080
Genome browser
AA seq
922 aa
AA seq
DB search
MTQKNTLLLIDGYGFVFRAYYAQQPLTSPKGEPVGALYGFASMLLKLLSDFKPKHVAVVF
DSGGKNFRHHIYPEYKANRPPPPEDLVVQLPLVRDVASNLNFPILEKNGYEADDIIATFA
AKTAALGEDVVVISSDKDLLQLMGENIKIYDPLKGKYITEDDVVKKFGTTSDKLREVMAL
IGDRSDNIPGVPSIGPKTASSLITQFGSVENIFNSLEQVSSLKQRETLQNSKEAALISWQ
LIGLDSNVDLDFQLNNLEWSPPNSDKLTGFLQEYGFKSLYKRAENLFDIKINDHKEIVEN
KVTEAKEISNASELADFAKKAEKIGIFGIYLLQHKGDNVALILSLQNQSYIIKISNTSHD
LFSYNTKNNNDWFSDIIFNLLTDKSIRKITYSLKPLLKFYAEQSHEITAIEDLELMQYAL
SAGLSQKNLFEEALKEDNRHLSKPAYREEFKGDTEALATAAYKSVREDASTGSTSKLPLE
TKFGKMSNVINESARIVAEFTSLYKQNILELKDNKAFRLYSNIDLPICFILDKMEKIGIK
VDANYLNQLSAEFGAEILKLEEEIFALSGTKFNIGSPKQLGEILFEKMQLPFGKASAKAS
SYSTGAEILEKLSEHGYNIADLLLRWRQLTKLKNTYTDSLPKQIDNITHRVHTTFLQTST
TTGRLSSQEPNLQNVPIRSSEGNKIRQAFIAEEGYKLISADYSQIELRILSHIANIDALK
QAFINKDDIHTQTACQIFNLQKHELTSEHRRKAKAINFGIIYGISAFGLAKQLNVSNGEA
SEYIKKYFAEYKGVQEYMEQTKAFASSNGYVINFFGRKCFVPLIHDKKLKQFAERAAINA
PIQGTNADIIKIAMINLDQEIEKNNLKTRLVLQIHDELLFEVPEDEVELVTPIIKKIMEN
STNMDVPIITEIRVGNNWMEIH
NT seq
2769 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactcaaaaaaatactttattgctcatagacggatatggatttgttttcagagcctat
tatgcacaacagcctttaacttcaccgaaaggcgagcctgtcggtgctctttacggcttc
gcttcaatgctcctaaaattgctgagcgactttaagcctaaacatgtcgctgtagtattt
gacagcggcgggaaaaatttccgccatcatatttatcctgaatataaagctaaccgcccg
cctccacctgaggatttagtcgtacaattacctttagttcgtgatgttgctagtaactta
aactttcctattctagagaaaaacggttatgaagccgatgacattattgcaacctttgcc
gctaaaacagctgcactcggcgaagatgtagttgtcatctcttccgataaagatttattg
cagttaatgggtgaaaacatcaaaatatatgatccgttaaaaggaaaatatattacggaa
gatgatgtggttaaaaagttcggtactacttctgataaattacgtgaagtgatggcttta
atcggcgatagatcggataatatcccgggcgtaccgtctattggaccaaaaacggcaagt
agccttataacgcaatttggttctgtagagaatatatttaactctttagaacaagtctca
agcctaaaacaacgtgaaactttacaaaattctaaagaagcggcgttaatttcatggcaa
ttaatcgggcttgattctaatgttgatttagattttcagctgaataatttagaatggtca
cctccaaatagcgataaattaacaggatttttacaggaatacggttttaaatctttatat
aaaagagcagaaaatttatttgatattaaaattaatgaccataaagagatagtagaaaat
aaagtaaccgaagcaaaagaaatcagtaacgctagcgagttagcggattttgctaaaaaa
gctgagaaaataggaatattcgggatatatttactgcagcataaaggggataatgttgct
cttattttatcattgcaaaaccaaagctatattattaaaatttctaacacttcccatgat
ctattttcctataatactaaaaataataacgactggttttcggatataatcttcaattta
ctaaccgataaatctataagaaaaattacctactctctaaagcctctacttaaattctat
gcagaacaatctcatgaaattacggctatagaggatttagaactaatgcaatatgcgtta
tctgccggtttatcacagaaaaatttatttgaagaggctttgaaagaggataatagacat
ctttctaaaccagcttatagagaggaatttaaaggagacacggaagcacttgccaccgca
gcgtacaaaagcgtacgtgaggatgcgagtaccggatcgacgtctaaattacctctagaa
acgaagtttgggaaaatgtctaatgtaattaatgaatcggcaagaatagtcgccgaattt
acttcactttataaacaaaatatactggagcttaaagataataaagcctttagactttac
agcaatattgatttacctatttgttttattttagataaaatggaaaaaattgggattaaa
gtagacgcaaattatctaaatcagttatctgctgaatttggagcagaaattctaaaactt
gaagaagaaatttttgctcttagcggaactaaatttaatatcggttcaccaaaacaacta
ggtgagattttatttgaaaaaatgcagttacctttcggtaaagcttcggctaaagcgagc
tcttactcaacaggagcggaaatattagaaaagcttagcgagcatggatataatattgcc
gacttgttattaagatggcggcaacttacaaaattaaagaatacctacaccgatagttta
ccgaaacagatagataatataacacatagagtacatacgacatttttacaaacttctacc
actacagggagacttagctcacaagaacctaatttgcaaaatgtacctattcgctctagt
gaggggaataaaatcagacaagcttttatcgctgaagaaggctataaattaatatctgcc
gattattcccaaattgagcttagaatattaagccatatcgcaaatatagatgcactaaaa
caagcgtttatcaataaagacgatatccatactcaaacggcttgtcaaatctttaacttg
caaaaacatgaactaactagcgaacatagacgtaaagcaaaagccataaattttggtatc
atttacggtataagtgcttttgggcttgctaaacaattaaacgttagtaacggcgaagca
tccgaatatatcaagaaatattttgccgaatataaaggagtgcaggaatatatggagcaa
acgaaagcttttgcaagtagcaacggctatgtcataaatttctttggcagaaaatgtttt
gtacctctaattcatgataaaaagcttaaacaatttgcagaacgtgcagctattaatgct
cctattcaaggaactaatgccgatataattaaaattgctatgatcaatctagatcaagaa
atagaaaaaaataatcttaaaaccagattagtactgcaaattcatgatgaattactattt
gaagtgccggaggatgaagtagaactcgtaacgcctattatcaaaaaaattatggaaaac
tctactaatatggatgtaccgattataaccgaaattagagtaggtaataactggatggaa
attcattga
DBGET
integrated database retrieval system