KEGG   Rhinolophus ferrumequinum (greater horseshoe bat): 117031743
Entry
117031743         CDS       T07722                                 
Symbol
VPS13A
Name
(RefSeq) vacuolar protein sorting-associated protein 13A isoform X1
  KO
K19525  vacuolar protein sorting-associated protein 13A/C
Organism
rfq  Rhinolophus ferrumequinum (greater horseshoe bat)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:rfq00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:rfq04131]
    117031743 (VPS13A)
Membrane trafficking [BR:rfq04131]
 Endosome - Golgi transport
  Rab GTPases and associated proteins
   Rab associated proteins
    117031743 (VPS13A)
SSDB
Motif
Pfam: VPS13_N VPS13_M VPS13_VAB VPS13_C RRM_fung Mannitol_dh
Other DBs
NCBI-GeneID: 117031743
NCBI-ProteinID: XP_032978278
Ensembl: ENSRFEG00010011976
UniProt: A0A671EWH7
LinkDB
Position
12:42019343..42211377
AA seq 3173 aa
MVFESVVVDVLNRFLGDYVVNLDTSQLSLGIWGGAVALKNLEIKENALSQLDVPFKIKVG
HIGNLNLTIPWKHLYTQPVVAVLEDIYLLIVPSSIIKYDPLKEEKQLLEAKQQELKRIEE
AKQKVADQEKQLVEKQDTFTEKLITQIIKNLQVKISSIHIRYEDNITNRENPLSFGISLQ
NLSMQTTDQNWVPCLHDETEKLFRKLIRLDNLFAYWNVKSQMFYVNNYDESLYRLKSGVV
FENIVPEGYDFVFRPISANAKLQMNRRSDFDFSAPKINLDVELHDIAIEFNKPQYFSVME
LLESVDMMTQNLPYRKFKPDVPLHSHAREWWAYAIHGVLEVNVCPHLRMWSWKHINEHRQ
KMKQYKELYKKKLINKKPADELLNSLEELEKTLDVFNIIIVRQQAEVEVKKAGCKIYREG
SKDSEDNKGWFSWLWTWSEPDAKEQQADVKPASLEEMLTLEEKTLLYEAIGYSETAVDPT
LPKTFEAMKFYVHLKSMSIVLREKQRKPQLLDIVIEEFSTWIVQRPGAQAIKFETKIDSF
HVTGLPDNSIKPRLLSSLDGATSLFQITFETNPLDETVAQRCIIEAEPLEMIYDARTVNS
IVEFFRPPKEVNLAQLTSATLTKLEEFRDKTATGLLYIIETQKVLDLKINLKASYVIIPQ
DGIFSPTSNLLLLDLGHLKVTSKSRSDLPDMKQGVAKLEEIMQRAYDSFDIQLTSIQLLY
SRVGDNWKEARKLNVSEQHILVPLHFNLELSKALVFMDIRMPKFKIFGKLPLISVRISDK
KLQGILELIESIPNPAPAADGPAPIKSVQTQRSASLGASHVSQKMLPLLELTCIEEDSEE
EFYDAPCSPLEETCPTTASVKFNQQKKSQKLDFSKNIIQYKIRFEVPEVLIQFYHLVGDC
ELPVVEIDVLGLGTEIELRTFDMKATAFLKEFCLKCPEYFDENRKPVYLITTLDNTMEDL
LTLEYVKAEKNVPNLKSTYNNVAQLVKVNFSSLDIHLHTEALLNTLNYFNNIITQLEEKS
ASVHVIETEDKGEVIKKIASKRSRNEDIITLQILAELSCLQIFIQDQTRNISEIKIEGLD
SEVIMRPSVTEINAKLRNIIVLDSHVTAIYKKAVYITGKEVFSFKMISYADATAGSAYTD
MNVVDLQVNLTVGCIEVVFVTKFLHSILAFIDNFQAVKQALAEATVQAAGMAATGVKELA
QRSSRLALDVNIKAPVVVIPQSPVSENVFVADFGLITMTNTFHMIKESQSNPPPIIDLIT
IKLSEMRLYRTQFINDAYQKVLDLLLPLNLEVIVERNLSWEWYQEVPCFNVNAHLKPMEF
ILSQEDITTIFKTLCGNIWYEEGSSASPAGIKDQSSITSGVTNASHHSGGTTIVTAAVVE
VHSRDSQVKTTLNMSFRTDYLTMILYSPNPEQTSFTDVRDPSLKLAEFKLENIISTLKMY
TDDSTFSAFSLKNCILDDKRPHVKKATPRMIGLTVGFDKKDMMDVKYRRVRDGWVADLVL
QEIYICASVEFLLTVANVFLEAYTTGTAVETSVQAWTAKEEVPVQERVKWEVNIIIKNPE
IVFVADMTKNDAPALVITTQCEICWNGDFENSTMTAAIKDLQMRACPFLPVKRKDKITTV
LQPCDLFYQATQLGTDPQVIDISVKSLTLKVSPVIINTVIIITSALYTNKETTTQETASS
TAHLWEKKDTKNLKMWFLEEPNEVENIAPTTELVPKGEKIKMNIDSIFIVLEAGIGHRTV
PMLLAKSSFLGEGKNWSSLINLHCQLELEVHYYNEMFGVWEPLLEPLEIDQTEDFRPWNL
GIKMKKKAKRAIVESDTEEEDYKVPEYKTVISFYSKDQLNITLSKCGLVMLNNLVKAFTE
AATGSSAVFIRDLAPFMILNSLGLTISVSPSDAFCVLNVPMAKSYVLKNEESLNMDYVGT
KDNDHFSAMTSLSSKLFFILLTPANHSTADKIPLTKVGRRLYTVRHRESGVERSIVCQID
TVEGSKKVTVRSPVQIKNHFSIPLFVYDGDTLLGTVSPGNEFNVPLASYRSLLSLKPEGE
DYQMCEGIDFEEIIKNDGTFLKRKCRPINPSKKPFIINVVPEKDNLTSLSVYSEDGWDLP
YIMHLWPPILLRNLLPYKIAYYIEGIEHRVFTLNEGHSAQIYTVQVDKAKLHLKLLDYLN
HDWKSEYHLKPNQQDISFINFTCVTEIEKTDLDIAIHMTYNPGQAVIAFHSPYWMVNKTG
RMLQYKADGIHRKHPPDYKKPVLFSFQPKHFFNNNKVQLMVTDSELSDQFSIDTVGSHGA
VKCKGLTLEYQVGVTIDLSSFNITRIVTFTPFYMIENKSKYRISVAEEKNNKWLSLDLEQ
CIPFWPEDASNKLLIQVEGSKGPPQKIHFNKQENCMLLRLDNELGGIIAVVNLAEHSTVI
TFSDYHDGAATFLLINHTKNDIVEYKQSSLAEIEDSLPPGKAVFYTWADPVGSRKLKWIC
GKNHGEVTQKDDMMTAINSGKKTIYLVSFFEGLQRIILFTEDPQVFKVTYESEKAELAEQ
EIVLALQDVGISLINNYTKQEVAYIGITSSDVVWEIKPKKKARWKPMSVKHTEMLEKEFK
EYTESSPSEDKVIELDTNIPVRFTPSGSNMKILQPHLIAIRRNYLPALKVEYNTSAHQSS
FRIQIYRIQIQNQIHGAIFPFVFYPIKPPKSVALDSAPKPFTDVSIVMRSAGHSQISRIK
YFKVLIQEMDLRLDLGFVYALAELMTQAEVTEKTEVELFHKDTEAFQEEFKTVSLVDSSQ
VSLYEYFHISPLKLHLSVSLSSGKEEAKDSEQHGGLVAIRSLNLLLKSIGATLTDVQDVV
FKLAFFELNYQFHTTSELQSEVIRHYSKQAIKQMYVLILGLEVLGNPFGLIREFSEGVEA
FFYEPYQGAIQGPEEFVEGMALGLKALVSGAVGGLAGAASKITSAMAKGVAAMTMDEDYQ
QKRREAMNKQPAGLREGITRGGKGLVSGFVSGITGIVTKPIKGAQKEGAAGFFKGVGKGL
VGAVARPTGGIIDMASSTFQGIKRATETSDEVESLRPPRFFNEDGVIRPYRLRDGTGNQM
LQVMENGRFAKYKYFTHVMINKTDMLMITKSGVLFVTKGTFGQLTCEWQYSFDEFTKEPF
IVHGRRLRIEAKERVKSVFHAKEFGKIINFKTPEDAKWILTKLEEAREPSPSL
NT seq 9522 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggtgttcgagtccgtggttgtagatgtgttgaaccggttcttgggggactatgtggtg
aacctggacacgtcccagctctctctgggcatctggggaggagctgtggccctcaagaat
cttgaaattaaagaaaatgccctgagtcaactggatgtaccatttaaaattaaagttggt
catataggtaatcttaatcttacaattccatggaaacacctttatactcaaccagttgta
gctgtattagaagacatttatttactcatagtgccttcttctataataaaatatgatcct
ttaaaagaagagaagcaactcttggaagcaaagcaacaggagctaaaaagaatagaagaa
gcaaaacaaaaagtagctgatcaagaaaaacaactggtggagaaacaggacacttttaca
gaaaaattgattactcagatcataaaaaatcttcaagtgaaaatttccagcatccatatt
cgttatgaagataatatcacaaatcgagaaaacccactgtcatttggtatttcccttcaa
aatctcagcatgcagacaactgatcaaaactgggttccgtgtttacatgatgaaactgag
aaactatttcgtaagttaatccgattggataacctttttgcctattggaatgtgaagtct
cagatgttttatgttaataattatgatgaatcattgtacagattgaagagtggcgttgtc
tttgaaaatattgttccagaaggttatgattttgtattccgccctatatctgctaatgcc
aaacttcagatgaatcgtcgatctgattttgacttttctgcccccaagataaacctggat
gttgagttacatgacatagcaattgaatttaataaaccacagtatttcagtgttatggag
cttcttgaatcagttgatatgatgacgcaaaatctgccatataggaaattcaaacctgac
gtacctcttcactcccatgccagagaatggtgggcttatgctatacatggtgttcttgaa
gtaaatgtttgtccccacttacggatgtggtcgtggaagcatattaacgaacacagacaa
aaaatgaagcaatacaaagaactatataaaaaaaagctaataaataagaagccagctgat
gaacttctcaactctttggaggagttggaaaaaactctggatgtatttaatataattata
gtgagacaacaggcggaagttgaggtaaagaaagctggatgcaagatttacagagaagga
tcaaaagattcagaggataataaaggatggtttagctggttgtggacttggtcagaacca
gatgctaaagaacagcaggcagatgtgaaacctgcaagtcttgaagaaatgttgacactt
gaagaaaaaactttactgtatgaagcaattggctatagtgaaacagcagttgatccaacc
ttgccaaaaacatttgaagccatgaagttttatgttcacttgaaaagtatgtctattgtt
ttaagagaaaaacaacgaaaacctcagctgttagatattgtaatagaagaatttagtact
tggattgtgcaaagaccaggagcacaagcaattaaatttgaaaccaaaattgattcattt
catgttactggtttaccagacaattcaataaaaccccgcctcctgtcttcattggatggt
gctacatcacttttccaaattacttttgagacaaatccattagatgaaactgttgctcaa
aggtgtatcatagaagctgaacctttagaaatgatatatgatgccagaacagtgaatagt
atagtggaattcttcagacctccaaaagaggtaaatctagcacagctcacttcagcgact
ttgactaaacttgaagaatttcgtgacaagacagcaacaggtctactatatattattgaa
acacagaaagtgcttgatctcaaaattaatttgaaagcttcatatgttattatcccacaa
gatggaatttttagccctacatcaaatctgcttcttttggatcttggtcatttaaaggta
acaagtaaaagtcgttcggatttaccagatatgaaacaaggtgtggccaaacttgaagaa
ataatgcaaagagcttatgactcctttgatattcagcttacaagcatacagctgctttac
agcagagttggtgataattggaaagaagcacgaaaactcaatgtatccgaacagcatatt
ttggtacctctgcacttcaacttggaactctctaaggccttggttttcatggacataagg
atgcccaaattcaagatttttggaaagttacccctgatttctgtacgaatctcagataaa
aaactgcaagggattttggagttaattgaaagcattccaaaccccgcccctgcggctgac
ggacctgcccctatcaaatcggttcagactcaaagatctgcttctttgggagcatcacat
gtttcacagaaaatgttgcctctcttggaacttacatgtattgaagaagattcagaggag
gaattttatgatgcaccatgtagtccgttggaagaaacttgtccgacaacggctagcgtt
aaatttaatcaacaaaaaaagtctcaaaagctggatttttcaaaaaatattattcagtat
aaaataagatttgaagtgccagaggtattgattcaattttatcaccttgttggagattgt
gaactacctgtggtagaaattgatgttttaggattgggcacagaaattgagcttagaaca
tttgatatgaaagccactgcctttttgaaagaattctgtttaaaatgcccagaatacttc
gatgaaaacaggaagccagtttatttgattaccacgctggataacacaatggaagatctc
ttaacactagaatatgtgaaggctgaaaagaatgtacccaacttgaaaagtacctataac
aatgttgcacaactggttaaggtgaatttttcctctttggatattcatttgcatactgaa
gcacttctgaatacactaaattattttaataatattattacacaattggaggaaaagtca
gcctcagtgcatgttatagagactgaagacaaaggagaggtcattaaaaaaatagcttca
aaacgatccaggaacgaagatattattaccttgcagattttagcagaattatcatgtttg
cagatctttattcaagatcagacacgtaacatttctgaaattaaaattgaagggcttgat
tctgaggtgattatgaggccttcggtaactgaaataaatgcaaagctaaggaatataatt
gttttggattctcatgtaactgctatatacaaaaaggctgtgtacatcactggaaaggaa
gttttcagcttcaaaatgatttcttatgcggatgcaactgctggttctgcatacacagac
atgaatgtggttgaccttcaggttaatttaactgttggttgcattgaagtagtttttgtc
acaaaatttctacattctatattggcttttatagataattttcaagcagttaaacaagcc
ttggctgaggcaactgttcaggcagcaggaatggctgcaactggtgtaaaagaactggca
caaaggagttctagattggcattagatgttaacatcaaagccccagttgtggtcatccca
cagtctccagtttctgaaaatgtttttgttgctgattttggactaatcacaatgacgaat
acattccatatgataaaagagagccagagcaaccccccacccattattgatttgataaca
ataaagctgagtgaaatgcgactatacaggactcaatttattaatgatgcctaccagaaa
gtactggatctattactgccattaaatcttgaggtgattgttgagcgaaatttatcctgg
gagtggtaccaggaagttccttgttttaatgtaaatgctcacctaaagcccatggagttc
attcttagtcaagaggatataacaactatttttaaaacattatgtggtaatatatggtat
gaagaaggcagtagtgcctcaccagcaggaataaaagatcagagtagtattactagtgga
gttactaacgcgtcacatcattcaggaggaacaactatagtgacagctgctgtggttgaa
gtacattcacgtgactctcaagttaagacaacactaaatatgagtttcagaactgattat
ctcaccatgatactgtatagtccaaatccagaacagacttcgtttacagatgttcgtgat
ccttctctgaaacttgctgaatttaaattggagaatataataagtactttaaaaatgtat
acagatgactcaacattttctgccttctcattaaaaaactgtattttagatgataaaagg
cctcatgtcaagaaggcaactcctagaatgataggactgacagtcggatttgacaaaaag
gacatgatggatgtaaagtatagaagagtcagagatggttgggtggctgacttagtcctt
caagaaatatatatttgtgcaagtgtggaatttctgctgacagttgcaaatgtctttctt
gaggcctacaccacaggcacggctgtagaaaccagtgttcaagcatggactgctaaggaa
gaagtacctgtacaggaacgagtgaaatgggaagttaatattattattaaaaatcctgaa
attgtgtttgtggctgatatgacaaaaaatgatgctcctgccttagtcattacaacacaa
tgtgaaatttgttggaatggtgactttgaaaacagtacaatgactgctgctattaaagat
ctccaaatgagagcatgcccatttcttccagtcaagagaaaagacaaaatcactactgtt
ttgcagccctgtgatttgttctatcaagctacgcagctaggtacagatccacaagtgatt
gatatatcagtaaaatctctgacactaaaggtttcaccagttatcataaatactgtgatt
atcataacttcagcactttatacaaataaggaaaccaccacacaagaaactgcttcttct
acagcacatttatgggagaagaaggatacaaagaatttaaaaatgtggtttcttgaagaa
ccaaatgaagttgaaaacatagctcccacaactgaattggtacccaaaggagagaaaata
aaaatgaacattgattctattttcatagttcttgaggctggaattggtcatagaacagtg
cctatgcttttggcaaaatcaagttttttaggggaaggcaaaaactggagttccctcata
aatctccactgtcagcttgagctagaagttcattattataatgaaatgtttggtgtatgg
gagcctttgcttgaacccttagaaattgatcagactgaggattttagaccatggaatctt
ggaatcaagatgaaaaagaaagcaaaaagggccattgttgagtcagatactgaagaagaa
gattacaaagtgccagaatataaaactgttatcagtttctattcaaaagaccaactaaac
attacattatccaaatgtggtcttgtaatgttaaataatttagtcaaggcatttacagaa
gctgccactggatcttcagctgtcttcataagggatctagcaccatttatgattttaaat
tctcttggacttactatctctgtttcaccaagtgatgctttctgtgtactcaacgttcca
atggcaaaatcatatgtattgaaaaatgaggagagtttaaatatggattatgttggaact
aaagacaatgatcatttcagtgcaatgaccagcttaagcagcaaacttttcttcattctc
cttacacctgctaatcactctactgctgataaaattcctttaacaaaagtgggacgacga
ctgtacactgtaagacacagagagtctggagttgaaagatctattgtttgtcaaattgat
acagtggaaggaagtaagaaggtaacagttcgctccccagtgcagattaaaaatcacttt
tcaatcccactttttgtttatgatggagatactttattgggaacggtttcacctggaaat
gaatttaacgtaccactagcatcttaccgatcactcctttctctgaagccagaaggcgag
gactatcaaatgtgtgaaggaattgactttgaagaaattataaaaaatgacggcactttt
ctaaaaaggaaatgtagacctataaacccttccaagaaaccatttatcattaatgttgtc
ccagaaaaagataacttgacatctctgtcagtatattcagaagatggttgggacttacca
tacataatgcatttgtggccacctatcctactccgaaatcttcttccttacaaaattgct
tattatatagaggggattgaacatagagtttttactctaaatgaaggacattcagctcag
atttatactgtacaagtggataaagccaagctacatttaaaattacttgactatctaaat
catgattggaaaagtgaatatcatctaaaacctaatcaacaggatattagtttcatcaat
ttcacctgcgttacagaaatagaaaagactgatttagatattgctatccatatgacttac
aatcctggccaagcagttatagcatttcatagtccttattggatggtcaataaaactggt
cgaatgttacaatataaagcagatggaattcatcgaaagcatcctcctgattataaaaag
ccagttctcttttcttttcagccaaagcacttttttaataacaataaggttcaacttatg
gtaactgacagtgaattgtcagatcaattttcaattgatactgttggtagtcatggagct
gttaaatgtaaaggcctgacattggaatatcaagttggtgtcactattgacctcagcagt
tttaacattaccagaattgtaacatttacccctttttatatgattgaaaacaaaagcaaa
tatcgtatatcagtggctgaagagaaaaataataaatggctctcccttgatttggagcag
tgtattccattttggcctgaggatgcttcgaataaacttcttattcaagttgaaggaagt
aaaggccctccacaaaagatacattttaacaagcaagaaaattgtatgttattgcgtctg
gataatgagcttggaggtattatagcagtagttaatttggctgagcattctacagttatt
acattttcagattatcatgatggagcagctacattcctgttaataaatcatactaagaat
gacattgttgaatacaagcaaagttctcttgctgaaatagaagattcactccctcctgga
aaagcagtattttatacatgggctgatcctgtgggctctagaaaactgaagtggatttgt
ggaaaaaaccacggtgaagtaacacaaaaggatgatatgatgacagctataaattcggga
aaaaaaactatttatttagtttcattctttgaaggcttacaacgcattattttattcact
gaagatccacaggtatttaaagtgacatacgaaagtgaaaaagcagagttagcagagcaa
gaaattgtgttggcattacaagatgttggaatttctctcatcaataattacacaaagcaa
gaagtagcctatattggcattacaagttctgatgtggtttgggagataaagcccaagaag
aaggcaagatggaagccaatgagtgtaaagcacactgagatgttggagaaagaatttaag
gaatatactgagtcttcaccttcagaagataaggttattgagttggacactaacattccg
gttcgcttcacacctagtgggagtaacatgaaaattctgcaaccacatctaatagctata
cgaagaaattatctcccagcgttaaaagtggaatataacacatctgcacatcaatcatca
tttagaattcaaatttacagaatacaaatccaaaaccagatacatggtgctatatttcca
tttgtgttttatcctattaaacctcccaagtcggtcgccttggattcagcaccgaagccc
tttacagatgtcagtattgtcatgagatctgcagggcattcccagatatcacgtattaaa
tacttcaaagtgttgatacaagaaatggatctcaggttagatcttgggtttgtctatgct
ttagcagaacttatgacacaagctgaagtaactgaaaaaacggaggttgaactttttcat
aaagatacagaagctttccaagaagaatttaaaacagtttcattagtagattcatcacaa
gtcagtctctatgaatactttcatatatctcctctcaagttgcatttaagtgtttcactg
agttcgggtaaagaagaagctaaagattcagaacaacatggaggattggttgcaattcgt
tctttaaatcttttactgaagagtattggtgccactctgacagatgtacaagatgtagtt
tttaagcttgcattttttgaactcaactatcagtttcatacaacatctgaactgcagtct
gaagtaataagacactattcaaaacaggccattaagcagatgtatgtactcattcttgga
ctcgaagttttgggaaatccctttggcttgatcagagaattttctgaaggtgtagaagca
tttttttatgaaccttaccagggagccatccagggtcctgaagagtttgttgagggaatg
gcactaggactgaaggcattagttagtggagctgttggtgggttagctggtgcagcctcc
aaaatcaccagtgctatggctaaaggagtagcagctatgactatggatgaagactaccaa
cagaagaggagagaagctatgaataagcaaccagccggtcttagagaaggcatcactcgt
ggaggaaaaggcttagtttctggttttgtaagtggcataacaggaattgttacaaaacca
atcaaaggagctcaaaaagaaggagcagctggtttctttaaaggtgttgggaaaggttta
gttggagcagtggcgaggccaactggaggcatcatagacatggctagcagtacgtttcag
ggaataaaaagggctacagagacttcagatgaagtggagagtctgcgaccccctcggttc
tttaatgaagatggagttatcagaccttacaggttgagggatggtactggaaatcaaatg
ttacaggtcatggaaaatggaagatttgcaaaatacaaatattttacccatgtcatgatc
aataaaaccgatatgttaatgataaccaaaagtggtgtattgttcgtaacaaaaggaaca
tttggacagcttacatgtgagtggcagtacagttttgatgagtttaccaaagagccattc
attgttcatgggagaagattgcgcattgaggcaaaggaacgggtgaagtctgtattccat
gccaaagagtttggaaaaataattaacttcaagaccccggaggatgctaagtggatcctc
acaaagctagaagaagcaagagaaccttccccaagcctctga

DBGET integrated database retrieval system