Entry |
|
Name |
(GenBank) hypothetical protein
|
KO |
K21449 | trimeric autotransporter adhesin |
|
Organism |
rgl Rhodanobacter glycinis
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:rgl00001]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:rgl02000]
CS053_16100
Transporters [BR:rgl02000]
Other transporters
Pores ion channels [TC:1]
CS053_16100
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
complement(3620390..3626122)
|
AA seq |
1910 aa
MNHIYRLVWCKSLNALVVASELSSRQHGGVSASSRSGKTAKLLSIALLGMGGFIYATGAF
AQSTGNVKLDDLQSLVSKYDAPLVGATSSGTVQAVVGAPVTVVKQTLSSLPVGSTLGQVG
QVVKSTLASVPPVHAGAHLSTPVAHVHAGVRINHHGVAIGAGVRTSSLASAVASVTNQVS
GLPVAGKVLSGVGGVVNTVAAAVPPLHLGVGVTVGAPSAMEPMVADRQRYDSHVSSQARA
LGIADGNGGGLPTQVIDGVVANVAKVPVVGPIVGQVGGALTSVASGAGNPAGALGNVVGT
VTGATSQIPVVGPVVGQVAGALGSVTSGAGNPTGALGNVVGTVTGATSQIPVVGPVVGQV
AGALGSVTSGAGNPTGALGNVIGTVTGATSQIPVVGPVVGQVAGALGSVTSGTGNPAGAL
GNVVGTVTGATSQIPVVGPVVGQVAGALGSVTSGAGNPAGALGNVVGTVTGATSQIPVVG
PVVGQVAGALGSVTSGAGNPTGALGNVVGTVTGATSQIPVVGPVVGQVAGALGSVTSGAG
NPTGALGNVIGTVTGATSQIPVVGPVVGQVAGALGSVTSGTGNPAGALGNVVGTVTGATS
QIPVVGPVVGQVTGALGSVTSGQNDLGTTLGHVVGGVVNNGAKLPLLGDTVASVGQALKT
VTSGGDLGSGLQGQLGQVVGGVVNSLAQQPGVGPVVAKVGQTLQETTAQIGNGSGGNGGL
GGGLTGVVGKVVGGVVGATSKVPVVGPVVGQVGGALASATSGGGDLTGTLGHVVGTVAGA
TSKVPVVGPVVGQVAGALGSATSGGGDLTGTLGSVVGTVTGAAAQVPVVGPVVAQVGDAL
TSVTSGSGDATGLLGNVVGTVADATSQVPVVGPVVSQLGGALGSVTSGSGGLLPMTSSGA
APMSSAAMAPNNVAMASASPAAVPVVPPPSATPTGLIIGNGGVVGTATQLLGSTESSIFN
NSNPSGYITNGSLKVSNANFSQGYSTLNLLGLPVVNSTPVGTVLTTVGGTTLGGTGSNSH
LTLIGGVTSGNYISNINNGAAGGLLGLVLPKNAPAWASTCLNVLGVLKESCWAVNAAQDN
QVLVGDGASANGSEEVVIGTNASHTLPTVDASKAFPGNGTNDPNNPTGVPTADYAARLGH
SVVIGDGASGTANAQTIIGAGATSSVANSVALGFNSNASRGEQMNYTAYGLATPQTSVGE
VSIGSPGAERQITNVAAGSANTDAVNVAQLKGVAATADNSVQYDSTSHTLVTLAGPASTD
GGVTGGTTITNLHQGALSATSTDAVNGSQLFATNSSLVKYMGGTTNFDPTTNTWTAPTFS
ITSVAIDGSTTKGSYNNVTDAFAAVDNSVNTINDRIKNINEVGSKYFQANSTGPAANAKG
TDSVAVGPSSVASGASSMAMGNGATASSANAVAIGTGAIAQNGSAVSIGNGNTADGDGAV
AMGDPNTATGQGAVALGYNNAATGQGAIAMGSTSIANGASAIALGDSANASAANAMAFGA
GATASMANSIALGAGSSAVIGALSGYTAYGLTAPQTSAGEVNVGNRQITGVAAGSAASDA
VNVAQLEAVDNKANSTDKLAVKYDADTSGDPTNTITLTGNGTGSQVLITNLAAGAESATS
TDAVNGSQLWHWTQDTTNQYSNLSLYNDIQNIHPGTGSVKYFNVNSTGPDSKATGSDSIA
IGPSATSGGKDSMAMGNGANASADNSVAIGAGSVADRANTVSVGSAGNERQVTNVAAGTA
KTDAVNVGQLDSAISTTTKGNVRYDTNTDGSINYGSVTLGNGGTGDTTVHNVAAGTAPTD
AANVGQVQQAMDWSKSYTDQQVGQLNGQIQRVGDRANAGIAAAMATAGLPQAYEPGRSMA
AIAAGSFRGESSIAVGVSTISEGGRWVYKLAGSADTRGDAGVSIGAGMQW |
NT seq |
5733 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgaaccacatctatcgccttgtctggtgcaagtccctcaatgccttggtggtcgcctcg
gagctgtcgtcgcggcaacatggaggcgtttccgcctcgtcgcgcagcggcaagaccgcg
aagctgctgtcgatcgcgctgttgggcatgggtggcttcatctatgcaaccggcgcattc
gcgcagtccacgggcaacgtcaagctggatgacctgcagtcgctggtgagcaagtacgac
gcgccgctggtcggtgcgacttccagcggcacggtgcaggcggttgtcggcgcaccggtg
acggtggtgaagcagacgctttccagtttgcctgtgggcagcacgctcgggcaggttgga
caggtggtgaagtcgacgctggcttcggtgccgccggtgcatgccggtgctcatctgtcg
acgcctgttgcccatgtgcatgcgggcgtaaggatcaatcatcacggagtggccatcggg
gccggtgtacgtaccagctcgctggccagcgcagttgccagcgtaacgaaccaggtttcc
ggtttgccggtggccggaaaggtgctgtccggcgtgggtggtgtggtgaacacggtggca
gcggcggttccgccgttgcatctgggtgttggcgtgacggtgggcgctccttcggcgatg
gagccgatggtggcggatcgccagcgctatgactcccatgtttccagtcaggcgcgtgcg
ctgggtatcgccgatggcaacggcggcggcctgccgacccaggtcatcgacggcgtggtc
gccaacgtcgcgaaagtcccggtggtgggtccgatcgtgggtcaggtgggcggtgcattg
acgtccgtggcatcgggcgccggcaatcccgcgggcgcgctgggtaacgtggtcggcacg
gtgacgggtgcgacctcgcagattccggtggtcggcccggtggtaggtcaggttgcgggc
gcgctgggttcggtgacgtccggcgccggcaatcccacgggtgcgctgggtaacgtggtc
ggcacggtgacgggtgcgacctcgcagattccggtggtaggtccggtcgtgggccaagtt
gcgggtgcactgggatcggtgacgtccggcgccggcaaccccacgggtgcgctgggtaat
gtgatcggcacggtgacgggtgcgacctcgcagattccggtagtgggcccggtggttggc
caggttgcgggtgcgctgggatcggtgacgtccggcaccggcaatccagcgggcgcgctg
ggtaacgtggtcggcacggtgacgggtgcgacctcgcagattccggtggtgggccccgtg
gtgggtcaggttgcaggtgcgctgggatcggtgacgtccggcgccggcaatcccgcgggc
gcgctgggtaacgtggtcggcacggtgacgggtgcgacctcgcagattccggtggtaggt
ccggtggtgggtcaggttgcgggcgcgctgggatcggtgacgtccggcgccggcaatccc
acgggtgcgctgggtaacgtggtcggcacggtgacgggtgcgacctcgcagattccggtg
gtaggtccggtcgtgggccaagttgcgggtgcactgggatcggtgacgtccggcgccggc
aaccccacgggtgcgctgggtaatgtgatcggcacggtgacgggtgcgacctcgcagatt
ccggtagtgggcccggtggttggccaggttgcgggtgcgctgggatcggtgacgtccggc
accggcaatccagcgggcgcgctgggtaacgtggtcggcacggtgacgggtgcgacctcg
cagattccggtggtgggtccggtggtaggtcaggtcacgggtgccttgggctcggtgact
tccggccagaacgatctcggcacgacgctcggtcatgtggtgggaggcgtggtcaacaac
ggcgcgaagttgccgctgcttggcgataccgtggccagcgtcggtcaggcgctgaagacg
gtgacttcgggtggcgacctcggtagcggcctgcaaggccagttgggccaggtagtcggt
ggcgtggtgaattcgctggcacagcagccgggcgttggtccggtggtggccaaggtgggt
cagaccctgcaggagacgactgcgcagatcggcaacggcagcggcgggaatggcggcctt
ggcggcggtctcacgggtgtcgtgggcaaggttgtgggtggcgtggtgggtgctacgtcg
aaggttccggtggtgggtccggtggtgggccaggtcggcggtgcattggcatcggcgaca
tcgggcggtggtgatctcaccggcacgcttggtcacgtggtgggtacggttgccggtgcc
acgtcgaaggttccggtggtcggcccggtggtggggcaggtcgctggcgcgctgggatcg
gcgacatcgggcggcggtgatctcaccggtacgcttggcagtgtggtcggtaccgtgacg
ggtgctgctgcacaggttccggtggtcggtccggtggtggcgcaggtgggtgatgcgctg
acttcggtgacctcgggcagtggcgacgccacgggcctgctgggcaacgtggtgggtacg
gtggcggatgccacttcgcaggttccggtggtgggcccggtggtgtcgcaactgggtggc
gcactgggttcggtaacctcgggtagtggtggcctgttgccgatgacttcatccggcgcc
gcgccgatgagcagtgccgcgatggcacccaacaatgtggccatggcctcggcttcgccg
gcggccgtcccggtggtgccgccgccgagtgcgacgcccacgggcctgatcatcggcaac
ggtggcgtggtcggtacggcaacgcagctgctcggttccaccgagagctcgatattcaac
aattcgaacccgagcggctacatcaccaatggcagcctgaaggtgagcaatgccaacttc
agccagggttattcgacgctgaacctgctcggtctgccggtggtgaattccacgccggta
ggcaccgtgttgaccacggtgggtggtaccacgctgggtggcacgggcagcaactcgcac
ctcaccctgatcggtggcgtgacctccggcaactacatttccaatatcaacaatggcgcg
gcgggcggtctgcttggcctggtgttgccgaagaatgcccctgcatgggcttccacctgc
ctcaacgtgctcggcgtgctgaaggaatcgtgctgggcggtgaatgcggcgcaggacaac
caggtgctggtgggcgatggcgcctcggccaacggttcggaagaggtcgtgatcggcacc
aatgccagccatacgctgcccacggtggatgccagcaaggcattcccgggcaatggcacc
aacgatccgaacaatcccaccggcgtgccgacggcggattacgccgcgcgcctgggccat
tcagtggtgatcggcgatggcgcttcgggtaccgccaacgcgcagaccatcatcggcgcg
ggagcgacttccagcgtggcgaacagcgtggcgcttggtttcaattcgaatgcctcgcgt
ggcgagcagatgaactacaccgcctacggtctggcgacaccgcagacctcggtcggcgaa
gtgtccatcggttcgccgggcgcggaacgccagatcaccaacgtggcggccggcagtgcc
aacaccgatgcggtgaacgtggcgcagttgaagggcgtggcggccacggccgacaactcg
gtgcagtacgacagcaccagtcataccctggtgactctggccggcccggccagcaccgat
ggcggcgtcaccggcggcaccaccatcaccaacctgcatcagggtgccttgagcgccacc
agtaccgacgcggtgaacggcagccagttgttcgccaccaactcgtcgctggtgaagtac
atgggcggcaccaccaacttcgacccgaccacgaacacctggacggcaccgacgttctcg
atcacctcggtggcgattgatggcagcaccaccaagggcagctacaacaatgtgacggat
gcgtttgccgcggtcgacaactcggtgaacacgatcaacgaccggatcaagaacatcaac
gaggttggcagcaagtatttccaggccaactccacggggcctgccgcgaacgccaagggt
accgacagcgtggccgtcggaccgtcttccgtggcttccggtgccagcagcatggcgatg
ggcaacggcgccacggccagctcggccaacgcggtggcgatcggcaccggtgcgatcgcg
cagaacggcagtgccgtgtcgatcggcaacggcaacaccgccgatggcgacggtgcggtg
gcgatgggcgatccgaacacggccacgggccagggtgcggtcgcactgggttacaacaac
gcggccactggccaaggtgcgattgcgatgggttcgacttccatcgccaatggcgcaagc
gccattgcattgggcgacagcgcgaacgcttccgccgccaacgcgatggccttcggtgcg
ggtgccacggccagcatggccaacagcattgcgctgggtgccggctcctccgccgtgatt
ggtgcactgagtggttacacggcctacgggctgaccgcaccgcagacgtcggcgggcgaa
gtgaacgtgggcaaccgccagatcaccggcgtggccgccggctcggccgccagcgatgcg
gtgaacgtggcccagctggaggcggtggacaacaaggccaacagcaccgacaagctggcg
gtgaagtatgacgccgataccagcggtgatccgaccaacacgatcacgctgaccggcaac
ggcacgggttcgcaggtgctcatcaccaacctggccgcgggtgcggaaagcgccaccagt
accgatgccgtgaatggctcgcaactgtggcactggacccaggacaccaccaaccagtac
agcaacctcagcctgtacaacgatatccagaacatccatcccggtacgggcagcgtgaag
tacttcaacgtgaactccaccggtcccgactccaaggccaccggcagcgacagcatcgcg
atcgggccctccgccacgtccggtggcaaggacagcatggcgatgggcaacggtgcgaat
gcctcggccgacaactcggtggcgatcggcgctggctcggtggccgaccgcgccaacacg
gtctcggtgggcagtgccggcaacgagcggcaagtcaccaatgtggcggcgggtacggcg
aagaccgatgcggtgaacgtgggccagctggattcggcgatcagcaccaccaccaagggc
aacgtgcgttacgacaccaacaccgacggcagcatcaactacggcagcgtgaccctgggc
aacggcggtaccggtgacaccaccgtccacaacgtggcggcaggtactgcgcccaccgat
gcggcgaacgtgggccaggtgcagcaggcaatggattggtcgaagagctataccgaccag
caagttggccagctcaacggccaaatccagagggtgggcgatcgtgccaacgcgggcata
gcggcagcgatggccacggcgggcctgccgcaggcttacgagccgggtcggagtatggcg
gcgatcgcagccggctcgttccgcggcgaatccagtatcgccgtcggcgtttccaccatt
tcggaaggtgggcgctgggtctacaagctggccggttcggccgacacgcgtggcgacgcg
ggtgtctcgatcggtgcgggcatgcagtggtag |