Rodentibacter haemolyticus: IHV77_03770
Help
Entry
IHV77_03770 CDS
T07810
Name
(GenBank) hemagglutinin repeat-containing protein
KO
K15125
filamentous hemagglutinin
Organism
rhae
Rodentibacter haemolyticus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rhae00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
rhae00536
]
IHV77_03770
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
rhae00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Microbial pathogens
IHV77_03770
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
Fil_haemagg_2
ESPR
Fil_haemagg
B_solenoid_ydck
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QPB43234
UniProt:
A0ABX6UZM5
LinkDB
All DBs
Position
complement(759583..768852)
Genome browser
AA seq
3089 aa
AA seq
DB search
MNKKCFCVIFSNTLQRLVVTSELAKSADKSSSGEKHQSAVSFEAIWATLKPLSFSLFCAL
GFVVFSSQAVADTLIIKADPNAPKNQQPIVLQTANGLPQVNIQTPNDKGLSHNKYQDFNV
DTKGAILNNSRKTTLTQQAGMVQGNPYLVRGEAKVILNEVTSNNPSQLKGYLEVAGKKAE
VIIANPNGLYCDGCGTINAARSTMTTGKPQIKDGQIESFKIERGKVKVNGKGLDNSRVDY
TNILAREAEINAGLWAGKKLNVVTGQNEIKQASLENADNDLQITRISSEKLAENQPHFAL
DVSELGGMYAGKIHLVGTEQGLGVRNAGHIGASAETLTVDSQGKIVNSGILNAQRQITLK
TPKEIENNGRIEAKTQHIELQSNANIKQNGNVIAQAGGISASAKNTISQRGETVAKGKIS
YKANDISAAQSALIAAGVTTTQTANGETRQLDSQSAQGANIDIQAENKAQLASRHMASGK
LNINAQSVNLDNSQNHAYDIVVIAKSGDVQADNSRLSAVENLRISTPKTLSTQNSQLAAN
RIQTSQQNLHTQNALWQQFGTGDFSLNARHIQNQGGTFSTGGDFNVNADDIDNTSGRLIA
GQNLTIKISDKLNSAQGMLFANNNLSLQANQLMNTNGLIKSLGNMSLNIRDISNRQTNIS
DNIQKGIIALGHLAVNSATVDNTLGFIGSNRNLAINADKLFNDSGKVYAAQQAELRLNNG
YYSRGGQLQASSLSITTPIIEQQQGNITVNHQLNIIGDSLVSANRSTISANEINMKLAKS
LTQSESAILGNHSVVIDVKGGLDNTNSTVASRHNDLVINTDNATLNNAKGTLFAKENLRL
NSGNLNNDEGIVQSKSNATLRVNEISNKDGVIMANSAEVISAGINNEKGMVFTHTALNIV
SNVLNNAKGSIISLGELNINTQGEALNNLQGQIFANAVKLNSGAINNQQGLLRGDKTLVI
DTNNQQLNNQQTQEERQGIVGLGSVVLNNISQLNNTQGRIATAENLAINTRTLTNTKGIV
NAQAQTTIHADQIDNQKGSIWGANTHLNAATINNRKEGQNGSLIGANDTLNITAIQLNNQ
QTVATGDKPNQGLQAKNIQLNTAELNNRQGGIYATNTLSAIIENQFNNQAGEFLAGQTAK
IYSQANQLVVDNLAGTIEAGQQLNLKAKTLQNEGTIKTQGNAEIVLTDNFTLNQAFQVGN
NLTFSTLGDFVNNVKQIVGNQASFSAANLINHQNAEISANRTLINTGTITNYGLLDGTEN
IIKTGTLNNLGSGRIYGDHLAIQAEKLNNLNQGEKSATIAARERLDLGVGTLINRDHSLI
FSIGDIAIGGQLNDQNQAIGYAKFVDNGSATIEALGNGEVKTERLLNHDLHLKLGEHHTD
EHIIEYAPSKNSKRYALLNKDGGEGRFELKNNDKHDSNSYFILKDGTRIASRYWTTWDYN
RHTKTSTIEHRDPAKILIGGTLSLSGSDLENNASTLSVGKALLLGDSIFTKNENNGNLTA
GGITLKNIDILGDIDVTDTGKWNSFGKERKRYGVRGKKRWAVYGKGRGDFSEIHPTAHFT
FNKVLNEIGNDVIGTNTEIDSKSNSTKVELKTIATSSLSASIEKGNIVTPASAVISGQVS
ASYPEKLGDNRLPVIKTHLAEITLPKAGLYQINPDAPNGYLVETDSKFTDRKKWLSSDYM
FNALRYDHNNVQKRLGDGFYEQRLINEQINRLTGRRFLDNYSSDFEQYKALMNNGVYYAN
KFNLTPGVGLTAAQMAELTSDMVWLVNKEITLPSGKTLTVLTPQVYLVSRNLDVTTQGAL
ISAREISGNIKGNITNSGTIAGRNLTALSAEHLNNQGIVLGSSVNLLAKQKLVNLGGKIQ
ALDSAVLMGNQGVEIASQTSSSANYDGFGNQFAHTNLNRQAEIDVKGQLQIISPKDVTLK
AANLNADVIHIQGDKVDIGTVSTSNKQHYNANLDNYSRLDQQQEIGSKLNAANHISILSQ
NATRVRQAALHSNNGTLAITSINGDIQIQEGRNKEQLAFGAKSTHSGTLQKTTVTTKHDH
SYDMAEGSAIDGNRILLRADKGNVTVQGSSVVGEKGFTAIAQNIAIQEAENRMFEQDFEK
TSKSGLMGSGGFGFSVGMRKESVENDQTKYYAQKSQVGSLNGDTTLIADKHYSQSASHVT
SVKGNVSIQAEQVDIAAASDKYETNYKRTFEQKGLTIAINTPIQAAINAVKQVADSVQTV
GESKDNRINAMAAANAGWTAYRAGQTLGQVGKSLGELMQNGTVPTEAVSVSITYSEQKSE
ETRRTEGSTANNSQVNAGGKVMIQASGGGKQSNINIIGSDVGGKQGTALIADNDVNLTAQ
QQTHQERSRNKSSGFNAGVAIAVGNGVSFGITAGGNYGRGYGNGDDETYRNSHIGDSSSQ
TLIQAGNNATLKGAQVQGKGVSLNAENLHIESLQDKMKYQGKQMNVSGQVTVGYGFSASG
SYNQSKINSDYASVVEQSGIYAGDEGYQINVGNHTSLKGGLITSSQQAEDQGKNRFSTGT
LTAQNIENHANYKGTAFGVSGSASMGGGESAKEVGGAKLMTFGNNTQEQRIDTQTGDVTT
KAEGQFSVSKSIGFGYDTGSQSSVTKSGINTANIEIRNANAQLSKSGKTVAETLSAIRTD
VTSESAVKNSGVLANNFDKDRVQKELNTQLAVTQEFDKNRQDIKDELYAIVDSKRAEATN
IRKQNGGYDTGHSMKLDEEAKSLDEKVRWLDMGLGLALGSVGNSNTLWGMYATTQADRVY
RSVTAPKEIWFQKCNSSNGECNRRENSRQIWSLNDLTAEERQILRENGNLLTISNPGIFN
DREDALKNAQKQNTSETNQKGIITIMNPPTGDYKGWGEWKILTSLPSELMYAAYDKLNDK
FLWGGLPLSNSQKANQDLYLQAMNQGYKIDTSNHSRGGLTASISLQDMNIWKGVKNVPIR
KSRFYGTATNVQAYAEQLQRNGYSYTGENRKIYQSGAYSAVHQADFVGNKWGLGLLGSNE
ATGGACWLCYSHSSYYVEVPEAYLKNKQGQYIDYSGDMVSKENSVGNPQYKEFEKIWGKP
KHNGDNSSIPQLIKPANNSDKDFYNEKPF
NT seq
9270 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaaaatgcttttgtgtcatcttcagtaatacattacaacgtttagtggtgaca
tccgagttggcaaaatcagcggataagtcaagctcaggcgaaaaacaccaaagtgcggtt
agttttgaagctatttgggcaacgctaaaaccgttatcgtttagtttattttgtgcgttg
ggttttgttgtgttttcctcgcaagccgttgccgataccttaattattaaagccgacccg
aatgcaccgaaaaatcaacaaccgatagtgctacaaactgcaaacggtttaccgcaagtc
aatattcaaaccccgaatgacaaagggctttctcataataaatatcaagatttcaatgtg
gataccaaaggggcgattttaaataacagtcgtaaaacgaccctcacacagcaagctgga
atggtacaaggcaacccttatttagtcagaggagaggcaaaagttatcctaaatgaagtg
acttcaaataacccaagccagttgaaaggttatttggaagtggcaggtaaaaaagcggaa
gtgattattgccaatccgaacggtttgtattgtgacggttgcggtacgattaatgccgcc
cgtagcacaatgaccacgggtaaaccgcagattaaagacggtcaaatagagagctttaag
attgaaagaggaaaagtaaaagttaatggaaagggattggataacagccgtgtggattat
acgaatattctcgcccgtgaagcggaaattaatgcaggcttatgggcgggtaaaaaactc
aatgtagtcaccgggcaaaatgagattaaacaagctagccttgaaaatgccgataacgat
ttacaaatcacccgaatttcaagcgaaaaactcgccgaaaatcaaccgcactttgcatta
gatgtgagtgaacttggcggaatgtatgcgggtaaaattcatttagttggcacggaacaa
ggattaggtgtacgcaatgcagggcatatcggagcaagtgccgaaactttgactgttgac
tcgcaaggtaaaattgtcaatagcggtatactcaatgctcaacgtcagattacgttaaag
acaccaaaagagattgaaaataacggtcggattgaagctaaaacgcaacatatcgaatta
caatctaacgctaatatcaaacaaaacggtaatgttattgctcaagccggcggtattagt
gctagtgccaaaaacaccattagccaacggggtgaaactgttgcaaaaggtaaaatcagt
tataaagctaatgatattagtgcggcacaatccgcattgattgcagccggtgtaacgacc
actcaaacggcgaatggtgaaacacgccaattagatagccaatcagcacaaggtgcaaat
attgatattcaagcggagaataaagcgcaacttgccagtcgtcatatggcaagcggtaaa
cttaatatcaatgcacaatcggttaatttagataatagccaaaaccatgcttatgatatt
gtagtcattgccaaatccggtgatgtgcaagccgataatagccgattaagtgcggttgaa
aatttaaggatttctacaccaaaaacgctttcaacccaaaacagtcagcttgctgcaaat
cgtattcaaacatcgcaacaaaatttacatacccaaaatgcattatggcaacaattcggt
acgggcgattttagcttgaacgcccgccatattcagaaccagggcggtacctttagcaca
ggtggtgattttaatgtaaatgccgatgatattgataacacctcaggacggttaattgcc
ggtcaaaatcttacaataaagatttccgataaactcaattcggcacaaggtatgttgttt
gcgaacaacaatcttagtttacaagctaatcaattaatgaataccaatgggcttattaaa
agccttggtaatatgtctctcaatatccgagatatttccaatcggcaaactaatataagt
gacaatatacaaaaaggcataattgccttaggtcatctcgctgtaaacagtgcaacagtg
gataatacgctcggttttatcgggagcaatcggaatttggcgataaatgcggacaagcta
ttcaatgattcaggcaaagtgtatgccgctcaacaagcagaattacgtttgaataatgga
tattatagtcgtggtggtcaattacaagccagctcattatctattacaacgccaattatt
gaacagcagcaagggaatattaccgtaaatcatcagctcaacataataggcgatagctta
gtatcagcaaatcgttctaccatttcagccaatgaaatcaatatgaagctggcaaaatcc
ttgactcaatccgagagtgctattttaggtaatcactcggttgttattgatgtgaaaggc
ggattggataacaccaattcaacggttgcgagtcgtcataatgatttggtgattaatacc
gataatgccaccttaaacaatgccaagggtacgctatttgctaaggaaaatcttcgtctt
aatagtggaaatctgaataatgatgagggaattgtacagagtaaatcaaatgccaccttg
cgtgtaaacgagattagtaataaagatggcgtaataatggcaaatagtgctgaggttatc
agcgccggaattaataatgagaaggggatggtatttacccataccgcactgaatatcgtc
tcaaatgtgttaaataatgccaaaggttcaattatcagcctaggtgagctaaatattaat
acgcaaggagaggcattaaataatcttcaaggacaaatttttgccaatgcggttaaatta
aatagcggagcaattaataatcaacaaggtttgttgcgaggagacaaaactctcgtaatc
gataccaacaatcaacaacttaataatcagcaaacgcaagaagaacgccaaggtattgta
gggctaggttcggttgtattaaataacattagtcagcttaataatacccaaggcagaatt
gcaacggctgaaaacttggcaattaatacccgaacgctcaccaatacaaaaggtattgtt
aatgcacaagctcaaaccacaatccacgcagatcaaattgataaccaaaaaggatcgatt
tggggagcaaatacgcacttaaatgctgcaacgattaataatcggaaagaggggcaaaat
ggttcattgattggtgctaatgatacattaaatatcacagcaatacagcttaataaccaa
caaaccgttgcaacaggcgacaaaccaaaccaagggttacaagctaaaaacattcaactc
aatactgctgagttaaataatcgacaaggtggtatttatgctacgaataccctatctgcc
atcattgagaatcagtttaataatcaagcaggagaatttttagcaggacaaacagcgaaa
atttattcgcaagcgaatcaattagttgtcgataaccttgcgggaacgattgaagccggt
caacagctgaatttaaaagccaaaactttgcaaaatgaagggacgattaagacccaagga
aatgctgaaattgttcttactgacaactttaccttaaatcaggctttccaagtgggaaat
aatttaactttcagtacgcttggtgattttgtgaataatgtgaaacaaattgttggcaat
caggcatcgttcagtgctgcaaatttaattaatcatcaaaatgctgaaatttccgcaaat
cggacattaattaatactggtactattactaattacgggttattagacggcacggaaaat
attattaaaaccggcacgttaaataaccttggtagcggtcggatttacggcgatcattta
gctattcaagcagagaaactgaataatctcaatcaaggtgaaaaatcggcaaccatcgct
gcacgcgaacgtttagatttgggtgtaggtacattaatcaatcgtgatcacagtttgatt
ttcagtattggagatattgctatcggcggtcaattaaatgatcaaaatcaagctatcggt
tacgctaaatttgtggataacggcagtgcgaccattgaagccttggggaatggtgaggtt
aaaacagaacggttattaaaccacgatcttcatttaaaactgggagaacatcatactgat
gagcatattattgaatatgctccttcaaaaaattcaaaacgttatgcgttactcaataaa
gatggcggtgaggggcgttttgagctaaaaaataatgacaaacatgattccaactcttat
tttattttaaaagacgggacgagaatcgcttcccgttattggacaacctgggattacaat
cgccatacgaaaaccagtacgattgaacatcgtgatccggctaaaattctcatcggtggc
acgttatcgctttccggttcggatttagaaaataatgcttcaacattatctgtcggtaaa
gcgttgttattaggcgatagtatttttacgaaaaacgaaaacaacggtaatttaacggca
ggaggcattaccttaaaaaatattgatattctcggggatattgatgtgacggatacggga
aaatggaatagctttggaaaagaacgcaagcgttatggggtaagaggtaaaaaacgttgg
gcggtttatggcaaaggaagaggcgatttcagtgaaatacacccgacagcgcatttcacc
tttaataaagtgttaaatgaaatcggcaatgacgttatcggcacaaatacggaaattgat
agcaaatcaaattcaacgaaggttgaattaaaaaccattgcaacatcaagcttatcggca
tctattgagaaaggaaacattgtgactccggcaagtgcggtcatttccggacaagtttct
gcgagctaccctgaaaaattgggggataatcgtctgccggtgatcaaaacccatttggca
gaaatcaccttaccgaaagccggtttgtatcaaattaatcctgatgcaccaaatggctat
ttggtggaaacggacagcaaattcaccgatcgcaaaaaatggctcagttccgattatatg
ttcaatgccttgcgttatgatcacaacaacgtacaaaaacgccttggtgacggtttctat
gagcaacgtttaatcaacgaacaaattaaccgattaaccggtcgccgtttcttagataat
tacagctcagactttgaacagtataaggcgttaatgaataacggggtttattatgccaat
aaatttaatttaacgccgggagtgggcttaacggctgcacaaatggcggagttgacttcc
gatatggtatggctggtaaataaagaaatcaccttaccgagcggtaaaaccttaaccgtc
ctcacaccgcaagtttatttggtttcccgcaatcttgacgttaccacgcaaggtgcttta
atttcggcacgggaaatcagtgggaatatcaagggtaacattacaaacagcggtaccatt
gcaggtcgaaatctgaccgcactttcagcagaacatttgaacaatcaggggattgtgctg
ggtagtagtgtcaatttacttgccaaacagaagttggtgaatcttggaggtaaaattcaa
gccttggattctgccgtactgatgggaaatcaaggtgtagaaattgcaagccaaaccagc
agttcagccaattatgatggctttggcaatcaatttgcccataccaatctgaatcgccaa
gcggaaattgatgtgaaggggcagttgcaaattatcagcccgaaagatgtcacactcaaa
gcagcgaatctcaatgcagatgttattcacattcaaggggataaggtagatattggcacg
gtatcgacaagcaataaacagcattataacgccaatttggataactattctcgcttagac
caacagcaagaaatcggctcaaaactaaatgccgctaatcatatttccattttaagccaa
aatgcgaccagggttcgccaagccgctttacacagtaataacggcaccctcgccatcaca
tcaattaatggtgatatacaaattcaagaaggacgtaataaagaacaacttgcgtttggc
gccaaaagtacacacagcggcacattgcaaaaaacaaccgtcaccacaaaacacgaccac
agctacgatatggcggaaggttctgcgattgatggaaatcgtatcttattgcgtgccgat
aagggcaatgtcactgtacagggttcctcagttgtgggggaaaagggctttaccgcaata
gcacagaatatcgctatccaagaagcggaaaatcgaatgtttgaacaagactttgaaaaa
acgagcaaatcgggactaatgggcagcggaggctttggttttagtgttggaatgcgtaaa
gaaagcgtggagaacgaccaaaccaaatactacgcccaaaaaagccaagtagggagtttg
aacggtgatacaacgctgatagcagataagcactacagccaaagtgccagccacgtgact
tcggtgaaagggaatgtctctattcaagccgaacaagtggatatcgccgcagcaagtgat
aaatacgaaaccaactacaaacgcacgtttgagcagaaagggttgacgatagcgattaac
acgccaatccaagcagcgataaatgcagtgaaacaagtagcggactcggtacaaaccgta
ggtgaaagcaaagataaccgcattaatgccatggcggcagccaatgcaggttggacggct
taccgagcagggcaaacccttgggcaggtagggaaatccctgggtgaattaatgcaaaac
ggcaccgtaccgacagaagcggtgagtgtttctattacttacagtgaacaaaaaagtgaa
gaaacccgccgtaccgaaggcagcacggcaaataatagccaggtgaatgcaggcggtaaa
gtgatgattcaagcaagcggaggcggcaaacaatcgaatatcaatatcatcggttcagat
gtgggtggtaaacaaggcacagccctgattgccgataatgacgtgaatctcacagcccaa
cagcaaacccaccaagagcgtagccgaaataaatccagcggttttaatgcaggggttgct
attgcagtgggcaatggcgtgtctttcggcataaccgcaggggggaattatggcagaggc
tatggcaatggagatgacgaaacctatcgaaacagccatattggcgacagttcaagtcaa
accctgattcaagcaggcaataacgcgaccctaaaaggggcacaagtacagggcaaaggc
gtaagcttgaatgccgagaaccttcatatcgaaagtttacaggacaagatgaaatatcaa
ggtaaacaaatgaacgtgagcggacaagtcactgtcggttacgggttctctgcttcaggc
agttataaccaatcaaaaatcaactcggattatgcaagtgtagtggaacaatcggggatt
tatgccggagatgaggggtatcaaattaatgtgggtaaccacaccagtcttaaaggcggt
ttaatcacctcaagccaacaggctgaagaccaaggcaaaaaccgcttcagtacgggaact
cttaccgcccaaaacattgaaaaccatgcgaattataaaggcactgcctttggtgtttcg
ggttctgccagtatgggtggaggagaaagtgcaaaagaagtgggaggggctaagttgatg
acgtttggaaacaatacccaagaacaaaggattgatacgcagacaggtgatgttacaacc
aaagcggaaggacaattttctgtgagtaaatcgattggttttggttatgacacagggagt
caatccagtgtcactaagagtggtattaatactgccaatatcgaaatccgtaatgcaaat
gcccaattaagtaaaagcggtaaaactgttgcagagacgttgtctgccattaggacggat
gtcaccagtgaaagtgcggtcaaaaattcgggtgttttagcgaataattttgataaagac
agggttcaaaaagagctgaatacacagcttgccgttactcaagagtttgataaaaatcga
caggatattaaggatgaattatatgctattgttgatagtaaacgggctgaagcaactaac
attcgaaaacaaaatggtggttatgatactggacattcaatgaagttggatgaggaagct
aagagcttagatgaaaaagtgcgttggttagatatgggattgggattagcacttggcagt
gttgggaactctaatacgctttggggaatgtatgctacaacacaagcggacagagtttat
cgttctgttactgcaccgaaagaaatctggttccaaaaatgtaattcttctaatggggaa
tgtaacaggagagaaaatagccgacaaatctggtcgttgaacgacttaacagcggaagaa
cgacaaatattgagagaaaatggaaatctcttaacaatttctaatccggggatttttaat
gacagagaggatgcgttgaaaaatgcacagaagcaaaatacatcagaaaccaatcaaaag
ggtattattaccataatgaatccacccacaggggattataaaggttggggggaatggaaa
atactgacttcattgccatccgaattgatgtatgcggcttatgacaaattgaatgataaa
tttttatggggaggattaccgctgagtaattcccaaaaagccaatcaagatttatatctt
caagcgatgaatcaaggttataaaatagataccagtaaccatagtcgaggaggattaact
gcaagcatttccttgcaagatatgaatatttggaaaggtgtgaaaaatgttccaatacgg
aaatctcgtttttatggtacagcaacaaatgtccaggcttacgcagagcaattacaaaga
aatggatacagctatacaggagaaaacagaaaaatctatcaaagtggtgcttattcggct
gtgcatcaagcagattttgtcggcaataaatggggattgggtttacttggtagtaacgaa
gcaacaggtggagcttgctggctttgttattcacatagcagttattatgttgaagtgccc
gaggcatacttaaaaaataaacaagggcaatatattgattactcaggggatatggtaagt
aaggaaaattctgttggtaatcctcaatataaagaatttgaaaaaatttgggggaaaccg
aaacataacggtgacaattcatctataccacagttaataaaaccagctaataatagtgat
aaggatttttataatgagaaaccattttaa
DBGET
integrated database retrieval system