Rickettsia conorii subsp. heilongjiangensis: Rh054_05035
Help
Entry
Rh054_05035 CDS
T01587
Name
(GenBank) transcription-repair coupling factor
KO
K03723
transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) [EC:
5.6.2.4
]
Organism
rhe
Rickettsia conorii subsp. heilongjiangensis
Pathway
rhe03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rhe00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
Rh054_05035
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
rhe03400
]
Rh054_05035
Enzymes [BR:
rhe01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
Rh054_05035
DNA repair and recombination proteins [BR:
rhe03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
TRCF (transcription-repair coupling factor)
Rh054_05035
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
TRCF
Helicase_C
CarD_TRCF_RID
UvrB_inter
ResIII
Cas3-like_C_2
RecG_dom3_C
MFD_D3
NBD94
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEK74913
LinkDB
All DBs
Position
complement(870055..873420)
Genome browser
AA seq
1121 aa
AA seq
DB search
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NT seq
3366 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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gtgtag
DBGET
integrated database retrieval system
