Ruminiclostridium herbifermentans: EHE19_003060
Help
Entry
EHE19_003060 CDS
T07161
Name
(GenBank) helix-turn-helix domain-containing protein
KO
K02647
carbohydrate diacid regulator
Organism
rher
Ruminiclostridium herbifermentans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rher00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
rher03000
]
EHE19_003060
Transcription factors [BR:
rher03000
]
Prokaryotic type
Helix-turn-helix
Other families
EHE19_003060
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HTH_30
GGDEF_2
HTH_8
Diacid_rec
sCache_3_2
TRAPP14_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNU67520
UniProt:
A0A4U7JHJ5
LinkDB
All DBs
Position
716324..717403
Genome browser
AA seq
359 aa
AA seq
DB search
MSVKLFQTLSEKYSEIIGKEIGVTDESGIIIAHSNFQLVGNTDSNIIDFLQSKSHNQIIE
DRIYYKVMVKNKVEFISFVKSTEPQDLKYLELFSLNILNLKSFYDEKYDKNTFIKNIIVE
NILPGDILLKAKELHIDYNLLRVVFLINASSEKDIHVHEVLESLFPNKNRDFIIVIDNDN
IVLVKEVKNKEDHKDLSKIAKTIIDTLNSELMVKASIGIGTIINNLKDITKSYKEAQMSM
IIGNIFSGDQKVYDYNNLGLGRLVYHIPITLCQLFLDEVFKDKSADSLDNETMLTIQKFF
ENNLNVSETARQLYIHRNTLVYRLDKIKRLTGLELTSFDDAVTFKIAVLVRKYLASINE
NT seq
1080 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcggtaaaattatttcagacgttatctgagaaatatagcgaaattataggcaaagag
ataggtgtaactgacgaaagtggaataattatagctcattcaaattttcagttggtaggt
aatactgattcaaatattattgatttcttgcaatcaaagagccataatcaaataatagag
gataggatatattataaggttatggttaaaaacaaagtggaatttatatcctttgtaaaa
tctacagagcctcaagatttgaagtatttggaattgttttctctaaatatacttaatctt
aaaagcttttatgacgaaaaatacgacaagaatacatttataaagaatataatagtagaa
aatattttgcctggtgatattttgttaaaggccaaagaactgcatattgattacaactta
cttcgggttgtatttcttattaatgcttcaagtgaaaaagacattcatgtacatgaagta
cttgagagtttattccctaataagaatagagattttataattgtaattgataacgataat
atagttttggttaaagaggttaagaataaagaagaccataaggatctttcaaaaattgca
aaaactattatagatactcttaattcggaattaatggtaaaggcaagtattggtattgga
acaattataaataatctaaaagatattactaaatcatacaaagaagctcagatgtctatg
ataattggtaatatttttagtggtgaccaaaaggtctatgattataataacctgggactt
ggcaggcttgtttaccatatcccaataacattatgtcagttgtttctcgatgaagtattt
aaagataaatctgctgattcattagacaatgagactatgttaacaattcaaaaattcttt
gaaaataatttaaatgtcagtgaaacagcaaggcagctatacattcatagaaatacgttg
gtatacaggctagataaaataaaacgcttaacaggtttagaacttactagctttgatgat
gctgttacctttaaaattgctgtattagttagaaaatatttagcaagtataaatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
