Ruminiclostridium herbifermentans: EHE19_003140
Help
Entry
EHE19_003140 CDS
T07161
Name
(GenBank) cellulosome protein dockerin type I
KO
K18578
xyloglucan-specific exo-beta-1,4-glucanase [EC:
3.2.1.155
]
Organism
rher
Ruminiclostridium herbifermentans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rher00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09191 Unclassified: metabolism
99980 Enzymes with EC numbers
EHE19_003140
Enzymes [BR:
rher01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.155 xyloglucan-specific endo-processive beta-1,4-glucanase
EHE19_003140
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sortilin-Vps10
Dockerin_1
BNR
BNR_6
Tli3
BNR_2
PSII_BNR
Kelch_1
EF-hand_7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNU67529
UniProt:
A0A4U7JFI2
LinkDB
All DBs
Position
complement(729722..732352)
Genome browser
AA seq
876 aa
AA seq
DB search
MKIRNIRKIIILSLVIIFTCTSIITPNLCANGATSVPYKWDNVTIEGGGGFVCGIIYNPS
EEGLVYARTDMGGAYIRNKQTLEWEPITDWVSPDEWNLLGCESIATDPVETNRVYIAAGT
YTNSWTSMNGYILRSDDYGKTWERTELPFKFGGNMPGRSVGERLMIDPNSNNILYFAARS
GNGLWKSTDYGKTWAKVTSFTNVGNYVEDPNFEYTSDNLGLCFVTFDSAKGTKGTPTQDI
YVGVADKKNPLYVSHDAGKTWSPVEGQPTEATFTRHNQDALTIGIPYHGVISGNGILYVT
YGDRGGPYQCQDGAVYKYDTNTGVWTDITPPSGKNWDGSPKYENYYGFAGLSVDAQNPDT
LIVTTLESWWPDDNIYRSTDAGATWDAIWEFGDSWPSRNLKYTMDISKAPWLSWGKKVNA
ASGGLVSGNEIVDSPTPKLGWMIGDIEINPFDSDEMMYGTGATVYGTKNLTDWDKGKYVN
IEVMGIGIEQTAVLSLMCPPIDGVELISGVGDICGFVHEDLQKGPDCMMTNPTFTSTTGM
DYAELNPNMMVRVGNIDKEQYEMIKKSVAISKDGGKTWTEAHPNVSYTFPATNPDDIVQG
GTVAMSADGSTFVWSPSTSQGVICYVNGGWKAVSTLPAGADVCSDRVNPKVFYAYADSTF
YVSNDGGLTFTAVQTGLESPTAKIKAVPGKEGHVWIPGPTTGLSYTTDGGKTINKVNGPT
RCDVIGFGKAKDGGNYLAIYMCGETDGLYAVYRSDDMAKSWVRVNDDQHQYGSINYSITG
DLRVYGRVFVATNGRGIVYGEPSGAEPQIPTFSLGDINKDGNIDSVDFAALKMYLLGSTT
LTQEQLVLADVNKDGSVNAIDFAALKSYLLGIITSF
NT seq
2631 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagattagaaatatcagaaaaataataattctatctttagttattatttttacgtgt
acatccataataacaccaaatttatgcgcaaatggagcaacaagtgttccatacaaatgg
gataatgtaacaatcgaaggtggaggaggatttgtctgcggaattatctataatccaagt
gaagaaggtcttgtttatgctagaactgatatgggaggagcatatattagaaataagcag
acattagagtgggagcctattactgattgggtttcacctgatgaatggaatttacttgga
tgtgaaagtatagctacagatcctgttgaaacaaacagagtttacattgcggctggtaca
tatacaaatagctggacttcaatgaacggatatatcttacgttctgatgactacggcaaa
acatgggaaagaactgaactacctttcaaatttggcggaaatatgcctgggcgttcagtt
ggtgagcgcttaatgatagatcctaacagcaataacatactatattttgctgcaagaagt
ggaaatggattatggaaaagtacagactacggtaaaacatgggcaaaagtaactagcttt
acaaacgtaggaaactatgttgaagacccaaattttgaatatacatctgataatttaggt
ctgtgttttgtaacctttgattctgccaaaggaactaaaggcacacctacacaggatatt
tatgtaggagttgctgataaaaagaatccactttatgtaagtcatgatgccggaaaaaca
tggagtcctgttgaaggtcagcctacagaagctacatttacgcgacataaccaagatgct
ttgacaataggaattccataccatggagttatcagcggtaacggaattttatatgtaaca
tatggtgatagaggcggaccatatcagtgtcaagatggtgcagtttacaaatatgataca
aatacaggtgtttggacagatataacacctccttcagggaaaaactgggacggttctcct
aaatacgaaaattactatggatttgctggtttaagcgttgacgcacaaaatccagacaca
ctaattgtaacaacattagagtcatggtggcctgatgataacatttaccgttctactgat
gctggagctacttgggatgctatatgggagtttggtgattcatggccttcaagaaatcta
aaatatacaatggatatttcgaaagcaccttggctctcctggggtaaaaaagtaaacgct
gcatcaggaggtctagtatctggtaatgaaatagtagacagccctacaccaaagctgggt
tggatgattggcgatatagaaattaatccttttgactcagatgaaatgatgtacggtaca
ggtgctaccgtctacggtacaaagaacttaactgactgggataaaggtaaatatgtaaat
attgaagttatgggaattggaatagagcagacagcagttttaagccttatgtgcccacct
attgacggtgtagaattaataagcggtgttggtgatatatgcggttttgttcatgaagac
cttcaaaaaggacctgactgcatgatgacaaaccctacatttacaagtactactggtatg
gattatgcagaacttaatccaaatatgatggtaagagtaggtaatattgataaagagcaa
tatgagatgattaaaaagagtgttgctatatcaaaagatggcggaaagacatggactgaa
gcacatccaaatgtaagctatactttccctgctacaaatccagacgatatagtgcagggt
ggtactgttgcaatgtctgctgacggttctacctttgtttggtcacctagtacaagccag
ggagttatatgctatgtaaacggtggctggaaagctgttagtactctgcctgcaggtgca
gatgtttgctcagatagagttaatccaaaagtattctatgcatatgcagacagcactttc
tatgtaagtaatgatggaggacttacatttactgcagtacaaacaggtcttgagtcccct
actgctaagattaaagccgttccaggtaaagaaggtcatgtttggattcctggtccaaca
actggtctttcctataccactgacggcggaaaaacaataaataaagttaatggtcctacc
agatgtgatgttattggcttcggaaaggctaaagatggaggaaattatcttgcaatatat
atgtgcggtgaaacagacggtctatatgcagtttaccgctcagatgatatggctaaaagc
tgggtaagagtaaatgatgaccagcaccagtatggctcgataaattattctattactgga
gatttaagagtttatggacgtgtctttgttgcaaccaacggaagaggtattgtatatggt
gaaccttcaggcgctgagcctcaaataccaactttctctttaggagacattaacaaagac
ggcaatattgattctgtcgattttgctgcattaaaaatgtatcttctaggttcaactact
ctcactcaagagcaattagttcttgctgatgttaataaagatggctctgtcaatgctatt
gactttgcagcactaaaaagctatttgttaggtataattacttcattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
