Ruminiclostridium herbifermentans: EHE19_008860
Help
Entry
EHE19_008860 CDS
T07161
Symbol
carB
Name
(GenBank) carbamoyl-phosphate synthase large subunit
KO
K01955
carbamoyl-phosphate synthase large subunit [EC:
6.3.5.5
]
Organism
rher
Ruminiclostridium herbifermentans
Pathway
rher00220
Arginine biosynthesis
rher00240
Pyrimidine metabolism
rher00250
Alanine, aspartate and glutamate metabolism
rher01100
Metabolic pathways
rher01110
Biosynthesis of secondary metabolites
rher01240
Biosynthesis of cofactors
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rher00001
]
09100 Metabolism
09104 Nucleotide metabolism
00240 Pyrimidine metabolism
EHE19_008860 (carB)
09105 Amino acid metabolism
00250 Alanine, aspartate and glutamate metabolism
EHE19_008860 (carB)
00220 Arginine biosynthesis
EHE19_008860 (carB)
Enzymes [BR:
rher01000
]
6. Ligases
6.3 Forming carbon-nitrogen bonds
6.3.5 Carbon-nitrogen ligases with glutamine as amido-N-donor
6.3.5.5 carbamoyl-phosphate synthase (glutamine-hydrolysing)
EHE19_008860 (carB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CPSase_L_D2
CPSase_L_D3
MGS
ATP-grasp
Dala_Dala_lig_C
ATP-grasp_3
ATPgrasp_Ter
ATP-grasp_4
GARS_A
ATP-grasp_5
ATP-grasp_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNU68490
UniProt:
A0A4U7JL80
LinkDB
All DBs
Position
2131115..2134327
Genome browser
AA seq
1070 aa
AA seq
DB search
MPKRQDIHKVLVIGSGPIIIGQAAEFDYAGTQACQALKEEGIEVVLVNSNPATIMTDANI
ADKVYIEPLKAEVVKNIIIAEKPDSILPTLGGQTGLNLAMELAESGFLQEQGVKLLGTAT
EAIKMAEDRQDFKDTMERIGEPCIASKVVTTIEDAIAFANEIQYPVIVRPAYTLGGTGGG
IVNNESELREIGENGLRLSRVHQVLIEKCIAGWKEIEYEVMRDSKGNVITVCNMENIDPV
GVHTGDSIVVAPSQTLADKEYQMLRTSALKIISALGIQGGCNVQFALHPTSYEYAVIEVN
PRVSRSSALASKATGYPIAKVASKIAIGYGLDEIKNAVTGKTYACFEPTLDYVVVKIPKW
PFDKFVKAQRTLGTQMKATGEVMAISSSFEAALMKAIRSLELGLFTLEQDIYKQLDGNEI
VKKLEDVNDERIFVIAEAIRRSVELDEIHNITKIDYFFLCKIKELVLMEEKLKSLKIDQL
DKAVLRRAKKMGFTDSIIAKFTNSTKEEITELRKKEGIVATYKMVDTCAAEFEAQTPYYY
STYDNYSEVKPSNREKILVLGSGPIRIGQGIEFDYCSVHSVWALKDMGYETIIANNNPET
VSTDFDTSDRLYFEPLTPEDVINIVEAENPKGAIVQFGGQTAIKLTKTLDDYGVKLFGTE
AKSVDAAEDREKFDEILEKTGIPRPQGRTIFTLEEALAAANELGYPVLVRPSYVLGGQGM
EIAFSDKDVIEFMEIINRTVQEHPILIDKYMMGKEIEVDAICDGENMLIPGIMEHLERAG
VHSGDSISVYPSQTISEKTKAIIVDYTERLAKALNVVGLVNIQYVLYNDEVYVIEVNPRS
SRTVPYISKVTGIPMVDLATKVMMGKKLSDFKYGTGLYKEPNYVSVKVPVFSFEKLHGVD
TTLGPEMKSTGEVLGIADNFPEALYKGIIASGIKLPQKGDGILMTVRDTDKPELAEIAEG
FEKLGFTLYGTGKTANMLNHKGIATNAVKKLDEGSPNILDLIQSGKIGLIINTPTKGRKP
DRDGFKIRRKAVEMSIPCLTSLDTANAILKCLKLGKTLGELDVLNLSIFE
NT seq
3213 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctaaacgtcaagatatacacaaggtactggttattggatcaggaccaattatcata
ggacaagctgcagaatttgactatgccggaacgcaagcatgtcaagcacttaaagaagaa
ggaatcgaagttgtattagtaaacagtaatcctgcaacaataatgactgatgcaaatatt
gcagataaagtatatatagagccactcaaggcagaagtggttaaaaatattattattgct
gaaaaacctgacagtatattgccaactcttggaggacaaaccggactaaacttggcaatg
gaattagctgaatcgggttttttgcaggaacagggagttaagcttttaggtactgcaact
gaagctattaaaatggctgaggacagacaggatttcaaggataccatggaaagaataggt
gagccttgtattgcaagtaaagtggtaacaactattgaggatgcaattgcatttgccaat
gaaatacaatatcctgttattgttagacctgcatatacactaggaggaacaggcggcggt
atagtaaataacgaaagtgaacttagagaaattggtgagaatggactgagactaagccgt
gttcatcaggttcttatagaaaaatgtattgccggctggaaagaaattgaatatgaagta
atgagggatagtaagggtaatgttattactgtatgtaacatggaaaatatagaccctgta
ggagtacatacgggagacagtatagttgttgcaccatctcagaccttggctgataaagaa
tatcaaatgcttagaacctcggcactaaaaattatatctgctttagggatacagggagga
tgtaatgtacagtttgctcttcaccctacaagctatgaatatgcagttattgaggttaac
cctagagttagcagatcctctgcattagcatcaaaggcaacaggctatccaattgcaaag
gttgcttcaaagattgctattggatatggtctagatgaaattaaaaatgctgttacaggt
aaaacatatgcttgctttgagcctactttggactatgtagtagttaaaataccaaaatgg
ccatttgataaatttgttaaagcgcagagaactcttggcacacaaatgaaagcaactggt
gaagtaatggctataagcagttcctttgaggctgccttaatgaaagctattcgctcactt
gaattaggattatttacattagagcaggatatatacaagcagcttgatggtaatgagatt
gtgaaaaagcttgaggatgttaatgatgaaagaatttttgtcattgcagaagctatacgc
cgttcagttgaacttgatgaaattcataatataactaaaattgattacttcttcctttgc
aagataaaagaacttgtgcttatggaagaaaaacttaaatcacttaaaattgatcagctg
gacaaagctgtattaagaagagcaaagaaaatgggctttacagatagcataattgctaaa
ttcactaattcaacaaaagaagaaattactgaattaagaaagaaagaaggaattgttgca
acctacaaaatggttgatacctgtgcagctgagttcgaagctcaaaccccatactactat
tcaacttatgataattattctgaggttaaaccttcaaatagagaaaagatattagttttg
ggctcaggtccaataagaattggtcagggtattgaatttgattattgttcagttcattct
gtatgggccttaaaggatatgggatacgagactataatagcaaataacaaccctgagaca
gtaagtacagattttgatacatcagacaggctttactttgaaccacttactcctgaggat
gtaattaatattgttgaagcagagaacccaaagggtgctattgtacaatttggaggtcaa
actgcaattaagttgacaaaaactcttgatgattatggagttaaattgtttggtacagaa
gcaaaaagtgttgatgctgctgaggatagagaaaaatttgatgagatacttgaaaaaact
ggcattccaagaccacagggaagaacaatatttacacttgaggaagcattagctgctgca
aatgagttaggatatcctgtgcttgtaaggccatcctatgtacttggcggtcagggaatg
gaaatagccttcagtgacaaagatgttattgagtttatggaaataattaatagaactgtt
caagagcatcctatattgatagataagtatatgatgggtaaggaaattgaagttgatgct
atttgtgacggtgaaaatatgcttattcctggcattatggagcatcttgaaagagctgga
gttcactctggtgacagtatttccgtttatccttcacagacaattagtgaaaaaactaaa
gctattatcgttgattatacagaaagattggctaaagcactcaatgtagtaggtttggtt
aatattcaatatgttttatataatgatgaggtttatgtaatagaggttaacccaagatca
agtcgtacagttccgtatataagcaaggttacaggtatacctatggtagatttagccact
aaagttatgatgggtaaaaaactcagtgactttaaatatggtacaggtttgtataaagaa
ccaaattatgtttctgttaaagttcctgtattctcatttgaaaagcttcatggtgttgat
accacattaggtcctgaaatgaagtctacaggagaggttttaggtatagcagacaatttc
ccagaagctctttataaaggaataattgcttcaggtataaaattgcctcaaaagggtgat
ggaatattaatgacagtaagagatactgataagcctgagttagcagagattgcagaaggc
tttgaaaagcttggcttcacactatatggtacaggaaagactgcaaatatgttaaatcac
aaaggtattgctactaatgcagttaaaaagcttgatgaaggctcaccaaatattttggat
ttgattcaatcaggtaaaataggtttaataatcaatactcctacaaagggtagaaagcct
gatagagatggcttcaagataagaagaaaggcagttgaaatgtcaataccatgcttaact
tcacttgatacagcaaatgcaatattaaagtgcttgaagctgggtaaaactttgggagaa
ctagatgtgttgaacttgagtatttttgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
