Ruminiclostridium herbifermentans: EHE19_011095
Help
Entry
EHE19_011095 CDS
T07161
Name
(GenBank) endo-1,4-beta-xylanase
KO
K01181
endo-1,4-beta-xylanase [EC:
3.2.1.8
]
Organism
rher
Ruminiclostridium herbifermentans
Brite
Enzymes [BR:
rher01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.8 endo-1,4-beta-xylanase
EHE19_011095
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_10
CBM9_1
CBM_4_9
SLH
Serglycin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNU65476
UniProt:
A0A4V6EPA0
LinkDB
All DBs
Position
complement(2700567..2705588)
Genome browser
AA seq
1673 aa
AA seq
DB search
MSKKLSLLLVIAIVLTSLLPMSMSDVQAADTLFAEAGDTKKYDFEDGSSQGWEGLVSTVE
VVNDTVAANSGSYGLKSSNSSANWQGAMLNITSFPAGKYKIEGYVKLVSAERSALKITHQ
HTDKGADGDAYDQLTANDNVTSSEWTKLEGTFTLSKIMVASSIKIESADSNNTPDYYLDD
VTFTLVSLDNSKPEASSNIKSYEYNFDNGTTQGWSPRGDGVNVAVSAEAATSLPNSIKVT
GRSQNWHGASINALGKLDKDVIYTVTAKVKSICASTTPSAISLTMQQKATAGGASTEYKQ
VASTGSINDSEWHEIKGTYSFTEDMVDQTLYFESSDPYDSFYIDDIYIASPGAGVPNIGF
EDKTTQGFTSRLGCNVTVTNADKKAGTYSLLVSDREDEIDGPIIDVSGKMLQGSKYNIST
WLKIAPGSEQSGIIVSMAYTKDGDTKYTNLFGSVSNPFVVTESEGWVNLNFDYLMAYDAD
EVSLYIESRGDTASFYIDDFCVTYIPPSGIQTDIPSLKDVYEKYFEMGASVVPGEYTGSS
GDLLKKHFNSMVAGNDNKPESILPNTFLALEDITEANLNLDFSDYIKEYTEANNLKWRWH
TLVWHSQTPDWLFTDENGNDLTTTDENGNLVLIEKDPVKQAANKELVLNRLKAYIKLIIN
RYGEYIDYYDVVNEVIDPAEPDGMRRSKWYVITGKDYIKVAFKTAKDELYAKGYTGKLYI
NDYNTEQPSKRDFLYNLVQEINKDEPLIDGVGHQCHIGRTSPSVSSIIASIEKFADAGLD
NQVTELDVSNYDDSVSDFAKSTANKDVPEEVLLEQGYRYKQLFEGLLDIDKKKDCISSVA
IWGISDANTWLSTFPITRLEKPLLFDTNQQAKYAYWGVVLANPEYKEYSANLPILIKNLS
TPKGTPKIDGNSELLWESNAPISVQGDNGYIGSFRVRWDENNLYVFAEVTDASTNKSGSI
DVFVNDTKTTFERKNSNSNFKTVETEKGYILEAKIPLTSTVVLDEKVSFDIRFVDGNGKM
VSWNDITNNQDTSKANIGKLTLSEAVSATEAIKGTPTIDGTKDKIWDNANEISVNKFITG
TSGATAVARTMWDENKLYVYAVVTDGSLHKESKDTYQQDSIEIFVDQKNDKTDIYGDDDG
QYRINFDNEQSFGSNPGGSALTSAAIVTETGYIVEAAIDLDKIDAKEGTVIGFDLQVNNS
DNSNGIRDSVAIWNDISGNSWSSLVKIGVVKLVSTKGSNTDNGSGSGSNSGSGSGTGTTP
NDDKIKINGKNDKFAKIISEVIKGKKHTILEIIEDEISKILKDNILTITIDVKNGSNIVE
GRFEGVTFKELKTKNAVLQINTENGTYILPASKIDIEKIALALGSDLKDITISIKIAESS
DEKIALAEENAKKNKYKLVAKPIEFEITVTNGDKTIDVSKFDSFIERLIAIPDDINPKEI
STAVIINTDGSFSHIPTSIVYIDGKYYAKIKSMTNSTYAVIANNKAYSDVEKHWSKDAVN
VVTSRLILSGTVGDKFEPNLSINRGEFVDSVVKALGLYRSGAGVDSFIDVTKASAYYDSI
SIAYEYGLVSGYADNSFKPNSKITRQEALVIVAKAMKLAGIKTDLNENELNNILSSFKDS
NKVSSWSKMAIAACIKNNIISGTNTKMIEPQSNITRGEVASIINKILKNSGLI
NT seq
5022 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaaaaaactaagtctgcttttggtaatagcgatagttttaacatcattattacca
atgagcatgtcagatgttcaagcagcagatactttatttgctgaggctggtgacacaaaa
aaatatgattttgaagatggttcttctcaaggttgggaaggattagtcagcactgttgaa
gtagttaatgatacagttgcggctaatagtggttcgtatggactaaagtcatcaaattct
tctgcaaattggcaaggagcaatgctcaatattacttcatttccagcaggaaaatacaag
attgagggttatgtaaagcttgtgtcagcagaaagaagtgctcttaagataacccaccag
catactgataaaggtgcagatggtgatgcttatgatcagcttacagcaaatgataatgtt
acttctagcgaatggacaaagcttgagggaacattcacattgtctaaaataatggttgct
agcagtataaaaattgaatctgctgatagcaataatacacctgactattatcttgatgac
gtaactttcacattagtaagtttagataattcaaaaccagaagcatcaagtaatataaag
agttatgaatataattttgacaatggaacaacacaaggatggagtccaagaggagacggt
gttaatgttgctgtttctgcagaggcagccacatcattaccaaacagtataaaggtaaca
ggacgaagtcaaaattggcatggtgcaagcataaatgctttaggaaagttggacaaggat
gtaatttacacagttacagcaaaggttaaatctatatgtgcatcaacaacacctagtgca
attagtttaacaatgcagcaaaaagcaacagctggcggagcaagcacagaatataaacag
gttgcttcaactggcagcattaatgatagtgaatggcatgaaattaaaggtacatattca
tttactgaagacatggtagatcaaaccttgtactttgaaagcagtgacccatatgattca
ttctatattgatgatatatatattgcatctccaggagctggtgtacctaatataggattt
gaagacaagaccactcagggctttacatcaagattaggttgtaatgttacagtaacaaat
gctgataaaaaagcaggaacatatagtttacttgttagtgacagagaggatgaaattgac
ggtcctattattgatgtaagtggaaaaatgcttcagggttcaaaatataatatttccact
tggctgaaaatagcacctggcagcgaacaatcaggaatcattgtttcaatggcttatact
aaagatggtgacacaaaatatactaatctttttggttctgtgagcaatccatttgttgta
acagaaagtgaaggttgggttaatcttaattttgattacttaatggcatatgatgctgat
gaagtaagcttgtacatagaatcaaggggagatacagcatccttctacattgatgatttc
tgtgttacatatataccaccttcaggaatacagactgatattccttcattaaaggatgta
tatgaaaaatatttcgaaatgggagcatcagtagtacctggtgagtatactggatcttca
ggtgatttgctcaagaagcattttaatagcatggtagcgggaaatgataataagccagag
tcaatattacctaatacattccttgcccttgaggacatcacagaagcaaatttaaattta
gatttttcagattatattaaagaatatacagaagctaataatttgaagtggcgttggcac
accttagtatggcatagtcagacacctgactggctctttacagatgaaaacgggaatgat
ttaacaacaacagatgaaaatggaaatttggttctaatagagaaggatcctgtaaagcag
gctgccaacaaagaattggtgcttaatagattgaaagcttatataaagctgataattaat
agatatggagaatacattgactattatgatgtggttaatgaggttattgacccagctgag
cctgatggaatgcgcagaagcaagtggtatgtaataactggtaaggattatatcaaggta
gcctttaaaactgcaaaggatgaattatatgcaaaaggctatactggtaagctttatatt
aatgattacaatacagaacaaccttcaaaacgtgatttcttatataatcttgtacaagag
ataaataaagatgaacctctgattgatggtgtgggtcatcagtgccatataggccgtact
tctccatctgtaagttctattatcgcttctattgagaaatttgcagatgcaggtcttgac
aatcaggttactgaacttgatgtaagtaactatgatgacagtgtaagtgatttcgctaag
tcaacagctaataaggatgttccggaagaagtacttctagaacaaggatatcgttacaag
cagctatttgaaggacttttagacatagataagaaaaaagattgcataagcagtgttgct
atatggggaatttctgatgctaatacatggttatctactttcccaataacaagactggag
aaaccgcttctttttgacacaaatcaacaagcgaaatatgcatactggggtgttgttttg
gcaaatccagagtataaagaatattctgcaaatctgccaattttaataaagaatttatca
acacctaaaggaacacctaagattgatggaaatagcgaacttctttgggaatcaaatgcg
ccaatttcagtgcaaggtgataatggctatataggttcatttagagtacgttgggatgaa
aacaatctatatgtatttgcagaggtaacagatgcttctactaataagtcaggttcaata
gatgtatttgtaaatgatacaaaaacaacctttgaacgcaaaaactcaaatagtaatttt
aaaacagttgagactgaaaaaggttatattcttgaagcaaaaatcccattaacttcgact
gttgttttagacgaaaaagtttcttttgatattcgctttgttgatggaaatggaaaaatg
gtttcatggaatgatataacaaataatcaggacacaagcaaagccaatattggaaaatta
actctcagtgaagccgttagtgcaactgaagctataaaaggtacacctacaatagatggt
actaaggataaaatatgggataatgctaatgagattagtgttaataaatttataactgga
acatcaggagcaactgctgtagcaagaactatgtgggatgaaaacaagctttatgtatat
gctgtagttactgacggcagcttgcataaagaaagcaaggatacataccagcaggattct
attgaaatatttgttgaccaaaaaaatgataagactgacatttatggtgatgatgacggt
caatatagaattaattttgacaatgagcagagctttggaagtaaccctggaggaagcgct
cttacatcagcagcaattgttactgaaacaggttatattgtagaagctgctattgactta
gataagattgatgctaaagaaggaactgttattggttttgacctacaagttaataattca
gataacagcaatggtataagagacagtgttgctatttggaatgatatttcaggtaatagc
tggtctagtttggttaaaataggtgttgtaaaattagtgtcaacaaaaggctcaaatact
gacaatggttctggttcaggttctaactcaggctccggttctggcactggcacgacacca
aatgatgataaaattaaaatcaatggcaagaatgataaatttgcaaaaataatatcagaa
gttataaaaggcaaaaaacatactatacttgagataatagaagatgaaattagtaaaatt
ctcaaagacaatattttgactattactattgatgttaaaaatggttctaatattgttgaa
ggcaggtttgaaggtgtaaccttcaaagaactgaaaacaaaaaatgctgtactgcaaatt
aatactgaaaatggaacctacattcttcctgcttcaaaaattgacattgaaaaaatagcg
ttagcgttgggttcagatttaaaggacataactataagtattaaaatcgcagagtcatct
gatgagaaaattgctttagccgaagagaatgctaaaaagaataagtataagcttgtggca
aagcctatagagtttgaaattacagtgactaatggagataagactattgatgtatcaaaa
tttgacagctttattgagagattgatagcaattcctgatgatattaacccaaaagaaatt
tctacagctgttataattaatacagatggtagcttctctcatattccaacctcaatagta
tatattgatggtaagtattatgctaagataaagagcatgacaaatagtacatatgctgta
attgctaataacaaagcttacagtgatgtagagaagcattggtcaaaggatgcagtaaat
gtagttacttcaagacttattttgagcggtactgtgggtgataaatttgaacctaattta
agtattaacagaggcgagtttgttgactcagttgtaaaggctttaggtctatatagaagt
ggtgcaggagtggatagcttcattgatgtgacaaaagcttctgcatactatgattcaata
agtatagcttatgaatatggtttagtatctggctatgcagacaattcatttaaaccaaac
agcaaaattactcgtcaagaagctttagtaattgttgcaaaggctatgaaacttgctgga
ataaaaactgatttaaatgaaaatgaattaaacaacatattaagcagttttaaggattct
aacaaggtatcaagctggtcaaagatggctattgctgcttgtataaagaataatataata
tctggtacaaatacaaaaatgattgaacctcaaagcaatattacccgtggagaggtagca
tcaatcattaataagattttgaaaaactcaggcttaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system