Ruminiclostridium herbifermentans: EHE19_014380
Help
Entry
EHE19_014380 CDS
T07161
Name
(GenBank) cellulase family glycosylhydrolase
KO
K01179
endoglucanase [EC:
3.2.1.4
]
Organism
rher
Ruminiclostridium herbifermentans
Pathway
rher00500
Starch and sucrose metabolism
rher01100
Metabolic pathways
rher02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rher00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00500 Starch and sucrose metabolism
EHE19_014380
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
EHE19_014380
Enzymes [BR:
rher01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.4 cellulase
EHE19_014380
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cellulase
Dockerin_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNU66059
UniProt:
A0A4U7JLK2
LinkDB
All DBs
Position
3588032..3589678
Genome browser
AA seq
548 aa
AA seq
DB search
MKKKTKKFISLSLAALTAFSLLLAPAKPVYVEAAVEAEANDDWLHVEGTNIVDKYGNKVW
LTGANWFGFNCRERMLLDSYHSNIVADIQMVADKGINVVRMPIATDLLYAWSKGEYPPST
DTSYNNADLAGLNSFELFNFMLENFKKVGIKVILDVHSAETDNQGHNYPLWFKGAITEKV
FKDAWVWVANHYKNDDTIIGFDLKNEPHTNSGDLKIMSESAIWDNSNRPTNWKRVAQETA
LAILEVHPNALIFVEGVEIYPKDGIWDDETTNTSPWTGNDDYYGNWWGGNLRGVKDYPID
LGKHQKQLVYSPHDYGPLVFEQSWFKGEFVTADDAKAKKILYEQCWRDNWAYIMEDGISP
LLLGEWGGLTEGNDKLLDLNLKYLRSMRDYILENKYKLHHTLWCINIDSADTGGLFTRGE
GTPFEGGRDLKWNDNKYDNYLLPVLWKNADGKFQGLDHKIPLGRNGVPLGTTPIDDEDDD
EDTVKYGDVNNDGDINALDIAALKMYLLGVNQSIDLKAADVNVDNSVDAIDFALLKKYLL
GAATLPVK
NT seq
1647 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagaaaacgaaaaagtttatcagcttatctcttgctgctttaacagctttctca
ttgttactggcaccagccaaaccagtatatgttgaagcagctgttgaagctgaagctaat
gatgactggcttcatgtagaaggcaccaatattgttgataagtatggaaataaagtttgg
ctgacaggtgccaactggtttggtttcaactgccgtgaaagaatgcttctagattcatat
cacagtaacatagttgcagacattcagatggtagccgataagggtattaacgtagttaga
atgccaattgcaacagacttattatatgcttggagtaagggtgaatatcccccatcaaca
gatacaagctataataatgctgatttagctggattaaacagctttgaactatttaatttt
atgttagaaaactttaaaaaggtaggaattaaagttatattagatgtacatagcgcagaa
accgataaccaaggtcacaattacccactttggtttaaaggagctataacagaaaaagtt
ttcaaagatgcttgggtatgggtagctaatcattacaaaaatgatgatacaattataggt
tttgaccttaaaaatgaacctcatacaaattccggtgatttaaaaataatgtctgaaagt
gctatttgggataactctaacagaccaactaactggaaaagagttgctcaagaaactgca
ttggcaatattagaagtacacccaaatgcattaatatttgttgaaggtgtagaaatatat
cctaaagacggaatatgggatgatgaaacaactaacacaagtccatggacaggaaatgat
gactattacggcaactggtggggcggtaacttaagaggtgtgaaagattatcctattgat
ttaggaaagcatcaaaaacagttggtttactcaccacatgattatggtccattggtattt
gagcaatcatggttcaaaggcgaattcgttaccgcagatgatgctaaagctaaaaaaata
ttatatgaacagtgttggagagacaattgggcttatattatggaagatggtatttcccca
ttactacttggtgaatggggtggcttaacagaaggaaatgataagctacttgacctaaac
cttaaatatcttagatctatgagagactatattttagaaaacaaatataagctgcatcac
actttatggtgcatcaatattgattcagccgatactggcggattattcactcgtggtgaa
ggaacaccttttgaaggcggaagagacctaaagtggaatgacaataagtatgataattat
ttgttgcctgtactttggaaaaatgctgatggaaaattccaaggtctcgaccataaaatt
cctttaggcagaaatggtgtgccattaggtacaactcctattgatgatgaagatgatgat
gaagatactgttaaatatggagacgtaaacaacgatggagatatcaacgctttagatata
gcagctttaaaaatgtatttattaggcgttaaccagagtattgatttaaaggctgcagat
gtaaatgttgataattcagtcgatgcaattgattttgcactcttaaagaaatatctctta
ggcgcagctacactacctgtaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
