Ruminiclostridium herbifermentans: EHE19_014650
Help
Entry
EHE19_014650 CDS
T07161
Symbol
ccsA
Name
(GenBank) cytochrome c biogenesis protein CcsA
KO
K02198
cytochrome c-type biogenesis protein CcmF
Organism
rher
Ruminiclostridium herbifermentans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rher00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
rher02000
]
EHE19_014650 (ccsA)
Transporters [BR:
rher02000
]
Other transporters
Others
EHE19_014650 (ccsA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cytochrom_C_asm
CcmF_C
ResB
Sdh_cyt
MFS_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNU68901
UniProt:
A0A4V6EP01
LinkDB
All DBs
Position
3665312..3667204
Genome browser
AA seq
630 aa
AA seq
DB search
MNFIGTWMLRFAFACCLTAFLLIVFKKESDESKNLGILTGVVSCFGVLISSILLFYSLIS
GIFSVEYVYHSTEKSLPLIYKISAFWSGSSGSMLFWTSAFAVLLIIIYFRDRHKNSTKTI
FGVLLFVMTLFMFVVTFINNPFKLVSAESDGFGLNPALQSLGMVFHPPVIIISFSFFFIA
FAYQLFDIRKNTEEHVEITWKWAMWGWILLTFGIVTGGIWAYTELGWGGYWAWDPIENSS
LVNWLFATAFIHGLRIKGKNNKRMNFVLIFLTVFTILVGTYIARSGLLESVHAYSSRGVT
VVFGVVLLVLILFFIIYNFKIKKLHANDISDNHNENSFKKILLALIKPSNMFSTLTIITA
VLVFGGTTFPLYGGLFVSDASATPISFYEYVFGIYGILILLIMAINPMFSPKKFLLIPGS
ACGLIILGLMLFLTEYSILTNLCLSVCAMLTVNLIIQLVIKYKNRTVHLSHTANILLHAS
LIIMAVGVACSMGMLVSTNETLEKGNVMVVKEYEVKYRNLYWKEEPGKTTAVSVVGVSGP
MGKIQLKPELSYYQKMKTAHSRAVIKSTFKEDLYIIFEGIDENDNISLKVKIVKWISLIW
IGSVLLILGTVLYYFSETKKTKDKLIKKLE
NT seq
1893 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattttattggtacatggatgttgcgttttgcttttgcatgttgtcttactgctttc
ctgcttattgtatttaaaaaagaaagtgatgagagcaaaaatcttggaattctaacaggt
gttgtttcctgtttcggagttctgatatcttcaattcttctattttattcactaataagt
gggatcttttccgttgaatatgtgtatcacagtacagaaaaatcactaccgctaatttat
aaaatttcagcattctggtcaggtagttcaggttcaatgcttttttggacttcagcgttt
gccgttcttcttataataatttattttagagataggcataaaaattcaacaaaaaccata
tttggtgttttgctatttgttatgacactttttatgttcgttgtaacctttataaataac
ccatttaaactggtatctgctgaaagtgatggttttggccttaacccagcactacaaagt
ttaggtatggtctttcacccacctgttataattatttcgttttcatttttctttattgcc
tttgcatatcaattattcgacatcagaaaaaataccgaagaacatgtagaaatcacttgg
aaatgggcaatgtggggatggattcttcttacctttggtattgtaaccggtggaatttgg
gcttataccgaactaggatggggaggttattgggcttgggatccaatagagaattcatca
ttggttaactggttatttgcaaccgcttttattcatggtctgcgaatcaaaggcaaaaac
aataaacgaatgaatttcgttttgatatttttaactgttttcaccatacttgtgggaaca
tacattgcaagaagcggtttgctagaatcagtacatgcttatagcagtcgtggcgtaact
gtggtcttcggtgtggttttattggtgcttatattatttttcatcatttataacttcaaa
atcaaaaaattgcacgctaacgacatatcagataatcataatgaaaattcgtttaaaaaa
atattattggctttaattaagcctagtaatatgttttcaacactgactattatcacagct
gtattagttttcggtggtactactttccccttgtatggaggtctctttgtaagtgatgca
tcagcaacgccaataagtttctatgagtacgtttttggaatttatggtatcttaatactt
ctaattatggcaatcaatcctatgttttcacctaagaagtttcttcttattccaggctct
gcatgcggattaataatcttaggattaatgctgttccttactgagtatagcattctaaca
aatttgtgtttgtctgtatgtgcaatgcttacagttaacttgattatacaacttgtaata
aaatataaaaatcgtactgtacatttaagtcatacagcaaatatattactgcatgcttca
cttataataatggcagttggagttgcatgttctatgggtatgcttgttagcaccaatgaa
actctagaaaaaggcaatgtcatggttgttaaggaatatgaagtaaaatacaggaacctc
tattggaaagaggaaccaggaaaaactacagctgtttcagtggtaggtgtaagcggtcca
atgggaaaaatccaattaaaacctgaactatcttattatcaaaaaatgaaaacagcacac
tccagagcggtaataaaatcaacatttaaagaagatttgtatattatttttgaaggaata
gatgagaatgacaacatatcactaaaagtcaagatagtaaaatggataagccttatttgg
attgggagtgttttactaatattaggtacagtactgtattatttttctgaaaccaaaaaa
acaaaagataaattaataaaaaaattagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
