Ruminiclostridium herbifermentans: EHE19_014730 Help Entry EHE19_014730      CDS       T07161                                  Name (GenBank) pectate lyase   KO K01728   pectate lyase [EC:4.2.2.2] Organism rher  Ruminiclostridium herbifermentans Pathway rher00040   Pentose and glucuronate interconversions rher01100   Metabolic pathways rher02024   Quorum sensing Brite KEGG Orthology (KO) [BR:rher00001]  09100 Metabolism   09101 Carbohydrate metabolism    00040 Pentose and glucuronate interconversions     EHE19_014730  09140 Cellular Processes   09145 Cellular community - prokaryotes    02024 Quorum sensing     EHE19_014730 Enzymes [BR:rher01000]  4. Lyases   4.2  Carbon-oxygen lyases    4.2.2  Acting on polysaccharides     4.2.2.2  pectate lyase      EHE19_014730 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Pectate_lyase_4 Dockerin_1 Beta_helix Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  QNU66122 UniProt:  A0A4U7JJL0 LinkDB All DBs Position complement(3690814..3693117) Genome browser AA seq 767 aa AA seqDB search MFKRFKAIILAGLVLAQSVVGFSGGADVKAATGSELFGLVGFATLNGGTTGGTGGKVVTS KNLTDINNLLNQRKKDKDTSPLIIKINGKISGTEAIAVKEVSNITITGVGTSGELDGVGI NIVKSNNIIVQNLKIHNCLAPMDCIGIENSKNIWIDHCELYNMLGDCNGDGVVDTKGDIA GGDVDWYDGLLDCKKDSAYITVSWNYFHDSFKCSLVGSSDSDNYDRKMTYHHNIFKNIKE RTPSYRFGTGHIFNNYFGDVLNSAVNSRMGAQLLIEGNYFERVGSGSINSESGLAAGPIG AYNSDVNGLWNVRNNVFDNCKGNQPTTSNCSFTPSYSYSNVLSSVNDVKSIVARYAGIGR LDGSNNSVIDLGISNIGDEDPGENPDNPGQNPENPGQNPGGKIVYGDTNGDGFVDAIDYA NYKKYLLGQISYIDIEVYDLDGDKAVTALDYAIFKKYLLGLISVFPVDNSTTPGDDNPPE DGNITIEPNGPITLQQAIDSIKPGKTIYLKGGTYYFSKTVIIAEGNNGSAGSTKNIAALG NEKPVLDFSSMAFNSSNRGVVLAGNYWNIKGIKIQKAGDNGMLLAGHNNTIDSCEFYANK DTGLQLSRYNSAYNSISQWPSNNTIINCYSHNNYDPDDGEDADGFAAKLTCGSGNKFIGC VSKYNIDDGWDLYTKDDTGPIGSVYLENCEASYNGRTEEGISTTDSDGNGFKLGGSKISV DHTLINCKAFNNKKHGFTWNSNPGKLTLIGCQASGNGGNNFEKVTNN NT seq 2304 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgttcaaaagatttaaagctatcattttagctggcttagtgctagcacagtcagttgtt ggctttagcggtggtgctgatgttaaagctgcaactggcagtgaactttttggactagtg ggttttgcaacactaaatggtggtactacaggaggaacagggggtaaggtagtaacatct aaaaacctaacagacataaataatctgttaaaccaaagaaaaaaggataaagatacttct ccgcttattataaaaataaacgggaagatttctggaacagaagcaattgcagtaaaggaa gtttcaaacatcaccattactggtgttggaactagcggtgaattagatggtgtgggaatt aacattgtaaaatccaataacataatcgttcagaacctgaaaatacataattgcttagct cctatggattgtataggaattgagaacagcaaaaatatatggattgaccattgcgaactt tacaatatgcttggtgattgcaatggtgacggggtagtagacacaaaaggtgatattgct ggaggagacgttgactggtacgatggcttgcttgattgcaagaaggatagtgcatatatt acagtgtcgtggaactactttcatgactctttcaaatgcagtttagtgggaagttcagac agtgacaactacgacagaaaaatgacgtatcaccataacatatttaaaaacattaaagaa cgaaccccaagttatagatttggtacaggacacatctttaataattactttggcgatgtt ttgaatagtgcagtaaattccagaatgggagcacagctgcttattgaggggaactatttt gaaagagttggttctggaagcataaattcagaatcaggacttgctgcaggccctataggt gcatataacagcgatgtgaacggcttatggaatgtaaggaacaatgtgtttgataattgt aagggcaatcaacccacaacttcaaattgcagctttaccccatcatattcctactcaaat gttttatcaagtgtaaatgatgtaaagtcaatagtagcaagatatgcgggtataggaaga cttgatggctccaataacagtgttattgatcttggaataagtaatattggcgatgaagac cccggtgaaaatccagataatccaggtcaaaacccagaaaacccaggacaaaacccagga ggcaaaatagtatatggagataccaacggtgatggttttgttgatgcaatagactatgca aactataagaagtatctgttaggacaaataagctacatagatatagaggtttacgatcta gacggtgataaagcagtaactgcccttgattatgccatttttaaaaaatatttgcttgga ctaatatcagtttttcctgttgataatagtacaacgccaggtgatgataatccaccagaa gatggtaacattacaatagaaccaaatggtccaatcaccttacaacaggctattgatagt attaagcctggaaaaactatttatttaaagggtggtacttattatttttccaaaactgta attattgcagaaggaaataacggcagtgcaggaagtactaaaaatatcgctgctctaggc aatgaaaagcctgtattggatttctcatctatggcatttaattcatcaaatagaggggta gtactagcagggaactattggaatattaaaggtataaaaattcaaaaggccggtgacaat ggtatgctgctggcaggtcacaacaataccattgacagctgtgaattctatgcaaataag gatacaggtcttcagctgtctagatataattcagcatataattctataagccagtggcca agcaataacactattatcaactgctactctcacaacaactatgaccctgacgatggcgaa gatgcagacggatttgcagctaagcttacatgtggcagcggcaataaatttataggctgt gtatcaaagtataatattgatgacggttgggacctatacacaaaggatgatacaggacca attggctcagtatacttagaaaactgtgaagcaagctacaatggaagaactgaagaaggt atatctaccactgatagcgatggaaatggatttaagcttggaggctcaaaaataagcgta gaccacacactaataaattgcaaagcctttaacaacaaaaagcatggcttcacatggaat agcaatcccggaaagcttacattaatagggtgtcaagccagcggcaatggtggaaataac tttgaaaaggtaacaaataattag

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