Ruminiclostridium herbifermentans: EHE19_017675
Help
Entry
EHE19_017675 CDS
T07161
Name
(GenBank) carbohydrate-binding protein
Organism
rher
Ruminiclostridium herbifermentans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CBM_6
Esterase
Dockerin_1
CBM_35_2
EF-hand_5
EF-hand_7
EF-hand_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNU68934
UniProt:
A0A4U7JKD5
LinkDB
All DBs
Position
complement(4357701..4359185)
Genome browser
AA seq
494 aa
AA seq
DB search
MDKKIIPAFLSFALLCAMPVGQVKAETLPVLPPSGFDQVQSNVQRGQVSTFTYFSKATNS
NRNARIYLPPGYSTNNKYSVLYLLHGYGGNENDWYSGGGSANVILDNLLAQDKIKPFIVV
IPNANATGAGISDGYLNFKADLLNSLIPYVESKYSVYTDREHRAIAGLSLGGAQSINFGL
TNLDVFGYVGGFSPGGPASITNTNFFPDPSTTKRLNKLLFICIGTNDSMGFSESVVNSCK
QYGIPHTYFLIPGRGHDWTVWKPSLWNFAQMACASGFTDYGPVTPPEPISAFEKIEAEKY
TFQSGVEIEANPEGDGQNIGYIQNGDYTVYQKVDFGSGAAKFIARAGSDSNGGNIEIRLD
SLTGTLIGTCAVPNTGGWKAWTEVSCDVSKVTGEHDLYLKFTGSESYLLNLDWFQFVKEA
ESSTIVGDLNGDKSIDATDYALLKMYLLGSIDKFPVEDGIKAADLNGDGTIDALDFATFK
QYLLGSITELPYAK
NT seq
1485 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataaaaaaataatacctgcatttttaagttttgccttattatgtgcaatgccagtg
ggtcaggttaaagcagagacacttccggttctgccaccatcaggatttgaccaagtccag
agcaatgttcaacgtggtcaggtcagcacttttacatatttctcaaaagcaacaaacagc
aatagaaatgcaagaatatatctcccaccaggatattcaacaaataataaatacagcgtt
ttgtatttgttacatggttatggaggaaacgagaatgactggtatagcggtggaggctca
gctaatgtaattttagataatcttcttgctcaagataaaatcaagccatttattgttgta
atacctaatgcaaatgcaacaggagcaggaatatcagatggatatttaaatttcaaagct
gatttgcttaacagcctaataccctatgttgaatcaaaatattctgtttacacagacaga
gaacacagagctattgcaggattatctttgggtggtgcacaatcaataaattttggacta
actaatttagatgtatttggatatgtaggaggattctcaccaggaggacctgcttcaata
actaatactaattttttcccagatccttcaacaactaagaggttaaataagcttttattt
atttgtattggaacaaatgatagtatgggatttagtgaaagtgtagttaattcttgtaaa
caatatggtattccgcacacatatttccttatccctggaagaggtcacgactggacagta
tggaaaccaagcttatggaattttgcacaaatggcgtgtgctagtggatttacagattac
ggtccagttacacctccagaacctatatcagcatttgaaaaaatagaagcagagaaatat
actttccaatcaggagttgagattgaagctaatcctgaaggagacggtcagaatataggt
tatatccaaaacggagactatacagtttaccaaaaagttgatttcggcagtggtgctgca
aaattcatagcaagagctggaagtgattcaaatggcggaaatatagaaattcgtttggat
agtctgacaggaacactaataggaacttgtgccgtacctaatacaggcggatggaaagca
tggactgaagtatcctgtgatgtcagcaaagttactggagagcatgatttatatctgaaa
tttacaggaagcgaaagttacttattaaacttagattggttccagtttgtaaaggaagct
gaatcttcaactattgtcggtgatctaaatggcgataagagtattgatgcaacagactat
gctctattgaaaatgtatcttcttggctcaatagataaattcccagtagaagatggtatt
aaagccgcagatttaaatggtgacggtactatcgatgcgttggattttgcaacatttaaa
cagtatctattaggaagtattacagagttgccttatgcaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system