Rodentibacter caecimuris: FEE42_07620
Help
Entry
FEE42_07620 CDS
T06473
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
rhey
Rodentibacter caecimuris
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Bactofilin
GMPPB_C
ESPR
YadA_anchor
YadA_head
LbH_EIF2B
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIA77234
LinkDB
All DBs
Position
1511913..1520852
Genome browser
AA seq
2979 aa
AA seq
DB search
MNKIFKVIFNHTTQTWMAVSELAKGHCKSSSNSTVEVSDKSEVKGKSFAGIKTIAITSAV
MMAVVVPNAFAIQAGSGEIKHKSGQGTAIAGGEATGDSNAIAIGIENNKQWGETRAKAAA
PGAIAIGTGSNVTTRVGVALGYRASATGSNNGDQDFPSVAVGGYTNANGLEATAVGGRSQ
ADGRGTASFGANATANGEGATAVGFKSNATNAGTTAVGTSSLANGETATAVGGNSNATGK
GAVALGANTTTNGAGSTAVGFLSKATAAGGTAIGTNTTAGTGVAIGQDASASNGRTDKAS
VAVGVKATANGELTTAIGTGATAKSGETVALGANATAGAPWQNHATAIGANSKAVHQGGV
ALGFYSETERAGTSTNFTVKNDSGNNINTDNFAGAAKTGDPSDSNDITRVVSVGNGTMKR
QIINVAAGRVSATSTDAINGSQLYQAMKHTGFNIQQNGSTKSRINNDGLVNFTNGDYTTA
VVTDGDNSSSVKMNVVTQNISTDARGVTNVSGNTAGLTTAKTVSDAINNALNNSSFLLKA
NDDAGEKITRNSSINIAQGKNINVERNGSTITVKTVDNPKFKQVDVDKQLNVAAGGSLTV
SGTSNLRGNILLGGEGKNITFQSGSTVHMGDNKITNVNNGTAKTDAVNKGQLDDVSKVAN
AANTTANAANTTANTANSTANAANTTANTANATANAANTTANTANTTANAANTTANTALN
KVNQGWNINTGKAEGGNVEGNSSTNVQMGDTVKVIAGKNLNITQSGKDITLSVNDSPNFT
SITTSNGATIGGDLTVNGTTKTKDLNVTNNANIEKNLTVKGDSTVKGNSAVEGTTTTKDL
NVTNNATVNNLTATNGTITNLNSTNGTITNLNSTNGTITNLNSTNGTITNLNSTNGTITN
LNSTNGTITNLNSTNGTITNLNSTNGTITNLNSTNSTITNLNSTNGTITNLNSTNGTITN
LNSTNGTITNLNSTNGTITNLNSTNGTITNLNSTNGTITNLNSTNGTITNLNSTNGTITN
LNSTNSTITNLNSTNGTITNLNSTNGTITNLNSTNGTITNLNSTNGTITNLNSTNGTITN
LNSTNGTITNLNSTNGTITNLNSTNGTITNLNSTNGTITNLNSTNGTITNLNSTNGTITN
LTSENGTFSNNLTSTGETLLSGNTTVGGQGKTFTVANGTKVDMGGNVISNITDGNISEGS
KDAITGGQLHSTIQNITTSLTNQGMNFTGNNGVVVTRKLGETLTVQGSLAENKEADSSNI
RTVANATTGAIEIVMAKDPTFRNLTATGNATVGGDLGVNGTTTTKDLNVTNNANIEKDLT
VKGNSTVDGNSTVNGTTTTKDLNVTNNANIEKDLTVKGNSTVDGNSTVNGTTTTKDLNVT
NNANIEKDLTVKGNSTVDGNSTVNGTTTTKDLNVTNNANIEKDLTVKGNSTVDGTTTTKD
LNVTNNANIEKDLTVKGNSTVKGSSTVEGDSTVKGNVTVEGSTTTKDLTVTNNATVNNLT
ATNGTITNLTSENGTFSKNLTSTGETVLSGNTTVGGQDKTFTVANGTKVDMGGNVISNIT
DGNISEGSKDAITGGQLHTTIQNITSSLTDKGLSFTGNSGNTSRKLGETLNITGTATTSG
NYSSKNVKTVVTEGKVEIQIAERPEFETISTTGDATIGGNSTVNGDSTVKGNATFEKDTV
TKGNATVEGTTTTKDLNVTNNANIEKDLTVKGNSTVNGNSTVEGDSTVKGNATFEKDTVT
KGNATVEGTTTTKDLNVTNNANIEKDLTVKGNSTVKGNSTVEGDSTVKGNATFEKDTITR
GNATVEGTTTTKDLNVTNNANIEKDLTVKGNSTVKGNSTVEGDSTIKGNATFEKDTVTRG
NATVEGTTTTKDLNVTNNANIEKDLTVKGNSTVKGNSTVEGDSTVKGNATFEKDTVTKGN
ATVEGTTTTKDLNVTNNANIEKDLTVKGNSTVKGNSTVEGDSTVKGNATFEKDTVTRGNA
TVEGTTTTKDLNVTNNANIEKDLTVKGNSTVKGNSTVEGDSTVKGNATFEKDTVTKGNAT
VEGTTTTKDLTVTNNATVNNLTATNGTITNLTSENGTFSNKLTSTGETVLSGNTTVGGQD
KTFTVANGTKVDMGGNVISNIGEGNVTEGSKDAVTGGQLYTTIQDFSNLTGKGLNFTGNN
GEIVNRKLGETLTVKGSLAEDKEADSSNIRTVANATTGAIEILMAKDPTFRNLTTTGNAT
IGGNLDVDGTTTTKDLTVTNNATIEKDLAVKGNSTVDGDSTVKGNATFEKDTLTKGNATF
EKDTLTKGNATFEKDTLTKGNATVEGDSTVKGNATFEKDTLTKGNATFEKDTLTKGNATV
EGDSTVKGNATFEKDTLTKGNATVNGDSLVKGNSTVEGDSTVKGNATFEKDTLTKGNATV
EGDSLVKGNSTVEGDSTVKGNATFEKDTLTKGNATVEGDSTVKGNATFEKDTLTKGNATV
NGDSLVKGNSTVEGDSTVKGNATFEKDTLTKGNATVEGDSLVKGNSTVEGDSTVKGNATF
EKDTLTKGNATVEGDSTVKGNATFEKDTLTKGNATFEKDTLTKGNATVEGDSTVKGNATF
EKDTLTKGNATVNGDSLVKGNSTVEGDSTVKGNATFEKDTLTKGNATVEGDSLVKGNSTV
EGDSTVKGNATFEKDTLTKGNATVEGDSLVKGNSTVEGDSTVKGNATFEKDTLTKGNATV
EGDSLVKGNSTVEGDSTVKGNATFEKDTLTKGNATVEGDSLVKGNATIEGTTTTQDLLVN
GDSTTKGNSTIGGSLTVEGNTVLQDVTINKSLTLADNAKIDLGNSDIEGSFNIYGNTDKK
TLSQALDQLQMTGPLVYVDPKTNKDVQHRTDVVRLNSGSDKPVRVTNVADPKEASDAVNL
GYFDKKLSLNMRDVHSRINRVDRRLRSGIASAVAMSLLPQSYRAGESVVSVGGGTYRGAS
AIAVGYSRVTDNGRVIIKIGGSANNSGDYAGGAAVGWKF
NT seq
8940 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaaatctttaaagtaattttcaaccacaccacgcaaacttggatggcggtatct
gagttagcaaaagggcattgtaaatcctcctctaatagcaccgttgaggtttcggataaa
agtgaagtaaaagggaaatcttttgccggtattaagactattgctattacatctgcagtg
atgatggcagtggtggtaccaaatgctttcgccatacaagccggtagtggggaaattaaa
cacaaatcggggcaaggtactgcaattgcaggtggtgaagcaaccggtgatagtaatgca
attgctattggtatagaaaataataaacagtggggtgaaactcgagcaaaagccgcagcc
ccaggagctatcgcaattggtaccggctcgaatgtaacaacaagagttggggtagcactt
ggttatcgggcaagtgctacgggaagtaataacggtgatcaggatttcccttcagtagca
gttggtggatatacaaatgctaatggtttggaagctactgcagttggtggtcgctctcaa
gcagacggaagaggtactgcatccttcggagccaacgctacagcaaatggtgaaggagca
acggcagtcggttttaaaagtaatgcaacaaatgctggcacaacagcagtaggtacgagt
agtcttgctaatggtgaaacagccaccgcagtagggggaaattcaaatgctaccggtaaa
ggagctgttgctttaggagcaaatactacgacaaatggcgcaggttcaacagctgttggt
tttttatctaaagcgacagcggcaggtggtacagctattggtacgaatactaccgcagga
acaggtgttgcgattggtcaagatgcctctgcatcaaatggtcgtactgataaagccagt
gtggcagtaggggtaaaggcaactgcaaatggtgaattaacaaccgctattggaacaggg
gctactgctaagtcaggtgaaaccgtagcgttaggagcgaatgctacggcaggcgctcct
tggcagaaccatgcaactgcgataggggctaattctaaagccgttcatcaaggtggtgtg
gcattaggcttttattcagaaactgaacgagctggaacatcaacaaactttacagtaaag
aatgattctggcaacaatattaacactgataattttgctggagcagccaaaacaggggat
cctagcgatagtaatgatattactagggttgtatctgttggcaatggaacaatgaaacgc
caaattattaatgttgcagcagggcgggtttcagcaacatcaaccgatgcaatcaatggt
agccaactttatcaagcaatgaaacatacgggttttaatattcaacaaaacggcagtaca
aaatctcgtattaataatgatggtttagtgaatttcactaatggcgactatacaacagca
gtggttaccgatggtgataatagttcatctgtcaaaatgaatgtggtgacacaaaatatt
tctactgatgcaagaggtgttaccaacgtttcaggtaatacagcaggtttaacaaccgct
aaaaccgtatcagatgcaattaataatgcactcaataattctagtttcttgcttaaagct
aatgatgatgccggtgagaagatcacacgaaatagttcaatcaatattgctcaaggaaaa
aatattaatgtagagcgtaacggtagcacaattacagtcaagaccgttgataatccgaaa
tttaagcaagtcgatgtggacaagcaattgaatgtagccgcaggtggttcattaacagta
tccggtacatcaaatttacgtggtaacattctacttggaggtgaaggtaaaaatattact
ttccaaagtggttccactgtacacatgggtgataataagatcactaatgtaaataatggt
acagcaaaaacggatgcggtaaataaaggacagttagatgatgtaagcaaggttgctaac
gctgctaatactacggcaaatgcagccaatacaaccgcaaataccgctaattcaactgcg
aatgcagctaacacaactgcaaatactgctaatgcaactgcgaatgcagctaacacaact
gcaaatactgctaatacaactgcgaatgcggctaacactacggcaaacaccgccctaaat
aaagttaatcaaggttggaacatcaatacaggaaaggccgaaggcggtaatgtagaaggt
aatagttcgaccaatgttcagatgggcgatactgtaaaagttattgcaggaaaaaatctt
aatatcactcaaagcggcaaagatattacattatctgttaatgattcaccgaatttcacc
agcattacaacgagcaatggtgcaacgattggcggagatttaactgttaatggcacaacc
aaaactaaagacttaaatgtcaccaacaatgcaaacattgagaaaaacttaaccgttaaa
ggtgattctacggtgaaaggtaactctgctgttgaagggacaaccacaaccaaagactta
aatgtcaccaataatgctaccgttaataatttaacagcaaccaacggtacgatcactaac
ctgaattcgactaacggtacaatcactaacttgaattcaactaacggtacaatcactaac
ctgaattcaactaacggtacaattactaacttgaattctaccaatggtacaatcactaac
ctgaattcaactaacggtacaattactaacttgaattctaccaacggtacaatcactaac
ctgaattcaactaacggtacaattactaacttgaattctaccaacagtacaatcactaac
ctaaattcgactaacggtacaattactaacttgaattctaccaatggtacgatcactaac
ttgaattctaccaatggtacgatcactaacctgaattcgactaacggtacaattactaac
ttgaattctaccaacggtacaatcactaacctgaattcaactaacggtacaatcactaac
ctgaattcaactaacggtacaattactaacttgaattctaccaacggtacaatcactaac
ctgaattcaactaacagtacaatcactaacctgaattcgactaacggtacgatcactaac
ctgaattcaactaacggtacaatcactaacctgaattcaactaacggtacaattactaac
ttgaattctaccaacggtacaatcactaacctgaattcaactaacggtacaattactaac
ttgaattctaccaacggtacaattactaacttgaattctaccaacggtacaattactaac
ttgaattctaccaacggtacaatcactaacctgaattcaactaacggtacaattactaac
ttgaattctaccaacggtacaatcactaacttgaattctaccaatggtacaatcaccaat
ttaacgtctgaaaatggcacgtttagcaataacctgacttccacaggtgaaactctatta
tccggtaacacaactgtaggtggtcaaggtaaaacatttacggtagcgaatggcacaaaa
gtggatatgggtggcaatgttatcagcaacattactgacggaaatatctccgaaggcagt
aaagatgcgataacaggtggtcagcttcactcgacaattcaaaacattacaacaagtcta
accaatcagggtatgaattttacggggaacaatggtgtagttgtcacccgtaaattaggt
gaaacacttacggttcaaggtagcttagcagagaataaagaagctgatagcagcaatatt
cgtacagttgcaaatgcaacgacaggtgcgatagaaattgtgatggcaaaagaccctaca
tttcgtaacttaacagcgactggtaatgcaaccgtaggcggtgatttaggtgtaaatggt
acaaccacaacaaaagacttgaatgtgaccaacaatgccaatatcgaaaaagatttaacg
gtaaaaggtaattcaaccgttgatggcaactcaacggttaatggcaccaccacaaccaaa
gatctgaatgtgaccaacaacgccaatatcgaaaaagatttaacggtaaaaggtaattca
accgttgatggcaactcaacggttaatggcaccaccacaaccaaagatctgaatgtgacc
aacaacgccaatatcgaaaaagatttaacggtaaaaggtaattcaaccgttgatggcaac
tcaacggttaatggcacgaccacaaccaaagatctgaatgtgaccaacaatgccaatatc
gaaaaagatttgacggtaaaaggcaattcaaccgttgatggcacgaccacaaccaaagat
ctgaatgtgaccaacaacgccaatatcgaaaaagatttgacagtgaaggggaattcaacg
gtgaaaggtagttctactgttgagggcgatagcacggtcaaaggtaatgtgacagttgaa
ggttcaacaaccactaaagatcttactgtcactaataacgcaacagtgaacaatttaact
gcgacaaacggcacaatcaccaatttaacttctgaaaatggtacgtttagcaagaacctg
acttccactggtgaaaccgtattatctggtaatacaactgtaggtggtcaagataaaacc
tttactgtagcgaatggcacaaaagtggatatgggtggcaatgttatcagcaacattact
gacggaaatatctccgaaggtagtaaagatgcgataacaggtggtcaattacacaccaca
attcaaaatatcacctcaagcctaacagataaagggttaagctttacaggtaattcagga
aatacaagtcgtaaattaggtgaaacattaaatatcacgggaacagctacaacaagcggt
aactatagctctaaaaatgtcaaaaccgtggtgaccgagggtaaagttgaaattcaaatt
gcagaaagacctgaatttgaaacaatttcaaccacgggtgatgcaacaattggtggtaat
tcaacagtgaacggtgatagcacagtcaaaggcaatgcgacttttgagaaagatactgtc
accaaaggtaatgcgacagttgaaggcacgaccacaaccaaagacttgaatgtgaccaac
aatgccaatatcgaaaaagatttgacggtgaagggcaattcaaccgtgaatggcaactct
actgttgagggagatagcacagtcaaaggcaatgcaacttttgagaaagatactgtcacc
aaaggtaatgcaacagttgaaggcacgactacaaccaaagatttgaatgtaaccaacaat
gccaatatcgaaaaagatttgacggtgaagggcaattcaacggtgaaaggtaactctact
gttgagggtgatagcactgtcaaaggcaatgcaacttttgagaaagatactatcaccaga
ggtaatgcgacagttgaaggcacgactacaaccaaagatttgaatgtaaccaacaatgcc
aatatcgaaaaagatttgacggtgaagggcaattcaacggtgaaaggtaactctactgtt
gagggtgatagcacgatcaaaggcaatgcgacttttgagaaagatactgtcaccagaggt
aatgcgacagttgaaggcacgactacaaccaaagatttaaatgtaaccaacaatgccaat
atcgaaaaagatttgacggtgaagggcaattcaacggtgaaaggtaactctactgttgag
ggcgatagcacggtcaaaggcaatgcaacttttgagaaagatactgtcaccaaaggtaat
gcgactgttgaaggcacgaccacaaccaaagacttgaatgtgaccaacaatgccaatatc
gaaaaagatttgacggtgaagggcaattcaacggtgaaaggtaactctactgttgagggt
gatagcacggtcaaaggcaatgcaacttttgagaaagatactgtcaccagaggtaatgcg
actgttgaaggcacgactacaaccaaagatttaaatgtaaccaacaatgccaatatcgaa
aaagatttgacggtgaagggcaattcaacggtgaaaggtaactctactgttgagggtgat
agcacggtcaaaggcaatgcgacttttgagaaagatactgtcaccaaaggtaatgcgact
gttgaaggcacaacaaccaccaaagatcttactgtcacgaataacgcgacagtgaataat
ttaactgcgacaaacggcacaatcaccaatttaacttctgaaaatggcacgtttagcaat
aaactgacttccacaggtgaaaccgtattatccggtaatacaactgtaggtggtcaagat
aaaacctttactgtagcgaatggcacaaaagtggatatgggtggcaatgttatcagcaat
attggtgaaggaaatgtcacagagggtagtaaagatgcagtaacaggtggtcaactttac
acaacgatccaagacttcagtaatcttacaggtaaaggtctgaatttcacgggaaataat
ggtgaaattgtcaaccgtaaattaggcgaaacactgacagttaaaggcagtttagcagag
gataaagaggctgatagtagtaatattcgtactgtagctaatgcaacaacaggtgcgata
gaaattctaatggcgaaagatcctactttccgtaatttaacaaccacaggtaatgcaact
attggtggtaacttagatgtagatggcacaaccacaactaaagatctgactgttactaat
aacgctacaattgaaaaagacttagcagttaaggggaattcaaccgttgacggtgatagt
accgttaaaggaaatgctacctttgagaaagatactcttactaaaggcaatgcgaccttt
gagaaagatacccttactaaaggaaatgcgacctttgaaaaagataccttaacgaaaggt
aacgcaactgttgaaggcgacagcaccgttaaaggaaatgctacctttgagaaagatact
cttactaaaggcaatgcgacctttgaaaaagataccttaacgaaaggtaacgcaactgtt
gaaggcgacagcaccgttaagggaaatgctacctttgagaaagatactcttactaaagga
aatgcaacggttaatggtgatagccttgtgaaaggcaattcaaccgttgaaggtgacagc
accgttaaaggcaatgcaacctttgagaaagacaccttaacgaaaggtaacgcaaccgtt
gagggcgacagccttgtgaaaggtaactctacggttgaaggtgacagcaccgttaaaggc
aatgcgacctttgagaaagacaccttaacgaaaggtaacgcaaccgttgaaggcgacagc
accgttaaaggaaatgctacctttgagaaagatactcttactaaaggaaatgcaacggtt
aatggtgatagccttgtgaaaggcaattcaaccgttgaaggtgacagcaccgttaaaggc
aatgcaacctttgagaaagacaccttaacgaaaggtaacgcaaccgttgagggcgacagc
cttgtgaaaggtaactctacggttgaaggtgacagcaccgttaaaggcaatgcgaccttt
gaaaaagataccttaacgaaaggtaacgcaactgttgaaggcgacagcaccgttaaagga
aatgctacctttgagaaagatactcttactaaaggcaatgcgacctttgaaaaagatacc
ttaacgaaaggtaacgcaactgttgaaggcgacagcaccgttaagggaaatgctaccttt
gagaaagatactcttactaaaggaaatgcaacggttaatggtgatagccttgtgaaaggc
aattcaaccgttgaaggtgacagcaccgttaaaggcaatgcaacctttgagaaagacacc
ttaacgaaaggtaacgcaaccgttgagggcgacagccttgtgaaaggtaactctacggtt
gaaggtgacagcaccgttaaaggcaatgcaacctttgagaaagacaccttaacgaaaggt
aacgcaaccgttgagggcgacagccttgtgaaaggtaactctacggttgaaggtgacagc
accgttaaaggcaatgcgacctttgagaaagacaccttaacgaaaggtaacgcaaccgtt
gagggtgacagtcttgtgaaaggtaactctacggtcgaaggtgacagcaccgttaaaggc
aatgcaacctttgagaaagacaccttaacgaaaggtaacgcaacggttgagggtgacagt
cttgtgaaaggtaatgcaacgattgaaggtacaaccaccactcaagatcttttggtgaat
ggcgacagtaccacgaaggggaattcaacgattggaggaagtctaaccgttgaaggcaat
actgttttacaagatgtaacgattaataaatctttaactcttgcggataatgcgaaaatt
gatttaggtaattctgatattgaaggtagctttaatatttatggcaataccgacaaaaaa
acgcttagtcaggcattggatcaattacaaatgaccggaccactcgtttatgtcgatcct
aaaacaaacaaagatgttcaacatcgaacagatgttgtaagactcaatagcggctcggac
aaacctgtacgggtaacaaatgtcgcagatccgaaagaagccagcgatgcagtaaatctc
ggttattttgacaagaaattgtcgctaaatatgcgcgatgtgcatagtcgtattaatcgg
gttgatcgtcgcttacgcagtggtatcgcttccgctgttgcaatgagcttactaccgcaa
tcttatcgtgcaggtgaaagtgttgtgagtgtgggtggtggtacttaccgtggtgcatcg
gcaatcgcagtgggctactccagagtgaccgacaacggtcgcgttattatcaaaatcggt
ggtagtgcgaacaattcaggagattatgccggtggtgcagcggttggttggaagttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
