Rhodoferax aquaticus: EXZ61_19375
Help
Entry
EXZ61_19375 CDS
T06176
Name
(GenBank) hemolysin
Organism
rhg
Rhodoferax aquaticus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
HCBP_related
Pro_Al_protease
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDL56146
UniProt:
A0A515ETZ8
LinkDB
All DBs
Position
complement(4202203..4207335)
Genome browser
AA seq
1710 aa
AA seq
DB search
MTVPYVNLSHIQLTDLASMRIDGRYVEAYEYMRDIVHDKRIQTTDTGRSYDLLKLENWLD
RAASINGNDGSLSSEFVRGATEGIRERLGNPLSDAEFQAASDALADKVLTDVIDGLGIPS
AKDIIERDVAQAVGKPSDGGLGLPGWGWAGTLGDFLPPPLGLGGNYQSIDGVSVRDYAKN
LMDSASSQLIDGLGRVLRSNWGQFDKLIVGKDLAGINDIEYDINGNVNGLTTQALNWVAP
RRDPLVLDLDGGGIKTSGINPAAPILFDQDGDGIQTATGWIASGEAIVVRDINGNGKIDS
GRELFGDATILTRGPKAGQTAAHGFEALADLDSNGDGKFDANDAAFASVKLWKDANQDGI
SQTNELFTFADLGVASIKVAGTASNVDLGGNNTQTFAGSFTTTTGTNGNAGTAQLAGSLL
LANNNFYRQFTDDPALTTAALALPQMQGSGLVRDLRPALSLGNSQAAALQAKLTQFAQDT
TRDQQMANLDAVIQSWGNTSAMQTSVKTNRTLRNFGGGGNVIGDINGVPVFGNTAIEKFS
LDNPAMYAKITALEQFNGQTILDKWVRNTTAWYVDPVTNQNKTYTYGTVTYSAEQEALIN
QAYDALKSSVYGALVVQTRLKPYLDSIGLVIDEKGVQFDATALLKMIATKKASDSTAALF
DLVDLDRFNAIPVPAIKQTVHDKLISELLELPHGSPLWNSLKPALAIPNLLTSLSPTGTS
GNETYIGDLENNVFDGATGNDTMYGGAGNDTLTGDYGNDTLIGGVGNDILYGGLGNDTYV
FKAGDGYDWISESDASTGNTDTVLFTDIKSTDITGIYNNGGSLRITYGSTDVLNISGFLA
SADYRMELFKFSDGVTWTVADIMARVSIQGTAGDDTMTGQDGQVNRMYGLAGNDKITGST
KDDVLDGGAGNDTLTGDYGNDTLIGGVGNDILYGGLGNDTYVFKAGDGYDWISENDASTG
NTDTVLFTDIKSTDITGIYNNGGGLRITYGSTDVLNISGFLASADYRMELFKFSDGVTWT
VADIMARVSIQGTAGDDTMTGQDGQVNRMYGLAGNDKITGSTKDDVLDGGAGNDTLTGDY
GNDTLIGGVGNDILYGGLGNDTYVFKAGDGYDWISENDASTGNTDTVLFTDIKSTDITGI
YNNGGGLRITYGSTDVLNISGFLASADYRMELFKFSDGVTWTVADIMARVSIQGTAGDDT
MTGQDGQVNRMYGLAGNDKITGSTKDDVLDGGAGNDTLTGDYGNDTLIGGVGNDILYGGL
GNDTYVFKAGDGYDWISENDASTGNTDTVLFTDIKSTDITGIYNNGGGLRITYGSTDVLN
ISGFLASADYRMELFKFSDGVTWTVADIMARVSIQGTAGDDTMTGQDGQVNRMYGLAGND
KITGSTKDDVLDGGAGNDTLTGDYGNDTLIGGVGNDILYGGLGNDTYVFKAGDGYDWISE
NDASTGNTDTVLFTDIKSTDITGIYNNGGGLRITYGSTDVLNISGFLASADYRMELFKFS
DGVTWTVADIMARVSIQGTAGDDTMTGQDGQVNRMYGLAGNDKITGSTKDDVLDGGAGND
TLTGDYGNDTLIGGVGNDILYGGLGNDTYVFKAGDGYDWISENDASTGNTDTVQYLGDVH
ADQLWFRKVNNNLEVSIIGNNGSVSINNWYLGSQYHVEQFKTSDGKTLLDSQVQNLVNAM
AAFAPPTAGQTTLTAAQQTALAPVIAANWQ
NT seq
5133 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacagttccttacgttaatctatctcacatccaacttaccgaccttgcttccatgcgt
attgatggacggtatgtcgaagcgtatgaatacatgcgcgacatcgtgcatgacaaacgc
attcagacaaccgacacgggtcgcagctatgacctgcttaaactggagaattggctggat
cgtgcggccagtatcaatggcaatgacggctcactcagcagtgagtttgtgcgcggcgcg
actgaaggcattcgtgagcgtttgggcaatccattaagtgacgcagagtttcaagcggca
tctgatgcactggcagacaaagttttgacggacgtaattgatggtttgggaatcccgagt
gccaaggacattatcgagcgagatgtggctcaagcagtgggtaaacctagcgatggcggc
ctcggtcttcccggctggggttgggctggtaccttgggtgattttcttccaccgccgctc
ggtttgggtggcaactatcaatctattgacggcgtttcggtcagggactatgcaaagaac
ttgatggattctgcgagttcgcagctgatagatggattgggccgggtgctgcgtagcaac
tggggtcagttcgataagctgattgttggaaaagacttagcaggcatcaacgacatcgaa
tacgacatcaatggcaacgtcaacggattgaccacccaagccctcaactgggtagccccc
cgccgcgaccccttggtcctagacctcgacggcggtggcatcaaaaccagcggcatcaac
cctgctgcccccatcctcttcgaccaagacggcgacggcatccaaaccgccaccggctgg
atcgcatcgggcgaagccattgtggtgcgagacatcaacggcaatggaaagatcgactcc
gggcgcgaactctttggcgacgccaccatcctcacccgtggccccaaagcaggccagacc
gccgcccacggctttgaagccttggccgacctggacagcaatggcgacggcaagtttgat
gcgaatgacgccgcatttgccagcgtcaaactgtggaaagacgccaaccaagacggcatc
agccaaaccaacgagctctttacctttgcagacttgggcgtagccagcatcaaggtggcc
ggcacggccagcaatgtggacttgggtggaaacaacacccaaacctttgctggcagcttc
accaccacaaccggcaccaatggcaacgcaggcaccgcccaacttgcaggcagcttgcta
ctggccaacaacaacttctaccgccaattcaccgatgacccggcccttaccaccgcagcc
cttgccctgccccaaatgcaaggcagcggtttggtgcgcgacctgcgcccggcattgagc
ctgggcaactcacaggccgcagcactgcaagccaagctgacccagtttgcgcaagacacc
acgcgcgaccagcagatggccaacttggacgcggtgattcaaagctggggcaataccagt
gcgatgcagactagcgtgaagaccaaccggactttgcgcaattttggtggtggtggcaat
gtcattggcgatatcaacggcgtccccgtgtttggcaatacagccattgagaaattttcg
ctggacaacccagccatgtacgccaagatcacggcgctggagcagttcaacggccagacc
atcttggacaaatgggtgcgcaacactacggcgtggtatgtggatccagtcaccaaccag
aataagacttacacctacggcacagtgacgtacagcgcggagcaagaggccttgattaac
caagcgtatgacgcgctaaagagcagcgtttacggggcgttggttgtacagactcgattg
aagccgtacttggacagtattgggctggtgattgatgagaagggggtgcagtttgatgca
accgcccttttgaaaatgattgccaccaaaaaggcctcggattcgactgctgcgttgttt
gatttggtggacttagaccgcttcaatgcaatacctgtgccagcaataaagcaaacggtt
cacgacaagttaatctcggaactcttggaattgcctcatggatcaccgttatggaattca
cttaaaccggcgcttgcaatccccaacttactaaccagtctgtcgccgactggaaccagc
gggaatgaaacatacattggcgatttagaaaacaatgtgtttgacggtgccacgggtaac
gacacgatgtacggcggtgctggcaacgacacgctcaccggcgactatggcaacgacacc
ttgatcggtggcgtgggcaacgacatcctgtacggcgggcttggcaatgacacctatgtc
tttaaggccggtgatggttatgactggatttcagagagcgacgccagcacaggcaacacc
gatacagtgctcttcaccgacatcaagtccaccgatatcacgggtatttacaacaacggc
gggagcctaagaatcacctatggcagcaccgatgtattgaatatttcggggtttctagcc
agcgctgattaccgaatggagctgttcaagttcagcgatggcgtgacgtggacggtggct
gacatcatggcccgggtctccattcaaggcaccgctggcgatgacaccatgactggccaa
gacgggcaagtcaaccgcatgtatggcttggccggtaacgacaagatcacgggctccacc
aaggacgatgtcttggatggcggtgctggcaacgacacgctcaccggcgactatggcaat
gacaccttgatcggtggcgtgggcaacgacatcctgtacggcgggcttggcaatgacacc
tatgtctttaaggccggtgatggttatgactggatttcagagaacgacgccagcacaggc
aacaccgatacagtgctcttcaccgacatcaagtccaccgatatcacgggtatttataac
aacggcgggggcctaagaatcacctatggcagcaccgatgtattgaatatttcggggttt
ctagccagcgctgattaccgaatggagctgttcaagttcagcgatggcgtgacgtggacg
gtggctgacatcatggcccgggtctccattcaaggcaccgctggcgatgacaccatgact
ggccaagacgggcaagtcaaccgcatgtatggcttggccggtaacgacaagatcacgggc
tccaccaaggacgatgtcttggatggcggtgctggcaacgacacgctcaccggcgactat
ggcaacgacaccttgatcggtggcgtgggcaacgacatcctgtacggcgggcttggcaat
gacacctatgtctttaaggccggtgatggttatgactggatttcagagaacgacgccagc
acaggcaacaccgatacagtgctcttcaccgacatcaagtccaccgatatcacgggtatt
tacaacaacggcgggggcctaagaatcacctatggcagcaccgatgtattgaatatttcg
gggtttctagccagcgctgattaccgaatggagctgttcaagttcagcgatggcgtgacg
tggacggtggctgacatcatggcccgggtctccattcaaggcaccgctggcgatgacacc
atgactggccaagacgggcaagtcaaccgcatgtatggcttggccggtaacgacaagatc
acgggctccaccaaggacgatgtcttggatggcggtgctggcaacgacacgctcaccggc
gactatggcaatgacaccttgatcggtggcgtgggcaacgacatcctgtacggcgggctt
ggcaatgacacctatgtctttaaggccggtgatggttatgactggatttcagagaacgac
gccagcacaggcaacaccgatacagtgctcttcaccgacatcaagtccaccgatatcacg
ggtatttataacaacggcgggggcctaagaatcacctatggcagcaccgatgtattgaat
atttcggggtttctagccagcgctgattaccgaatggagctgttcaagttcagcgatggc
gtgacgtggacggtggctgacatcatggcccgggtctccattcaaggcaccgctggcgat
gacaccatgactggccaagacgggcaagtcaaccgcatgtatggcttggccggtaacgac
aagatcacgggctccaccaaggacgatgtcttggatggcggtgctggcaacgacacgctc
accggcgactatggcaacgacaccttgatcggtggcgtgggcaacgacatcctgtacggc
gggcttggcaatgacacctatgtctttaaggccggtgatggttatgactggatttcagag
aacgacgccagcacaggcaacaccgatacagtgctcttcaccgacatcaagtccaccgat
atcacgggtatttataacaacggcgggggcctaagaatcacctatggcagcaccgatgta
ttgaatatttcggggtttctagccagcgctgattaccgaatggagctgttcaagttcagc
gatggcgtgacgtggacggtggctgacatcatggcccgggtctccattcaaggcaccgct
ggcgatgacaccatgactggccaagacgggcaagtcaaccgcatgtatggcttggccggt
aacgacaagatcacgggctccaccaaggacgatgtcttggatggcggtgctggcaacgac
acgctcaccggcgactatggcaacgacaccttgatcggtggcgtgggcaacgacatcctg
tacggcgggcttggcaatgacacctatgtctttaaggccggtgatggttatgactggatt
tcagagaacgacgccagcacaggcaacaccgatacagtgcagtaccttggtgacgttcat
gccgatcagctttggtttcggaaggtgaacaacaacctggaggtcagcatcatcggcaac
aacggctctgtctccatcaacaactggtacttgggtagccaataccacgtagagcagttc
aaaaccagtgatggcaagacgctgttggacagccaagtgcaaaacttggtgaatgccatg
gcagcctttgcaccaccaacggctgggcaaaccaccttaactgcggcccaacagactgcg
ttggcaccggtgattgcggctaactggcaatga
DBGET
integrated database retrieval system
