Rhodocytophaga rosea: GXP67_03710
Help
Entry
GXP67_03710 CDS
T06412
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
rhoz
Rhodocytophaga rosea
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Por_Secre_tail
Cadherin
Big_9
CHU_C
PA14
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QHT65833
UniProt:
A0A6C0GDF6
LinkDB
All DBs
Position
complement(855134..859225)
Genome browser
AA seq
1363 aa
AA seq
DB search
MNKRILLIYYRKVQEQFAKCKNRLERRLLKGTFKTLPTHKRNGLLQRINRLQCQLSRFQQ
QLSLISVGSAFVTGLATSTETLAQTGAATAGNPIQVNSFTTNNQVNAAIAVDPDGDFVVV
WQGNSQIANSGYDIYMRRYDAAGKPLDPDGKLVNTGYTTGNQVNPAVAMDADGDFVITWQ
SEGQDGSLNGIYAQRYTAAGVAQLPVIQANNLTTGEQTNPAIAMFRNGDFVLAWEGLDAS
GTGIYLRRYNAAGAAQTANEVVVNTTTAGNQIAPAISMDDTGNFVIAWQSSDGAGDGIFA
KRYNAAGTAQSGDLPVNTTTAGSQREPSVAVTTGDTAGSSIFMITWVSTNQDGAGEGVFA
RRFVNNTGGSEFPVNTYTTSDQSRPVVATDEGGIFVIIWQSIGQDGSEEGIYTRRYTRTG
NAIDANEFLVNAFTTGKQTKAAVATDAAGNFIIAYSSYGQLSPTSNEDVFAQRYTLSTSD
QRISAGNTSGVIAAMDASGDYVLIWQSSGREGDAAGEANIYAQRYNAAGIAQGSEFRINS
IITGSQTNSSVAMDQNGNFVVVWQSGNQLWGKRYNASGVVQGTEFNIGPSAVFPDSPEVA
MDADGDFVVVWVGDDRIWGKRYNVSGIAQGGEFAIDEPDGFNTGNPAVAMDQDGDFVVAW
QENPADYNVYQGLYARRYNRLGVAQGNQFTVDSSNSTRGVKRRPSAAMDAVGNFVIVWDS
DFEDTNGASGYDIFRARFSANGTRLDNPANNIAIKINTWTGVNRNNLFSRVFMDAVGNFT
VVWSSESDTEPNPLDGSCNSAIARRYNSNGDALSSEFRVNSYTKGDQDKPALAMNMAGNF
VIAWRSGGDCGNGDVNAQQGIYSRLFLLPTNLTLTAAAVPENQTGAAVGIFATSDATAGD
THAYTFATAADNTDDDNASFIIENGQLKLKANIAFNFEVKSTYRIRIRSTDASGLYIEKA
FVITVSDDNDAPTNITLSAASVMENKPVKTSVGNLTTIDADAGNTHTYSLVDGTGSTDNG
SFVIESNQLQTNVLFNFEAKSSYSIRLRTTDAAGLFFEKVFIITIVNINDAPTLNPISDQ
PLAQNVPLQTVTLSGISSGGEPGQTITITHQILPGGNQNLISNVNIMYTSPATTGSLQFK
PNANQIGEVTIRITVKDNGGIDFLTRDIKIIGAPSVPVNLTAIANPLKPESEIILSWNDS
ESETAYFIEVSKGDESAFVELGSVGENSTTYTHKDITDPGGTKFFYRIRAFNNVYSAYSQ
VVGVVTAASIVTGLETGSEKERFSVYPNPTIEYIVIDHTKLNLSGIMGGNIEIYNAQGKS
VWSGEWERGKEGQTIQVAHLPDGMYHLILTAGDRKFTQKIVKQ
NT seq
4092 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaagaatactactcatctattataggaaagtacaagaacagtttgccaagtgc
aaaaaccgcctggagcgtagactgttgaaaggtactttcaaaactttacccacacacaag
cggaatggattgcttcaacgcatcaaccgcctgcaatgccagcttagccgttttcaacag
caactcagcctgatttctgttggaagtgccttcgtaaccggtctggcaacctctacagaa
accctggctcagactggcgcagcaactgcaggaaatcctatacaagttaattcctttact
acgaataatcaggtaaatgcagccattgctgtagacccggatggtgattttgtagtggtg
tggcaaggcaacagccagattgctaattccggttacgatatttatatgcgccggtacgat
gctgccggaaagcctttagatccggatggaaaattagtgaatacaggctatacgactgga
aaccaggtaaatccggcggtggcgatggatgcggatggtgattttgtaatcacctggcaa
agtgaagggcaagatggttcgctgaatggtatttatgcacaacgatacactgccgctgga
gtagcccagcttccagtgattcaagccaataatctaaccactggcgaacagaccaatcca
gcgatagccatgttccgcaatggagattttgtattggcctgggaaggattggatgcttca
gggacaggtatttatctcaggcgatataatgctgccggtgctgcccagaccgcaaatgaa
gtagtcgtgaacacaactacagctggcaaccagattgctccggccatcagtatggatgat
accggaaattttgttattgcctggcagagcagcgatggggcaggggatggtatttttgct
aaacgctataatgcagccggaacagcccaaagcggtgacctgcctgtcaatacaactacg
gctggcagccagagggagccatcggtggcggtaacaaccggagatacggctggttccagt
atttttatgattacctgggtgagcactaatcaggatggtgcaggagaaggtgtatttgcc
agaagatttgtaaataatacaggcggtagtgaatttccggtaaatacctataccaccagt
gaccagagccgaccggtagtagctacggatgaagggggaatctttgtaatcatttggcaa
agcataggtcaggatggctcagaggaagggatctataccagaagatacaccagaactgga
aacgccatagatgcaaatgagtttttagtaaatgcttttactactggtaagcagacaaaa
gctgcagtggccacagatgcagcaggtaattttattatcgcttacagtagctatggacag
ttaagtcctacgtctaatgaagatgtttttgcccagcgctataccttatccacttcagat
caacggatcagtgcgggtaataccagtggtgtaattgctgctatggatgccagtggggat
tatgtattaatctggcaaagttccgggagagagggagatgcagccggagaagcaaacatc
tatgcccagcgctacaatgcagcgggcattgctcagggcagtgaattcaggataaacagc
atcattaccgggagtcaaacgaattcatcggtagccatggatcagaatggtaattttgta
gttgtctggcagagcggaaatcaattatggggaaagcggtataatgcatctggtgtggtg
cagggaactgaattcaatataggcccatcagcagtttttccagacagtccggaagtagcc
atggatgcggatggtgattttgtagtagtatgggttggagatgatagaatctggggaaag
cggtataatgtttctggtattgctcagggtggtgaatttgccattgatgaacctgatgga
tttaatacaggaaatccggcagtagccatggatcaggatggtgattttgtagtggcctgg
caggaaaatcctgcggattacaatgtttaccagggactatacgccagaagatataaccga
ctgggtgtggcacaaggaaatcagtttacagtagatagttctaacagtaccaggggagtg
aaacgtcgtccttctgcagcaatggatgcggtaggaaattttgtgattgtatgggacagt
gattttgaagataccaatggcgcctccggatacgatattttccgggctcgttttagtgcc
aatggcaccaggctggataatccggcaaataatatagctataaaaattaatacatggact
ggagtaaaccggaataacttgtttagccgtgtttttatggatgccgttggaaattttacg
gtcgtgtggtcgagtgagtcggatacggaacccaatccgctggatggctcctgtaattca
gcaatcgccaggcgttacaatagcaatggagatgccctcagcagtgaattccgggttaac
tcgtataccaaaggagatcaggataagcctgcgcttgccatgaatatggccggaaatttt
gtaattgcctggcgcagtggcggagattgcggcaatggcgatgtaaatgcccagcaggga
atctacagccgtttgtttctgctgcccaccaacctgacactcactgcggcggctgttcca
gaaaatcaaaccggagctgccgtaggtattttcgctacaagcgatgctacggccggtgat
acgcatgcttatacgtttgctacggctgctgataataccgatgatgataatgcaagtttc
atcatcgaaaacggacaattaaagcttaaagccaacatagctttcaatttcgaagttaaa
tctacctatcgtatccggataagaagcacagatgccagcggtttatatattgaaaaagcc
tttgtaattaccgtgagcgacgacaatgatgcacccacgaatattaccttaagtgctgct
tctgtgatggaaaataaaccggtcaagacttctgtcggcaacctgactactatagatgcc
gatgcaggcaatacccatacctattcactggtagatggtaccggaagtaccgataatggc
agttttgttattgaaagcaatcaactccaaacaaacgttctctttaattttgaggcaaaa
agcagttatagtatccggctacgtaccaccgatgctgccgggttattctttgagaaggta
tttatcattacaattgtcaatatcaatgatgcgcctaccttaaatcccatttcagaccag
ccactagcccagaacgttcctctgcaaacagttacactctctggtatttcttctggggga
gagccggggcaaactattactatcactcatcagattttgccaggaggaaatcagaatttg
atttctaatgtgaatataatgtataccagtccggccaccacaggcagtttacaatttaaa
cccaatgccaatcagataggagaagtcaccatccggataactgtaaaagataatggaggc
atagattttcttacccgggatattaaaataataggagccccttctgtaccagtcaatctg
acggctatagccaatccattaaagccagagagtgaaattatcctttcctggaatgattcg
gaaagtgaaacagcttattttattgaggtttcaaaaggagatgaatctgcttttgtggag
cttggttctgttggagaaaatagtactacttatacccacaaagacattacagatcctggt
ggtaccaagtttttctaccggattagggcttttaataatgtatactcagcttacagccag
gtggtcggtgtggtcacggctgcttccatcgttacaggtcttgaaacaggttctgaaaaa
gaaagattttcggtatatcccaatccaacaatcgaatatattgtaatagaccatacaaaa
ctcaatttatcaggcattatggggggtaacattgaaatatataatgcgcaggggaagtca
gtctggtcgggagaatgggagagaggtaaggaaggtcaaacgattcaagtggctcatctt
ccggatggcatgtaccacctcattttaactgccggagacaggaagtttacccaaaaaata
gtgaagcaatga
DBGET
integrated database retrieval system