Rhodocytophaga rosea: GXP67_35615
Help
Entry
GXP67_35615 CDS
T06412
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
rhoz
Rhodocytophaga rosea
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CBM60
PLAT
Por_Secre_tail
DUF6359
DUF5435
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QHT71622
UniProt:
A0A6C0GWA8
LinkDB
All DBs
Position
complement(8703632..8706193)
Genome browser
AA seq
853 aa
AA seq
DB search
MKSLFFTLHTRAVKLPFFYSPFALSKRLSLSLVFVVLVFCEISAQTRLGLHFTQQELDIW
RKRANVGPYKHFGYESTSSPADWDRITSNAKSFLSNPSAERYKGVSTGSCVQVGASEPTN
NGKKLRDAAFVYLITGDISYRNAVRNELIAQSSEANANFAVRSRWCTNLGDAPPAYPIAS
WLTRLLFAYDYIKSTLSDSDRNKLDKWFYDAAIFLQLNVDQDLGKYYVNRSSDNYTLSEY
AHMMSASYGRTTHYNGYKTSSIGRAYNNRRSAQVKYFALVGIMQNASVLKNSGKRYVKEM
LMYSIYPDGTSAEFQRWTEGFPDAGWSYVSHSIFDAVDVADHFARAGDAELYRFTTSQGA
YGTSGGTKNLALVVNHVLNYVDGTVRRYGTASSGNQNTNYQINNIDEGDGWFAINELWFS
KPNLYFKNDRTKKLYTRTASNVKPYPSGPAGSGPHVPFGGSWDTYPGMLFMFGQMENKVW
PYVNISNPSSLQSDPNANNTITVSAYGKNSPKFRVIVNGIIVGDVTASSSVQNLKFTTKF
SLSDIKTVMIHHYNDDTGKDLFINSITVGSQNIKANASNVKYDKFNIDGKDIINGQTAML
WNGALVFKPSGYQNDEDPVEEPAPSNGTTVTVKAYSTISSGVYGHFKVMIKGTVIGEAYT
TNSLKDYTFTSDWNISDLSQVVVHYDNDRNANGEDRNLFVKSIVVNGVEISSTSSSVKFD
RYALDGKDVMAGRVDLLWAGYLVYNLPNSLTDAIARQDFSVEGGDPELSKITDVIIAPNP
NPGVFTLFVEMNAETDVALVVMDMIGNVLYEETYPSVSYQLDEKIELPELPAGMYLVKVL
VGNESVIKKFVKQ
NT seq
2562 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatcgctatttttcacactgcacacacgtgcagtgaaacttccattcttttattcc
ccctttgctttaagcaaacgcctttctttaagtttagtatttgttgttttagtattttgc
gaaatttctgctcaaaccagattaggtttacattttacacagcaggaattagatatatgg
cggaaacgggcaaatgttgggccttataagcattttggatatgaaagtactagttctcct
gctgactgggaccgtattacctcaaatgctaaatcattcctgagcaatccttctgcggaa
agatacaagggagtgtcaactggttcttgtgtacaagtgggggcaagtgaacccacaaac
aacggaaaaaagcttagggatgctgcttttgtttacctgattacaggtgatatcagttac
agaaatgctgtccgtaatgaattaattgcacaatcctctgaagctaatgctaattttgct
gttaggtcccgttggtgtactaacttaggagatgcgcctcctgcttatcctattgcttcc
tggcttacccgtttgttatttgcatacgattatataaaaagcactttatctgattctgat
agaaataaacttgataagtggttttatgatgcagccattttcttgcaattaaatgtagat
caggacttaggtaaatattatgttaaccgcagtagtgacaattataccttaagtgaatat
gcacatatgatgagtgcaagctatggaagaactactcattataatggctataaaacctca
agtataggacgtgcctataataaccggagaagtgcacaagtgaaatatttcgctttggta
ggtattatgcaaaatgcaagcgtattaaaaaacagtggaaaacgatatgtaaaggaaatg
cttatgtatagcatatatcctgatggcacatcagctgaatttcaacgctggacagaaggt
tttcctgatgccggttggtcatatgtgtcacattcaatttttgatgctgtagatgttgca
gaccattttgcacgtgcgggagatgcagaactttaccggtttactacatcacagggtgca
tatggtacaagtggtggcacaaaaaatctggcgctggtagtaaaccatgtgctaaattat
gtagatggcacggttaggcggtatggaactgcctcatcaggcaaccagaatactaactac
cagatcaataatatagatgaaggagatggttggtttgcaataaatgaattatggttttct
aaaccgaatctgtatttcaaaaatgatagaacaaaaaaattatatacccgtactgcttcc
aatgtaaaaccttatcctagcggtcctgccggctcaggtccccatgttccatttggtggt
tcctgggatacttatccgggtatgctctttatgttcggacaaatggagaataaagtatgg
ccttatgtaaatatctctaatccatcttccttgcaatcagatccaaatgctaataatacg
attactgtaagtgcgtatggtaagaattcccctaaattcagagtaattgtaaatgggatt
attgtgggtgatgttacagcttccagttctgtacaaaaccttaaattcacaactaagttt
tctcttagtgacataaaaactgtaatgattcatcactataatgatgataccggaaaggat
ctttttatcaattcaataacggttggaagtcaaaacataaaagcaaatgcgagtaatgtg
aagtatgataaattcaatattgatggaaaagacatcattaatggacagacagctatgctt
tggaatggggctttggtgttcaagccttccggatatcaaaatgatgaagatccggtggaa
gaaccagcaccttcaaatggtaccacagtaactgtaaaagcgtatagcactatcagttca
ggcgtatatggacatttcaaagttatgatcaaaggtacggttattggcgaagcgtataca
acaaatagtttgaaggattacacgtttacttcagactggaacattagtgacctaagccag
gtagtggttcattatgacaatgacaggaatgccaatggagaagacagaaacctgtttgtg
aaatccatagtggtaaatggggttgaaatatcatctacatccagcagtgtgaaatttgat
agatatgcattggacggtaaagatgtaatggcaggaagagtagacctgttatgggctggg
tatctggtttacaatctgcctaatagcttaactgatgctattgcccggcaggattttagt
gtagaaggaggagatccggaattgtcaaagataaccgatgtaatcattgcacctaatcct
aatcctggtgtgttcactctatttgttgaaatgaatgctgaaacggatgttgcgctggtc
gtaatggatatgatcggcaatgtattatatgaagaaacctatccttcggtatcatatcag
ctggatgaaaaaattgaacttccagagcttcctgccggaatgtatctggttaaagtattg
gtaggaaatgaatcagtcattaagaagttcgtgaaacaataa
DBGET
integrated database retrieval system
