Rhizophagus irregularis: OCT59_011018 Help Entry OCT59_011018      CDS       T10295                                  Name (RefSeq) uncharacterized protein   KO K24155   rabconnectin-3a Organism rie  Rhizophagus irregularis Pathway rie04142   Lysosome Brite KEGG Orthology (KO) [BR:rie00001]  09140 Cellular Processes   09141 Transport and catabolism    04142 Lysosome     OCT59_011018  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    04131 Membrane trafficking [BR:rie04131]     OCT59_011018 Membrane trafficking [BR:rie04131]  Exocytosis   Small GTPases and associated proteins    Rab associated proteins     OCT59_011018  Endosome - Lysosome transport   Acidification regulators    Rabconnectin-3 complex     OCT59_011018    RAVE complex     OCT59_011018 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Rav1p_C TPR_GEMI5 Beta-prop_CAF1B_HIR1 Beta-prop_RIG_2nd Motif Other DBs NCBI-GeneID:  36864314 NCBI-ProteinID:  XP_025186111 LinkDB All DBs Position 19:complement(2159047..2165832) Genome browser AA seq 1507 aa AA seqDB search MLLKQVCPGKSNGLVQSFHTAYWENSRYLIYGTGNKLVIYSGLSELVQTINASEFLEEES NKEIIFSAELSEFDGKIAITIGTNVLIFKPDQDDKTMKIRWSLLKILKHDYSVFCTSWSL INGQLLVGGEAIVHWEQNKSNEENRSKWNKLWEQSVASKIIHIEVSQDSTLIATVGEYDR FVKIWCCQKNDGKERKYKFHYLPHPRSVTNFSWRKGPHEQINSQGSNILLTVCKDGLCRI WAATNPDEPHNLYICTVVDPEQSLVTLPSLEEERICHKHFDCFSPIHWIHPREFLISVKL AIDSFENENNETERSCINDGLKKLKTLAKDTPDLFYQVQQDGSIVIWGIRNIYCRPRRIP KVLVLFRASQVLSPSESDYFHGSTFVFHDNTSPDFKSTSVELTILAQSPQGYISRYSIRL VDMFENLQSIPLELKYLWTGHHNDIKAIIKSSGTDSFVSLASDEGAILWDFTKPEISQLV NQVSPKIIEKTTVPMKQIKLVCVLPEGKCVVAHDGIQIVLFIFDDRNDFTQKIVFNDYDA SYELLLLSSYKHKTSSSTPTYIVGVSSHKNTIFCWKFFFDKGSKVDLVSKASLPINSQIK LAVSVEQWAGSNKRCYPSSDLSPPILLTYSDDGCIMYWQLNMKYDSNNLDANKELWMKEV VYDIGTKEPMLIKCGPQGRAAIVMKKGNNYEMTIWECITKRLPSAKDFIEEFSEKIVDIG WLFTSNAEIVLAISTSRKICIYTQLRKHHVSGRSSWIMFSEIENNSALPISAISWENLGS LIVANCNQLRCYDKWLTEENMEKVSSITGVNQKKYPTLFHVVDHLNGPLPHYHPTFLLEY IMWDQMDLVKQIFAHLYKFLIILDRTNKPIERILPLPFDKFFQDNMSTASTKTTRYNVLF GEDSDEEGSQENLLEFTEKEANFLIEKLQVISLPDLSPVEQAQLLALVNTINQVENQKRS LDENGVRYVIFMRRYHYLNKISFGIRSPGLNYRDMNWALHSNSQDLLIEYSIQASGGKFL WKDARIHGIFLWLRSNESVRQQMENVARNHYMLKEERDPTDCSLFYMALRKKKLLLGLWK TANTHREQAIMLKFLINDFTEPRWKTAALKNAYALLGKQRYGYAAAFFLLGDQLKDAVNV CLKHLDDFQLAIAITRVYEGEDGPILKSIYEDYIIPLAIRTGDRWLASLAFWSLNQRDKA VKAIMVPLETLCDKKVETTPLTTDSPDAALVVLYKQLKDKSIQTLRGAAEISSKTEYFFV LRSIFAYDRMGCPLLALHLVRTWTFSQQSDPKRPDHILKSRRRTTIFDIPMADSDGDDVI SKGVVNFDTWDWNEPISPVSSKFSKHITDKSDDLFTEEPSPLVSPVTPRRISFNDNSFKD STNEEDIWGWNTPGHYQKLNSYNSKNTDIFANNNEETLGKGDIENDAGNNATLLYDVDFY DYKVSLVKRLCQQLLDVAMAVQENPELFEHSYYIDYINRAEQGLITICENVKVPISDIKE SLLLYPL NT seq 4524 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgttacttaagcaagtttgtcctggaaagtctaatggacttgtccaaagctttcatacg gcatactgggagaattctcgttaccttatatatggtacagggaataaacttgtaatttat agtggactttcggaattggttcaaacaataaatgcctccgaatttttagaggaggaatcg aataaagaaataattttttccgcagagttatcagaatttgatggaaagattgctataaca attggaacaaatgtgcttatatttaaaccagatcaagatgataaaaccatgaaaattcga tggtctttattgaaaatactgaaacatgattattctgtgttttgcacttcatggagttta attaatggtcaactcttggtgggtggagaagctattgttcattgggaacaaaataagtct aatgaagagaatcgtagtaaatggaacaaattatgggaacaaagcgttgcttctaaaata attcatattgaagtatcacaagattctacattaattgctactgttggagagtatgataga tttgtgaaaatttggtgttgtcaaaaaaatgatggcaaggaacgaaaatataaatttcat tatttgccacatccaagatcagtaaccaacttttcatggcggaaaggtccacatgaacaa ataaattcacaagggagcaatattctcttaacagtttgcaaggatggattatgtagaata tgggctgcaacaaaccctgatgaacctcataatctttatatatgtacagttgtcgacccc gaacaatcattggttacacttccttccttagaagaagagagaatctgtcataaacatttt gattgtttttcgcccattcattggatacatccaagagaatttttgatatctgtaaaatta gctatagattcctttgaaaatgaaaacaatgaaacagaacggtcctgtataaatgatgga ttaaagaagttaaaaaccctcgcaaaagatacacctgatttgttttatcaggttcaacaa gatggttctatcgttatttggggaataaggaatatttattgtaggcccagacggattcca aaagttctcgtcttatttcgtgcatctcaggtgctttcaccatcagaatcggattatttt catggaagtacatttgtgtttcatgataatacaagtccggattttaagagcacttcggtg gaacttacaatattggctcaaagtccgcaaggttatattagcagatattcaattcgtctc gttgatatgttcgaaaatttgcaatcaattccgttagaattaaaatatttatggactgga catcataatgatataaaagctatcattaaatcttctggaactgacagcttcgtttcactt gctagtgatgaaggagcaatcctgtgggattttacgaagcctgagatatcacagcttgtt aatcaagttagcccaaaaattattgaaaaaactactgttccgatgaaacaaattaagctt gtatgtgtgcttccagaaggaaaatgtgttgttgcacatgacggaattcaaattgtcctt ttcatattcgacgatagaaatgattttactcaaaagattgtttttaatgattatgatgct tcttatgaactgctcttgttatcttcttataaacataaaacttcctcgtctactcctact tatattgttggagtaagctctcataagaatacaattttttgttggaaatttttttttgac aaaggttcaaaagttgacttggtttcgaaggcttctcttcctattaacagtcagattaaa ctggctgtatctgttgaacagtgggcggggtctaataaaagatgttatccatcaagtgac ttatctcctcctatattattgacatattctgatgatggatgtatcatgtattggcaatta aatatgaaatatgatagcaataaccttgatgctaataaagaattatggatgaaagaagtt gtttatgacatcggaaccaaagagccaatgttaatcaaatgtggtccacaggggagagct gcaattgttatgaaaaaaggaaataattatgaaatgacgatatgggaatgcataactaaa agattgccatctgcaaaagattttatagaagaatttagtgaaaaaattgttgatataggt tggcttttcacttctaatgctgagattgtattagctatatcaacgtcgcgaaaaatttgt atttatactcaacttcgtaaacaccatgtttccggacgaagttcttggattatgttttca gaaattgagaacaattctgcattaccaatttctgctatatcttgggaaaatttgggttca cttattgtagctaattgtaatcaattacgttgttatgacaagtggttaacagaagaaaat atggaaaaagtttctagtataactggggttaatcaaaaaaagtatcctacattgtttcat gttgttgaccatttgaatggtccattaccacattatcatccaacgtttcttttagaatac attatgtgggatcaaatggatttggtgaagcagatttttgcccacctttataaatttctt ataattttggatagaacaaataaacctattgaacgaattcttcccttaccatttgacaaa tttttccaggataacatgtcaacagcatcaacgaaaactactcgctataatgttcttttt ggagaagacagtgatgaagaaggatctcaagaaaatttacttgaatttactgaaaaagaa gctaattttttgattgaaaaattacaagtcatttcattacctgacttatcacccgttgaa caagcgcaattattagctttagttaataccataaatcaggtagaaaatcaaaaacgaagt ttggacgaaaatggtgttcgatacgtaatatttatgcgacggtatcattatttaaataaa atatcctttggtatacggtcgcctggtttaaattatcgagatatgaactgggcattgcat agtaattctcaggatcttttaatagaatacagcatccaagcatctggtggaaaattttta tggaaagatgcaagaatacatggtatctttttatggcttcgaagtaatgaatcagttcga caacaaatggaaaacgtggctcgtaatcattatatgttgaaagaagagagagatccaaca gattgctctcttttctatatggcattacggaaaaagaaattattgttaggtttatggaaa accgccaatactcatagagagcaagcgatcatgttgaaatttcttataaatgattttacc gaacccagatggaaaacagcagctttaaaaaacgcttatgctctgttgggcaaacaacgt tatggatatgcggctgctttctttcttcttggtgatcagttaaaagatgctgttaatgta tgcttaaaacatttggatgactttcaattagctattgctattactagagtttatgagggt gaggatggtcctattttgaagagcatatatgaagattatattattcctctagccattaga acaggggatcgatggttagccagtttggctttttggtcattgaatcaaagagataaagct gtgaaagctattatggtacctttggaaactctgtgcgacaagaaagtagaaacaacaccc ttaaccactgattctcctgatgcagctttggtagttttatacaaacaattaaaagataaa tccattcaaacactgagaggggcagcagaaatttcatcaaaaacggaatatttcttcgtg ttaagaagtatttttgcttatgatcgtatgggatgtccactgttagctcttcatctcgta agaacatggactttttcacaacaatcagatccaaaaaggcctgatcatattttaaaatct agacgcagaacaactatttttgacataccaatggcagatagtgatggtgatgatgttatt tcgaaaggtgttgttaattttgatacatgggattggaatgaaccaatttcaccagtttct tcaaaatttagtaaacatataacagataaatccgatgacctttttacagaagagccaagt cccttagttagtcctgttacgcctagaagaatatcgtttaatgataattcatttaaagat tcaacaaatgaagaagatatatggggatggaatactcccggacattatcaaaaattaaac tcgtataattcaaaaaatactgatatttttgctaacaataatgaagaaactcttggtaaa ggtgatatcgaaaatgatgcaggaaataatgctacattactatatgatgtagatttttat gattataaagtttctttggttaaaagattatgtcaacaattattggatgtagcaatggct gttcaagaaaatccagaattatttgagcattcttattatattgattatattaatagggcc gaacaaggattaataaccatatgtgaaaatgttaaagttccaatatcagatataaaagaa tcactattattatatcctttataa

DBGET integrated database retrieval system