Rhizophagus irregularis: OCT59_013127
Help
Entry
OCT59_013127 CDS
T10295
Name
(RefSeq) uncharacterized protein
KO
K10597
ubiquitin conjugation factor E4 B [EC:
2.3.2.27
]
Organism
rie Rhizophagus irregularis
Pathway
rie04120
Ubiquitin mediated proteolysis
rie04141
Protein processing in endoplasmic reticulum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rie00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
04141 Protein processing in endoplasmic reticulum
OCT59_013127
04120 Ubiquitin mediated proteolysis
OCT59_013127
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
rie04121
]
OCT59_013127
Enzymes [BR:
rie01000
]
2. Transferases
2.3 Acyltransferases
2.3.2 Aminoacyltransferases
2.3.2.27 RING-type E3 ubiquitin transferase
OCT59_013127
Ubiquitin system [BR:
rie04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
U-box type E3
OCT59_013127
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Ufd2P_core
U-box
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
36866287
NCBI-ProteinID:
XP_066001491
LinkDB
All DBs
Position
20:complement(2493825..2499251)
Genome browser
AA seq
1049 aa
AA seq
DB search
MDPKVPEQVAEQVTPESSSPSTDADKIRLKRLAKLAKLQQNSSENLAGTSRNVASSSSTK
SAKSNNSNAATTSQKQQLQDKGNKEPMNTPLISQKPKQPLKSFEDWQDDVISKVFQVTLD
KSLAEKKDSQLVYLNSLVEELKKEDPEKKSFKLSQSHLESALVARLNIDPNQMSDDEETF
QAISKLPRISLFDYLLDCWKRASEIKSNLLTRSSKTLEPSVVNERVKVMDALKDLLVNYA
CLVIQYPDMFPQINDSTELGSRQLVSRLLSDINSPEGLPLDFIQELAAKVDEEQFDQIFG
SALIGLAAQMRTKNILNNDYLKPLNGLATLTEIKSLAAMLPTLRSWNPQNSTAKAYEVMS
LLGPFCRISVFPSDEPSIPEKYFGNIQQRSKADVDSLMISLSGAIQGVQRTLFNIFNNIV
RSSPSSKEAVLSYFARVIKLNEKRTQMQVDPSQVGTDGLLMNLSSILLIFADPIYSKIDR
IDVNYFRKSRRIDISQETKIKATQQESDAYYSSAVNEAASPNFISEIFFITLAMHHYGPL
QCYNKYNNLNRDLAELQKQYDRLKADQPKWAGTPAETFNNALLERCKDQLEKWAVHKISI
VDPTGQHPIKQISLPLPPTPPEEFIMLPEFVIEDITEFFSFISRYNPKVMLSCSRDELVI
FIITFLKSSTYIKNPYLKAKLVEILFYYTIRNENEGGIGSILNTHPIALEHLMSSLMSFY
VEVEQTGTHTQFYDKFNIRYNISQIFNSIWNNQMYRNKLREESRKMDTFVRFANLLMNDA
TYLLDESLTKLTEIRNIQNEMDNIDEWEKKTQQQRQERESLFHSLERQATSYMALGNETV
HMLEYMTSEVADPFLTPQIVDRLAAMLDYNLNSLVGPKCTGLKVKNREKYRFQPRILLQQ
LITVYLNLSKSKEFIQAVAKDGRSYSKELFLKAFSILKEHGLKLDRDIKVLEKFVNNVEE
VIKQEEQGEEELGDIPEDFLDPLLFVIMEDPVILPESRISIDRKSITTHLLSDATDPFNR
KPLTIDQVIPDLKLKERIEAFKKEKREKK
NT seq
3150 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatcccaaagtaccagagcaagtagctgaacaagtaacaccggaatcttcgtcacct
tcaacagacgcagataaaattcgattaaaacgtttagcaaagttagcaaaacttcaacag
aatagttcagaaaacttggctggaacttcaagaaatgtcgcgtcgtcttctagcacaaag
tccgcaaaatcaaataattcgaatgctgcgacgacttcgcaaaagcaacaactacaagac
aagggtaacaaagagcctatgaatacgccattgatttcacaaaaaccaaagcaacctctt
aagtcttttgaagattggcaagatgatgtcatttcaaaggtttttcaagttactcttgat
aaatcattagccgaaaaaaaagactctcaattggtatacttaaattctctcgttgaggaa
ttaaagaaagaagatcctgaaaagaaatcattcaaattatcgcaatctcatcttgaaagt
gctctagttgctcgattaaatattgatcccaatcaaatgagtgatgatgaggagactttt
caggctatttcgaaattacctcgtatatccttatttgattatctgctggattgttggaaa
cgagcatctgaaattaagagtaacttgttaacacgctcctcaaaaacattagaaccttct
gttgttaacgaacgagttaaggtcatggacgccttaaaagacctattagtgaactatgct
tgtttggttattcaatatcctgatatgtttcctcaaataaatgattccacggaattaggt
tcccgacaacttgtttcaagactattgtccgatataaactcccccgaagggttacctttg
gattttattcaagaattggcagcaaaagttgatgaggaacaatttgatcaaatttttggt
agtgctttaatcgggcttgcggctcaaatgcggacaaaaaacattttaaataatgattac
ttaaaaccacttaatggtttagcaactttaacagagataaaatctttggcagcaatgtta
ccaacactacgaagctggaatcctcaaaattcaactgcaaaagcatatgaggtcatgtca
cttttaggtccattttgtaggatatctgtttttccatcggatgagccatctattccagaa
aagtattttggtaacattcaacaaagaagtaaagctgatgttgattctcttatgataagt
ttaagtggcgctatacaaggagtacagagaactctttttaatatattcaataatattgta
cgctcttcaccatcttcaaaagaagctgttctttcttattttgctagagttattaaattg
aacgaaaaaagaacacagatgcaggttgatccttcacaagtaggaacggatgggcttttg
atgaatttaagttctatattattaatatttgcagatcctatttattctaagatcgatcgt
atcgacgttaattatttccgcaagtcgagacgaattgatattagtcaagaaacaaaaatt
aaggcaacccaacaagagtcagacgcatattattcttctgcagtaaatgaagctgcatca
ccaaattttatatcagaaatatttttcataactttagcaatgcatcactacggaccattg
caatgctataacaaatacaataacttgaacagagaccttgcagaattacaaaagcagtat
gataggttgaaagctgatcaaccaaaatgggcaggaactccggctgaaacatttaacaat
gccctactagagcgttgtaaggatcaacttgagaaatgggctgtacataaaatatcaatt
gttgatcctacaggtcaacaccctataaagcaaattagtttacctttgccaccaacacca
ccagaagaatttattatgttgcctgaatttgttattgaagatattactgaatttttttca
ttcatttccagatataatcctaaagtaatgctttcatgctcacgtgatgaattggtcatt
tttatcatcacttttcttaaatcttcgacatatatcaaaaatccatatttgaaagccaag
cttgtagagattctattctactacacaatacggaatgaaaatgagggtggtataggaagt
atattaaatacacaccctattgcattggaacatttaatgtcatctctgatgtctttttat
gttgaggtggagcagactggaacgcacactcaattttatgataagtttaatattagatat
aatatttcgcaaatatttaattcaatatggaataatcaaatgtataggaataaattaaga
gaagaaagtcgaaaaatggatacctttgtaagatttgctaatttgttaatgaatgatgca
acttatctcctcgacgagagtcttacaaaactaactgaaattcgtaacatacaaaatgaa
atggataatatcgatgaatgggaaaagaaaacgcagcaacaacgtcaagaacgtgaaagt
ttgtttcactctcttgaacgacaggctacatcttatatggctcttggaaatgaaactgtg
cacatgcttgaatatatgacatcagaagtagctgatccatttcttacacctcaaattgtt
gatcgattagcagcaatgttagattataatttaaattctcttgttggtcctaagtgtact
ggacttaaagttaaaaatagggaaaaatatcgatttcaacctagaattttattgcagcaa
ttaataactgtatatttgaacttaagtaaaagcaaagaattcatacaagcagttgcgaaa
gatggtagaagttatagcaaagaattgtttttgaaagcatttagtattttgaaagaacat
ggattgaaattagatagagatattaaagtgttggagaaatttgttaataatgttgaagaa
gtaattaaacaagaagaacaaggtgaagaagagttgggcgacataccggaagatttcttg
gatccacttttatttgtaataatggaagatccagttattttacctgaatcacgaatatca
attgatcgtaaatcaattacaactcatcttttaagtgatgctacagatccttttaataga
aaacctttgacaatagatcaagttattccagatttgaaattaaaggaaagaattgaagct
tttaaaaaagaaaaaagagaaaagaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
