Rhizophagus irregularis: OCT59_016555
Help
Entry
OCT59_016555 CDS
T10295
Name
(RefSeq) uncharacterized protein
Organism
rie Rhizophagus irregularis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3712
Pif1_2B_dom
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
36863404
NCBI-ProteinID:
XP_025188130
LinkDB
All DBs
Position
25:407808..415656
Genome browser
AA seq
2355 aa
AA seq
DB search
MLNSQNSLLRFEIGIMDNSKEFSIDVDAEEELPITSNISDKPDKSPRESQILKPDNTKKS
LFATIKSWYEPTYVKSLDAPTQEKPKLRYCNGRLTKRRFIIYHILIISFFFTIIFAPVAY
YLIIPAFIRYKVQHVDLNEISIDHMDVLEWKSDGLRFSWKATLPKQFFLPLKTKLAALDL
TIHDANSNSLLVIGIPEMEVNIGEPITLNFEGDVSFKETSGLKNFLGEISKPDGISDTSL
SADTQITVNMWGITWYKNLNIKRTIPIPKMSGNLLDLWNTMPKFLISKDMQSMTLNQQSS
DTVIEIGGVNVTNVNKPIVIDGVSYWQILPGFPPINLQSFDIAFTNEGPNISLKAALINP
TVLSIPLPDTSIGLQLEDSYLATTSVNGFNLTRGLNNIDLNLKLTFDPSRIVSPNQLSNS
ISLAAGKLLGISQSNDQLRFNVIGPVGLKGVDFIGDATEKLSLTLPINEIINNTNVMLLK
NLFDVKGIESLLHTIHFDVKIQQDRIIIPVDISLPSFLPLPPSLEFKYNTSLGIFKGEQN
ALTVNLGGISMTNNETLNIVTSVTIFPNNTFEAAGALASIVNPSLSGNISSADIKNFSIF
NETGGTFPWANDLFGGLSLNIPIPGFNTTTIINMLTQNGTSIPAEMLGMRLTQRSDVAGF
NVNGTVAIKYPPFLPIITIGTGYLESTIFTDDVLLATAKLPNGIFYTAGENSTNIVASAI
LNKDDRLKSIISQLVMSVLETEDNVKMPIIGISGLKMGASETLSFVTFSQILVPINLATL
KPAMKTTIGTISQSIQKQVGLLSLTGVDFAIVTSNSLSINLQTILNNPMNIIADIGSVSF
TTTLFYGELANITLSPIQLAIGRNPFNLQMRIDIVDGKNGMSDNILQLFKDLTSTEGDFR
SIIGIKNFIIAPPPPTTQDGNVNVTLATIDQFSSAQITVPSSLVPAENLRSINVIEMIKN
PKNGIIDISGILPTSETTFTLPTIKSVSIETKENAQLLIGTTFSYINPLPISAKVPYFGA
TVILDGNNFITFGITRIDLERNQGNMDISLAMSFDNSDGTKSAVNEFLKNILNGEVKQKI
EISGIYFGGPNENPNDLMNLLKLPLPTDLVDINSIKNKVIELSPIKLPLSLDQLLSSQFM
PQLKSVDISTLPNRVLSLKVGAQLNVPFEVSANIGYVGVKGITLDDKQFTSVDITGIQTS
GAGINYVTLGIQLAFSDDESIQKSVKSIYDSLINGNFISTKGGINGVSLGISADDSIRTF
EKISLSTEIGNLITGQLNLNGIIDSMLTNVGNSNNIITAGQGSITVNIPNLAQIVIGQLG
IKFLPGKMIEIKMVSTITLSFTLTMNIGFAGVGIFLDDLSAFDIRVAAASEGQVVSIASS
VKVNDSDELADKLGGLAKSFFDNTPLTGNLAIKNPFIGASNDDVIRAFSLISLDLSLEKL
VTPLIKNLPKSIDPITLIDQIGFKLNALGIDTAPQHKILANVQASFNNNFPVTIDIGFVE
LSLGLDLVNFVDASLSDLSIGSGANNGLSIKSSLDFQPSNDQVQDKIASFVTSLQQNGLG
KTNELFSVSGIKIGPSPNEFIKSFEKVVVGIPSSLILNQVVVEKLLGMAGLSLTDLTIEG
MLNRLSIGNVAVDMNPNGQELAIKGNVGISNISLPLNVNMGILELSVALNASPLTRVILP
DVKIVSSNNVISTDFTVALIFQDSDGLEDEVAALAKSLIEGNNGTVIPGNANINGLLFGS
SNSDKDIINTFSKVLISLPLNPILQPIKAMITNIVSGFIDGTGAVKLTLDDVSVGIKNSN
TLTTDIVADLTGLPQISLNIPFASVDVSINGGLFVSTVINGMKFEGNRFTTSVELGFQDN
KQIANQLAVIISDLVFRRLTYTVSLPVGINNLIFGPSPQKTFGLTRKISVGMDVGKFINQ
FSDFNQKNNLITLENIQGQLTQQGVEAIVTSPAIPNLPLNLNIPSLLAQVFFKGVSGGIS
KAAVKPNVKKGQAKWEFGLTVLVDNGPMSQALETAVPNLLSFKSYTDGASLGGVILCTSD
DCLNPPDNSFKIFNEINFVPPPLFLFNPINVELTKIFPTLGLNTLFTNTGPLHVDIGNFV
LSLQSSGTSIFEVSSPQPVIIQNNLENAGKNVIPVEGKLTLDPLQIPKLLLDLVDLEKDF
AIVLQVNKNGDPIGWLNDLLKNLPQTVIKNLFPILQGLLKNISIGIDLNNKNSTVPIGDG
KTINGTVPIGDGKTPPPNGDGKVPDGKAPDGKIPDGKVPDDGSPKIPQGEVPKQPTEEEP
KKPAAKDPQEPEKPKQDETPKQGKNPDGEDESIGGKIIDVITKPFRPKDSLTAETNDNIE
NPKPIYTWTINAPNN
NT seq
7068 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttaactctcaaaattccttgctgcggttcgaaattggaataatggataattcaaaa
gaattttcaatagatgtagatgcggaagaagaattgcctattacttcaaatatttcagat
aaaccagataaatcccctcgagaatctcaaattctaaaacctgataatactaaaaagtcc
ttattcgctacaataaaatcatggtatgaaccaacgtacgtaaaatcattagacgctcca
acccaagagaaacctaaattacgttattgtaatggtcgattaacgaaacgaagatttatt
atttatcatatcttaataatatcattcttctttacaataatatttgctccagttgcttat
tatttaatcataccagcttttataagatataaagtacaacatgttgatctaaatgaaata
tcaattgatcacatggatgttttagaatggaaatctgacggactaagattttcttggaaa
gctactttaccaaaacaattttttcttcctttaaaaacaaaattagccgctttagattta
acgattcatgacgcaaattcaaatagtttattagttattggtatacccgaaatggaagtt
aatataggagaacctatcacactaaactttgaaggtgatgtttcttttaaggaaactagt
ggattaaaaaatttcttaggagaaatttctaaacctgatggtataagtgatacttcactt
tctgctgacactcaaattactgtaaatatgtggggtataacttggtataagaatttaaac
attaaacgtactattcctatacctaaaatgagtggtaatttacttgatctttggaacaca
atgcccaaatttttaatttccaaagatatgcaaagtatgacgttgaaccaacaatcaagt
gataccgttattgaaattggaggcgttaatgtgactaacgtaaataaaccgattgtaata
gatggagttagttattggcaaatccttcctggctttccaccaatcaatttacaatcattt
gatattgcgtttacaaatgaaggaccaaatatttcattaaaagcagcgttgataaatcca
acagttctctcaataccattacctgatacatccattggtttacaattagaagattcatat
ttagcaacaacatctgttaatggattcaatttaacaagaggattaaataatattgacttg
aatttaaaattaactttcgatccaagtagaattgtaagtccaaatcaattaagtaattca
atatctctagcagcaggaaaattacttggaataagtcaatcaaatgatcaattaagattt
aatgttatcggaccagttggacttaaaggtgttgattttattggagatgcaacagaaaag
ttatctttaacattaccaataaatgaaattattaataataccaatgttatgctattaaaa
aatttgttcgatgttaaaggaattgaaagtttattacacacgatacattttgatgttaaa
atacaacaagatagaataattattcctgttgatatctcattaccaagttttcttccttta
ccaccaagcttagaatttaaatataatacatcacttggaatatttaagggagaacaaaat
gctcttacagttaatttaggtggaatttcgatgacaaataatgaaaccttaaatattgta
acttcggtaacaatattcccaaataatacttttgaggcagctggtgcattagcttcaatt
gttaatccttcattatctggtaatatttccagtgcagatataaaaaatttttcaattttc
aatgaaacaggaggaacatttccttgggctaatgatttattcggaggcctttctcttaat
attccgattcccggatttaatactactacaataattaacatgctaactcaaaatggtaca
agcattccagcggaaatgcttggaatgagattgactcaacgaagtgacgtagctggattc
aatgtcaatggaacagttgctattaaatatcctccattccttcctattataactattggt
actggatatctagaatcaaccatttttactgatgatgtattattagctaccgcaaaatta
cctaatggaatattttatactgctggagagaattcgactaatattgttgcttccgctata
ttaaataaagatgatagattgaaatcaattatttcgcaattagtcatgagtgttttagaa
acggaagataatgttaaaatgccaattattggtattagcggacttaagatgggtgcaagt
gagactttaagttttgttacatttagccaaattttagtacctattaatttagcaacgtta
aaaccagcaatgaaaacaactataggaacaatatcacaatcaattcaaaaacaagttgga
ttgttatcattaacaggagtcgattttgccatcgttacatcaaattcattatcaattaat
ttacaaactattcttaataatccaatgaatataatagctgatattggatcagtatcattt
acgacaacattattttatggtgaattggccaatataactttatcacctattcaattagca
ataggaagaaatccatttaatttacaaatgcgtattgatattgttgatggtaaaaatgga
atgtcagataacattttacaattgtttaaagatttaactagtactgaaggtgattttaga
tcaatcatcggaatcaaaaactttatcattgctcctcctcctcccactactcaagatggt
aacgttaacgttacattagctactattgatcaattttcctcagcacaaattacggttcct
tcttcacttgtcccagccgaaaatttaagatccattaatgtaattgaaatgatcaaaaat
ccaaaaaacggtattatagatatatccggaatattaccaacatcagaaactacttttacc
cttcctacgatcaaaagtgtttcaattgaaacaaaagaaaatgctcaattattaattgga
acaacattcagttatattaatccattacctattagtgccaaagttccttattttggtgct
accgttatattagatggaaataattttatcacatttggtattacacgaattgatttggaa
agaaatcaaggaaatatggatatttcgttagctatgtcatttgataattctgatggaact
aaatctgcagttaatgaattcttaaaaaatattttgaatggagaagttaaacaaaagatt
gaaataagcggaatatattttggaggaccgaatgaaaatccaaacgatttaatgaattta
cttaaacttccattaccaacagatttagtagatattaattcaattaagaataaagtaatc
gaattatcaccaatcaagttaccacttagtttagatcaattattatcatctcaattcatg
ccacaattaaaatcagttgatatttctactttacctaatagagtattgtcgttaaaagtt
ggtgctcaattaaacgtaccatttgaagttagtgctaatattggttatgttggtgtcaaa
ggaattacattggatgataaacaatttacatctgttgacataactggaattcaaacaagt
ggtgctggaatcaattatgttacactagggattcaattagcattcagtgatgatgaatct
attcaaaaatccgttaaaagcatttatgattctttaattaatggtaattttatttcaaca
aaaggaggaattaacggagtttcacttggaatatcagcagatgattccatccgtacgttt
gaaaaaatttctctttcaacagaaattggaaacttaattacaggacaattaaatttaaat
ggaataatagattcaatgttaacaaatgttggtaatagtaataatataataacagcgggt
caaggttctataacagttaatattccaaatttagctcaaatagttataggacaattagga
attaaatttttaccaggaaaaatgatcgaaattaaaatggtatcaactattactttatca
ttcacattaacaatgaatatcggatttgctggcgtaggaatatttttggacgatttatct
gctttcgatattcgagtagctgctgcaagtgaaggtcaagttgtttcaatagcttcttcg
gtaaaagtcaatgattctgatgaattagctgataaacttggtggtttggccaaaagtttc
tttgataatactccactaacaggaaatttagcgattaaaaacccttttattggtgcttca
aatgatgatgttattagagcattttcattaatttctttagatctatcattagaaaaatta
gttacacctttaattaaaaatttaccaaaatcaattgatccaataactttaatagatcaa
attggtttcaaattgaatgcattaggaattgatacagctcctcaacataaaatattagca
aatgttcaagcatcatttaataataatttcccagttacaattgatattggatttgttgaa
ttatcattaggattagatttagttaattttgttgatgcaagtttatctgatttatcgata
ggttctggtgctaataatggactctctataaaatcaagtttagattttcaaccatctaat
gatcaagttcaagataaaattgcttcatttgtcacctctttacaacaaaatggtttgggg
aaaacgaatgaattatttagtgttagtggaatcaaaattggaccttcacctaatgaattt
attaaatctttcgaaaaagttgttgtaggaatcccaagttctttaattcttaatcaagta
gttgttgaaaaattattaggaatggcaggactttctttaactgatttgacaattgaagga
atgttaaatagattaagtattggtaatgttgctgttgatatgaatccaaatggtcaagaa
ttagctattaaaggaaatgtagggattagtaatatttcactccccctaaatgttaacatg
ggaatacttgaattatcagtcgcgttaaatgcatcaccacttacaagagtaattttaccg
gatgttaaaatagtttcttctaataatgttatttcaacggattttactgtcgcattaatt
ttccaagattcagatggattagaagatgaagtagccgcattagctaaatcattaattgaa
ggaaacaatggtaccgtcattccaggaaatgcgaatattaatggattattatttggtagt
tcaaattctgataaggatattataaatacttttagtaaggtattaatttcactcccgtta
aatccaatattacaaccgattaaagcaatgatcactaatatagttagtggatttattgat
ggtactggagctgttaaacttacattagatgatgtaagtgtcggaatcaagaattcaaat
actttaactactgacatcgtggctgatttaactggattacctcaaatatctcttaatatt
ccattcgctagtgttgatgtttcaattaatggtggacttttcgtatcaactgttataaat
ggaatgaaatttgaaggcaatcgatttacaacttcagttgaattaggatttcaagataat
aaacaaattgctaatcaattggccgtaattatatcagatctagtatttagaaggttaaca
tatacagtatcattaccagttggaataaataatttaatatttggaccttctccacaaaaa
acttttggtttaacaagaaaaatctcagtaggaatggatgtaggaaaattcattaatcaa
ttctcagattttaatcaaaagaataatttaattaccttagaaaatattcaaggacaactt
actcaacaaggtgttgaagctatagttacttctcctgctatccctaatttaccgttgaac
cttaatattccttcattgttagctcaagtatttttcaaaggtgtatctggtggtatatct
aaagctgctgttaaaccaaatgttaaaaaaggtcaagctaaatgggaatttggtcttaca
gtacttgttgataatggtccaatgtctcaagctcttgaaacagctgttcctaatttactt
tcgttcaaatcatatactgatggtgcttccctcggaggtgtaatactttgtacttcggat
gattgtttaaatcctccagataattcatttaaaatatttaatgaaattaatttcgtacct
ccaccattattcttatttaatccaattaatgtagaattaactaaaatattcccaacactt
ggacttaatactttatttacaaatactggaccccttcacgttgatattggtaatttcgta
ttatcattacaaagtagtggtacatcaatatttgaagtatcatcacctcaacctgttata
atacaaaataatttagaaaatgctggtaaaaatgttataccagtagaagggaaattaact
ttagatccattacaaatacctaaattattattagatttagttgatttagaaaaagatttt
gctatcgttttacaagttaataagaatggtgatccaattggatggttaaacgatttattg
aaaaatttaccacaaaccgtcataaaaaatcttttccccattttacaaggattattaaaa
aacattagtataggtatcgatttaaataataagaatagtactgttcctattggggatgga
aaaacaattaacggaactgttcctattggtgatggtaaaactcctccaccaaatggtgat
ggtaaagttcctgatggtaaagctcctgatggtaaaattcctgatggtaaagttcctgat
gacggttctcctaaaatccctcaaggagaagtaccaaaacaacctactgaagaagaacct
aaaaaacctgcagctaaagatcctcaagaacctgaaaagccaaaacaagatgaaactcca
aaacaaggaaaaaatcctgatggtgaagatgaaagcataggtggtaaaattatagatgtt
atcaccaaaccatttagaccaaaggattctttaacagctgaaacaaatgataatatagaa
aatcccaaacctatatatacttggactattaatgctcccaataattag
DBGET
integrated database retrieval system