Rhizophagus irregularis: OCT59_019931
Help
Entry
OCT59_019931 CDS
T10295
Name
(RefSeq) uncharacterized protein
KO
K00698
chitin synthase [EC:
2.4.1.16
]
Organism
rie Rhizophagus irregularis
Pathway
rie00520
Amino sugar and nucleotide sugar metabolism
rie01100
Metabolic pathways
Brite
Enzymes [BR:
rie01000
]
2. Transferases
2.4 Glycosyltransferases
2.4.1 Hexosyltransferases
2.4.1.16 chitin synthase
OCT59_019931
Glycosyltransferases [BR:
rie01003
]
Polysaccharide
Structural polysaccharide
OCT59_019931
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
36859602
NCBI-ProteinID:
XP_025178187
LinkDB
All DBs
Position
29:2694572..2698283
Genome browser
AA seq
1127 aa
AA seq
DB search
MQTDEITTAESVSSTVVPSTTDEDIRRTIYDVIIQNDVKELTAILTDIVNFDVNKPLSEK
EGDNKNALMIASSLDCYDIVKYLLTDNNIDINLQDNFGETALFLASALGNAKIVKLLLRN
NANPNIYNNENVTPLIVSSYNGHNDTVKALLEKGDVNINYQDNLCKTALSFAAHEGQPLI
VELLLKNGADVNIADKLGWTPLMLAAYAGRANICKQLLIANANKNLKTSDNKTASIFAKD
AGHFHIAEMIDKFVYHSNMVTYNYDEEIINVRKRDTHFLGNGNHDSRRISTASRLRTEML
PREGNTWWVYISWITTFFILDRFLIKYGNMNDKRVRQAWREKFTLCFIALLITIFMAFIT
FGFVSLSCSPTAPPIPLPLVDEFWGVNKKVMIVRGRIYNVGDFFNSGGHRPIIPFDDASL
EPIIDQYYGKDVGELFPVNDQAIGCNKNSTVNGLSCRIDSDNRYHCHTSTNSFRTLESLF
INRLVSISWDEIKNTQFRKLFAHKGRVFDLTNYLSETNTNRWLGDDEFTKSFLESLIGKD
VTSDLSNIKDNNQKEIMKCFEHFQVGAVEGVTYGCASVTMAVIVVSSISTGAVIMKLISA
LAFDNLIAKKLVKKVITTDNVKDVIIMVPCYSEGYESMKASFDSLVATDYPDQNKILFII
ADGNITGSGNDKSTPDILLDFIVPYNENFDNVRAKSYLSIGEGTKRHNMAKVYIGHYQYQ
NRNIPTLLIVKVGNQEERNYPKAGNRGKRDSQLVLMQMLHHAFNNGKMSPLEFDIFEKYR
KLTQRTIDKCEFVMMVDADTIVKEDSVSNMVNYMLNDPSVTGLCGETRILNKTENWVTLI
QVFEYYLSHHLGKSFEAVFASVTCLPGCFCMYRVFAYNYDGNRVPILVDENIMMNYSTNE
VTTLHQQNLLLLGEDRYLTTLMLRAFPKRKTAYCPSAICETIAPAEFKVLVSQRRRWING
TIHNMFELLVTSELPGRFCFSMQFSVFLDIIGTFTSPFALLYVLYTFIGLVAGFPFQTAV
IFSAISFSLQLILAIFTSFDPIIVMWFFIYLFSVPIWYIILPLYSFWNFDDFTWGATRKL
NDDGTSSYSDTIFDKFDPKSVPFKKWEQWVKSTNSKGVSKSVSYKYI
NT seq
3384 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaacagacgagataacaacagcagagtcagtctcttctacagtagttccttcgaca
acagatgaagatattcgaagaacaatttacgatgtaataatacaaaatgatgttaaagaa
ttaactgcaatattaactgatattgtcaattttgatgtaaataaacctttaagtgaaaaa
gaaggagataataagaatgctttgatgattgctagttctttggattgttatgatattgtt
aaatatttattaactgataataatatcgatataaatttacaagataatttcggagaaacc
gctttattcctcgcgtcagcattagggaatgcaaaaatagtaaaattattacttagaaat
aacgcaaatccaaatatatataataatgaaaatgtgactccattaatagtgtcatcatat
aatggacataatgatactgtaaaagcattattagaaaaaggtgatgtaaacataaattat
caggataatttatgtaaaacagcattatcgtttgctgctcacgaaggtcaaccattgatt
gttgaattattgttaaaaaatggtgctgacgttaatatagcagataagcttggatggaca
cctttgatgttggcagcttacgcaggaagagcaaatatttgcaaacaattattgatcgca
aatgccaataaaaacttaaagacaagtgataacaagacagcatctatatttgcaaaagat
gcaggacattttcatatagccgaaatgatcgacaagttcgtttatcattcaaatatggta
acatataattatgacgaagaaattataaatgttagaaaaagagacacccattttcttgga
aatggaaatcatgatagtagaagaatcagtacagcttcaaggttaagaactgaaatgtta
ccaagagaaggaaatacttggtgggtttatatatcatggataacaactttttttattctt
gatcgattcctcataaaatatggtaatatgaatgataagagagtaagacaagcttggaga
gaaaaatttactttatgctttatagcattactgattacaatatttatggcatttataaca
tttggttttgtttctttatcatgttcaccaactgctcctccaattccactccctcttgtt
gatgaattttggggtgtaaataaaaaagttatgatcgtacgtggtagaatatataatgtt
ggagatttttttaattctggtggtcatagaccaataattccatttgatgatgcttctttg
gaaccaattattgatcaatattatggaaaagatgttggagaattatttcctgtaaatgat
caagctattggatgtaataaaaattcaactgtaaatggattatcatgtagaatagattca
gataatagatatcactgtcatacatcaacaaattcatttagaacattagaatcattattc
ataaataggttagtttcaatttcatgggacgaaataaaaaatacacaatttagaaaatta
tttgctcataaaggaagagtatttgatttaactaattatttatcagaaactaatacaaat
agatggttaggtgatgatgaatttacaaagtcatttttagaaagtttaattggtaaagat
gtaacttcagatttatcaaatattaaagataataatcaaaaggaaattatgaaatgtttt
gaacattttcaagttggagctgttgaaggagtaacatatggatgcgcttcagttacaatg
gctgttattgtagtatcaagtatttcaacaggagctgttataatgaaattaatttctgct
ttagcatttgataatcttattgcaaaaaaattagttaaaaaagttattactactgataat
gtaaaggatgtaattattatggttccatgttattctgaaggttatgaatctatgaaagct
tcatttgattctttggtagccactgattatccagatcaaaataaaatattattcattata
gctgatgggaacattactggtagtgggaatgataaatcaactccagacattttattagat
ttcatagtaccttataatgaaaattttgataatgtaagagcaaaaagttatttatcaata
ggagaaggaacgaagaggcataatatggcaaaagtatatataggacattatcaatatcaa
aatagaaatattccaacgttattaatcgttaaagtagggaatcaagaagaaagaaattat
cctaaagctggtaatagaggaaaaagagattcacaattagttttaatgcagatgttacat
catgcttttaataatggtaaaatgtcaccattagaatttgatatttttgaaaaatatcgt
aaattaactcaaaggaccatcgataaatgtgaatttgtaatgatggttgatgcagatact
atcgttaaagaagatagtgtaagtaatatggttaattatatgcttaatgatccttccgtc
actggtctttgtggtgaaaccagaatattaaacaaaacagaaaattgggtaactttgatt
caggtctttgaatattatctatctcatcatttgggaaaatcatttgaagccgtattcgcg
agcgtcacgtgtttacccggatgtttttgtatgtacagagtattcgcatataattatgat
gggaatcgcgtaccaattctagtagatgagaatataatgatgaattatagtacaaatgag
gtgacaacccttcatcaacagaatttattattattaggagaggatcgttaccttaccaca
ttaatgttaagagcattcccaaaacgtaaaacggcatattgtccatcggcaatatgtgaa
acaatagcgccagcggaatttaaagtattagtatcacaaagacgtagatggattaatgga
acgatacataacatgtttgaattattagtaacatccgaattacctggtcgattctgtttt
tcaatgcaattttcagtattcttagatataattggtacttttacgtccccatttgcatta
ctgtacgttttatatacatttataggcttagttgccggttttccttttcaaacagcagta
attttttctgctatatcattctctttacaattaatattagcaatctttacttcttttgat
ccaatcattgtaatgtggttttttatttacctattttcggttcctatttggtatataatt
ttacctttatactctttttggaattttgatgattttacttggggtgctacaagaaaactt
aatgatgatggtacttcaagttatagtgatactatttttgataaatttgatcctaaatct
gtaccatttaaaaaatgggagcaatgggttaaaagtacaaatagtaaaggtgtcagtaaa
agtgtctcttataaatatatatag
DBGET
integrated database retrieval system
