Rhizophagus irregularis: OCT59_024594
Help
Entry
OCT59_024594 CDS
T10295
Name
(RefSeq) uncharacterized protein
Organism
rie Rhizophagus irregularis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AMP-binding
AMP-binding_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
36878472
NCBI-ProteinID:
XP_025167785
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(38373..40509)
Genome browser
AA seq
541 aa
AA seq
DB search
MIFKSLLPDIEIPAMGIYQYVTSNPNGISDDKVIFTDGITDKKLTYGELKSNSKKLAAGL
IDKAGFKRGDVLAIISPNQVDYAIVSFGTIVAGGIVTFVNPMYTVDELTYQLKDSGAKYI
IAFPLLLSNVIKAAAAANIHESNIFLFGDAEINGIKPYSSLISEKEANPIEYSQEEAKST
TAYLCYSSGTTGKSKGVETTHYNIVANLSQIYAHEDDVNSDAIYLGLLPFFHIYGLSCII
HFPIIKGASVIVIPKYELSTFCRIIQDYSVNRITVVPPIILSLVKDPIVKNYDLSSLLVC
LCAAAPLSKELSDEFTKIYNVPIIQGYGLTEASPATHLAKIDNIVPGSVGKLISNLESKI
LSEDGKELGVDQPGELCVRGPNIMKGYLNNKEATDACIDGEGWLHTGDIVTVDKFGNFYL
IDRAKELIKYKGFQVPPAELESILLTHTSIADAAVIGVYSEEHATEYPTAYVKLQPNVPQ
SDQLKKEIEDFIAQKVANYKRLRGGVLFIDQIPKSTSGKILRRSLRDRIKTEHPFYANNV
G
NT seq
1626 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattttcaaatctttattaccggatattgaaattcctgcaatgggaatttatcaatat
gttacaagtaatccgaatggaattagcgatgataaagtaatattcaccgacggtataact
gacaaaaaattaacttatggtgaacttaaaagtaactcaaagaaattggcagcaggatta
attgataaagcaggatttaaacgtggcgatgtattagcaattatttctccaaatcaggtc
gattacgcgattgtttcattcggaacaattgtagcaggtggaattgtgacttttgttaac
cctatgtatacagttgatgagcttacctaccaattaaaagattcgggtgcaaaatatatt
attgcatttccattacttctctcaaacgtgattaaagcggcagctgcagcaaatattcat
gaatcaaacatatttttatttggtgatgcagaaattaatggaattaaaccttattcttca
cttatttctgaaaaggaagcaaatccaattgaatattcacaagaagaggcaaaatcaaca
acggcatatttatgctatagttctggtacaacagggaagagtaaaggggttgaaacaact
cattataatattgtagctaatttgtctcaaatttacgctcacgaagatgatgttaattct
gatgctatttatcttggtttattacctttctttcatatttatggattaagttgtatcatt
catttcccaattattaaaggagcatcagttattgtaattccaaaatatgaattgtcaaca
ttttgtagaattattcaagattatagtgttaatagaatcacggttgtacctccaataata
ttatcattagttaaggatccaattgttaaaaattatgatttgtcaagtttactagtatgt
ttatgtgccgccgctcctttaagtaaagaattatccgatgaattcaccaaaatatataat
gtacctattatacaaggatatggtttgactgaagcttctcctgcaactcatctcgctaaa
attgataatatcgttcctggttctgttggaaaactaatttcaaatttggaaagcaagatt
ctttctgaagacggaaaagaacttggagttgatcaacctggagaactttgtgttcgtggt
ccaaatatcatgaaaggttaccttaataacaaagaagctactgatgcgtgtattgatggc
gaggggtggttacataccggtgatatagtaactgttgataaatttggaaatttttacctt
atagatcgtgccaaagaattaattaaatacaaaggtttccaagttccacctgccgaatta
gaatcaatcttacttactcatacatcaatcgctgatgctgctgtaattggtgtttattct
gaagaacatgcgaccgaatatccgactgcttatgtcaaattacaaccaaatgtccctcaa
tctgatcagttaaagaaggaaattgaagattttattgctcaaaaagttgcaaattataaa
agattacgtggcggtgttttatttattgatcaaattcctaaaagtacttctggtaaaatt
ttgaggagatcattaagagataggattaagactgaacaccctttttatgcaaataatgtt
gggtga
DBGET
integrated database retrieval system