Romboutsia ilealis: CRIB_1478
Help
Entry
CRIB_1478 CDS
T09982
Name
(GenBank) Dockerin type 1
Organism
ril
Romboutsia ilealis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cthe_2159
DUF7406
BclA_C
DUF5478
DUF4969
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CED94086
UniProt:
A0A1V1I1I8
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(1440941..1442977)
Genome browser
AA seq
678 aa
AA seq
DB search
MNKKLVAMLSALSLCVTVTACSKSEENTKSQSSTNKTSINIESLDNESVSDPDTYIKLGA
ETTVEGQGAEVSNNKVTITKAGTYSVSGKIEDGQILVDAGAEDKVYIILNGADIKCSNSA
PIYVKNAKKAIISLADGTENNITDGETYVFEDESSNDPNAAIFSKDDMTIIGTGKLTVNA
NYNNGIASNDDLKIQSGNIVVNAKNNGIKGKDCINVTDGNITINSKGDGMKADNTTDETK
GYIYIEGGKINITSSQDGIQAETELLIADGDITIKTGGGSENSTKSNQAPGKMPEGMPKG
ERPTIPDGQTQGERPEIPQDIRHPSSNQDTNKNSNTDVSTNTSTDENTSMKALKATTNII
IDGGTFNIDSEDDSIHSNANAIINGGTFEIASGDDGIHSDTKLDINGGIINISKSYEGIE
STTININDGNIHVVASDDGINAAGGNDVSTETGMPGNDKFSSSGDALININGGYVYVDAS
GDGIDANGSINMVGGTVLVNGPTNNGNGSLDYDETFDISGGTLVAAGSAGMAQMPSDSSS
QKILNLSLTSQESNTVVNIKSSDGKNILTYSPSKNYSSVIVSTPDIKDNTKYTVSVGGTA
KGEAKDGLYYDGNYSGGTEVGSETISSTITNITQEGASTNSMGGHGGQGGRPGGKGHKMQ
PNTSGQTNNQINSQITEQ
NT seq
2037 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataagaaactagtagccatgctgtcagcactatcattatgtgttacagtaacagct
tgttcaaaaagtgaagagaatacaaaatcacaaagtagtacaaataaaactagtattaat
atagaatctttagacaatgaaagtgtttcagacccagatacatatataaaactaggagct
gaaacaactgttgaaggccaaggagcggaagtttcaaataacaaagtaactattacaaaa
gcaggaacttatagtgtaagtggaaaaattgaagatggccagatattagtagatgcagga
gctgaagataaggtatatattatcttaaatggagctgatatcaaatgttctaatagtgca
cctatatatgtaaaaaatgctaaaaaagcaataatatctttagcagatggaactgaaaat
aatataactgatggagaaacttatgtgtttgaagatgaatcaagtaatgatccaaatgca
gcaatatttagcaaagatgatatgaccataataggtactggtaaacttacagtaaatgca
aattacaacaatggtatagccagtaatgatgatttaaagattcaaagtggtaatatagtt
gtaaatgctaaaaataatggtataaaaggtaaagactgcattaatgtaacagacggaaat
ataactataaattcaaaaggcgatggaatgaaagctgataatacaacagatgaaacaaaa
ggttatatatatattgaaggtggaaaaataaatataacttcaagtcaagatggaatacag
gctgaaacagagttacttatagctgatggagatataacaataaaaacaggtggaggaagt
gaaaatagcactaagtcaaatcaagctccaggtaaaatgccagagggcatgccaaaaggt
gaaagaccaacaataccagatggacaaacacaaggtgaaagaccagagataccgcaagat
attaggcatccatcaagtaatcaagatacaaataaaaactcaaatactgatgtgagtact
aatacatcaacagatgaaaatactagtatgaaagctttaaaagcaacaactaacataata
attgatggaggtacttttaatatagattcagaagatgactcaattcattcaaatgctaat
gcaattatcaatggtggtacttttgaaatagcttctggagatgacggcatacattcagat
actaaattagatattaatggaggaattataaatatatctaaatcttatgaaggtatagaa
agtacaactataaatataaatgatggaaatatacatgttgtagcaagtgatgatggaata
aatgcagcaggtggaaatgatgtatcaacagaaacaggtatgccaggaaatgataagttt
agttcatcaggtgatgctttaataaatattaacggtggatacgtatatgtagatgctagt
ggtgacggaatagatgcaaatgggagtataaatatggtaggtggaactgtattagtaaat
ggtccaactaataatggtaatggaagtttagactatgatgaaacttttgatataagtgga
ggtacactagtagctgctggaagtgcaggtatggcacaaatgcctagtgattcatcatct
caaaaaatattaaatttaagcttaacatcgcaagaatctaatactgtagttaatattaaa
tcatctgatggaaaaaatatattaacttattctccgtcaaagaattattcatcagtaata
gtttcaacacctgatattaaagataatactaaatatacagtatcagtaggtggaactgca
aaaggagaagctaaggacggattatattatgatggaaattattctggaggaactgaagtt
ggaagtgaaactatatcaagtactataacaaatattactcaagagggtgcatcaactaat
agtatgggaggtcacggtggccaaggaggtagaccaggcggtaaagggcataaaatgcaa
cctaatactagtggtcaaactaataatcaaataaatagtcaaataactgaacaataa
DBGET
integrated database retrieval system
