Rivularia sp. PCC 7116: Riv7116_4615
Help
Entry
Riv7116_4615 CDS
T02364
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
riv
Rivularia sp. PCC 7116
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
riv00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
riv02000
]
Riv7116_4615
Transporters [BR:
riv02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Riv7116_4615
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFY57034
LinkDB
All DBs
Position
complement(5776184..5782474)
Genome browser
AA seq
2096 aa
AA seq
DB search
MPNSSSTEKCPKSKNRKRLWFLVLSRGGLAFGGLLIVGISFGIWRLQVFIRQDLAPLVEK
NLTSIIDRPLELGEVNGFSLSGVRFGASAVPKTATDADTVKADAIEVGFDPLKLLFNRKL
KLDITLVNPVGYVDRDEQGRWITTKIVLPEKPGAIAIDLEKVNLRNGSVTLMPFGENRQV
SPKVVFSELNGYAKFFDNYQAVRFEVGGKPGRSGNVSVRGKVGIKTKTGNLQLQVEDLIA
SEVTPLVELPINLKGGKINGDLQVKLPAGEKIQPLLYGNARVEGLSFQVARMPKPLVNSQ
GTLQFDGTKVRLNDVVTSYGKIPLSGGGIIDWKTGYDLTARVNAVSVNDTLQTLEIQSPL
PVGGVVKGDLKMTGAITQPIISGTVATVKPGIVDKVKLKTASGKFAFVTADSTITFTDIR
GTAAVGGDVRGAGKILMGDDTVGRSSQVNFNFLTSNAPGDSFARIYDIPTPSFQVGRVAA
TANLSGTPETLRTLVEFNAPQATYPATGEVVVNRDRSLQFRNVALAVAGGTALAYGSWNQ
QRWQAVANTKGIKINQFVSQEQLEKVNLDSADFNGKVIVSGSSTPFKIAQIKTENADIKV
AGGRVAVNSVKFNEQDFSADLVASGVQVGRLFKNANLPINGSLNGKFQVSGSTSNFDMKT
LQVRGNAGLAAAGGTITASDIRVKDGIYLARVKANNLQLQQLSEQIPKSFKGKLRGDFDV
AGSLDSFQPESIVANGKAEIETAGGTVAANNIRVKNGVYLADVAANNVRVRELSQQIPKS
FSGRLTGNFNVAGSLDSFAPENLIVSGKGNLNTAAGRILARDIEFARGQYRAKIGVNNID
VRQLSPQIPSSFPGKLTGNFDVAGSTKSLEDLTISGNGFVNAAGGRITAAEIAVYNGRYQ
AKVVANDLLVRQLSPQIPKSFAGRLTGKFDVAGSVNSFEDLTASGNAAINTGAGKITASD
ILVNNGNYQAVVAANQIKIRQIAPQVPEVLAGTLTGKLNIAGSLNSFDSLTAAGNAAIDA
AGGKIAASNIQLKNGSYQAIVNAANLELNQLNQNLRGKFNGNLQVAGNWKNPSLADVRAN
GNVQFSQGIPGFEKPIDAAIAWNGNKLKIQRASAPGLYISGDIFANAKSTGIPTITQLDL
NVRANDFDLQQLPVDVYNAVDVAGKVDFNGKITGKLPIPNIVGQVALKDFAVNDIAFEPV
LAGNVKSQQGSSLQLNVAGKQDKISVNLNANNRPESFLIKRGEAFASGQSQGDILALNVN
KFPLRLLKLPLPVNRYLGSGKIAGEFTGNLRMNQKTFATASGEIAVKNPEVGRLKGDNLV
ANFNYNGKQIRVVKGEFVKGESIYSLAGTVNKINTTPQIKGKLKVKEGKIQDVLTALQIY
ELSDIQRGLEEPTYGKASQLKTTPVGLPNQSLLTQLRRYSEIQALLARQKQQRRDASPFP
ELGNLKGTFNGEISLDTAEDKGISTQFDIKGKNFTWGTEEDPERYRAKQVIAQGAFENGI
LRLIPLRIESTNRLFSFSGAVGGDEQYGTLQVNNFPLEVLNNFVNLPVGLTGNLNGRAAL
AGSIKNPLTKGEFRITDGTLNQKGIESAAASFSYSNGRLNFASNVMINDAEPVDINGSIP
YQLPFASVAPASNQINLDVNVKNEGLAVLNLISNQATFEKGEGEIQLTVRGTLQEPVVNG
NATLNNATFSAQALPEKLTNVTGKVQFDFDTIVIDALQGDFSRGKVVAKGEIPIYDDQFI
QINNPLAVTLDKLAINLKGLYQGGVGGKVVVKGSALSPIISGNINLSNGLVLLPENETEN
VAANSSGIKRLKANKQINQEENARGKFDNLKLTLSKDVKVERPPIISITASGLLNVNGTF
SNPIPVGTLKLKKGGVNLFTTQFNIDKGEENTATFIKNQPRDPILDISLFAKVLDVIQNS
DFSRANATGLAALETVRVEAEVNGPASKINENLELKSSPARTETEIVALLGGGFDGEGRA
SSAVGLLNIAGSAVFGNLQTAFNEIGTAFGLDELRIFPTIISDNPDAGKSNSTVELAAEA
GVDVTNRISVSALKILTADDPFQFGINYRLKDRIRLRGSTNFDDDSRAVIEYQRRF
NT seq
6291 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctaattcctcttctactgaaaaatgtcccaaatccaaaaatcgcaaacgtttgtgg
tttttggtacttagtcgcggtgggttggcttttggtggattgctaattgtaggaatttcc
ttcggaatctggcgactacaggtttttattcgacaagatttagcgcccttagtagaaaaa
aatctgactagtattatcgatcgcccgcttgagttaggggaagtgaatggtttttcgctt
tctggcgtgcggtttggagcttcggctgttcccaagacggcaacagatgcggatacagtt
aaagctgatgctatagaagttggatttgacccgttaaaattattgttcaatcgtaaatta
aagctagatataactttagtcaacccagttggctatgtagatcgagatgaacaaggacgt
tggattacgactaaaattgttttaccggaaaaacccggagcaattgctatagatctagaa
aaagttaatttgcgtaatggaagtgtaacattaatgccttttggagagaatcggcaagta
tctcccaaggtagtattttcagaacttaatggttacgctaagtttttcgataattatcaa
gcagtcaggtttgaagtcggaggaaaaccggggcgcagcggtaatgtttcggtgagaggt
aaggtagggattaaaacaaaaacgggtaatttacagttacaggtagaagatttaatcgca
tcagaagttacacctcttgttgagctaccaattaacttaaagggagggaaaataaatggg
gatttacaggtaaaattacctgctggggaaaaaatacagcctttattatacggcaacgct
cgggttgaaggattgagtttccaggttgctcgaatgccaaagccgttggtgaattctcag
ggaactttgcagtttgacggtacaaaagtcagattgaacgatgtagttaccagttacgga
aaaattcctttgagtggtggcggtattattgattggaaaacaggttacgatttgacggct
cgggtgaatgctgttagcgtcaacgatactttacaaactcttgagattcagtcaccttta
ccggtaggtggagttgtcaaaggcgatttgaagatgacgggggctattactcaaccaatt
atttccggtaccgttgccaccgttaagccaggtattgtggataaagtgaagttaaaaacc
gctagcggtaaatttgcttttgttacagccgattcaacaattacttttacagatattcgc
ggtactgctgctgtaggtggagatgtgcgcggtgccggtaaaattttaatgggtgacgat
acggtaggtagaagttcccaagttaattttaattttctcactagcaacgcacctggggat
agtttcgcgagaatttatgatattcctacaccttcgtttcaagttgggagagtcgcagca
actgctaatttaagcggtacgccggaaactcttcgcactctggtagaatttaatgctcct
caagcgacatatccggcaacgggggaagtagttgttaatcgggataggagcctacagttt
cgtaatgtagctttggctgtggctggcggtacggctttagcttacgggagttggaatcag
cagcgctggcaggctgtggcgaatactaagggtataaaaattaatcagtttgtcagtcag
gagcagttagaaaaggtaaatcttgatagtgctgattttaacggtaaggtgattgtttct
ggttcttccacaccgtttaaaatcgctcaaataaaaactgaaaatgccgatattaaggtt
gctgggggaagagttgcagttaattcagtcaagtttaacgagcaagatttttccgccgat
ttagtcgcttctggggttcaagtcggacgtttattcaaaaatgctaatttacctattaat
ggttctttgaacggtaagtttcaggtatcgggaagtactagcaatttcgatatgaaaact
ttgcaggtgcggggtaatgctggtttagcggctgcgggaggaaccattacagcgtcggat
attcgggtaaaagacggtatttatttagctagagttaaagctaataatttacagttgcag
caattatcagagcaaataccaaagtcgtttaaagggaaattgaggggagattttgacgtt
gcgggttctttggattcctttcaaccagaaagtatagtagctaatggtaaagctgaaata
gaaaccgcaggtggtacagttgcagccaataatattcgagtcaaaaacggagtttattta
gctgatgtcgcggcaaataatgtccgagtgcgggaattgtcgcagcagattccgaagtct
ttttctggcagattaactggtaactttaatgttgctggttccctagattcttttgcgccg
gaaaatttgattgtatcggggaaaggaaatttaaatactgctgccggtagaattttagcg
agggatattgagtttgcgagaggacaatatcgcgccaaaattggggtgaataatatagat
gtacgtcaattatcgccgcaaataccttcatctttcccaggaaaattaacggggaatttt
gatgttgcaggttcgacaaaatccttggaagatttaactatatctggaaatggttttgtg
aatgcagcagggggtaggattactgctgccgagattgcagtttataacggtagatatcaa
gccaaggttgttgcgaatgatttgttagtaagacaattatcgccgcaaattcccaaatct
tttgcaggaagattaactggtaaatttgatgttgcaggttcggtaaattcttttgaagat
ttaactgcgtcgggaaatgctgcgataaatactggtgctggtaagattacagcatcggat
attttggttaataacggtaattatcaagctgtagttgctgctaatcaaatcaaaatcaga
caaattgcaccacaggtaccggaagttttagctggaacattaaccggaaaactgaatatt
gcaggttcgctaaattcctttgatagtttaactgctgcgggtaacgctgcgatagatgca
gcaggtggtaaaattgcagcgtctaacatccaattgaaaaacggaagctatcaagcaatt
gttaatgctgcgaatttggaattaaaccagttaaatcaaaacttgcgcggtaagtttaac
ggtaatttacaagttgccggtaactggaagaatcccagtttagctgacgtgcgggctaac
ggaaacgtacagttttcccaaggaattccgggatttgagaaaccaatcgatgcagcgatc
gcctggaatggtaataaactaaaaattcaacgagccagcgcaccgggtttatatataagc
ggcgatatttttgctaatgccaagagtacgggaatacctacaattacgcagttggatttg
aatgtccgagctaatgattttgatttgcagcagttacctgtagatgtttacaatgctgtt
gacgtggctggtaaagtagattttaacggtaaaattactggtaaactacctataccaaac
atcgtagggcaagtagcactaaaagattttgcagttaacgatattgcatttgagccagtt
ttagctggtaacgtgaaatcgcaacaaggaagcagtttgcaattaaatgttgcgggaaag
caagataaaatatcggttaatttgaatgctaataatcgtcccgaatcttttttaattaaa
cgtggtgaagcatttgcttccggtcaatctcaaggagatatcttagcactgaacgtgaat
aaatttcctttacggctattaaaattacctttaccagttaatcgctatcttggttccggt
aaaatagctggagaatttaccggaaacctgcgaatgaatcaaaaaacctttgctacagct
tcaggagagattgcggtcaaaaatccagaagttggacgcttaaaaggcgataatttggtt
gcgaattttaattataatggcaaacaaattagggttgttaaaggtgaatttgtcaaagga
gaaagcatttatagccttgccgggacagtaaacaaaataaatacgacaccgcaaattaaa
ggcaagctaaaagttaaagaaggtaaaatacaagacgttttaacagcactgcaaatatac
gaattatcagatattcaacgtggtttagaagaaccaacttatggtaaagcaagtcaactc
aaaacaactccagtcggtttaccaaatcaaagtttattaacacaactgcgtcgctattca
gaaatacaagcattattagcacgacaaaaacaacagcgacgcgatgcttctccttttcca
gaattaggaaacttgaaaggaacctttaatggtgaaatcagcttagatacagccgaagac
aaaggaataagtacgcaatttgatattaaagggaaaaactttacttggggtaccgaagaa
gatccagaacgctatagggcaaaacaagttattgctcaaggtgcttttgaaaatggaatt
ttaagattaatcccgttacggatcgaatcaacaaatagacttttcagctttagcggtgcg
gttggtggagacgaacaatacggtactctacaagtaaataattttcctttagaagtattg
aataactttgtgaatttgcctgtaggcttaactggcaatcttaatggcagagcagcttta
gccggtagtattaaaaatcctttaactaaaggagaatttagaattaccgatggaacttta
aatcaaaaaggaatagaatcagccgcagcgagcttcagttatagcaacggacgcttaaat
tttgctagtaacgtcatgattaatgatgccgaacccgttgatattaacggcagcattcct
tatcaattaccttttgcttcagtagctcccgcaagcaatcaaattaatttagatgtaaat
gtcaaaaatgaagggttagccgtactaaatttaattagcaatcaagcaacctttgaaaaa
ggtgaaggagaaattcaactaacagtacgcggtactttacaagaaccggtagtcaatggc
aatgctactcttaataatgcgacattttcggcacaagctttacccgaaaaactcacaaac
gttacgggaaaagtacaatttgattttgacaccatagtaatagatgctcttcaaggagac
tttagccgaggtaaggtagtagcaaaaggcgaaattcctatatatgacgaccaatttatt
caaattaacaacccacttgcagtgactttggataaattagcgataaatctcaaaggactt
tatcaaggtggtgtcggaggtaaagtagttgtcaaaggttccgcattgagtccaattatt
agcggtaatatcaatttgagtaacggcttggtattgctaccagaaaatgagacagaaaat
gtggctgcgaatagtagcggaatcaaacgtttaaaagcgaataaacaaatcaatcaagaa
gaaaatgccagaggaaaatttgataacctaaaattaactttaagcaaagatgtcaaagtc
gaacgccctccgataattagcattacagcaagcggacttctaaacgtcaacggtacattt
agcaatcccataccggttggcactctgaaattgaaaaaagggggagttaacttatttact
acccaattcaatatagataaaggtgaagagaatactgccacatttataaaaaatcaaccc
cgcgatccaattttagatatcagcttatttgctaaggtattagatgtaattcaaaattcc
gactttagtagagcaaatgccactggtttagcagctttagaaacggttcgtgtagaagca
gaagtaaatggtccagctagtaaaattaatgaaaacctagaattaaaaagtagccccgca
cgcactgaaacagaaattgtagctttgttaggaggtgggtttgatggtgagggaagagct
agttccgccgtgggattgcttaatattgccggttcggctgtttttggtaatttacaaacc
gcatttaatgaaatcggtactgctttcggtttagacgaactgcgaatatttccaactatt
atttctgacaatcccgatgccggaaaaagtaattcaactgttgaacttgcagcagaagct
ggagtcgatgtcaccaatagaatttcggtttctgctttaaagattttaacggcagatgac
ccatttcaatttggtattaattaccgattaaaggatagaattcgtcttcgcggttctact
aattttgatgatgatagtcgtgctgtgattgaatatcaaagaaggttttga
DBGET
integrated database retrieval system
