KEGG   Rivularia sp. PCC 7116: Riv7116_5953
Entry
Riv7116_5953      CDS       T02364                                 
Name
(GenBank) superfamily II RNA helicase
Organism
riv  Rivularia sp. PCC 7116
SSDB
Motif
Pfam: DSHCT Ski2_cyano_M DEAD ResIII Helicase_C DEXQc_Suv3 AAA_22 nSTAND3 MetOD2 nSTAND_NTPase5 ATPase_2 MTR4-like_stalk
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFY58314
LinkDB
Position
7508910..7511579
AA seq 889 aa
MNNPALTSDVDPSSVFSFELDQFQHDAIASLNAGRSVVVCAPTGSGKTLIGEYAIYRALA
RGKRVFYTTPLKALSNQKLRDFRSEFGFDSVGLLTGDASINRDAPILVMTTEIFRNMLYG
TPIGQVGTSLIDVEAVVLDECHYMNDRQRGTVWEESIIYCPESIQLVALSATVDNSDQLT
DWLNQVHGPTDLIYSDYRPVPLDFHFGNSKGLFPLLNEEKTQLNHRLVKRKRKRGDKSKQ
IARQESPDISYVLEHLRQRDMLPAIYFIFSRRGCDRAVAEVGDLWLVDGDEAQRLRPQID
EFLTRNPDAGRAGHVGPLYRGIAAHHAGILPAWKTLVEELFQQGLIKVVFATETLAAGIN
MPARTTVISTLSKRTDSGHRLLNPSEFLQMAGRAGRRGMDEVGYVVTLQTPFEGSKEAGY
LATSHPDPLVSQFSPSYGMVLNLLQTHTLEEAKELIERSFGQYLANLHLQPEYKRIAEFK
QHLAQIQTKIADVSAEEVAKYEKLRQRLKVERKLLTTLQEQAAETRKEELSMMLSFAVSG
TLLSIKGDNAEFSAPITAVLVGKTPGNETPFLVCLGKNNRWYVTSVNDVIDLYAQIPRID
ISPDLLPPSQLLLKPGQSCSGDEITEAIAAQIPEAPDDSFMAPEVVEQLRVVTDVQEQLE
SSPLYGLGNAASIYKRQARAVELEAEIQELRSQVEQQSQRHWDEFITLIEILQYFDAFDN
LVPTELGQMAAAIRGENELWLGLVLNSGNLDGLAPHHFATAVAALVTETSRPDSRVFFEL
SSEVADALASLRPIRRKVFQLQRRYGVALPVWLEFELITLVEQWALGMDWVEICENTTLD
EGDVVRILRRTLDLLSQIPHVPHLPQEIKRNAQRATQLIDRFPVNEVVE
NT seq 2670 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
gtgaataatcctgccctaacttcagacgttgacccgagttcagttttttcttttgaactc
gatcaattccaacacgatgccatagcttctctaaatgctggacgttcagttgttgtttgt
gcgcccacgggttccggtaaaactttgattggtgagtacgctatctaccgtgcattggca
cgaggaaagcgggtattttatactacccctctcaaagctctttccaatcaaaaattacgc
gatttccgttccgaatttggttttgattcggtggggctgctgactggagatgcttctatc
aaccgagatgctccaattttggtgatgactacggaaattttccgtaatatgctctacggt
acacctattgggcaagttggtacttcattaatagatgtggaagcggtggtgttagatgag
tgccactatatgaatgaccgtcaacgagggacggtttgggaagaatctattatttattgt
ccagaatcgatccagcttgtagctctttcggcaacggttgataatagcgaccagcttact
gattggttgaatcaggttcatggccccacagatttaatttattcggattatcgtccggtt
cctcttgattttcattttggcaatagtaaggggttgtttcctcttttaaatgaagagaaa
actcagctaaatcatcgtctggtaaaaagaaagagaaaaagaggcgataaaagcaagcaa
attgctagacaagaatctcctgatattagttatgtcttggagcatttgcgtcaaagagat
atgttgccagctatttactttatttttagccgtcgtggttgcgatagagcagtggctgag
gttggtgatttatggttggttgatggggatgaagcgcaaagattgcgacctcaaattgat
gagtttctaactcgcaatccagatgcgggaagagccggacatgttggtccgctttatcgg
ggaattgccgctcatcatgccggtattttacctgcttggaaaactttagtagaagagtta
tttcaacaaggcttaattaaagttgtatttgcaactgaaactttagccgcaggtataaat
atgcctgctagaactacagtaatttcgaccctttctaaacgtaccgatagcgggcatcgg
cttttaaatccttccgaattcttgcaaatggcaggaagagccggtcgtcgcggtatggat
gaagttggttatgtggtaaccttgcaaacgccgtttgagggttctaaagaagctggttat
ttagcaacatctcatccagaccctttagtcagccagttttcacccagttacggtatggtg
ttaaatttgctgcaaacccatacattagaagaggcgaaggaattaattgaacgaagcttt
gggcaatatttagctaatctgcatttacagccagagtacaaaagaattgctgagtttaaa
caacatttagcacaaatccagacaaagattgctgatgttagcgctgaggaagtcgctaaa
tatgaaaaattgcgtcagcgtttaaaagtagaacgcaaactgctaacaactttacaagaa
caagccgcagaaacacgcaaagaagaattaagcatgatgctcagctttgcggtgtctgga
actttgctaagtattaagggagacaacgccgaattctctgcaccaataacagcggtttta
gttggtaaaacccctgggaatgaaacacccttcctagtttgtttgggaaaaaacaaccgt
tggtatgtgacttcggtaaatgatgtgatcgatttatacgctcaaatacctcggattgac
atatctcccgatttattaccaccatctcaacttttattaaaaccggggcagtcatgttct
ggagatgagattacagaggcgatcgccgcacaaattcccgaagctccggatgattctttt
atggctccggaggtggtggaacaactgcgcgtggtaacggatgtgcaggaacaattggaa
agtagtccgctgtatggattgggcaatgccgctagcatatataagcgtcaagcccgtgct
gttgaattagaagccgaaatccaagaattgcgatcgcaagttgaacagcaatcccaacgc
cattgggatgaattcattacattaatagaaattctccaatactttgatgccttcgataat
ttagttccgactgaattaggacaaatggctgcggcaattcggggagagaatgaattatgg
ttgggtttagtgcttaatagcggcaacttggatggattagctccccatcattttgctaca
gcggttgcagcattggtaacggaaacttcccgccctgatagtagagtgttttttgagctt
agcagtgaagttgcagatgctttagcttcattacgtccgattcgtcgcaaggtatttcaa
ttacaacgcaggtatggagtagctttacctgtatggttggagtttgaattaattactttg
gtagagcaatgggcattaggaatggattgggtagaaatatgtgaaaacaccactttagat
gaaggggatgtagtcagaattttacgtcgtaccttagatttattatcgcaaattccccac
gttccccatttaccacaagaaattaagcgtaatgctcagcgagcaactcagttaattgat
aggtttccagtgaatgaagtggttgagtag

DBGET integrated database retrieval system