Rhodoferax lithotrophicus: MIZ03_2418
Help
Entry
MIZ03_2418 CDS
T10289
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
rlh Rhodoferax lithotrophicus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
Lipase_3
Hydrolase_4
PGAP1
ABHD18
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCO27530
LinkDB
All DBs
Position
2419187..2426194
Genome browser
AA seq
2335 aa
AA seq
DB search
MTTNLEYALFSANVYGNSPLVRYEQNTLPIPDGWDPIGTPVILSDGFMARAYQKGSEIVI
SYAGTTNEDAMDWLTGNVPGASAGYLAPQITDAAKFYLDVVKNNPGVSNISFTGHSMGGG
LASLMAVYFDKPAVVFDQAPFQKSADSSTVVSALKNALTAAGYTLPSTFSSYIALDPTGA
LIPSPTRQARDEQVTQIYTKGEALSLASTTMLNFVSAGLGLISPKLWMLGAGVDKVCGSE
IEIDPHAQTVLDWGTTAWGYTVTSGDPVTLHSITLLAGFLQSPDFLSVVRAYPELLPRMF
SGLYANDPKNKINANLTDLLVQREYRGEGALGALAVDVNKINRTEGLTSLKDLPGSDSKG
MNNVAAILMDAVLANLYAQGKTRAPEQGFVGKFDTLLRSVTGGLTADLQTLNKEADKVEV
ELNRMLGLLLGDEGNSVPHAHYARWTLQSGANALAADFNADAREDVVIGYNTADTINGGG
GDDVLAGLDGADTLNGGAGLDRIYGGEGNDILNGGLCGDWLYGGAGSDTYQLKSGELFDV
IQDSDGNGKITVNGTQLTGGKKADDNYWISADKQWGYLLTSGGDLVISKGSSLDTITIRN
WQSNGGNQLGIVLDNAQAPVDPKTGIRIFTGDQHAQLNASGYYKWGETSWAADGTLTAGV
AEADFADVISGTTGVDKISGLGGNDALNGGAGNDDMDGGSGDDLIGGGGGSDNINGGTGN
DIIFSALDLNVPQRIKADDTWKMPAGQTLVIQGSTWGYAVDKTSQSTNYPSYLGPLAQDD
APDVVNAGAGDDTVVTGRGDDRIDGGLGSDSLWGGGGNDIITAGDGGDIIFGDGDASGTW
DPALFTSAAEHGNDFLDGGAGDDMIVGGGGNDALYGGVDNDVLFGDNSERGLEEGVHGND
YLDGEDGNDQLMGGGKDDTLYGGAGDDKLWGDSSGLTDAPTYVSLASQGNDYLDGEDGND
YLEGGAKDDTLYGGAGNDQLWGDTSADNVANPADNALLWGNDYLDGEDGNDQLVGGGKDD
TLFGGTGDDNLYGDENIAVLQGPYNGNDYLDGEDGNDQLVGGGGDDTLYGGAGDDKLFGD
DELSRVAAEFQGNDILDGEDGNDYLDGGGGDDTLYGGTGNDTLKGGLGNNYLDGGDDTDS
LEVSSDSNILLGGAGDDQLLVTSGNDNLLDGQDGNDRLFVTGDNNSLAGGDGLDYLNIVS
GNGNKLDGGQGDDLLDTTGDNNVLSGGLGDDQLQTASGQQNMLNGDDGNDQLFVTGNNNT
LQGGADNDQLDVTSGNGNILDGQDGDDLLFVAGNNNTLLGGTGNDQLDMTSGDGNTLDGQ
EGNDRFFVIGNNNTLMGGADNDRLEITSGTNNTLMGGADNDRLEITSGTNNTLLGGEGND
VLLVGSGGNYLDGGAGRDIYAFRPGSGVNHISDSGGGNTVQFYRSFASAGLVLGIGSLKL
SFADGDVLHIDGFDPEDPINSCAVDTFIFEDRSFTLPELLALGAPDITGTPQDDVLQGTP
LGEHIDALAGNDTVSGGAGNDTISGGEGDDTLLGNSGDDTLAGGAGSNTLSGGTGNDTYV
VSSPEDTVIELAGEGVDTVQSSVSYTLGDNVENLTLVGSAYQGTGNALDNRIDASATVDG
VSLQSGGGNDTLMGGYGRDYLYGGAGNSTLIGNADDDVLVSGDGTDTMIGGRGNDNYTVN
NAADVVIENAGEGNDVVNASVSYTLSNNIEIIELTGTENIDAIGNELNNQLWGNSGNNIL
QGGAGNDDFFGLGGRDTLIGGTGDDYYLVQDANTVVVEAEGEGLDTVGSIVSYGLSDHVE
KLILNGNSDISGTGNAQDNAIIGNSGANTLDGGGGADEMRGGLGEDVYFVDNVNDRTIED
WVGPTYSNGWNGEFQLPEADTVNASVSFALGQNLENLNLLGADDLRGTGNVLDNVITGNS
GDNILSGLAGSDVLDGGVGADVLDGGSGSDVYYVDDVADQVIDTTAGEMRTSWYWGRSDQ
GFEKGWWSDYDRVNSSVSFVLGSNLEQLDLTGSADIDGRGNDLANLINGNDANNVLEGFG
GEDALAGGAGDDVLAGGDSNDRLDGGLGSDAMAGGAGDDTYWVDDAGDVVVEQAGEGVDL
VYGSVDITLTADVENLSLLDGAVVGIGNDSDNQILANTADNFLDAGAGDDVVDGFAGNDV
LKGGDGNDNLFGGHDDFVESGSNTLFGNADTIDGGSGNDTIDGGSGDDMIMGGSGDDTLF
GGRNDGAEGGDTLSNNDQITGGDGNDAIDGGSGADTLLGGAGNDVIYGGDSGGSRYYDPG
SDSLVNMSDDDFIDGGDGNDEVYGEQGNDVVLGGGGDDLMDGGSGNDVLMGGGWG
NT seq
7008 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaaccaatcttgaatacgcgctcttctccgccaatgtgtatggcaactcacctctg
gtgcgatacgaacagaacacccttccaatacccgacggctgggaccccataggaacaccg
gtcattctgtcagatggcttcatggcccgcgcctaccaaaagggcagcgaaatcgttatc
tcctatgccggcaccacaaacgaagacgcaatggactggctgaccggcaacgttcccggg
gcaagcgctggctatctcgcccctcaaattaccgatgccgccaagttctatctggatgtg
gttaagaacaaccccggcgttagcaacatcagttttaccgggcactccatgggtggcggt
ctggcatccctgatggcggtgtactttgacaaacccgccgtggtgtttgaccaggcccca
tttcaaaagagcgcggactcttccaccgtggtcagcgcgctgaagaacgcattgactgct
gcgggctacaccttgcccagcacgttttcctcctatatcgctttggaccccaccggcgcg
ctgatccccagcccgactcgtcaagcccgtgatgaacaggtcacccagatttacaccaaa
ggcgaagccctgtccttggccagcacgaccatgttgaattttgtttccgcgggtttgggc
ctgatcagtcccaaactgtggatgctgggggcgggggtagacaaagtgtgtggcagtgag
attgaaattgatccgcatgcccaaaccgttctggactggggtaccacagcatggggctac
acggtaaccagtggcgacccggtcaccttgcactccatcaccctgttggctggctttttg
caaagccccgacttcttgtcggtggtgcgggcatacccagagttgctgccgaggatgttt
tctgggctatatgcgaacgatccgaaaaacaaaatcaacgccaacctcaccgatttactg
gtgcagcgcgaataccggggtgaaggcgcactcggtgcgctggcagtcgatgtcaacaag
atcaaccgcactgagggcctgaccagtctcaaagacctgcccggatcggatagcaaaggc
atgaacaatgtcgctgccatattgatggacgcggtgttggcgaatttgtatgcgcaaggc
aaaacaagggcaccagagcaaggcttcgttggaaaattcgacactctgctgcgatcagtc
actggtggcctgaccgctgacctgcaaaccctgaacaaagaggccgataaggttgaagtg
gaactcaaccgcatgttgggtctgctgttgggtgatgaaggcaatagcgtgcctcatgct
cattacgcccgctggacgttgcaaagcggtgcaaatgcgttggcagccgacttcaatgcc
gatgcccgtgaagatgtggtgattggctacaacacagctgacactatcaatggtggggga
ggtgacgatgttttggcgggccttgatggagccgacaccttgaacggcggagcaggcctt
gaccgtatttacggcggcgaaggcaacgacatcctcaacggtggcctgtgtggcgactgg
ctctacggcggcgcaggctcagacacctaccaactcaaaagtggtgaactctttgatgtc
atccaggacagcgacggcaacggaaaaatcactgtgaatggcacgcaactcaccggcggc
aagaaggccgacgacaactactggatcagcgccgacaaacaatggggctacctgctcacc
agcggcggtgacctggtcatcagcaaaggctccagcctcgacacaatcaccatccgcaac
tggcaaagcaatggtggcaaccagctgggcatcgtgcttgacaacgcgcaagcgcccgtt
gaccccaagaccggcatccggatattcaccggcgaccaacacgcccagctgaacgcatct
ggttactacaaatggggagaaaccagctgggccgccgacggcaccctcaccgcaggcgtg
gccgaggccgactttgccgatgtcatcagcggcaccacaggcgttgacaaaatctcgggc
ctgggcggcaacgacgcactgaatggaggcgcgggtaatgacgatatggatggcggcagc
ggtgacgatttgataggcggtggcgggggctcggacaacatcaacggcggcacaggcaat
gacatcatcttcagcgcactcgatttgaatgtgccccagcgcatcaaagccgatgacaca
tggaaaatgcccgccgggcaaaccctggtgatccagggcagcacctggggctacgcagta
gataaaacctcgcaaagcaccaactaccccagctacctgggcccactggcgcaagatgac
gcacccgatgtggtgaatgccggtgcgggcgacgacaccgtagtgaccgggcgtggagat
gaccgcattgatggggggttgggcagcgattctctctggggcggtggtggcaacgacatc
attaccgcaggtgatgggggcgacatcatctttggtgacggcgacgcatcaggcacatgg
gaccctgctctattcaccagcgcagccgagcacggcaacgactttttggacggtggcgct
ggcgacgacatgattgtgggtgggggtggtaacgatgccttgtatggcggtgtggacaac
gacgtactgttcggggacaactcagaacgcgggttggaggaaggtgtgcacggcaacgac
tacctggatggcgaagacggcaacgaccagctgatgggtggtggcaaagacgataccctg
tacggtggtgcaggcgacgacaagctctggggcgacagtagtggcctaaccgatgcgccc
acttatgtgagtctggcttctcagggcaatgactacctggatggtgaagacggcaacgac
taccttgaaggtggagccaaagatgacacgctgtatggcggtgcaggcaacgaccagctc
tggggcgacaccagtgcggacaacgttgccaacccggctgacaacgcactgctgtggggc
aatgactatctggacggcgaggacggcaacgaccaactggtgggtggcggcaaagatgac
accctgtttggcggcacgggggacgacaacctgtatggcgacgaaaacatcgccgtgctg
caagggccatacaacggcaatgactacctggacggcgaagacggtaacgatcagctggta
ggtggtggcggggacgataccttgtacggcggtgcgggcgatgacaagctgtttggcgat
gatgaactctccagagtagccgctgagttccaaggcaacgacatcctggatggtgaagac
ggcaatgactacctggacggtggtggtggagacgacaccctgtacggaggcacgggcaac
gacacccttaaaggtggcctgggaaacaactaccttgatgggggtgatgacaccgacagc
cttgaggtcagctcggatagcaacatcttgctgggtggggcgggtgatgaccagcttttg
gtgaccagcggaaatgacaacctgctagacgggcaagacggcaatgaccggctgtttgtg
acgggggacaacaactctctggctgggggggatgggcttgactatttgaacattgtcagc
ggcaacggcaataagcttgatggtggccagggtgatgacttgctcgataccacgggggac
aacaatgtgttgtcgggtggactgggtgatgatcaattgcaaacagccagtggccagcaa
aacatgctcaacggggatgatggcaatgaccagctttttgtcactggtaacaacaacacg
ctgcagggtggcgcggataacgaccagcttgatgtcaccagcggtaatggcaacatcctg
gatggtcaagacggagacgacctgctttttgtcgctggtaacaacaacactctgttaggt
ggcacgggtaacgatcagcttgatatgaccagcggtgatggcaataccctggacggccag
gaaggtaatgaccggttttttgtcatcggtaacaacaataccttgatgggtggtgcggac
aacgaccgtctggaaattacctctggtaccaacaataccttgatgggtggtgcggacaac
gaccgtctggaaattacctctggtaccaacaataccttgctgggtggtgagggcaatgat
gtccttcttgtcggctctggtggcaactatttggacggtggtgcaggccgggatatttat
gccttcagacctggctcaggcgtgaaccacatttctgacagtggtggcggcaacacggtg
cagttttaccgctcgtttgccagtgccggcctggtgctgggcattggctcactcaagctc
agttttgccgatggtgatgtgctgcacatagacggctttgacccggaagacccgatcaac
tcctgcgcggtggacacattcatcttcgaagaccgtagcttcaccctacctgaactcctg
gccctgggagcaccagacatcaccggcacaccgcaagacgacgtgctgcaaggtacaccg
ctgggtgagcatatcgatgccctggcgggcaatgacacagtcagcggtggtgcgggcaac
gacaccatcagcggcggcgagggagacgacacccttctgggtaattcgggggacgacacc
ttggcaggtggcgcaggcagcaacaccttgagtggtggcacgggcaacgatacctatgtg
gtcagcagcccggaagacacggtgattgaactggcaggcgagggggtggacacggtgcaa
agcagtgtcagctacaccttgggtgacaacgtggagaacctgacgctggtgggctcggcg
tatcaaggaacaggcaatgctttggacaaccgtattgatgcttcggcaacggttgacggg
gtcagcttgcaaagtggcgggggtaatgacacgctgatgggtggttatgggcgcgactat
ttgtatgggggtgcgggtaacagcacgctgataggtaacgccgacgatgatgtgcttgtc
agcggcgatggcacagacaccatgattggcggacgtggtaatgacaattacacggtgaat
aacgccgctgatgtggtcatcgagaatgccggggaaggcaatgatgttgtgaacgcttcg
gtcagctatacgctaagtaacaacattgaaatcatcgaacttactggcactgaaaacatt
gatgccatcggcaatgagttgaacaatcaattgtggggtaacagtggcaataatattttg
caaggcggcgcgggcaacgacgatttctttgggttgggggggcgtgatactttgatcggt
ggcaccggcgatgactactatttggtgcaggatgccaacacggtcgttgttgaggccgag
ggtgaaggattggatactgtcggaagcatagtcagttatggcctgtcagaccatgttgaa
aagctgatattgaacggaaactctgatatctctggcacgggtaacgcgcaggataacgcg
atcattggcaacagtggggcaaatacgctggatggcggtggtggcgctgatgagatgcgc
ggcgggctgggggaggatgtctattttgtggacaatgtgaacgaccggacgattgaagac
tgggtggggccaacttactccaacgggtggaatggggagtttcagttgcctgaagccgat
acggtgaatgcgtcagtaagttttgcgctgggccaaaacctggaaaacctcaatcttctt
ggggcagatgacttgaggggtacgggcaatgtattggacaacgtgatcaccggcaacagt
ggggacaacatcttgtctggtttggcgggtagcgatgtgctggatggtggtgtgggcgcg
gatgtgctggatggcggttcgggcagcgatgtgtattacgtggatgacgtggctgatcaa
gtgattgacacaacggctggtgaaatgcgcacttcttggtattggggtcgatcagatcaa
gggtttgagaagggttggtggtctgattacgaccgagtgaattcgtcggtatcgtttgtg
cttggctcgaacctggagcagcttgatttgaccggctctgccgacattgatggccgtggc
aatgatttggccaatctgatcaatggcaatgatgccaacaatgtgcttgagggctttggg
ggtgaggatgctctggccggtggtgcgggggatgacgtgcttgctggtggcgatagcaat
gatcgtcttgatggtggtttgggcagcgatgccatggccggtggtgcgggggacgacacg
tattgggttgacgatgcaggggatgtggtggtggagcaggcaggggaaggtgttgatttg
gtgtatggctcggtggatatcactttgacagctgatgttgagaatttgagtttgctggat
ggcgcagtggttggcatcggtaatgacagtgataaccagattctggccaacactgctgac
aactttttggacgctggcgctggcgatgatgtggtggatggctttgctggcaatgatgtg
ctaaagggtggggatggcaatgacaacctgtttggtgggcacgatgattttgtggagagt
gggtccaacacgctctttggaaacgcagacacgatagacggtggctcgggcaatgacacg
attgatggtggctccggtgatgacatgatcatgggcggcagtggcgacgacacacttttt
ggcggtcgcaatgatggtgccgaagggggtgataccctgtccaacaatgatcaaataact
ggtggtgacggcaacgacgcgatagatggtgggtctggtgcagataccttgctgggcggt
gcgggcaatgatgtgatttatggtggtgatagtggcggttcgcgttactacgatccaggg
tcagactcattggtgaacatgtccgatgatgacttcatcgatggtggtgacggtaatgat
gaagtttatggagagcaaggtaatgatgttgttctaggtggcgggggcgacgatttaatg
gatggtggctctggcaatgatgttttgatgggtggggggtggggttga
DBGET
integrated database retrieval system