Rhopalosiphum maidis (corn leaf aphid): 113549138
Help
Entry
113549138 CDS
T06065
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC113549138
KO
K24387
lethal(3)malignant brain tumor-like protein
Organism
rmd
Rhopalosiphum maidis (corn leaf aphid)
Pathway
rmd03083
Polycomb repressive complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rmd00001
]
09120 Genetic Information Processing
09126 Chromosome
03083 Polycomb repressive complex
113549138
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
rmd03000
]
113549138
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
rmd03036
]
113549138
Transcription factors [BR:
rmd03000
]
Eukaryotic type
Zinc finger
Cys2HisCys zinc factors
113549138
Chromosome and associated proteins [BR:
rmd03036
]
Eukaryotic type
Histone modification proteins
Polycomb repressive complex (PRC) and associated proteins
Noncanonical PRC1 (PRC1.6)
113549138
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MBT
SAM_1
SAM_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113549138
NCBI-ProteinID:
XP_026806108
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(13726631..13741663)
Genome browser
AA seq
1272 aa
AA seq
DB search
MEKSDENIKTIMDVNSFEDCDSLLYSGYDNTSETNYQYDLSQYSSDNNESVMVIDDDDDT
LSDISNSEIIDEKNKLNVPTSIKMPEQKIIVNDDFEDDSEDESEDDSEDDSEDDSDTEIY
EETVSINKTILSAATKNTNVITKQKENDSLNVKNLFIPKNDSSIAKSNQIKLPSDAATNR
PKTTKNLQPESSSKNKFSQKGFYKLKSSKGSSSDVFIIPHNGMNYMITKKSPPMKSNHSL
STTLKGPSTVVTPNEQNKQVISKAASRGEKKEESNFVARIQQQLGKKYKVVPDQGQVPIN
LDRVFKRNPNFTKQKMATNPTPNGHKVGDFFRLGNSCQLANNKETRNVQHKIVPTPVKSS
WSKMSKTIDLTNESKNNKFIPHTITSKDATEKNTNYFIKNGNVYPKKISPTTTEIIDLSD
DSPPLSPTRYDKITKNNHKTIQSPSLDFLNKSKTKLNFFEMLKNSGNDSNGFSDEILQVN
CSKTGTSKNSNIRRAVKTNLNKNKVLLSDEIINLSDLSDSSNEENDDTSDQFISCKYEYC
DTLVYEPELIDDLYCSLTCKNLDMKKIVTEEENIDETTNLTKTSKVDRKHLLTKLENRIN
KRKQLLTSCPKDSVKENDFDQQLINFFNKPSLEDNQSLLELNKDLKGRCNIPDVIDIDDD
VDDDDDDDDDDEYFDLKPLIEDKDVLNYMVGMQFKSAPKKLFDRPFPSEKNLFVVGQKLE
GIDPKHEALFCVMTVSEVCGYRIKLHFDGYPDDYDFWVNADCPNLFHPGWCEMNSRILQP
PNNYENQFNWISYLRECQALPAPKHNFISTKNINNYKNQHKFHIGDKLEALDKLTRTLPK
QLICVATVADILGNRIRIHFDGWTDDFDYWTDITSTNIHPIRWCDNNGRILSPPSGYNDM
KGKKPFNWTEYLKETNSNPVPEDAFIRRPLRDFSNGMIIEVIDLVVPRLLRIARVVDVRG
DELKIVYDGFNDNYAYWVEDDSPDIHPVGWSAKTNHPIELPPAPNTLWNCSIFGCKGYGN
SSNRLKNDHVDLNECPYEMDSWKTAVAGLAKMPDRLKANNVLITTTLTSSKSKGNIHQNN
ENNIKNRISTEIKNYFTIKEKINEKRLNLMLDTNNIESERDSDSRNSFINNIPSSKNKKL
RKAVGLSLVGYNLGSVFMEQKRNDWIRHNAQLGIPFFNTTDVIKWSVHDVASYVKKVVAT
YTSKIHDTNEEISISDRFIDQGIDGESFLMLNQDDIMNILKVPLGHALKITNAIILLRQQ
TSGFHLFDLPQD
NT seq
3819 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaatctgatgaaaatataaaaactattatggatgtaaattcatttgaagattgt
gattcattgctatatagtggttatgacaatacaagtgaaactaattatcaatatgactta
tctcaatactcttcggataataatgagtcagtaatggtaattgatgatgatgatgataca
ttgagtgatatcagtaatagtgaaattatagatgagaaaaataaattaaatgtgcctact
tcaattaaaatgccagaacaaaaaattattgtaaatgatgattttgaagatgattctgaa
gatgaatctgaggatgattctgaagatgattctgaagatgattctgatacagaaatatat
gaggaaacagtttcaataaataaaacaattttatctgctgctactaaaaatacaaatgta
attacaaaacaaaaagaaaatgattctttaaatgtaaagaatttatttattcctaaaaat
gactcctctattgccaaatctaatcaaattaaattaccatctgatgctgcaactaacagg
ccaaaaactacaaagaatttacagccagagtcatcgagtaaaaataaatttagtcaaaaa
ggtttttacaaacttaaatcttcaaagggttcttcatcagatgtttttataatcccacac
aatggtatgaattatatgataaccaaaaaaagtccaccaatgaagtctaatcattcttta
tcaactacattaaaaggaccaagtactgtagttacaccaaatgaacaaaataaacaagtt
atatcaaaagctgcatcaagaggtgaaaaaaaagaggagtctaactttgttgctcggata
caacaacaacttggcaaaaaatataaagtggtaccagatcaaggacaggtacctattaat
ttagaccgtgtattcaaacgaaaccctaattttactaaacaaaaaatggcaacaaatcct
actccaaacggacataaagttggtgatttttttcgtctaggaaattcatgtcaattggca
aataataaggaaactagaaatgttcagcataaaatagtacctacacctgttaagtcttct
tggagtaaaatgtctaaaacaattgatctaactaatgagagtaaaaataataagtttatt
cctcatactattacaagtaaagatgccacagaaaagaatacaaattattttattaaaaat
ggcaatgtttatcccaaaaaaataagtcctactacaactgaaattattgacctatctgat
gatagtccaccgttaagtcctactagatatgataaaataactaaaaataatcataaaaca
attcagtcaccatcattagattttcttaacaaatctaaaacaaaattgaatttttttgag
atgctaaaaaacagtggtaatgattcaaatggctttagtgatgaaatattacaagtaaat
tgcagtaaaactggtacatcaaagaattcaaatattagaagagcagttaaaaccaatttg
aataaaaataaagtattattgtctgatgaaattattaatttaagtgatctcagtgattct
tctaatgaagaaaatgatgatacatctgatcagttcatttcttgcaaatatgaatattgt
gatacattagtgtatgaacctgaattgattgatgatttatattgtagtttaacatgtaaa
aatttagacatgaaaaaaatagtaactgaagaagaaaatattgatgaaactacaaatcta
acaaaaacatctaaagttgatcgaaaacatttattaacaaaattggaaaatagaataaat
aagaggaaacaattgctaacttcttgtccaaaggactcggttaaagaaaatgattttgat
caacaattgataaatttttttaataaaccatcattagaagataatcaatctttattagaa
ttaaataaagatcttaaaggcagatgtaatattccagatgtaatagatattgatgacgat
gttgatgatgatgacgatgatgatgatgatgatgaatattttgatcttaaacctttaata
gaagacaaagatgtattaaattatatggttgggatgcaatttaaatctgcccccaaaaaa
ttgtttgatagaccttttccgtctgagaagaacttatttgttgtaggacaaaaacttgaa
ggtattgatcccaaacatgaagcattattctgtgtaatgactgtatcagaagtttgtgga
tatcgcattaaattacattttgatggttatccggatgattatgatttttgggttaatgcg
gattgcccaaatttgtttcatccaggatggtgtgaaatgaattcgcggattctacaacca
ccaaataattatgaaaatcaatttaattggattagttatcttagagagtgtcaagcttta
ccggctccaaaacacaattttatctctactaaaaacattaataattataaaaatcaacat
aaatttcatatcggagataaattagaagcattagataaattaacccgcacacttccaaaa
caattaatatgtgttgccactgttgctgatatcttgggtaatcgcattcgtattcatttt
gatggatggacagatgattttgattattggacggatattacatcaactaatatacatcca
attagatggtgtgataacaatggtcgaattttgtctcctcctagtggttataatgatatg
aaaggaaaaaaaccctttaattggactgaatacttaaaagagacaaatagtaatcctgtg
cctgaagatgcatttatccgtagaccattaagagacttttctaatggaatgataattgaa
gttattgatcttgttgttccaagactgttaagaattgctagggtagtagatgttagaggt
gatgaactaaaaattgtttatgatggatttaatgataattatgcatactgggttgaagac
gatagtccagatattcatcctgttggatggtcagcaaagactaatcatccaattgaacta
cctccagcacctaatacactatggaattgcagtatctttggctgtaaaggttatggaaat
tcatcaaatagattgaaaaatgatcatgttgatttaaatgagtgcccatatgaaatggat
tcatggaaaacagctgtagctgggttagcaaagatgcctgatcgattaaaagctaataat
gttttaattaccacaacattgacaagttcaaaatcaaaaggcaatatacatcagaataat
gaaaataatataaaaaatagaataagtacagaaatcaagaattattttacgatcaaagaa
aagataaatgaaaaaagattaaatcttatgttggatacaaataatattgaatcagaacgt
gattctgatagtagaaattcatttattaataacattccaagtagtaagaacaaaaaattg
cgcaaagcagttggtttatctcttgtgggatataatttgggctcagtatttatggaacaa
aaacgcaatgattggatcagacataatgctcaactaggtataccattcttcaatacaact
gatgtaataaaatggtctgttcatgatgtggcctcatatgttaaaaaagtggttgcaact
tatacctcaaaaattcatgataccaatgaagaaatcagtatttctgatcggttcattgat
caaggaattgatggtgagtcatttttaatgttaaatcaagatgatataatgaatatatta
aaagttccacttggtcacgcattaaaaataaccaatgccattatactattaagacaacag
acttctggatttcatttatttgaccttcctcaagattaa
DBGET
integrated database retrieval system
