Rhopalosiphum maidis (corn leaf aphid): 113549689
Help
Entry
113549689 CDS
T06065
Name
(RefSeq) NFX1-type zinc finger-containing protein 1-like isoform X1
KO
K27391
NFX1-type zinc finger-containing protein 1
Organism
rmd
Rhopalosiphum maidis (corn leaf aphid)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_12
AAA_11
ZNFX1
AAA_19
AAA_30
SLFN-g3_helicase
ResIII
DEAD
PhoH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113549689
NCBI-ProteinID:
XP_026806897
LinkDB
All DBs
Position
4:31832916..31840964
Genome browser
AA seq
1106 aa
AA seq
DB search
MLLPFIMTRKKKEDYTLQYKWLENDLSKSSTVTSVSCFDDYRRIPLYPTLEDITNGPPIL
YANNVDRPYKNCDEYLNNFFRLMREDFVSVIRDILKTINANKSVLEREMDRLWYYSNVKI
EKKRNSSVTMYLQFDTPNKAKNFNYEDSKRFKNGALLLLSKDLFTTFSLGIVTDTFKLNK
GIVGVDVVDFEEVNKWNSIDLLEPDVFYEPYRYVLGVFQDLCETNFPMKNYIIHGIKEIS
YPSYLTGNSVYTINGITFDILQNDQWPSAEILNMDINQYEAFKGALTKEFTMIQGPPGTG
KTYIGLEIVKVIIENMYDTNKLNHPIMVVCMTNHALDQFLEGIWKITRNISRFGRGTKSD
ILVNYIPTMSVARKDECANIYVDARRDVKASIQNENQHLLNIKEVDHNKGVVDLSLLMQV
LNENGFNTWFQDSYDLLAWLLHGISSVNGINPIDFLKKDKLLATRFSKLDKNKTNKKIYC
ITLKSIKLYCTQIQCQLNNTSYNLKDDSKKKDLENALQLMRTIEDYIAKHLKLYKSGSSE
KFKNRNNRDLLEKRDRWLLYYYWIRLYITKEYNNIENIKSTTRQCRRDMNKFKSIGYLKP
VQNKYVIGMTTTAAAKNRYLLKNLKCPIVIIEEAAEVLEPHIVASLSEYCEHLILIGDHK
QLRPQTANHIIGKKYRLDISLFERMVNNKIPSYVLAEQHRMRPEIAGLVAPVIYPHLRNH
ASVMERPNVKGVYMNLFCMTHNVHEEKNYELSSFVNSAEAKYLVALANYLLKQGYYPEDI
TIMAMYNAQVVYISNLIKSPPFEHLADIRVSSVDGYQGEENEIVLLSLVRSNNNYSIGFL
KTNNRVCVALSRARLGFYIAGDLKLLARVSKLWSSIKKYLSNINALGPKLLLKCQIHNKC
LGSVSNHSDFQRLTACQLKCNVELSCGHLCKKLCHVEDRDHLMVKCSNVCNRKCPRDHKC
LKMCYEDCSCQVLINQMSDCGHIVQGKCCDIENMKCYMKVKKTLSCGHTLEKNCFEQFNC
NQICKKPNLNCLFRHLCKKPCGVNCGSCTHLIPIIMKCGHISEFSCSREPDTVECLECKG
YQKHFMSRNDVNRLVPEKNNSGIKVL
NT seq
3321 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttattaccattcattatgacgagaaaaaaaaaagaagactatacacttcagtataaa
tggttagaaaatgatttgtcaaagtcatcaacggtgacatctgtaagttgttttgacgac
tatagacgtattccactttaccccacattagaagatataaccaacggaccaccaatatta
tatgcaaataatgttgatcgtccatataaaaattgtgatgaatatctaaataattttttc
cgtcttatgcgagaagattttgtttcggttattagagatattttaaaaactataaatgct
aataaaagtgtactcgaacgagaaatggacagattatggtattatagtaatgttaaaatt
gaaaagaaaagaaattcatctgtaacaatgtatttgcaatttgatacacctaataaagct
aagaattttaactatgaagatagtaaacgatttaaaaatggtgctttgttgttactttca
aaagatttatttactacattcagtttaggaatcgtaactgatacatttaagttaaataaa
gggatagttggtgtcgatgttgttgattttgaagaagtaaataaatggaactcaattgat
ttattagagccagatgttttttatgaaccttacagatatgttttgggagtatttcaagac
ttgtgtgaaacaaatttcccaatgaagaattatattatacatggtattaaagaaatttca
tatcctagttatttaacaggaaattctgtttatactattaatgggattacatttgatatt
cttcaaaatgaccaatggccgtcagctgaaatacttaacatggatatcaatcaatatgaa
gcatttaaaggggctttaactaaagaatttactatgattcaaggaccacccggcactggt
aagacttacattggattagaaattgtaaaggttattattgaaaatatgtatgatacaaat
aaactcaaccatcctattatggttgtatgtatgacaaatcatgccttggatcaatttctt
gagggtatatggaaaataacaagaaatatttcaagatttgggcgtggaactaaaagtgat
attttagtgaactatattccaacaatgagtgttgctcgcaaggatgaatgtgccaatata
tatgtagatgccagacgagacgtaaaagcttcaatacaaaacgaaaatcagcatctgctt
aatattaaagaagttgatcacaataaaggtgtagttgatttgtctttacttatgcaagtg
cttaacgaaaatggttttaatacatggtttcaagattcatatgatttacttgcatggttg
ttacatggtatttcatccgtgaatggtataaatccaatagattttttaaaaaaagataag
ttacttgctacccgattctcaaaacttgataaaaataaaactaataaaaaaatatattgt
ataactttgaagagtataaaactgtattgtacccaaattcaatgtcaactaaataatacg
agttataatctaaaagatgattctaaaaaaaaagatttagaaaatgcattacaattaatg
agaaccatagaagattacatagccaaacatttaaaattgtataaatccggatcttctgaa
aaatttaaaaatcggaataaccgtgacttattagaaaaaagagatcgatggttattgtat
tattattggattcgtttatatataacaaaagagtataataatattgaaaatataaaaagt
actactcgtcaatgtagacgagatatgaacaagtttaagtcgattggatatttgaaacca
gttcaaaataagtatgtgattggtatgacaacaactgccgctgctaaaaatagatatttg
cttaaaaatcttaaatgtccaattgttataattgaagaagcagcagaggttttagaacct
cacattgtggcatcattgtcagaatattgtgaacatcttattctcattggtgatcataaa
caactgcgtcctcaaacagctaatcatatcataggcaaaaaatatcgacttgacatttca
ttgtttgaacgtatggtaaataataaaattccatcatatgtattagcagaacaacatcgc
atgcgaccagaaattgcaggcttagttgcaccagttatttatccacatttaagaaatcat
gcatctgttatggaacgaccaaatgttaaaggagtttacatgaatttattttgcatgact
cacaatgttcatgaagaaaaaaattatgagttgtccagttttgttaatagtgctgaagca
aaatatttggttgcattggcaaattatctattaaagcaaggatattatccagaagatatt
actattatggcaatgtataatgctcaagttgtatacatttctaatttgattaaatcacca
ccttttgaacatttggcagacattagagtttcttcagtggatggttatcaaggcgaagaa
aatgaaattgttttattgtcattggtgcgtagtaataataattacagtattggatttttg
aaaaccaacaatagagtatgtgttgccttatctagagctagattgggtttttatattgct
ggtgatttgaaattacttgctagagtcagtaaattgtggagtagtattaaaaaatacttg
agtaatataaatgcattaggcccaaaattattgttgaagtgtcaaattcataacaaatgt
ttaggaagtgtatcaaatcattcagattttcaaaggttgactgcatgtcaattaaaatgt
aatgttgaactttcttgtggccatttatgtaagaaattatgtcatgttgaagatagggac
catttaatggttaagtgttcaaatgtctgtaataggaaatgccctagagatcataaatgt
cttaaaatgtgttatgaagactgttcatgccaagtgttaattaatcaaatgagtgattgt
ggccatattgttcaaggaaagtgctgtgatatagaaaatatgaaatgctatatgaaggta
aaaaaaacattaagttgtgggcatacactcgagaaaaattgctttgaacaatttaattgt
aaccaaatatgtaaaaaacccaacttaaattgtttatttaggcatttatgcaaaaaacca
tgtggtgtaaattgtggttcatgtacacatttgattcctataataatgaaatgtggacat
atttcagaattctcttgttctcgagaaccagacacagtagaatgtttagaatgcaagggt
tatcagaaacattttatgtcaaggaatgatgtaaatagattagttcctgaaaaaaataat
tcaggcattaaggtcctgtaa
DBGET
integrated database retrieval system