Rhopalosiphum maidis (corn leaf aphid): 113554311
Help
Entry
113554311 CDS
T06065
Name
(RefSeq) RRP12-like protein
KO
K14794
ribosomal RNA-processing protein 12
Organism
rmd
Rhopalosiphum maidis (corn leaf aphid)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rmd00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
rmd03009
]
113554311
Ribosome biogenesis [BR:
rmd03009
]
Eukaryotic type
90S particles
Other 90S particles
113554311
Pre-60S particles
Other pre-60S particles
113554311
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRP12_HEAT
HEAT_RRP12_N
XMAP215_CLASP_TOG
Dopey_N
HEAT_GCN1
Cnd1
Katanin_con80
TPR_IPO5
T7-like_gp12
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113554311
NCBI-ProteinID:
XP_026813896
LinkDB
All DBs
Position
2:35507770..35514805
Genome browser
AA seq
1262 aa
AA seq
DB search
MAKFRKKLKSKGKRWVKGQSSVTNPDSKKYRSQAQMNFCKPIFGTVLNDGKSLLTQNKLK
EHDNIMNSYGSNNSKPDDVMSHTSATTYKTFETFASDWSSCTNPSFNRLLKNFSSNSYLH
KEMLAILAALTEVIKANGGKETSTEYFAAIITTLQTTLSNGQDDCEDSVTAMVSLLSMGM
KCVPKEVLCTKFGPTTQTLLTTLAKFAESDNNNLLKSVFSCLSLLLRIQEKIVWSHSSTI
QVYDAILNFIIHSKPKIRKAAQHAVCAILKCNKDSMHPMSGYTATYCTKVLTSSTVASNT
TTILHVLTILKELMPIFPKKELKPLCEEVLKLMTLNHPLLLSCGFQVFHGLFVSYPSSEL
VLSSTLNAKLLMALFDYRPTPMDTQPTLAWLAVQQEGYICLSKSDLSLCISHLKRIFKVC
IELWINGNSESLKASGCTLRILIEECIGKATDSTYHHSISVLFNLVTQCLSYQYKNACPQ
VLHTLSTFFKFYGKCAPSIFLECIKSLGQLRDSNDITFVNELEMTIGAGIRYIGPEHIIS
DKVIPLKVDDVGEFKRSWLLPVLKDSISNSTLKCYIDHFLPLALKCREMYENALKANDKI
TAISYDLLESQIWSLLASFCTNPSDISTSFRIIARTMGTMLSTRKELRDTILVSLRKLID
SVSKNDEVSDDKKQLSYFAKNFLPICLNLYTNPAHGTDEQATRFSALETIKMYLTLSDNE
IKEQLFEKCCGMLDNSKDAEHTVIESILDIIGVLVPYQSVKTLKSFFDSRISKAKQLKNF
KEEKKYFRILEEISSSKSPTCNKFVKKNFDNIQNFIISTAQNVAATSRGPRLRCLAHLLD
HTDEDNVIQNIIAHLPEAVLCCKGSTVNKRCRECAFSLINKMALLAIKVENGLENFLNAL
SAGLAGSIPMISCTILALASVLHNRKNEINSNQFETILSNICLLITTGTREVVSSALSFI
KVIITSFSNDLMPYLSTILSSLSKMTDDCKRKFRQETKNMYQRLVRKFGTDLIIKLVPNT
DVQTHVRLRAINKESERLKRNKEKRNKDQINDKADVDFSLKTKPKTFEEILAECEEDEEL
ETNLNQKPKVKLERGRKKKSAENYLHESEDDILDFTEANSNRKILMSKPKNEHNINIQKS
SNVDDNIKTAPDGRLIITDEPQEPSTKSGIEEDDVDNNYSDDDMPSKKRLKYMPGGKGIH
RPLDNKHLGNGKMNKQIKKNKTQNQPQRSNKNKGKKSNGNVRPFSYTDFKSYGASNKKRK
RN
NT seq
3789 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgaagtttcgaaaaaaattgaagtccaaaggcaaacgatgggtaaaaggacaaagc
tccgtcaccaatccagattcaaaaaaatatcgttcccaagcacaaatgaacttttgcaag
ccaatatttggaactgttctaaacgatggaaaaagtttgttaactcaaaacaaattaaaa
gaacatgataatattatgaatagttatggttctaacaactctaaaccagatgatgttatg
tctcatacttcagcaacaacttacaaaacatttgagacgtttgcttctgattggagttca
tgcaccaatccatcttttaataggttgctaaaaaattttagttcaaactcttatttacat
aaagaaatgttagccatacttgcagcattgacagaagtaattaaagctaatggaggtaaa
gaaacatctacagagtattttgcagctattataacaactttacaaacgaccttaagtaat
gggcaggatgattgtgaagatagtgttacagctatggtctcgttattaagtatgggtatg
aaatgtgttcctaaagaagttctttgtactaaatttggaccaaccactcaaactttgtta
acaacactagcaaagtttgctgaatcagataataataatttattaaaatcggtatttagt
tgtttatctttactacttcgtattcaagaaaaaattgtttggtcacatagttctacaata
caagtatatgatgcaattttaaattttattatccattcaaaacctaagattcgtaaagct
gctcaacatgcagtgtgtgctatattaaaatgtaataaagattcaatgcatcctatgtct
ggttatactgctacatattgtactaaagtgttgacatcaagtacagtagcaagtaacact
acaactattcttcatgttctaactatattaaaggaattaatgcccatttttcctaaaaaa
gaactcaagcctctttgcgaagaagtcttaaagttgatgactttaaaccatccattattg
ctttcgtgtggctttcaagtattccatggtttatttgtttcttatccgtcatcagagctt
gtactttcttctacactaaatgctaagttattaatggctctttttgattatcgtcctacg
ccaatggatacacaacctactttagcttggttagctgtccaacaagaaggttacatttgt
ttatcaaagagtgacttatcgttatgcatatcccaccttaaaagaatatttaaagtatgt
attgaactttggattaatggaaattcagaatctttaaaagcatctggctgtacattacgt
attcttattgaagagtgtattggaaaagctactgattcaacttatcatcatagtatttct
gtcttattcaatttagtaactcagtgtttatcatatcagtataaaaatgcttgtccacaa
gtcttacatactctatctacatttttcaaattttatggaaaatgtgctcctagtatattc
ttagaatgtataaaatcattgggacagcttagagattccaatgacataacatttgttaat
gaattagaaatgacaattggagctggtatcaggtatattgggcctgaacacatcatatca
gataaagttattccattaaaggtggatgatgttggagaatttaagcgcagttggttatta
cctgttttaaaagatagtatttcaaattctacacttaaatgctatatagaccacttttta
cctttggcattaaaatgtcgagaaatgtatgaaaatgctttaaaagctaatgataaaata
actgccattagttatgatcttctagaatcacaaatttggtcgttattggcaagtttttgt
acaaatccttctgatatatccacatcttttcggattattgcaagaacaatgggtactatg
ttaagtactcgtaaagagttacgagatacaattcttgtgtcattaagaaaacttatagat
tctgtttctaagaatgatgaagtatctgacgacaaaaagcagttgtcttattttgcaaaa
aactttttacccatttgtttgaatttatatactaaccctgcccacggtacagatgaacaa
gctactagattttctgcgttggaaacaatcaaaatgtacctaacgttgtcagataatgaa
ataaaagaacaattatttgaaaaatgttgtggtatgttggataattctaaagatgcagaa
catacagtgatagaaagcattcttgatattattggagttttagttccttaccaatctgtc
aaaacactaaaatcattttttgattctcgaatttctaaagctaaacagttgaaaaatttc
aaagaagaaaaaaaatattttagaattctggaagaaataagcagttctaagtctccaaca
tgtaataagtttgtgaaaaagaactttgataatatacaaaacttcataatatcaacagct
caaaacgttgctgctacgagtcgtggacctcgattacgatgtttagcacatctcttagat
catactgacgaagataatgtgattcaaaatataatagctcatctccctgaagctgtactt
tgctgtaaaggttccactgttaataaacgatgtcgtgaatgtgctttttcattgattaat
aaaatggctttattagcaattaaagttgaaaatggattagaaaactttttaaatgcttta
tcagcaggattggctggttcaattccaatgatcagttgtactattttagcactagcatca
gttctccacaaccgtaaaaatgaaattaattcaaatcaatttgaaacaattttaagtaat
atttgtttacttattacaactggaacaagagaagtagttagctctgctttaagttttatc
aaagtgattattacttcattctccaatgatttgatgccttacctttcaacaattttgagt
tctctttcaaaaatgacagatgattgcaaacgaaaatttcgtcaagaaactaaaaatatg
taccaaagactggtacgtaaatttggtacagaccttatcataaaattagtgccgaatact
gatgttcaaacacatgtccgtttacgtgctattaataaagaatctgaacgattaaagaga
aataaagaaaaaagaaataaagaccaaataaatgataaagcagatgttgattttagtctt
aaaactaaacccaaaacatttgaagagattttagctgaatgtgaagaagatgaagaatta
gaaactaatttaaaccaaaaaccaaaagttaaactagaaagaggcagaaagaaaaaatct
gctgaaaattatttgcatgaaagtgaagatgatatattagattttactgaagcaaattca
aatagaaaaattttaatgtcaaaacctaaaaatgaacataatataaatattcaaaagtca
tctaatgttgatgataacataaaaactgcacctgatggacgtcttataatcactgatgaa
cctcaagaaccttcaacaaagtctggtatcgaggaagatgatgttgacaacaactacagt
gatgatgatatgccatcgaaaaaacgattaaaatatatgcctggcggaaaaggtattcat
cgaccattagataataaacatttaggaaatggaaagatgaacaaacaaataaagaagaat
aaaacacaaaatcaaccgcaaagatctaataaaaacaaaggaaagaaatctaatggaaat
gttcgtccattttcttatactgatttcaaaagctatggagcttcaaataagaaaaggaaa
agaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
