Rhopalosiphum maidis (corn leaf aphid): 113556716
Help
Entry
113556716 CDS
T06065
Name
(RefSeq) codanin-1 isoform X1
KO
K19531
codanin-1
Organism
rmd
Rhopalosiphum maidis (corn leaf aphid)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
rmd00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
rmd03036
]
113556716
Chromosome and associated proteins [BR:
rmd03036
]
Eukaryotic type
Nucleosome assembly factors
Histone chaperones
Other Histone chaperones and regulators
113556716
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Codanin-1_C
HTH_54
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113556716
NCBI-ProteinID:
XP_026817633
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(44489700..44497041)
Genome browser
AA seq
1028 aa
AA seq
DB search
MQKYMSKSEVRCASLMNNVLEENININEILEKIKSFEPCNVRHGVGKIEFTFYVIDFVHN
KTVQYVNQPDENEHVINNAFNVPEVESPMVKRIIPKISTTKGSNSQGKKTVQIHTVTSKL
NKTKITDTTKKERRSLDILGSLYAAMINSNILCNLFHELGYVFTLLTVKNHEIKSNNDSF
SSNNTYFKSSDDCHYFASRTIEQLVPVLTYLEKPIINLILKQKVINTYAPELAKTFENKF
NSLNINDDTKSSSSSISKDMVKFDGEHDAKDCFPSIKMFYAFKTQRDAFYDLLENWKQNE
NQYELDPKKFENIKKMLNDNKNSVNMSKFAKLFVAQLINSTFEESKNVYKNKTIKELSAS
KLELLHQRITKRDYTSGYSVNPANEFPGMQMFFKEFINMLLDDGVFCKHLIDTLVHRIDV
LNTMEWASELQEGAIYQQTFFFYVDTLRLLSKFLAFTLYNPYKDYNVLNPTLKEYIWEVR
SKVLPPINLLAKLRCALKHGHSEIVLTTSWIIEYLYQVDPISITTPFYKDILTLIYSLCM
VNSDLTASKLMLRLQFNCLIEHINIEPHTLFDDSKRCFDKNFIENVAKELKNDLVVNTKQ
IYHYCPQLNNYRTVLESKVNNKKIKFLSPTVSLPSQKINQNRQIELELESHFFENHSPSV
LATVDFISKRIASSCTKKIQNQGIAAVKNQFVDIVCEKFKEHISKNTDVEFKLDENDVTK
CSLFLSSSIQQYVDHFSRNNIPNSINELLDSESVNPGSLPFCIAVTVRKFKALVTDWVKN
HINIKNMFITYIKTELKTNLKSGSIDEDGNNLRELLMPTHCDEPDEDLFIPENELLIDLN
IFSLKIIEVDNYKLSLDDILEYSEKFKIVLENKNKMESNLYRFIIARLIDNLLLATYQMP
KLFNKDVMKAYHPYLAENLYTVSMIICERNIYILSEKSNSHKAIISEKITAWMQYFIENN
FLTIDELTNQIMSILQLSWPEDTLKCLSICFKDLNSVCLKKFDDTKVQELFMWLTNFMDM
IEDYDIDY
NT seq
3087 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaagtatatgtctaaatctgaagttcgatgtgcaagtttaatgaacaatgtattg
gaagaaaatattaatataaatgaaattttggaaaaaattaaatcatttgaaccatgtaat
gttcggcatggtgtaggtaaaatagaattcacattttacgtgattgattttgttcataat
aagactgtgcaatatgtaaatcagccagatgagaatgagcatgttataaacaacgcattt
aatgtgccagaagttgaatcaccgatggtgaaacgaataatacctaaaatatcaacaaca
aaaggttccaacagtcagggtaaaaagacagttcaaatacataccgtgacttcaaaattg
aataaaacaaaaataactgataccactaagaaagaacgaaggagcttggatatattagga
agtctgtatgcggcgatgataaattctaatatattatgtaatttgtttcatgaattaggt
tatgtatttacacttcttactgtaaaaaatcatgaaataaaatctaataatgatagtttt
agttcaaataatacgtacttcaaatcatctgatgattgtcattattttgcttcaagaact
atagaacaattagttccagttttaacttatttagaaaaaccaattattaatctaatttta
aaacagaaagttatcaacacatatgcaccagaattggctaaaacatttgaaaataaattt
aactcattaaacataaatgatgatacaaaatcttcaagttcaagtatatcaaaagatatg
gtaaaatttgatggtgaacatgatgccaaagattgttttccatcaataaaaatgttttat
gctttcaaaactcaaagagatgcattttatgatttactagaaaattggaaacaaaacgaa
aatcagtatgaattagatcctaagaaatttgaaaatatcaagaaaatgcttaatgataat
aagaactctgttaatatgagtaaatttgctaaattatttgttgctcaattgataaattct
acatttgaagaatcaaagaatgtctataaaaacaaaactattaaggagttatctgcctca
aagttagaattactacatcagcgaattactaaacgagactatacaagtggatatagtgtt
aatccagctaatgaatttcctggcatgcaaatgttttttaaagaatttattaatatgttg
ttagatgatggagttttttgtaaacatttaatagataccttagtacatagaattgatgta
ttaaatacaatggaatgggcttctgaactacaagaaggtgcaatttatcaacaaaccttc
tttttttatgttgatactttaagattgttgagtaaatttttagcctttacattatataat
ccatataaagattataatgttttaaatccaactttaaaagaatatatatgggaagtacga
tcaaaggttttacctccaataaatttgcttgccaaattacggtgtgctcttaaacatgga
catagtgaaattgtattaactacttcgtggataattgaatacttgtaccaagtagatcca
atttcaattacaactcctttttataaagatatactgacattgatatattctctgtgtatg
gtaaattctgatttaactgcttccaaactaatgctgaggttacagtttaattgtttaatt
gaacacataaatatagaacctcatacactatttgatgactcaaaaagatgttttgataaa
aattttatagaaaatgttgcgaaggaattaaaaaatgatcttgtagtaaatacaaagcaa
atttatcactattgcccacagctaaataattatcgaactgtattagaaagtaaagttaat
aataaaaagataaaatttttatcgcctacagtaagtctacctagccaaaaaataaatcaa
aatcggcagatagaattagaattagaatcacatttctttgaaaatcattctccgtctgta
ttggctacggttgatttcatttctaaacgaattgcttcttcatgtaccaaaaagattcaa
aatcaaggtatagctgctgtaaagaatcaatttgttgatattgtgtgtgaaaaattcaaa
gaacatatcagcaaaaatacagatgtagagtttaaacttgacgaaaatgatgtaaccaag
tgtagtttatttttgagctcttctattcaacagtacgtagatcatttttctagaaacaat
attcccaactccattaatgaattattagattctgaatctgtgaatcctggttccttgcca
ttttgcattgctgttacagttcgtaaatttaaagcactagtaacagattgggtcaagaat
catataaatatcaaaaatatgtttattacttacattaaaactgaattgaaaacaaattta
aaaagtggcagtatagatgaagatggaaataatcttcgtgaattattgatgccaactcat
tgtgatgagccagatgaagatttgtttattccagaaaatgaacttttgatagatttgaat
atatttagtttaaaaattatcgaagttgataattataaactatcattggatgatatctta
gaatattctgaaaaatttaaaattgttttagaaaataaaaataagatggaatctaattta
taccgatttataattgcaagactaattgataatttattattagcaacgtatcaaatgcca
aagttattcaataaagatgtgatgaaagcttatcatccatatttggctgaaaatctttat
actgtttcaatgataatatgtgaacgtaacatatatattctgtcagagaagtcaaattct
cataaggctattataagtgaaaaaataacagcttggatgcaatattttatagaaaacaat
tttcttactattgatgaacttacaaatcaaattatgtcaattttacaattatcttggcca
gaagatacattaaaatgtttatcgatttgctttaaagatctaaatagtgtatgtttaaag
aaatttgatgatactaaggttcaagagttattcatgtggttaacaaattttatggatatg
attgaggactatgatatcgattattga
DBGET
integrated database retrieval system
